Ultrahurtig GEnome-sekventering (URGES)
Langlæst Human Genome Sequencing på 72 timer: "Ultra Rapid GEnome Sequencing"
Næste-generations sekventering (NGS) har revolutioneret området for genomik, hvilket muliggør påvisning af genetiske abnormiteter til diagnostiske eller terapeutiske formål. Omløbstider for exom- eller genomsekventeringsresultater er faldet til et gennemsnit på 3 til 6 måneder.
Et stigende antal diagnostiske og terapeutiske områder nyder godt af fremskridtene inden for ultrahurtig sekventering. I nogle situationer kan en kortere behandlingstid være nyttig til at træffe terapeutiske og/eller interventionelle ledelsesbeslutninger.
Denne undersøgelse har til formål at udforske gennemførligheden af meget hurtig hel-genom-sekventering, ultrahurtig genomsekventering (URGES) på 72 timer, som kan gavne patienter med cancer eller sjældne sygdomme.
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
- Blodprøve (5 ml)
- Ekstraktion af genomisk DNA fra lymfocytter
- Ultrahurtig genomsekventering (48 timer for et helt genom) ved hjælp af PromethION P2 Solo-sequencer (Oxford Nanopore Technologies)
- Bioinformatik analyse af rå high-throughput sekventeringsdata med SeqOne platform
- Medicinsk fortolkning af molekylære data: NGS-data skal fortolkes af et tværfagligt beslutningsstøtteteam for at bestemme mutationshandlingsevne og identificere potentielle "drivere"
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Pascal Pujol, MD, PhD
- Telefonnummer: +33 01 46 41 50 79
- E-mail: p-pujol@chu-montpellier.fr
Studiesteder
-
-
Ile-De-France
-
Levallois-Perret, Ile-De-France, Frankrig, 92300
- Institut Rafael
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Ingen kendte progressive eller kroniske sygdomme
- Samtykke til deltagelse
- Tilslutning til et socialt sikringssystem
Ekskluderingskriterier:
- Ude af stand til at forstå
- Gravide eller ammende kvinder
- Emne under beskyttelse af de voksne (værgemål, kuratorer eller retssikkerhed)
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Antal grupper/kohorter
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorteGruppe / kohorte |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Sunde frivillige
|
DNA-ekstraktion fra blodprøve og hele genomsekventering
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Tid (i timer) til lang læst humant genomsekventering og datafortolkning
Tidsramme: 72 timer
|
Tid (i timer) til at fuldføre en langlæst human genomsekventering, fra det ekstraherede DNA til de molekylære og kliniske resultater
|
72 timer
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Sekventeringsdækning
Tidsramme: 72 timer
|
>30 X henholdsvis til refseq BED
|
72 timer
|
|
Sekvenseringsdybde
Tidsramme: 72 timer
|
>30 X henholdsvis til refseq BED
|
72 timer
|
|
Antallet af varianter kaldet passende eller ej
Tidsramme: 72 timer
|
72 timer
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Faktiske)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- 2024/03
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .