Technologie jednobuněčné sekvence používaná k odhalení heterogenity sekundární hyperparatyreózy

Tento projekt má za cíl vybrat případy, které splňují požadavky výzkumu, vzít sekundární hyperparatyreózu, primární hyperparatyreózu a normální lidskou příštítnou tkáň, celkem tři skupiny, 4 případy v každé skupině, metodou jednobuněčné transkripce a sekvenování, sestrojit mapu funkčních typů lidských příštítných tělísek, odhalit genovou strukturu a stav genové exprese buněk a vizualizovat expresní charakteristiky, mezibuněčnou heterogenitu a heterogenitu buněčných podskupin sekundárních hyperparatyroidních buněk hierarchickým způsobem, nakreslit mapu jedné buňky a porovnat rozdíly mezi skupinami. Prozkoumat patogenezi sekundární hyperparatyreózy.

Sekundární hyperparatyreóza, tkáň příštítných tělísek primární hyperparatyreózy a normální tkáň příštítných tělísek získaná náhodně byly odebrány, zmraženy a konzervovány, zmrazená tkáň byla rozmražena, byla připravena jednobuněčná suspenze a každá buňka byla specificky označena systémem Mozhuo Genomics, po rozbití oleje, polymerázový řetězec reakční amplifikace, reverzní transkripce pro získání komplementární DNA a knihovna komplementární DNA, která prošla kontrolou kvality, byla zkonstruována pro získání vysoce kvalitních dat o buňkách příštítných tělísek. Ke snížení dimenzionality, shluku a vizualizaci dat byly použity Cell Ranger, balíček R Seurat a diagram redukce rozměrů t-SNE.

Aby bylo možné zkonstruovat jednobuněčný atlas příštítných tělísek, výzkumníci provedli shlukovou analýzu podobných buněk podle profilu genové exprese a poté data vizualizovali pomocí t-SNE. Podle výsledků shlukování buněk byly identifikovány specifické a vysoce exprimované geny v každém shluku buněk. Populace buněk byly identifikovány podle exprese orientačních genů a byly porovnány rozdíly v typech buněk a proporcích mezi skupinami.