- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT02340312
Studie funkčního mikrobiomu dyspepsie
Hodnocení duodenálního mikrobiomu u dětské funkční dyspepsie
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Intervence / Léčba
Detailní popis
Účelem této studie je popsat mikrobiom u dětí s FD a prozkoumat vztahy mezi mikrobiomem a postprandiálním distress syndromem, skóre úzkosti a slizničními biomarkery neboli úzkostí.
KONKRÉTNÍ CÍLE
- Stanovit frekvence a relativní podíly pro specifické bakterie nebo kmeny bakterií u dětí s FD jak ve vzorcích duodenální sliznice, tak ve vzorcích stolice.
- Zjistit, zda se frekvence nebo podíly konkrétních bakterií nebo kmenů bakterií u dětí s PDS a bez PDS liší.
- Stanovit dvourozměrné korelace mezi frekvencí bakterie/fyla, poměrem bakterií/fyla, skóre úzkosti a slizničními biomarkery, v daném pořadí.
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
Missouri
-
Kansas City, Missouri, Spojené státy, 64108
- The Children's Mercy Hospital
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Diagnóza FD stanovená lékařem GI v souladu s kritérii Řím III
- Věk 8-17 let včetně
- Naplánováno na horní endoskopii jako součást rutinní péče po selhání odpovědi na léčbu potlačující kyselost
Kritéria vyloučení:
- Užívání perorálních antibiotik nebo probiotik do 8 týdnů před zařazením
- Použití systémových steroidů nebo imunomodulačních léků do 8 týdnů od zařazení
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Analýza mikrobiomů
Časové okno: do 12 měsíců od odběru
|
Od každého subjektu budou odebrány vzorky stolice a 8 biopsií sliznice (sestupný duodenum).
Vzorky budou zpracovány a DNA izolována standardními laboratorními technikami.16S
rDNA sekvenční analýza mikrobiálních komunit ve vzorcích pacientů bude analyzována pomocí našich technologií HiSeq 1500 s rychlým chodem.
Provedeme 2 x 150 bp párové koncové sekvenování, které poskytne výjimečné pokrytí (čtení > 30 000).
Budeme sekvenovat oblast V4 16s RNA (E. coli 515-806), což je v současnosti metoda optimalizovaná pro Illumina HiSeq 1500.
Budeme také současně sekvenovat oblast V3 16s RNA, abychom poskytli analýzu vzorků s duální kontrolou.
V případě potřeby se použije konfirmační PCR.
Údaje budou uvedeny jako celkové počty pro každý identifikovaný bakteriální druh.
|
do 12 měsíců od odběru
|
|
Hustota zánětlivých buněk
Časové okno: do 12 měsíců od odběru
|
Pro stanovení hustoty eozinofilů se použijí rutinní histologická sklíčka dříve obarvená hematoxylinem a eosinem. IHC techniky budou využity pro stanovení hustoty žírných buněk. Sériové 3μm parafínové řezy budou sušeny na vzduchu a tepelně fixovány na sklíčka. Řezy budou zbaveny parafinu xylenem a jódem a rehydratovány v odstupňované sérii alkoholu. S využitím tryptázové monoklonální myší antihumánní žírné buňky tryptázové protilátky (klon AA1, Dako, Carpinteria, CA) budou řezy obarveny na automatickém Dako Autostainer 3400 s použitím Dako's LSAB+ kitu se streptavidinem konjugovaným s křenovou peroxidázou. Pro stanovení hustoty pro každý typ buněk bude celý vzorek naskenován, aby se určila subjektivní oblast největšího postižení. Hustota bude určena počítáním buněk v rámci 5 po sobě jdoucích vysoce výkonných polí (400x zvětšení). Stanoví se maximální a střední hustota buněk vyjádřená jako buňky/hpf. To bude dokončeno před ukončením studia. |
do 12 měsíců od odběru
|
|
Imunohistochemie (IHC)
Časové okno: do 12 měsíců od odběru
|
Bude provedeno IHC barvení a může zahrnovat DCLK1, BDNF, TRPV1 a/nebo CRH-R1, v daném pořadí, v závislosti na výsledcích probíhající pilotní studie.
Intenzita barvení bude hodnocena zaslepeným způsobem patologem pro přiřazení skóre pro průměrnou intenzitu IHC signálu (tj.
