Podróże międzynarodowe i rozprzestrzenianie się bakterii Escherichia Coli wytwarzających beta-laktamazy o rozszerzonym spektrum

Tytuł Znaczenie podróży międzynarodowych w rozprzestrzenianiu się bakterii Escherichia coli wytwarzających beta-laktamazy o rozszerzonym spektrum.

Główny badacz Johann DD Pitout, profesor, University of Calgary, Department of Pathology and Laboratory Medicine, no 9, 3535 Research Road NW, Calgary, Alberta, Kanada, T2L 2K8. Tel: (403) 770 3338. Faks: (403) 770 3347. johann.pitout@cls.ab.ca

Tło i uzasadnienie: Zmieniająca się epidemiologia zakażeń wywołanych przez bakterie wytwarzające beta-laktamazy o rozszerzonym spektrum działania Od 2000 roku na całym świecie pojawiły się bakterie Escherichia coli wytwarzające enzymy CTX-M jako ważne przyczyny pozaszpitalnych zakażeń układu moczowego (ZUM) i krwi bakterie wytwarzające beta-laktamazy o rozszerzonym spektrum działania (ESBL). Badania przeprowadzone na różnych kontynentach sugerują, że nagły ogólnoświatowy wzrost liczby E. coli wytwarzających CTX-M jest często spowodowany pojawieniem się klonu o nazwie ST131. Wydaje się również, że zagraniczne podróże do obszarów wysokiego ryzyka, takich jak subkontynent indyjski (Indie, Pakistan), mogą częściowo odgrywać rolę w rozprzestrzenianiu się E. coli wytwarzającej CTX-M na różnych kontynentach. Jednak dowody na to, że infekcje wywoływane przez bakterie E. coli wytwarzające ESBL są związane z podróżami międzynarodowymi, są poszlakowe i badacze chcieliby udowodnić, że to rzeczywiście prawda.

Hipoteza:

Naszą główną hipotezą jest to, że podróżujący odwiedzający Indie są narażeni na ryzyko nabycia E. coli wytwarzającej CTX-M w odbytnicy (tj. istnieje duże ryzyko kolonizacji odbytu tymi bakteriami). Powodem wyboru Indii jest to, że poprzednie badanie z Calgary wykazało, że ryzyko infekcji po podróży jest najwyższe w przypadku podróżnych powracających z tego kraju. Badacze uważają również, że nabycie tych bakterii jest związane z pewnymi ryzykownymi zachowaniami podczas podróży w Indiach, takimi jak picie wody ze studni, spożywanie niektórych produktów spożywczych lub przyjmowanie antybiotyków. Naszą drugorzędną hipotezą jest to, że niektórzy podróżnicy, którzy po powrocie z Indii zostali skolonizowani przez E. coli wytwarzające CTX-M, rozwiną później infekcje (najprawdopodobniej UIT) tymi samymi bakteriami, które po raz pierwszy pojawiły się w ich odbytnicy.

Cele:

Aby określić częstość nabywania przez odbyt E. coli wytwarzającej ESBL u osób podróżujących do Indii (tj. ryzyko kolonizacji).

Aby wykazać, że ta sama E. coli wytwarzająca ESBL utrzymuje się do sześciu miesięcy w odbytnicy podróżnych po ich powrocie do Kanady (tj. ocenić stopień wytrwałości). Badacze podejrzewają, że istnieje większe prawdopodobieństwo, że klon ST131 będzie obecny przez dłuższy czas niż inne bakterie E. coli wytwarzające ESBL.

Aby zidentyfikować różne zachowania podróżujących w Indiach, które narażają ich na wysokie ryzyko zarażenia E. coli wytwarzającą ESBL (tj. czynniki ryzyka kolonizacji).

Aby określić, jaki odsetek skolonizowanych podróżników rozwinie później infekcje tą samą E. coli wytwarzającą ESBL, którą nabyli podczas wizyty w Indiach (tj. ryzyko infekcji).

Scharakteryzowanie E. coli wytwarzającej ESBL i zidentyfikowanie klonu ST131 wśród tych bakterii.

Projekt badania:

Badanie zostanie przeprowadzone odpowiednio w dwóch klinikach podróżniczych w Calgary i Londynie w Kanadzie. Kliniki te świadczą kompleksowe usługi z zakresu medycyny podróży, w tym szczepienia ochronne i recepty na leki przeciwmalaryczne. Do udziału w badaniu zostaną zaproszone osoby w wieku powyżej 18 lat, które planują odwiedzić Indie na okres co najmniej 5 dni. Świadoma zgoda zostanie uzyskana przed zapisaniem uczestników. Podróżni, którzy zgodzą się na udział, otrzymają szczegółowy plan podróży i próbki kału pobrane przed podróżą. Uczestnicy badania zostaną poproszeni o powrót do klinik podróży w ciągu 7 dni po powrocie do Kanady i wypełnienie szczegółowej ankiety dotyczącej ich zachowań podczas wizyty. Wypełniony kwestionariusz i próbki kału zostaną pobrane podczas drugiej wizyty. Podróżni zostaną poproszeni o kontakt z klinikami, jeśli w ciągu najbliższych sześciu miesięcy rozwiną się u nich infekcje. Kolejna próbka kału zostanie pobrana sześć miesięcy po powrocie do Kanady. Wszystkie próbki kału zostaną przesłane do Calgary Laboratory Services i zamrożone w temperaturze -20°C do dalszych analiz. Próbki będą podzielone na partie i hodowane przy użyciu podłoża selekcyjnego chromID-ESBL. Wszystkie wyizolowane bakterie E. coli wytwarzające ESBL zostaną poddane charakterystyce fenotypowej i genotypowej, w tym identyfikacji klonu ST131.

Wstępne dane:

W lipcu 2009 r. 107 stolców pacjentów z biegunką w Calgary (bez historii niedawnych podróży) i 107 powracających podróżnych z biegunką zbadano na obecność bakterii E. coli wytwarzających ESBL; 5/107 (5%) pacjentów, którzy nie podróżowali w ostatnim czasie, miało w kale bakterie E. coli wytwarzające CTX-M, podczas gdy 26/107 (24%) pacjentów, którzy niedawno podróżowali, miało pozytywny wynik na obecność E. coli wytwarzającej CTX-M . (p<0,0001). Większość CTX-M zidentyfikowano jako CTX-M-15; 2/5 E. coli od nie-podróżujących należało do klonu ST131, podczas gdy 6/26 od podróżujących należało do klonu ST131.

Metody statystyczne:

Analizy zostaną przeprowadzone przy użyciu wersji Stata 9.0 (Stata Corp, College Station, TX). Zostanie określony odsetek pacjentów, u których uzyska się wynik pozytywny. W celu dalszych analiz związanych z ryzykiem nabycia (lub późniejszej infekcji) zostaną przeprowadzone porównania między osobami, które nabywają ESBL (lub ulegają zakażeniu), a tymi, które ich nie mają. Różnice w proporcjach między danymi kategorialnymi zostaną ocenione za pomocą dokładnego testu Fishera dla porównań parami. Do porównania średnich i median zostaną użyte testy t-Studenta lub testy U Manna-Whitneya. Dla wszystkich porównań statystycznych wartość p <0,05 zostanie uznana za reprezentującą istotność statystyczną.

Całkowity budżet:

Badacze chcieliby przeprowadzić badanie przez okres 1 roku i mają nadzieję zarejestrować 250 - 300 podróżnych. Szacunkowy koszt to 250 USD/pacjenta; całkowity koszt badania wynosi 75 000 USD.