Internationale rejser og spredningen af ​​udvidet spektrum beta-lactamase-producerende Escherichia Coli

Titel Betydningen af ​​internationale rejser i spredningen af ​​udvidet spektrum beta-lactamase-producerende Escherichia coli.

Principal investigator Johann DD Pitout, professor, University of Calgary, Institut for Patologi og Laboratoriemedicin, nr. 9, 3535 Research Road NW, Calgary, Alberta, Canada, T2L 2K8. Tlf.: (403) 770 3338. Fax: (403) 770 3347. johann.pitout@cls.ab.ca

Baggrund og begrundelse: Den skiftende epidemiologi af infektioner forårsaget af udvidet spektrum beta-lactamase-producerende bakterier. Siden 2000 er Escherichia coli-producerende CTX-M-enzymer dukket op verden over som vigtige årsager til community-debut urinvejsinfektioner (UTI) og blodstrømsinfektioner pga. udvidet spektrum beta-lactamase (ESBL)-producerende bakterier. Undersøgelser fra forskellige kontinenter antydede, at den pludselige verdensomspændende stigning af CTX-M-producerende E. coli ofte skyldes fremkomsten af ​​en klon ved navn ST131. Det ser også ud til, at udenlandsrejser til højrisikoområder som det indiske subkontinent (Indien, Pakistan) til dels kan spille en rolle i spredningen af ​​CTX-M-producerende E. coli på tværs af forskellige kontinenter. Beviset for, at infektioner på grund af ESBL-producerende E. coli er forbundet med internationale rejser, er indicier, og efterforskerne vil gerne bevise, at dette faktisk er sandt.

Hypotese:

Vores primære hypotese er, at når rejsende besøger Indien, har de en risiko for at få CTX-M-producerende E. coli i deres endetarme (dvs. der er høj risiko for rektal kolonisering med disse bakterier). Årsagen til at vælge Indien er, at en tidligere undersøgelse fra Calgary havde vist, at risikoen for infektioner efter rejsen er den højeste for rejsende, der vender tilbage fra dette land. Efterforskerne mener også, at erhvervelsen af ​​disse bakterier er forbundet med visse højrisikoadfærd under rejser i Indien, såsom at drikke vand fra brønde, indtage visse fødevarer eller tage antibiotika. Vores sekundære hypotese er, at nogle rejsende, der er koloniseret med CTX-M-producerende E. coli ved deres hjemkomst fra Indien, senere vil udvikle infektioner (mest sandsynligt UIT'er) med de samme bakterier, som først var til stede i deres endetarm.

Mål:

For at bestemme hastigheden af ​​rektal erhvervelse af ESBL-producerende E. coli hos rejsende til Indien (dvs. risiko for at blive koloniseret).

For at vise, at den samme ESBL-producerende E. coli forbliver i op til seks måneder i rektum hos rejsende efter deres tilbagevenden til Canada (dvs. vurdere graden af ​​persistens). Efterforskerne har mistanke om, at klon ST131 er mere tilbøjelig til at være til stede i længere perioder end andre ESBL-producerende E. coli.

At identificere de forskellige adfærd hos rejsende i Indien, der sætter dem i en høj risiko for at erhverve ESBL-producerende E. coli (dvs. risikofaktorer for at blive koloniseret).

For at bestemme, hvor stor en andel af koloniserede rejsende, der senere vil udvikle infektioner med den samme ESBL-producerende E. coli, som de erhvervede, mens de besøgte Indien (dvs. risiko for infektion).

At karakterisere ESBL-producerende E. coli og identificere klon ST131 blandt disse bakterier.

Studere design:

Undersøgelsen vil blive udført på to rejseklinikker i henholdsvis Calgary og London, Canada. Disse klinikker tilbyder omfattende rejsemedicintjenester, herunder forebyggende vaccinationer og recepter på anti-malaria-lægemidler. Personer ældre end 18 år, der planlægger at besøge Indien i en periode på mindst 5 dage, vil blive kontaktet for at deltage i undersøgelsen. Informeret samtykke vil blive indhentet før tilmelding af fag. Rejsende, der accepterer at deltage, vil få en detaljeret rejseplan og en afføringsprøve indsamlet inden rejsen. Undersøgelsesdeltagere vil blive bedt om at vende tilbage til rejseklinikkerne inden for 7 dage efter deres hjemkomst til Canada og udfylde et detaljeret spørgeskema vedrørende deres adfærd under besøget. Det udfyldte spørgeskema og afføringsprøver vil blive indhentet ved det andet besøg. Rejsende vil blive bedt om at kontakte klinikkerne, hvis de udvikler infektioner i løbet af de næste seks måneder. En anden afføringsprøve vil blive indsamlet seks måneder efter deres tilbagevenden til Canada. Alle afføringsprøver vil blive indsendt til Calgary Laboratory Services og frosset ved -20°C til yderligere analyser. Prøver vil blive batchet og dyrket ved hjælp af chromID-ESBL-selektionsmedier. Alle ESBL-producerende E. coli isolerede vil gennemgå fænotypisk og genotypisk karakterisering inklusive identifikation af klon ST131.

Foreløbige data:

I løbet af juli 2009 blev 107 afføringer fra patienter i Calgary med diarré (uden en historie med nylige rejser) og 107 af tilbagevendende rejsende med diarré undersøgt for tilstedeværelsen af ​​ESBL-producerende E. coli; 5/107 (5 %) af patienterne uden en historie med nylige rejser havde en CTX-M-producerende E. coli i deres afføring, mens 26/107 (24 %) med nylige rejser var positive for CTX-M-producerende E. coli . (p<0,0001). Størstedelen af ​​CTX-M'er blev identificeret som CTX-M-15; 2/5 af E. coli fra de ikke-rejsende tilhørte klon ST131, mens 6/26 fra de rejsende tilhørte klon ST131.

Statistiske metoder:

Analyser vil blive udført ved hjælp af Stata version 9.0 (Stata Corp, College Station, TX). Andelen af ​​patienter, der bliver positive, vil blive fastlagt. For yderligere analyser omkring risici for erhvervelse (eller efterfølgende infektion) vil der blive foretaget sammenligninger mellem dem, der erhverver ESBL'er (eller bliver smittet), og dem, der ikke gør det. Forskelle i proportioner mellem kategoriske data vil blive vurderet ved hjælp af Fishers eksakte test til parvise sammenligninger. Student T-test eller Mann-Whitney U test vil blive brugt til at sammenligne midler og medianer. For alle statistiske sammenligninger vil en p-værdi <0,05 blive anset for at repræsentere statistisk signifikans.

Samlet budget:

Efterforskerne vil gerne udføre undersøgelsen i en 1-årig periode og håber at tilmelde 250 - 300 rejsende. De anslåede omkostninger er US$250/patient; de samlede undersøgelsesomkostninger er US$75000.