0= žádné, 1= mírné, 2= střední a 3= silné), stejně jako procento tkáňových buněk nebo vláken vykazujících pozitivní imunoreaktivitu.
Bude aplikován sem-kvantitativní skórovací systém, ve kterém se konečné imunoreaktivní skóre bude rovnat součinu procenta pozitivních buněk krát průměrná intenzita barvení.
Procento pozitivních buněk nebo vláken bude hodnoceno následovně: 0= negativní-10 %, 1= 11-33 %, 2= 33-66 % a 3= > 67 %.
Imunoreaktivita bude považována za pozitivní, když se kombinované skóre pohybuje mezi 2-6 a negativní se skóre 0-1.
Mohou být provedena i jiná IHC barvení, pokud se stanou relevantními, jak je uvedeno v literatuře.
To bude provedeno před ukončením studie.
|
do 12 měsíců od odběru
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
T-skóre pro BASC budou shromažďovány jako součást této studie na formuláři pro sběr dat.
Časové okno: do 6 měsíců od dokončení
|
Tyto informace se používají k hodnocení psychosociálních informací od pacienta. Tyto informace budou shromážděny a zaznamenány před koncem studie.
|
do 6 měsíců od dokončení
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Craig A Friesen, MD, Children's Mercy Hospital Kansas City
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Youssef NN, Murphy TG, Langseder AL, Rosh JR. Quality of life for children with functional abdominal pain: a comparison study of patients' and parents' perceptions. Pediatrics. 2006 Jan;117(1):54-9. doi: 10.1542/peds.2005-0114.
- Grenham S, Clarke G, Cryan JF, Dinan TG. Brain-gut-microbe communication in health and disease. Front Physiol. 2011 Dec 7;2:94. doi: 10.3389/fphys.2011.00094. eCollection 2011.
- Neufeld KM, Kang N, Bienenstock J, Foster JA. Reduced anxiety-like behavior and central neurochemical change in germ-free mice. Neurogastroenterol Motil. 2011 Mar;23(3):255-64, e119. doi: 10.1111/j.1365-2982.2010.01620.x. Epub 2010 Nov 5.
- Rao AV, Bested AC, Beaulne TM, Katzman MA, Iorio C, Berardi JM, Logan AC. A randomized, double-blind, placebo-controlled pilot study of a probiotic in emotional symptoms of chronic fatigue syndrome. Gut Pathog. 2009 Mar 19;1(1):6. doi: 10.1186/1757-4749-1-6.
- Cryan JF, O'Mahony SM. The microbiome-gut-brain axis: from bowel to behavior. Neurogastroenterol Motil. 2011 Mar;23(3):187-92. doi: 10.1111/j.1365-2982.2010.01664.x.
- Lyte M, Li W, Opitz N, Gaykema RP, Goehler LE. Induction of anxiety-like behavior in mice during the initial stages of infection with the agent of murine colonic hyperplasia Citrobacter rodentium. Physiol Behav. 2006 Oct 30;89(3):350-7. doi: 10.1016/j.physbeh.2006.06.019. Epub 2006 Aug 2.
- Rasquin A, Di Lorenzo C, Forbes D, Guiraldes E, Hyams JS, Staiano A, Walker LS. Childhood functional gastrointestinal disorders: child/adolescent. Gastroenterology. 2006 Apr;130(5):1527-37. doi: 10.1053/j.gastro.2005.08.063.
- Schurman JV, Singh M, Singh V, Neilan N, Friesen CA. Symptoms and subtypes in pediatric functional dyspepsia: relation to mucosal inflammation and psychological functioning. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2010 Sep;51(3):298-303. doi: 10.1097/MPG.0b013e3181d1363c.
- Hall W, Buckley M, Crotty P, O'Morain CA. Gastric mucosal mast cells are increased in Helicobacter pylori-negative functional dyspepsia. Clin Gastroenterol Hepatol. 2003 Sep;1(5):363-9. doi: 10.1053/s1542-3565(03)00184-8.
- Friesen CA, Lin Z, Singh M, Singh V, Schurman JV, Burchell N, Cocjin JT, McCallum RW. Antral inflammatory cells, gastric emptying, and electrogastrography in pediatric functional dyspepsia. Dig Dis Sci. 2008 Oct;53(10):2634-40. doi: 10.1007/s10620-008-0207-0. Epub 2008 Mar 5.
- Santos J, Saperas E, Nogueiras C, Mourelle M, Antolin M, Cadahia A, Malagelada JR. Release of mast cell mediators into the jejunum by cold pain stress in humans. Gastroenterology. 1998 Apr;114(4):640-8. doi: 10.1016/s0016-5085(98)70577-3.
- Lozupone C, Knight R. UniFrac: a new phylogenetic method for comparing microbial communities. Appl Environ Microbiol. 2005 Dec;71(12):8228-35. doi: 10.1128/AEM.71.12.8228-8235.2005.
- Schurman JV, Friesen CA, Danda CE, Andre L, Welchert E, Lavenbarg T, Cocjin JT, Hyman PE. Diagnosing functional abdominal pain with the Rome II criteria: parent, child, and clinician agreement. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2005 Sep;41(3):291-5. doi: 10.1097/01.mpg.0000178438.64675.c4.
- Edgar RC. Search and clustering orders of magnitude faster than BLAST. Bioinformatics. 2010 Oct 1;26(19):2460-1. doi: 10.1093/bioinformatics/btq461. Epub 2010 Aug 12.
- DeSantis TZ, Hugenholtz P, Larsen N, Rojas M, Brodie EL, Keller K, Huber T, Dalevi D, Hu P, Andersen GL. Greengenes, a chimera-checked 16S rRNA gene database and workbench compatible with ARB. Appl Environ Microbiol. 2006 Jul;72(7):5069-72. doi: 10.1128/AEM.03006-05.
- Lozupone C, Lladser ME, Knights D, Stombaugh J, Knight R. UniFrac: an effective distance metric for microbial community comparison. ISME J. 2011 Feb;5(2):169-72. doi: 10.1038/ismej.2010.133. Epub 2010 Sep 9. No abstract available.
- Hyams JS, Davis P, Sylvester FA, Zeiter DK, Justinich CJ, Lerer T. Dyspepsia in children and adolescents: a prospective study. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2000 Apr;30(4):413-8. doi: 10.1097/00005176-200004000-00012.
- Walker LS, Garber J, Van Slyke DA, Greene JW. Long-term health outcomes in patients with recurrent abdominal pain. J Pediatr Psychol. 1995 Apr;20(2):233-45. doi: 10.1093/jpepsy/20.2.233.
- Gieteling MJ, Bierma-Zeinstra SM, Passchier J, Berger MY. Prognosis of chronic or recurrent abdominal pain in children. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2008 Sep;47(3):316-26. doi: 10.1097/MPG.0b013e31815bc1c1.
- Konturek PC, Brzozowski T, Konturek SJ. Stress and the gut: pathophysiology, clinical consequences, diagnostic approach and treatment options. J Physiol Pharmacol. 2011 Dec;62(6):591-9.
- Gabel LA, Marin I, LoTurco JJ, Che A, Murphy C, Manglani M, Kass S. Mutation of the dyslexia-associated gene Dcdc2 impairs LTM and visuo-spatial performance in mice. Genes Brain Behav. 2011 Nov;10(8):868-75. doi: 10.1111/j.1601-183X.2011.00727.x. Epub 2011 Oct 19.
- Li Y, Ji YJ, Jiang H, Liu DX, Zhang Q, Fan SJ, Pan F. Effects of unpredictable chronic stress on behavior and brain-derived neurotrophic factor expression in CA3 subfield and dentate gyrus of the hippocampus in different aged rats. Chin Med J (Engl). 2009 Jul 5;122(13):1564-9.
- Shi SS, Shao SH, Yuan BP, Pan F, Li ZL. Acute stress and chronic stress change brain-derived neurotrophic factor (BDNF) and tyrosine kinase-coupled receptor (TrkB) expression in both young and aged rat hippocampus. Yonsei Med J. 2010 Sep;51(5):661-71. doi: 10.3349/ymj.2010.51.5.661.
- Yang J, Yu Y, Yu H, Zuo X, Liu C, Gao L, Chen ZY, Li Y. The role of brain-derived neurotrophic factor in experimental inflammation of mouse gut. Eur J Pain. 2010 Jul;14(6):574-9. doi: 10.1016/j.ejpain.2009.10.007. Epub 2009 Nov 20.
- Yu YB, Zuo XL, Zhao QJ, Chen FX, Yang J, Dong YY, Wang P, Li YQ. Brain-derived neurotrophic factor contributes to abdominal pain in irritable bowel syndrome. Gut. 2012 May;61(5):685-94. doi: 10.1136/gutjnl-2011-300265. Epub 2011 Oct 13.
- Akbar A, Yiangou Y, Facer P, Walters JR, Anand P, Ghosh S. Increased capsaicin receptor TRPV1-expressing sensory fibres in irritable bowel syndrome and their correlation with abdominal pain. Gut. 2008 Jul;57(7):923-9. doi: 10.1136/gut.2007.138982. Epub 2008 Feb 5.
- Miranda A, Nordstrom E, Mannem A, Smith C, Banerjee B, Sengupta JN. The role of transient receptor potential vanilloid 1 in mechanical and chemical visceral hyperalgesia following experimental colitis. Neuroscience. 2007 Sep 21;148(4):1021-32. doi: 10.1016/j.neuroscience.2007.05.034. Epub 2007 Aug 23.
- Matsumoto K, Lo MW, Hosoya T, Tashima K, Takayama H, Murayama T, Horie S. Experimental colitis alters expression of 5-HT receptors and transient receptor potential vanilloid 1 leading to visceral hypersensitivity in mice. Lab Invest. 2012 May;92(5):769-82. doi: 10.1038/labinvest.2012.14. Epub 2012 Feb 13.
- Yang CQ, Wei YY, Zhong CJ, Duan LP. Essential role of mast cells in the visceral hyperalgesia induced by T. spiralis infection and stress in rats. Mediators Inflamm. 2012;2012:294070. doi: 10.1155/2012/294070. Epub 2012 Mar 7.
- Akbar A, Yiangou Y, Facer P, Brydon WG, Walters JR, Anand P, Ghosh S. Expression of the TRPV1 receptor differs in quiescent inflammatory bowel disease with or without abdominal pain. Gut. 2010 Jun;59(6):767-74. doi: 10.1136/gut.2009.194449.
- Fukudo S, Nomura T, Hongo M. Impact of corticotropin-releasing hormone on gastrointestinal motility and adrenocorticotropic hormone in normal controls and patients with irritable bowel syndrome. Gut. 1998 Jun;42(6):845-9. doi: 10.1136/gut.42.6.845.
- Dinan TG, Quigley EM, Ahmed SM, Scully P, O'Brien S, O'Mahony L, O'Mahony S, Shanahan F, Keeling PW. Hypothalamic-pituitary-gut axis dysregulation in irritable bowel syndrome: plasma cytokines as a potential biomarker? Gastroenterology. 2006 Feb;130(2):304-11. doi: 10.1053/j.gastro.2005.11.033.
- Posserud I, Agerforz P, Ekman R, Bjornsson ES, Abrahamsson H, Simren M. Altered visceral perceptual and neuroendocrine response in patients with irritable bowel syndrome during mental stress. Gut. 2004 Aug;53(8):1102-8. doi: 10.1136/gut.2003.017962.
- Bohmelt AH, Nater UM, Franke S, Hellhammer DH, Ehlert U. Basal and stimulated hypothalamic-pituitary-adrenal axis activity in patients with functional gastrointestinal disorders and healthy controls. Psychosom Med. 2005 Mar-Apr;67(2):288-94. doi: 10.1097/01.psy.0000157064.72831.ba.
- Dickhaus B, Mayer EA, Firooz N, Stains J, Conde F, Olivas TI, Fass R, Chang L, Mayer M, Naliboff BD. Irritable bowel syndrome patients show enhanced modulation of visceral perception by auditory stress. Am J Gastroenterol. 2003 Jan;98(1):135-43. doi: 10.1111/j.1572-0241.2003.07156.x.
- La JH, Sung TS, Kim HJ, Kim TW, Kang TM, Yang IS. Peripheral corticotropin releasing hormone mediates post-inflammatory visceral hypersensitivity in rats. World J Gastroenterol. 2008 Feb 7;14(5):731-6. doi: 10.3748/wjg.14.731.
- Wood JD. Enteric neuroimmunophysiology and pathophysiology. Gastroenterology. 2004 Aug;127(2):635-57. doi: 10.1053/j.gastro.2004.02.017.
- He SH. Key role of mast cells and their major secretory products in inflammatory bowel disease. World J Gastroenterol. 2004 Feb 1;10(3):309-18. doi: 10.3748/wjg.v10.i3.309.
- Friesen CA, Lin Z, Hyman PE, Andre L, Welchert E, Schurman JV, Cocjin JT, Burchell N, Pulliam S, Moore A, Lavenbarg T, McCallum RW. Electrogastrography in pediatric functional dyspepsia: relationship to gastric emptying and symptom severity. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2006 Mar;42(3):265-9. doi: 10.1097/01.mpg.0000189367.99416.5e.
- Friesen CA, Sandridge L, Andre L, Roberts CC, Abdel-Rahman SM. Mucosal eosinophilia and response to H1/H2 antagonist and cromolyn therapy in pediatric dyspepsia. Clin Pediatr (Phila). 2006 Mar;45(2):143-7. doi: 10.1177/000992280604500205.
- Talley NJ, Walker MM, Aro P, Ronkainen J, Storskrubb T, Hindley LA, Harmsen WS, Zinsmeister AR, Agreus L. Non-ulcer dyspepsia and duodenal eosinophilia: an adult endoscopic population-based case-control study. Clin Gastroenterol Hepatol. 2007 Oct;5(10):1175-83. doi: 10.1016/j.cgh.2007.05.015. Epub 2007 Aug 7.
- Friesen CA, Andre L, Garola R, Hodge C, Roberts C. Activated duodenal mucosal eosinophils in children with dyspepsia: a pilot transmission electron microscopic study. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2002 Sep;35(3):329-33. doi: 10.1097/00005176-200209000-00017.
- Friesen CA, Kearns GL, Andre L, Neustrom M, Roberts CC, Abdel-Rahman SM. Clinical efficacy and pharmacokinetics of montelukast in dyspeptic children with duodenal eosinophilia. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2004 Mar;38(3):343-51. doi: 10.1097/00005176-200403000-00021.
- Chrousos GP. Stress, chronic inflammation, and emotional and physical well-being: concurrent effects and chronic sequelae. J Allergy Clin Immunol. 2000 Nov;106(5 Suppl):S275-91. doi: 10.1067/mai.2000.110163.
- Kokkotou E, Torres D, Moss AC, O'Brien M, Grigoriadis DE, Karalis K, Pothoulakis C. Corticotropin-releasing hormone receptor 2-deficient mice have reduced intestinal inflammatory responses. J Immunol. 2006 Sep 1;177(5):3355-61. doi: 10.4049/jimmunol.177.5.3355.
- Leung L, Cahill CM. TNF-alpha and neuropathic pain--a review. J Neuroinflammation. 2010 Apr 16;7:27. doi: 10.1186/1742-2094-7-27.
- White FA, Feldman P, Miller RJ. Chemokine signaling and the management of neuropathic pain. Mol Interv. 2009 Aug;9(4):188-95. doi: 10.1124/mi.9.4.7.
- Caporaso JG, Bittinger K, Bushman FD, DeSantis TZ, Andersen GL, Knight R. PyNAST: a flexible tool for aligning sequences to a template alignment. Bioinformatics. 2010 Jan 15;26(2):266-7. doi: 10.1093/bioinformatics/btp636. Epub 2009 Nov 13.
- Price MN, Dehal PS, Arkin AP. FastTree: computing large minimum evolution trees with profiles instead of a distance matrix. Mol Biol Evol. 2009 Jul;26(7):1641-50. doi: 10.1093/molbev/msp077. Epub 2009 Apr 17.
- Helmus MR, Bland TJ, Williams CK, Ives AR. Phylogenetic measures of biodiversity. Am Nat. 2007 Mar;169(3):E68-83. doi: 10.1086/511334. Epub 2007 Jan 17.
- Friesen CA, Schurman JV, Qadeer A, Andre L, Welchert E, Cocjin J. Relationship between mucosal eosinophils and anxiety in pediatric dyspepsia. Gastroenterology 2005; 129:A-158
- Carpenter S. That gut feeling. Monitor on Psychol 2012; 43:51-55
- Bienenstock J, Collins S. 99th Dahlem conference on infection, inflammation and chronic inflammatory disorders: psycho-neuroimmunology and the intestinal microbiota: clinical observations and basic mechanisms. Clin Exp Immunol. 2010 Apr;160(1):85-91. doi: 10.1111/j.1365-2249.2010.04124.x.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia
Primární dokončení (Aktuální)
Dokončení studie (Aktuální)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhad)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 490390
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .