Einzelzellsequenztechnologie zur Aufdeckung der Heterogenität des sekundären Hyperparathyreoidismus
Ziel dieses Projekts ist es, Fälle auszuwählen, die den Forschungsanforderungen entsprechen, sekundären Hyperparathyreoidismus, primären Hyperparathyreoidismus und normales menschliches Nebenschilddrüsengewebe zu entnehmen, insgesamt drei Gruppen, 4 Fälle in jeder Gruppe, durch die Methode der Einzelzelltranskription und -sequenzierung eine Karte zu erstellen von menschlichen Nebenschilddrüsenfunktionstypen, offenbaren die Genstruktur und den Genexpressionsstatus von Zellen und visualisieren die Expressionseigenschaften, die interzelluläre Heterogenität und die Heterogenität von Zelluntergruppen sekundärer Hyperparathyroidzellen auf hierarchische Weise, zeichnen eine Einzelzellkarte und vergleichen die Unterschiede zwischen Gruppen. Untersuchung der Pathogenese des sekundären Hyperparathyreoidismus.
Sekundärer Hyperparathyreoidismus, Nebenschilddrüsengewebe des primären Hyperparathyreoidismus und zufällig gewonnenes normales Nebenschilddrüsengewebe wurden gesammelt, eingefroren und konserviert, das gefrorene Gewebe aufgetaut, eine Einzelzellsuspension hergestellt und jede Zelle nach dem Aufbrechen des Öls und der Polymerasekette durch das Mozhuo Genomics-System spezifisch markiert Reaktionsamplifikation, Reverse Transkription, um komplementäre DNA zu erhalten, und eine Bibliothek komplementärer DNA, die die Qualitätsprüfung bestanden hat, wurden erstellt, um qualitativ hochwertige Daten von Nebenschilddrüsenzellen zu erhalten. Cell Ranger, das R-Seurat-Paket und das t-SNE-Dimensionalitätsreduktionsdiagramm wurden verwendet, um die Dimensionalität zu reduzieren, die Daten zu gruppieren und zu visualisieren.
Um einen Einzelzellatlas der Nebenschilddrüsen zu erstellen, führten die Forscher eine Clusteranalyse ähnlicher Zellen entsprechend dem Genexpressionsprofil durch und visualisierten die Daten anschließend mit t-SNE. Anhand der Ergebnisse der Zellclusterung wurden die spezifischen und stark exprimierten Gene in jedem Zellcluster identifiziert. Zellpopulationen wurden anhand der Expression von Landmark-Genen identifiziert und die Unterschiede in den Zelltypen und Proportionen zwischen den Gruppen verglichen.
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
Studienkontakt
- Name: Chunyu Li
- Telefonnummer: 86 18031662801
- E-Mail: seonjuk@foxmail.com
Studieren Sie die Kontaktsicherung
- Name: Haowen Xu
- Telefonnummer: 86 15099539369
- E-Mail: xuhaowenbucm@163.com
Studienorte
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Beijing, China
- China and Japan Friendship Hospital
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Studienteilnehmer mit der Diagnose sekundärer Hyperparathyreoidismus, die sich einer chirurgischen Behandlung unterzogen haben
- Studienteilnehmer mit der Diagnose primärer Hyperparathyreoidismus, die sich einer chirurgischen Behandlung unterzogen haben
- Studienteilnehmer, die eine Einverständniserklärung eingeholt haben
Ausschlusskriterien:
- Andere nicht-sekundäre Hyperparathyreoidismus-Erkrankungen wie primärer Hyperparathyreoidismus waren zum Zeitpunkt der Einbeziehung von Studienteilnehmern mit essentiellem Hyperparathyreoidismus ausgeschlossen.
- Andere nicht-primäre Hyperparathyreoidismus-Erkrankungen wie sekundärer Hyperparathyreoidismus waren zum Zeitpunkt der Einbeziehung von Studienteilnehmern mit essentiellem Hyperparathyreoidismus ausgeschlossen.
- Verweigerung der Einwilligung nach Aufklärung.
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Anzahl der Gruppen / Kohorten
Kohorten und Interventionen
Gruppe / KohorteGruppe / Kohorte |
Intervention / BehandlungIntervention / Behandlung |
|---|---|
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Sekundärer Hyperparathyreoidismus
Patienten, bei denen ein sekundärer Hyperparathyreoidismus diagnostiziert wurde
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Die Einzelzellsequenzierungstechnologie kann die Genstruktur und den Genexpressionsstatus einzelner Zellen aufdecken und so die Heterogenität zwischen Zellen widerspiegeln.
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Primärer Hyperparathyreoidismus
Patienten, bei denen primärer Hyperparathyreoidismus diagnostiziert wurde
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Die Einzelzellsequenzierungstechnologie kann die Genstruktur und den Genexpressionsstatus einzelner Zellen aufdecken und so die Heterogenität zwischen Zellen widerspiegeln.
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Normale Gruppe
Nebenschilddrüsengewebe, das zufällig bei anderen Halsoperationen gewonnen wurde und von Menschen ohne Nebenschilddrüsenerkrankung stammt.
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Die Einzelzellsequenzierungstechnologie kann die Genstruktur und den Genexpressionsstatus einzelner Zellen aufdecken und so die Heterogenität zwischen Zellen widerspiegeln.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Konstruieren Sie den Einzelzellatlas
Zeitfenster: Ein Jahr
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Es wurde ein Einzelzellatlas der normalen Nebenschilddrüse, des primären Hyperparathyreoidismus und des sekundären Hyperparathyreoidismus erstellt. Eine Differenzialanalyse wird durchgeführt, um Unterschiede in der Genexpression zu untersuchen. Der nächste Schritt besteht darin, ein Kegg durchzuführen und die Pfadinformationen zu analysieren. Zellpopulationen werden verwendet, um Veränderungen im Zellzustand während der Populationsentwicklung zu untersuchen. Die quasi-zeitliche Analyse soll den dynamischen Verlauf der Zelldifferenzierung und den dynamischen Prozess der Genexpression beschreiben. SCENIC ist ein Netzwerk zur Ableitung der Gen-Koexpression. Um dies umzusetzen, werden die Ermittler Software wie CellRanger und das Seurat-Paket in R Word verwenden. |
Ein Jahr
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Ermittler
Ermittler
- Hauptermittler: Meng Yang, China-Japan Friendship Hospital
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
- 2023-NHLHCRF-YYPPLC-ZR-08
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Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
Produkt, das in den USA hergestellt und aus den USA exportiert wird
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