Technologie jednobuněčné sekvence používaná k odhalení heterogenity sekundární hyperparatyreózy
Tento projekt má za cíl vybrat případy, které splňují požadavky výzkumu, vzít sekundární hyperparatyreózu, primární hyperparatyreózu a normální lidskou příštítnou tkáň, celkem tři skupiny, 4 případy v každé skupině, metodou jednobuněčné transkripce a sekvenování, sestrojit mapu funkčních typů lidských příštítných tělísek, odhalit genovou strukturu a stav genové exprese buněk a vizualizovat expresní charakteristiky, mezibuněčnou heterogenitu a heterogenitu buněčných podskupin sekundárních hyperparatyroidních buněk hierarchickým způsobem, nakreslit mapu jedné buňky a porovnat rozdíly mezi skupinami. Prozkoumat patogenezi sekundární hyperparatyreózy.
Sekundární hyperparatyreóza, tkáň příštítných tělísek primární hyperparatyreózy a normální tkáň příštítných tělísek získaná náhodně byly odebrány, zmraženy a konzervovány, zmrazená tkáň byla rozmražena, byla připravena jednobuněčná suspenze a každá buňka byla specificky označena systémem Mozhuo Genomics, po rozbití oleje, polymerázový řetězec reakční amplifikace, reverzní transkripce pro získání komplementární DNA a knihovna komplementární DNA, která prošla kontrolou kvality, byla zkonstruována pro získání vysoce kvalitních dat o buňkách příštítných tělísek. Ke snížení dimenzionality, shluku a vizualizaci dat byly použity Cell Ranger, balíček R Seurat a diagram redukce rozměrů t-SNE.
Aby bylo možné zkonstruovat jednobuněčný atlas příštítných tělísek, výzkumníci provedli shlukovou analýzu podobných buněk podle profilu genové exprese a poté data vizualizovali pomocí t-SNE. Podle výsledků shlukování buněk byly identifikovány specifické a vysoce exprimované geny v každém shluku buněk. Populace buněk byly identifikovány podle exprese orientačních genů a byly porovnány rozdíly v typech buněk a proporcích mezi skupinami.
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Typ studie
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Chunyu Li
- Telefonní číslo: 86 18031662801
- E-mail: seonjuk@foxmail.com
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Haowen Xu
- Telefonní číslo: 86 15099539369
- E-mail: xuhaowenbucm@163.com
Studijní místa
-
-
-
Beijing, Čína
- China and Japan Friendship Hospital
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Účastníci studie s diagnózou sekundární hyperparatyreózy, kteří podstoupili chirurgickou léčbu
- Účastníci studie s diagnózou primární hyperparatyreózy, kteří podstoupili chirurgickou léčbu
- Účastníci studie, kteří získali informovaný souhlas
Kritéria vyloučení:
- Jiné nesekundární stavy hyperparatyreózy, jako je primární hyperparatyreóza, byly v době zařazení účastníků studie s esenciální hyperparatyreózou vyloučeny.
- Jiné neprimární hyperparatyreoidické stavy, jako je sekundární hyperparatyreóza, byly v době zařazení účastníků studie s esenciální hyperparatyreózou vyloučeny.
- Odmítnutí informovaného souhlasu.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Sekundární hyperparatyreóza
Pacienti, u kterých byla diagnostikována sekundární hyperparatyreóza
|
Technologie jednobuněčného sekvenování může odhalit genovou strukturu a stav genové exprese jednotlivých buněk, což odráží heterogenitu mezi buňkami.
|
|
Primární hyperparatyreóza
Pacienti, u kterých byla diagnostikována primární hyperparatyreóza
|
Technologie jednobuněčného sekvenování může odhalit genovou strukturu a stav genové exprese jednotlivých buněk, což odráží heterogenitu mezi buňkami.
|
|
Normální skupina
Tkáň příštítných tělísek získaná náhodně během jiných operací krku, odvozená od lidí bez onemocnění příštítných tělísek.
|
Technologie jednobuněčného sekvenování může odhalit genovou strukturu a stav genové exprese jednotlivých buněk, což odráží heterogenitu mezi buňkami.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Sestrojte jednobuněčný atlas
Časové okno: Jeden rok
|
Byl zkonstruován jednobuněčný atlas normálního příštítného tělíska, primární hyperparatyreózy a sekundární hyperparatyreózy. Pro prozkoumání rozdílů v genové expresi se provádí diferenciální analýza. Dalším krokem je provedení sudu a analýza informací o cestě. Populace buněk se používají ke zkoumání změn v buněčném stavu během progrese populace. Kvazi-časová analýza je navržena tak, aby vymezila dynamickou trajektorii buněčné diferenciace a dynamický proces genové exprese. SCENIC je síť pro odvozování společné exprese genů. Vyšetřovatelé k implementaci použijí software jako CellRanger a balíček Seurat v R word. |
Jeden rok
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Meng Yang, China-Japan Friendship Hospital
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Aktuální)
Primární dokončení
Dokončení studie (Odhadovaný)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- 2023-NHLHCRF-YYPPLC-ZR-08
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
produkt vyrobený a vyvážený z USA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .