Mezinárodní cestování a šíření rozšířeného spektra Escherichia Coli produkující beta-laktamázu

Název Význam mezinárodního cestování při šíření rozšířené beta-laktamázy produkující Escherichia coli.

Hlavní řešitel Johann DD Pitout, profesor, University of Calgary, Ústav patologie a laboratorní medicíny, č. 9, 3535 Research Road NW, Calgary, Alberta, Kanada, T2L 2K8. Tel: (403) 770 3338. Fax: (403) 770 3347. johann.pitout@cls.ab.ca

Pozadí a zdůvodnění: Měnící se epidemiologie infekcí způsobených širokospektrálními bakteriemi produkujícími beta-laktamázy Od roku 2000 se enzymy CTX-M produkující Escherichia coli celosvětově objevily jako důležité příčiny komunitních infekcí močových cest (UTI) a infekcí krevního řečiště v důsledku bakterie produkující rozšířené spektrum beta-laktamázy (ESBL). Studie z různých kontinentů naznačují, že náhlý celosvětový nárůst E. coli produkující CTX-M je často způsoben vznikem klonu s názvem ST131. Zdá se také, že zahraniční cesty do vysoce rizikových oblastí, jako je indický subkontinent (Indie, Pákistán), mohou částečně hrát roli v šíření E. coli produkující CTX-M napříč různými kontinenty. Nicméně důkazy, že infekce způsobené E. coli produkující ESBL jsou spojeny s mezinárodním cestováním, jsou nepřímé a vyšetřovatelé by rádi dokázali, že je to skutečně pravda.

Hypotéza:

Naší primární hypotézou je, že když cestovatelé navštíví Indii, mají riziko, že se v jejich konečníku nakazí E. coli produkující CTX-M (tj. existuje vysoké riziko kolonizace konečníku těmito bakteriemi). Důvodem pro výběr Indie je to, že předchozí studie z Calgary ukázala, že riziko infekcí po cestě je nejvyšší u cestujících vracejících se z této země. Vyšetřovatelé se také domnívají, že získání těchto bakterií je spojeno s určitým vysoce rizikovým chováním během cestování po Indii, jako je pití vody ze studní, konzumace určitých potravinových produktů nebo užívání antibiotik. Naší sekundární hypotézou je, že u některých cestovatelů, kteří jsou po návratu z Indie kolonizováni E. coli produkující CTX-M, se později vyvinou infekce (nejspíše UIT) stejnými bakteriemi, které byly poprvé přítomny v jejich konečníku.

Cíle:

Ke stanovení míry rektální akvizice E. coli produkující ESBL u cestovatelů do Indie (tj. riziko kolonizace).

Ukázat, že stejná E. coli produkující ESBL přetrvává až šest měsíců v konečníku cestovatelů po jejich návratu do Kanady (tj. posoudit stupeň perzistence). Vyšetřovatelé se domnívají, že klon ST131 je pravděpodobnější, že bude přítomen delší dobu než jiné E. coli produkující ESBL.

Identifikovat různé chování cestovatelů v Indii, které je vystavuje vysokému riziku získání E. coli produkující ESBL (tj. rizikové faktory kolonizace).

Chcete-li zjistit, u jaké části kolonizovaných cestovatelů se později vyvine infekce stejnou E. coli produkující ESBL, kterou získali při návštěvě Indie (tj. riziko infekce).

Charakterizovat E. coli produkující ESBL a identifikovat klon ST131 mezi těmito bakteriemi.

Studovat design:

Studie bude provedena na dvou cestovních klinikách v Calgary a Londýně v Kanadě. Tyto kliniky poskytují komplexní služby cestovní medicíny včetně preventivních očkování a předepisování léků proti malárii. Lidé starší 18 let, kteří plánují navštívit Indii na dobu alespoň 5 dnů, budou osloveni, aby se studie zúčastnili. Před zápisem předmětů bude získán informovaný souhlas. Cestovatelé, kteří souhlasí s účastí, obdrží před cestou podrobný cestovní itinerář a vzorek stolice. Účastníci studie budou požádáni, aby se do 7 dnů po návratu do Kanady vrátili na cestovní kliniky a vyplnili podrobný dotazník týkající se jejich chování během návštěvy. Vyplněný dotazník a vzorky stolice budou získány při druhé návštěvě. Cestující budou požádáni, aby kontaktovali kliniky, pokud se u nich během příštích šesti měsíců objeví infekce. Další exemplář stolice bude odebrán šest měsíců po jejich návratu do Kanady. Všechny vzorky stolice budou předloženy laboratořím Calgary Laboratory Services a zmraženy na -20 °C pro další analýzy. Vzorky budou dávkovány a kultivovány pomocí selekčního média chromID-ESBL. Všechny izolované E. coli produkující ESBL budou podrobeny fenotypové a genotypové charakterizaci včetně identifikace klonu ST131.

Předběžné údaje:

Během července 2009 bylo vyšetřeno 107 stolic pacientů v Calgary s průjmem (bez nedávného cestování) a 107 vracejících se cestujících s průjmem na přítomnost E. coli produkující ESBL; 5/107 (5 %) pacientů bez nedávného cestování mělo ve stolici E. coli produkující CTX-M, zatímco 26/107 (24 %) pacientů s nedávnou cestou bylo pozitivních na E. coli produkující CTX-M . (p<0,0001). Většina CTX-M byla identifikována jako CTX-M-15; 2/5 E. coli od necestujících patřilo klonu ST131, zatímco 6/26 cestovatelů patřilo klonu ST131.

Statistické metody:

Analýzy budou prováděny pomocí Stata verze 9.0 (Stata Corp, College Station, TX). Bude stanoven podíl pacientů, kteří budou pozitivní. Pro další analýzy týkající se rizik pro akvizici (nebo následnou infekci) budou provedena srovnání mezi těmi, kteří získají ESBL (nebo se infikují) a těmi, kteří ne. Rozdíly v proporcích mezi kategorickými daty budou posouzeny pomocí Fisherova exaktního testu pro párová srovnání. Pro srovnání průměrů a mediánů bude použit Studentský T-test nebo Mann-Whitney U test. Pro všechna statistická srovnání bude p-hodnota <0,05 považována za statistickou významnost.

Celkový rozpočet:

Vyšetřovatelé by chtěli provést studii po dobu 1 roku a doufají, že zaregistrují 250 až 300 cestujících. Odhadovaná cena je 250 USD/pacienta; celkové náklady na studii jsou 75 000 USD.