Ultra rychlé sekvenování genomu (URGES)
Dlouho přečtené sekvenování lidského genomu za 72 hodin: „Ultra rychlé sekvenování genomu“
Sekvenování nové generace (NGS) způsobilo revoluci v oblasti genomiky a umožnilo detekci genetických abnormalit pro diagnostické nebo terapeutické účely. Doba obratu pro výsledky sekvenování exomu nebo genomu se snížila na průměrně 3 až 6 měsíců.
Stále větší počet diagnostických a terapeutických oborů těží z pokroků v ultrarychlém sekvenování. V některých situacích může být kratší doba obratu užitečná pro rozhodování o terapeutickém a/nebo intervenčním řízení.
Tato studie si klade za cíl prozkoumat proveditelnost velmi rychlého sekvenování celého genomu, ultrarychlého sekvenování genomu (URGES) za 72 hodin, což by mohlo být přínosem pro pacienty s rakovinou nebo vzácnými onemocněními.
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Detailní popis
- Vzorek krve (5 ml)
- Extrakce genomové DNA z lymfocytů
- Ultra rychlé sekvenování genomu (48 hodin pro celý genom) pomocí sekvenátoru PromethION P2 Solo (Oxford Nanopore Technologies)
- Bioinformatická analýza nezpracovaných vysoce výkonných sekvenačních dat s platformou SeqOne
- Lékařská interpretace molekulárních dat: Data NGS musí být interpretována multidisciplinárním týmem pro podporu rozhodování, aby se určila akceschopnost mutace a identifikovali potenciální „ovladače“
Typ studie
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Pascal Pujol, MD, PhD
- Telefonní číslo: +33 01 46 41 50 79
- E-mail: p-pujol@chu-montpellier.fr
Studijní místa
-
-
Ile-De-France
-
Levallois-Perret, Ile-De-France, Francie, 92300
- Institut Rafael
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria zahrnutí:
- Žádná známá progresivní nebo chronická onemocnění
- Souhlas s účastí
- Příslušnost k systému sociálního zabezpečení
Kritéria vyloučení:
- Nelze pochopit
- Těhotné nebo kojící ženy
- Subjekt pod ochranou dospělých (opatrovnictví, kurátoři nebo zabezpečení spravedlnosti)
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Zdraví dobrovolníci
|
Extrakce DNA ze vzorku krve a sekvenování celého genomu
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Čas (v hodinách) pro dlouhé čtení sekvenování lidského genomu a interpretaci dat
Časové okno: 72 hodin
|
Čas (v hodinách) na dokončení dlouhého sekvenování lidského genomu, od extrahované DNA po molekulární a klinické výsledky
|
72 hodin
|
Sekundární výstupní opatření
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Sekvenční pokrytí
Časové okno: 72 hodin
|
>30 X odpovídající refseq BED
|
72 hodin
|
|
Hloubka sekvenování
Časové okno: 72 hodin
|
>30 X odpovídající refseq BED
|
72 hodin
|
|
Počet variant nazývaných vhodně nebo ne
Časové okno: 72 hodin
|
72 hodin
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Aktuální)
Primární dokončení
Dokončení studie (Aktuální)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- 2024/03
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
produkt vyrobený a vyvážený z USA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .