Kansainvälinen matkailu ja laajennetun spektrin beetalaktamaasia tuottavan Escherichia colin leviäminen

Otsikko Kansainvälisen matkailun merkitys laajakirjoista beetalaktamaasia tuottavan Escherichia colin leviämisessä.

Vastuullinen tutkija Johann DD Pitout, Professori, Calgaryn yliopisto, Patologian ja laboratoriolääketieteen laitos, nro 9, 3535 Research Road NW, Calgary, Alberta, Kanada, T2L 2K8. Puh: (403) 770 3338. Faksi: (403) 770 3347. johann.pitout@cls.ab.ca

Tausta ja perustelut: Laajakirjoisten beetalaktamaaseja tuottavien bakteerien aiheuttamien infektioiden muuttuva epidemiologia Vuodesta 2000 lähtien Escherichia coli, joka tuottaa CTX-M-entsyymejä, on noussut maailmanlaajuisesti tärkeiksi syyksi virtsatie- ja verenkiertoinfektioihin, jotka johtuvat laajennetun spektrin beetalaktamaasia (ESBL) tuottavat bakteerit. Eri mantereilta tehdyt tutkimukset viittaavat siihen, että CTX-M:tä tuottavan E. colin äkillinen maailmanlaajuinen lisääntyminen johtuu usein ST131-nimisen kloonin ilmaantumisesta. Näyttää myös siltä, ​​että ulkomailla matkustaminen korkean riskin alueille, kuten Intian niemimaalle (Intia, Pakistan) saattaa osaltaan vaikuttaa CTX-M:tä tuottavan E. colin leviämiseen eri mantereilla. Todisteet siitä, että ESBL:ää tuottavan E. colin aiheuttamat infektiot liittyvät kansainväliseen matkustamiseen, ovat kuitenkin satunnaisia, ja tutkijat haluaisivat todistaa, että tämä on todella totta.

Hypoteesi:

Ensisijainen hypoteesimme on, että matkustaessaan Intiassa heillä on riski saada CTX-M:tä tuottava E. coli peräsuoleen (ts. näiden bakteerien aiheuttama peräsuolen kolonisaation riski on suuri). Syynä Intian valintaan on se, että aiempi Calgary-tutkimus osoitti, että matkan jälkeisten infektioiden riski on suurin tästä maasta palaavilla matkustajilla. Tutkijat uskovat myös, että näiden bakteerien hankkiminen liittyy tiettyihin riskialttiisiin käyttäytymismalleihin matkustamisen aikana Intiassa, kuten kaivoveden juomiseen, tiettyjen elintarvikkeiden nauttimiseen tai antibioottien käyttöön. Toissijainen hypoteesimme on, että jotkut matkustajat, jotka kolonisoivat CTX-M:tä tuottavan E. colin palatessaan Intiasta, kehittävät myöhemmin infektioita (todennäköisimmin UIT:itä) samojen bakteerien kanssa, jotka olivat ensin läsnä heidän peräsuolessaan.

Tavoitteet:

Määrittää ESBL:ää tuottavan E. colin peräsuoleen hankinnan nopeus Intiaan matkustavilta (esim. kolonisoitumisen riski).

Osoittaakseen, että sama ESBL:ää tuottava E. coli säilyy matkustajien peräsuolessa jopa kuusi kuukautta heidän palattuaan Kanadaan (ts. arvioida pysyvyysastetta). Tutkijat epäilevät, että klooni ST131 on todennäköisemmin läsnä pidempään kuin muut ESBL:ää tuottavat E. coli -bakteerit.

Tunnistaa Intiassa matkustavien erilainen käyttäytyminen, joka asettaa heidät suurelle riskille saada ESBL:ää tuottava E. coli (ts. kolonisoitumisen riskitekijät).

Sen määrittämiseksi, kuinka suurelle osalle kolonisoiduista matkustajista kehittyy myöhemmin infektioita samasta ESBL:ää tuottavasta E. colista, jonka he saivat vieraillessaan Intiassa (ts. infektioriski).

ESBL:ää tuottavan E. colin karakterisoimiseksi ja kloonin ST131 tunnistamiseksi näiden bakteerien joukosta.

Opintojen suunnittelu:

Tutkimus suoritetaan kahdella matkaklinikalla Calgaryssa ja Lontoossa, Kanadassa. Nämä klinikat tarjoavat kattavia matkalääkepalveluja, kuten ennaltaehkäiseviä rokotuksia ja malarialääkkeiden reseptejä. Tutkimukseen kutsutaan yli 18-vuotiaita henkilöitä, jotka suunnittelevat matkustavansa Intiaan vähintään 5 päivän ajaksi. Tietoinen suostumus hankitaan ennen koehenkilöiden ilmoittautumista. Matkailijat, jotka suostuvat osallistumaan, saavat yksityiskohtainen matkasuunnitelma ja jakkaranäyte ennen matkaa. Tutkimukseen osallistujia pyydetään palaamaan matkaklinikoihin 7 päivän kuluessa Kanadaan palaamisesta ja täyttämään yksityiskohtainen kysely, joka koskee käyttäytymistään vierailun aikana. Täytetty kyselylomake ja ulostenäytteet saadaan toisella käynnillä. Matkustajia pyydetään ottamaan yhteyttä klinikoihin, jos he saavat infektioita seuraavan kuuden kuukauden aikana. Toinen ulostenäyte kerätään kuuden kuukauden kuluttua heidän palaamisestaan ​​Kanadaan. Kaikki ulostenäytteet toimitetaan Calgary Laboratory Servicesille ja pakastetaan -20 °C:seen lisäanalyysejä varten. Näytteet eristetään ja viljellään käyttämällä chromID-ESBL-valintaelatusaineita. Kaikille eristetyille ESBL:ää tuottaville E. colille tehdään fenotyyppinen ja genotyyppinen karakterisointi, mukaan lukien kloonin ST131 tunnistaminen.

Alustavat tiedot:

Heinäkuussa 2009 tutkittiin 107 Calgaryn ripulia sairastavan (ilman viimeaikaista matkustamista) ja 107 ripulia sairastavan potilaan ulosteesta ESBL:ää tuottavan E. colin esiintymisen varalta. 5/107 (5 %) potilaista, joilla ei ollut äskettäin matkustanut, oli ulosteessa CTX-M:tä tuottava E. coli, kun taas 26/107 (24 %) äskettäin matkustaneista potilaista oli positiivisia CTX-M:tä tuottavalle E. colille . (p < 0,0001). Suurin osa CTX-M:istä tunnistettiin CTX-M-15:ksi; 2/5 ei-matkustajien E. colista kuului klooniin ST131, kun taas 6/26 matkustajista kuului klooniin ST131.

Tilastolliset menetelmät:

Analyysit suoritetaan Stata-versiolla 9.0 (Stata Corp, College Station, TX). Positiivisiksi tulleiden potilaiden osuus määritetään. Hankinnan (tai myöhemmän infektion) riskejä koskevia lisäanalyysejä varten tehdään vertailuja niiden välillä, jotka saavat ESBL:n (tai saavat tartunnan) ja niitä, jotka eivät saa. Kategoristen tietojen suhteelliset erot arvioidaan käyttämällä Fisherin tarkkaa testiä parikohtaisiin vertailuihin. Keskiarvojen ja mediaanien vertailussa käytetään opiskelijan T-testiä tai Mann-Whitney U -testejä. Kaikissa tilastollisissa vertailuissa p-arvon <0,05 katsotaan edustavan tilastollista merkitsevyyttä.

Kokonaisbudjetti:

Tutkijat haluaisivat suorittaa tutkimuksen 1 vuoden ajan ja toivovat saavansa mukaan 250-300 matkustajaa. Arvioitu hinta on US$250/potilas; tutkimuksen kokonaiskustannukset ovat US$75000.