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Sequenziamento del GEnoma ultrarapido (URGES)

16 dicembre 2024 aggiornato da: CMC Ambroise Paré

Sequenziamento del genoma umano a lunga lettura in 72 ore: "Sequenziamento del genoma ultra rapido"

Il sequenziamento di nuova generazione (NGS) ha rivoluzionato il campo della genomica, consentendo l’individuazione di anomalie genetiche per scopi diagnostici o terapeutici. I tempi di consegna dei risultati del sequenziamento dell'esoma o del genoma sono diminuiti a una media di 3-6 mesi.

Un numero crescente di campi diagnostici e terapeutici stanno beneficiando dei progressi nel sequenziamento ultrarapido. In alcune situazioni, un tempo di risposta più breve può essere utile per prendere decisioni di gestione terapeutica e/o interventistica.

Questo studio mira a esplorare la fattibilità del sequenziamento molto rapido dell’intero genoma, sequenziamento ultrarapido del genoma (URGES) in 72 ore, che potrebbe avvantaggiare i pazienti affetti da cancro o malattie rare.

Panoramica dello studio

Stato

Completato

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

  • Campione di sangue (5 ml)
  • Estrazione del DNA genomico dai linfociti
  • Sequenziamento del genoma ultrarapido (48 ore per un intero genoma), utilizzando il sequenziatore PromethION P2 Solo (Oxford Nanopore Technologies)
  • Analisi bioinformatica di dati grezzi di sequenziamento ad alto rendimento con la piattaforma SeqOne
  • Interpretazione medica dei dati molecolari: i dati NGS devono essere interpretati da un team multidisciplinare di supporto decisionale per determinare l'efficacia della mutazione e identificare potenziali "driver"

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Effettivo)

4

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Luoghi di studio

    • Ile-De-France
      • Levallois-Perret, Ile-De-France, Francia, 92300
        • Institut Rafael

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Adulto
  • Adulto più anziano

Accetta volontari sani

Sì

Metodo di campionamento

Campione di probabilità

Popolazione di studio

Adulti senza malattie progressive o croniche note

Descrizione

Criteri di inclusione:

  • Non sono note malattie progressive o croniche
  • Consenso alla partecipazione
  • Affiliazione ad un sistema di previdenza sociale

Criteri di esclusione:

  • Incapace di capire
  • Donne incinte o che allattano
  • Soggetto sotto tutela degli adulti (tutela, curatori o salvaguardia della giustizia)

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Volontari sani
Estrazione del DNA da campioni di sangue e sequenziamento dell'intero genoma

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Tempo (in ore) per il sequenziamento del genoma umano a lettura lunga e l'interpretazione dei dati
Lasso di tempo: 72 ore
Tempo (in ore) per completare un sequenziamento del genoma umano a lunga lettura, dal DNA estratto ai risultati molecolari e clinici
72 ore

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Copertura del sequenziamento
Lasso di tempo: 72 ore
>30 X rispetto a refseq BED
72 ore
Profondità di sequenziamento
Lasso di tempo: 72 ore
>30 X rispetto a refseq BED
72 ore
Numero di varianti chiamate in modo appropriato o meno
Lasso di tempo: 72 ore
72 ore

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

8 ottobre 2024

Completamento primario (Effettivo)

12 ottobre 2024

Completamento dello studio (Effettivo)

12 ottobre 2024

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

13 agosto 2024

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

14 agosto 2024

Primo Inserito (Effettivo)

15 agosto 2024

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

25 marzo 2025

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

16 dicembre 2024

Ultimo verificato

1 dicembre 2024

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Altri numeri di identificazione dello studio

  • 2024/03

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

prodotto fabbricato ed esportato dagli Stati Uniti

No

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