Voyages internationaux et propagation d'Escherichia Coli producteur de bêta-lactamase à spectre étendu

Titre L'importance des voyages internationaux dans la propagation d'Escherichia coli productrice de bêta-lactamases à spectre étendu.

Chercheur principal Johann DD Pitout, professeur, Université de Calgary, Département de pathologie et de médecine de laboratoire, no 9, 3535 Research Road NW, Calgary, Alberta, Canada, T2L 2K8. Tél : (403) 770 3338. Télécopieur : (403) 770 3347. johann.pitout@cls.ab.ca

Contexte et justification : L'évolution de l'épidémiologie des infections causées par des bactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu bactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE). Des études menées sur différents continents ont suggéré que l'augmentation soudaine dans le monde des E. coli producteurs de CTX-M est souvent due à l'émergence d'un clone nommé ST131. Il semble également que les voyages étrangers dans des zones à haut risque telles que le sous-continent indien (Inde, Pakistan) pourraient jouer, en partie, un rôle dans la propagation d'E. coli producteurs de CTX-M sur différents continents. Cependant, la preuve que les infections dues à E. coli producteur de BLSE sont associées aux voyages internationaux est circonstancielle et les chercheurs aimeraient prouver que c'est bien vrai.

Hypothèse:

Notre hypothèse principale est que lorsque les voyageurs visitent l'Inde, ils ont un risque de contracter E. coli producteur de CTX-M dans leur rectum (c.-à-d. il y a un risque élevé de colonisation rectale par ces bactéries). La raison du choix de l'Inde est qu'une étude précédente de Calgary avait montré que le risque d'infections post-voyage est le plus élevé pour les voyageurs revenant de ce pays. Les enquêteurs pensent également que l'acquisition de ces bactéries est associée à certains comportements à haut risque lors de voyages en Inde comme boire de l'eau de puits, consommer certains produits alimentaires ou prendre des antibiotiques. Notre hypothèse secondaire est que certains voyageurs colonisés par E. coli producteurs de CTX-M à leur retour d'Inde développeront plus tard des infections (très probablement des UIT) avec les mêmes bactéries qui étaient d'abord présentes dans leur rectum.

Objectifs:

Déterminer le taux d'acquisition rectale d'E. coli producteur de BLSE chez les voyageurs en Inde (c.-à-d. risque de colonisation).

Démontrer que le même E. coli producteur de BLSE persiste jusqu'à six mois dans le rectum des voyageurs après leur retour au Canada (c. évaluer le degré de persistance). Les chercheurs soupçonnent que le clone ST131 est plus susceptible d'être présent pendant de plus longues périodes que les autres E. coli producteurs de BLSE.

Identifier les différents comportements des voyageurs en Inde qui les exposent à un risque élevé de contracter E. coli producteur de BLSE (c.-à-d. facteurs de risque de colonisation).

Déterminer quelle proportion de voyageurs colonisés développeront plus tard des infections par le même E. coli producteur de BLSE qu'ils ont contracté lors de leur visite en Inde (c'est-à-dire risque d'infection).

Caractériser les E. coli productrices de BLSE et identifier le clone ST131 parmi ces bactéries.

Étudier le design:

L'étude sera réalisée dans deux cliniques de voyage à Calgary et à Londres, au Canada, respectivement. Ces cliniques offrent des services complets de médecine des voyages, y compris des vaccinations préventives et des prescriptions de médicaments antipaludiques. Les personnes âgées de plus de 18 ans qui prévoient de visiter l'Inde pour une période d'au moins 5 jours seront sollicitées pour participer à l'étude. Le consentement éclairé sera obtenu avant l'inscription des sujets. Les voyageurs qui acceptent de participer recevront un itinéraire de voyage détaillé et un échantillon de selles prélevé avant le voyage. Les participants à l'étude devront retourner aux cliniques de voyage dans les 7 jours suivant leur retour au Canada et remplir un questionnaire détaillé concernant leurs comportements lors de la visite. Le questionnaire rempli et les échantillons de selles seront obtenus lors de la deuxième visite. Les voyageurs seront invités à contacter les cliniques s'ils développent des infections au cours des six prochains mois. Un autre échantillon de selles sera prélevé six mois après leur retour au Canada. Tous les échantillons de selles seront soumis aux Services de laboratoire de Calgary et congelés à -20 °C pour d'autres analyses. Les échantillons seront mis en lots et cultivés à l'aide de milieux de sélection chromID-ESBL. Tous les E. coli producteurs de BLSE isolés feront l'objet d'une caractérisation phénotypique et génotypique incluant l'identification du clone ST131.

Données préliminaires:

En juillet 2009, 107 selles de patients à Calgary souffrant de diarrhée (sans antécédents de voyage récent) et 107 de voyageurs de retour souffrant de diarrhée ont été examinées pour la présence d'E. coli producteur de BLSE; 5/107 (5 %) des patients sans antécédents de voyage récent avaient un E. coli producteur de CTX-M dans leurs selles tandis que 26/107 (24 %) ayant récemment voyagé étaient positifs pour E. coli producteur de CTX-M . (p<0,0001). La majorité des CTX-M ont été identifiés comme CTX-M-15 ; 2/5 des E. coli des non-voyageurs appartenaient au clone ST131 tandis que 6/26 des voyageurs appartenaient au clone ST131.

Méthodes statistiques:

Les analyses seront effectuées à l'aide de Stata version 9.0 (Stata Corp, College Station, TX). La proportion de patients qui deviennent positifs sera déterminée. Pour des analyses plus approfondies entourant les risques d'acquisition (ou d'infection ultérieure), des comparaisons entre ceux qui acquièrent des BLSE (ou s'infectent) et ceux qui ne le font pas seront faites. Les différences de proportions entre les données catégorielles seront évaluées à l'aide du test exact de Fisher pour les comparaisons par paires. Le test T de Student ou les tests U de Mann-Whitney seront utilisés pour comparer les moyennes et les médianes. Pour toutes les comparaisons statistiques, une valeur p <0,05 sera considérée comme représentant une signification statistique.

Budget global :

Les enquêteurs aimeraient réaliser l'étude sur une période d'un an et espèrent recruter 250 à 300 voyageurs. Le coût estimé est de 250 USD/patient ; le coût global de l'étude est de 75 000 USD.