- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT02340312
Funksjonell dyspepsimikrobiomstudie
Evaluering av tolvfingertarmens mikrobiome i pediatrisk funksjonell dyspepsi
Studieoversikt
Status
Forhold
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Hensikten med den nåværende studien er å beskrive mikrobiomet hos barn med FD og å utforske sammenhenger mellom mikrobiomet og postprandialt distress-syndrom, angstskår og slimhinnebiomarkører eller angst.
SPESIFIKKE MÅL
- For å bestemme frekvenser og relative proporsjoner for spesifikke bakterier eller bakteriefyla hos barn med FD i både duodenalslimhinneprøver og avføringsprøver.
- For å finne ut om frekvensene eller proporsjonene av spesifikke bakterier eller bakteriefyla er forskjellig mellom barn med og uten PDS.
- For å bestemme bi-variate korrelasjoner mellom bakterier/fyla-frekvens, bakterie/fyla-andel, angstskåre og slimhinnebiomarkører.
Studietype
Registrering (Faktiske)
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
Missouri
-
Kansas City, Missouri, Forente stater, 64108
- The Children's Mercy Hospital
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
Tar imot friske frivillige
Kjønn som er kvalifisert for studier
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Diagnose av FD som bestemt av GI-legen i henhold til Roma III-kriteriene
- Alder 8-17 år inkludert
- Planlagt for øvre endoskopi som en del av rutinemessig behandling etter ikke å ha respondert på syredempende behandling
Ekskluderingskriterier:
- Bruk av oral antibiotika eller probiotika innen 8 uker før påmelding
- Bruk av systemisk steroid eller immunmodulerende legemiddel innen 8 uker etter registrering
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Mikrobiom Analyse
Tidsramme: innen 12 måneder fra henting
|
Avføringsprøver og 8 slimhinnebiopsier (nedstigende tolvfingertarmen) vil bli tatt fra hvert individ.
Prøver vil bli behandlet og DNA isolert i henhold til standard laboratorieteknikker.16S
rDNA-sekvensanalyse av mikrobielle samfunn i pasientprøver vil bli analysert ved å bruke HiSeq 1500 hurtigløpsteknologier.
Vi vil utføre 2 X 150 bp paret endesekvensering som vil gi eksepsjonell dekning (leser > 30 000).
Vi vil sekvensere V4-regionen til 16s RNA (E. coli 515-806), som er metoden optimalisert for Illumina HiSeq 1500 for tiden.
Vi vil også sekvensere V3-regionen til 16s RNA samtidig for å gi en dobbeltkontrollanalyse av prøver.
Bekreftende PCR vil bli brukt når det er hensiktsmessig.
Data vil bli rapportert som totale tellinger for hver identifisert bakterieart.
|
innen 12 måneder fra henting
|
|
Inflammatorisk celletetthet
Tidsramme: innen 12 måneder fra henting
|
Rutinemessige histologiske lysbilder tidligere farget med hematoksylin og eosin vil bli brukt for å bestemme eosinofiltetthet. IHC-teknikker vil bli benyttet for bestemmelse av mastcelletetthet. Serielle 3-μm parafinseksjoner vil bli lufttørket og varmefiksert på objektglass. Seksjonene vil bli avparafinisert med xylen og jod og rehydrert i en gradert serie alkohol. Ved å bruke tryptase monoklonalt muse-antihumant mastcelle tryptase-antistoff (klon AA1, Dako, Carpinteria, CA), vil seksjoner bli farget på en automatisert Dako Autostainer 3400 ved bruk av Dakos LSAB+-sett med streptavidin konjugert til pepperrotperoksidase. For å bestemme tettheten for hver celletype, vil hele prøven bli skannet for å bestemme det subjektive området med størst involvering. Tettheten vil bli bestemt ved å telle celler innenfor 5 påfølgende høyeffektfelt (400X forstørrelse). Topp og gjennomsnittlig celletetthet uttrykt som celler/hpf vil bli bestemt. Dette vil bli gjennomført før studieslutt. |
innen 12 måneder fra henting
|
|
Immunhistokjemi (IHC)
Tidsramme: innen 12 måneder fra henting
|
IHC-farging vil bli utført og kan inkludere henholdsvis DCLK1, BDNF, TRPV1 og/eller CRH-R1, avhengig av resultatene fra en pågående pilotstudie.
Fargeintensiteten vil bli evaluert på en blind måte av en patolog for å tildele skårer for gjennomsnittlig IHC-signalintensitet (dvs.
0= ingen, 1= mild, 2= moderat og 3= sterk) samt prosentandelen av vevsceller eller fibre som viser positiv immunreaktivitet.
Et sem-kvantitativt poengsystem vil bli brukt der den endelige immunoreaktive poengsummen vil være lik produktet av prosentandelen positive celler ganger gjennomsnittlig fargingsintensitet.
Prosentandel positive celler eller fibre vil bli gradert som følger: 0= negativ-10 %, 1= 11-33 %, 2= 33-66 %, og 3= > 67 %.
Immunreaktivitet vil bli ansett som positiv når den kombinerte poengsummen varierer mellom 2-6 og negativ med en poengsum på 0-1.
Andre IHC-farginger kan utføres dersom de skulle bli relevante som angitt av litteraturen.
Dette vil bli utført før studieslutt.
|
innen 12 måneder fra henting
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
T-score for BASC vil bli samlet inn som en del av denne studien på datainnsamlingsskjemaet.
Tidsramme: innen 6 måneder fra ferdigstillelse
|
Denne informasjonen brukes til å vurdere psykososial informasjon fra pasienten. Denne vil bli samlet inn og registrert før studien avsluttes.
|
innen 6 måneder fra ferdigstillelse
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Samarbeidspartnere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Craig A Friesen, MD, Children's Mercy Hospital Kansas City
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Youssef NN, Murphy TG, Langseder AL, Rosh JR. Quality of life for children with functional abdominal pain: a comparison study of patients' and parents' perceptions. Pediatrics. 2006 Jan;117(1):54-9. doi: 10.1542/peds.2005-0114.
- Grenham S, Clarke G, Cryan JF, Dinan TG. Brain-gut-microbe communication in health and disease. Front Physiol. 2011 Dec 7;2:94. doi: 10.3389/fphys.2011.00094. eCollection 2011.
- Neufeld KM, Kang N, Bienenstock J, Foster JA. Reduced anxiety-like behavior and central neurochemical change in germ-free mice. Neurogastroenterol Motil. 2011 Mar;23(3):255-64, e119. doi: 10.1111/j.1365-2982.2010.01620.x. Epub 2010 Nov 5.
- Rao AV, Bested AC, Beaulne TM, Katzman MA, Iorio C, Berardi JM, Logan AC. A randomized, double-blind, placebo-controlled pilot study of a probiotic in emotional symptoms of chronic fatigue syndrome. Gut Pathog. 2009 Mar 19;1(1):6. doi: 10.1186/1757-4749-1-6.
- Cryan JF, O'Mahony SM. The microbiome-gut-brain axis: from bowel to behavior. Neurogastroenterol Motil. 2011 Mar;23(3):187-92. doi: 10.1111/j.1365-2982.2010.01664.x.
- Lyte M, Li W, Opitz N, Gaykema RP, Goehler LE. Induction of anxiety-like behavior in mice during the initial stages of infection with the agent of murine colonic hyperplasia Citrobacter rodentium. Physiol Behav. 2006 Oct 30;89(3):350-7. doi: 10.1016/j.physbeh.2006.06.019. Epub 2006 Aug 2.
- Rasquin A, Di Lorenzo C, Forbes D, Guiraldes E, Hyams JS, Staiano A, Walker LS. Childhood functional gastrointestinal disorders: child/adolescent. Gastroenterology. 2006 Apr;130(5):1527-37. doi: 10.1053/j.gastro.2005.08.063.
- Schurman JV, Singh M, Singh V, Neilan N, Friesen CA. Symptoms and subtypes in pediatric functional dyspepsia: relation to mucosal inflammation and psychological functioning. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2010 Sep;51(3):298-303. doi: 10.1097/MPG.0b013e3181d1363c.
- Hall W, Buckley M, Crotty P, O'Morain CA. Gastric mucosal mast cells are increased in Helicobacter pylori-negative functional dyspepsia. Clin Gastroenterol Hepatol. 2003 Sep;1(5):363-9. doi: 10.1053/s1542-3565(03)00184-8.
- Friesen CA, Lin Z, Singh M, Singh V, Schurman JV, Burchell N, Cocjin JT, McCallum RW. Antral inflammatory cells, gastric emptying, and electrogastrography in pediatric functional dyspepsia. Dig Dis Sci. 2008 Oct;53(10):2634-40. doi: 10.1007/s10620-008-0207-0. Epub 2008 Mar 5.
- Santos J, Saperas E, Nogueiras C, Mourelle M, Antolin M, Cadahia A, Malagelada JR. Release of mast cell mediators into the jejunum by cold pain stress in humans. Gastroenterology. 1998 Apr;114(4):640-8. doi: 10.1016/s0016-5085(98)70577-3.
- Lozupone C, Knight R. UniFrac: a new phylogenetic method for comparing microbial communities. Appl Environ Microbiol. 2005 Dec;71(12):8228-35. doi: 10.1128/AEM.71.12.8228-8235.2005.
- Schurman JV, Friesen CA, Danda CE, Andre L, Welchert E, Lavenbarg T, Cocjin JT, Hyman PE. Diagnosing functional abdominal pain with the Rome II criteria: parent, child, and clinician agreement. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2005 Sep;41(3):291-5. doi: 10.1097/01.mpg.0000178438.64675.c4.
- Edgar RC. Search and clustering orders of magnitude faster than BLAST. Bioinformatics. 2010 Oct 1;26(19):2460-1. doi: 10.1093/bioinformatics/btq461. Epub 2010 Aug 12.
- DeSantis TZ, Hugenholtz P, Larsen N, Rojas M, Brodie EL, Keller K, Huber T, Dalevi D, Hu P, Andersen GL. Greengenes, a chimera-checked 16S rRNA gene database and workbench compatible with ARB. Appl Environ Microbiol. 2006 Jul;72(7):5069-72. doi: 10.1128/AEM.03006-05.
- Lozupone C, Lladser ME, Knights D, Stombaugh J, Knight R. UniFrac: an effective distance metric for microbial community comparison. ISME J. 2011 Feb;5(2):169-72. doi: 10.1038/ismej.2010.133. Epub 2010 Sep 9. No abstract available.
- Hyams JS, Davis P, Sylvester FA, Zeiter DK, Justinich CJ, Lerer T. Dyspepsia in children and adolescents: a prospective study. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2000 Apr;30(4):413-8. doi: 10.1097/00005176-200004000-00012.
- Walker LS, Garber J, Van Slyke DA, Greene JW. Long-term health outcomes in patients with recurrent abdominal pain. J Pediatr Psychol. 1995 Apr;20(2):233-45. doi: 10.1093/jpepsy/20.2.233.
- Gieteling MJ, Bierma-Zeinstra SM, Passchier J, Berger MY. Prognosis of chronic or recurrent abdominal pain in children. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2008 Sep;47(3):316-26. doi: 10.1097/MPG.0b013e31815bc1c1.
- Konturek PC, Brzozowski T, Konturek SJ. Stress and the gut: pathophysiology, clinical consequences, diagnostic approach and treatment options. J Physiol Pharmacol. 2011 Dec;62(6):591-9.
- Gabel LA, Marin I, LoTurco JJ, Che A, Murphy C, Manglani M, Kass S. Mutation of the dyslexia-associated gene Dcdc2 impairs LTM and visuo-spatial performance in mice. Genes Brain Behav. 2011 Nov;10(8):868-75. doi: 10.1111/j.1601-183X.2011.00727.x. Epub 2011 Oct 19.
- Li Y, Ji YJ, Jiang H, Liu DX, Zhang Q, Fan SJ, Pan F. Effects of unpredictable chronic stress on behavior and brain-derived neurotrophic factor expression in CA3 subfield and dentate gyrus of the hippocampus in different aged rats. Chin Med J (Engl). 2009 Jul 5;122(13):1564-9.
- Shi SS, Shao SH, Yuan BP, Pan F, Li ZL. Acute stress and chronic stress change brain-derived neurotrophic factor (BDNF) and tyrosine kinase-coupled receptor (TrkB) expression in both young and aged rat hippocampus. Yonsei Med J. 2010 Sep;51(5):661-71. doi: 10.3349/ymj.2010.51.5.661.
- Yang J, Yu Y, Yu H, Zuo X, Liu C, Gao L, Chen ZY, Li Y. The role of brain-derived neurotrophic factor in experimental inflammation of mouse gut. Eur J Pain. 2010 Jul;14(6):574-9. doi: 10.1016/j.ejpain.2009.10.007. Epub 2009 Nov 20.
- Yu YB, Zuo XL, Zhao QJ, Chen FX, Yang J, Dong YY, Wang P, Li YQ. Brain-derived neurotrophic factor contributes to abdominal pain in irritable bowel syndrome. Gut. 2012 May;61(5):685-94. doi: 10.1136/gutjnl-2011-300265. Epub 2011 Oct 13.
- Akbar A, Yiangou Y, Facer P, Walters JR, Anand P, Ghosh S. Increased capsaicin receptor TRPV1-expressing sensory fibres in irritable bowel syndrome and their correlation with abdominal pain. Gut. 2008 Jul;57(7):923-9. doi: 10.1136/gut.2007.138982. Epub 2008 Feb 5.
- Miranda A, Nordstrom E, Mannem A, Smith C, Banerjee B, Sengupta JN. The role of transient receptor potential vanilloid 1 in mechanical and chemical visceral hyperalgesia following experimental colitis. Neuroscience. 2007 Sep 21;148(4):1021-32. doi: 10.1016/j.neuroscience.2007.05.034. Epub 2007 Aug 23.
- Matsumoto K, Lo MW, Hosoya T, Tashima K, Takayama H, Murayama T, Horie S. Experimental colitis alters expression of 5-HT receptors and transient receptor potential vanilloid 1 leading to visceral hypersensitivity in mice. Lab Invest. 2012 May;92(5):769-82. doi: 10.1038/labinvest.2012.14. Epub 2012 Feb 13.
- Yang CQ, Wei YY, Zhong CJ, Duan LP. Essential role of mast cells in the visceral hyperalgesia induced by T. spiralis infection and stress in rats. Mediators Inflamm. 2012;2012:294070. doi: 10.1155/2012/294070. Epub 2012 Mar 7.
- Akbar A, Yiangou Y, Facer P, Brydon WG, Walters JR, Anand P, Ghosh S. Expression of the TRPV1 receptor differs in quiescent inflammatory bowel disease with or without abdominal pain. Gut. 2010 Jun;59(6):767-74. doi: 10.1136/gut.2009.194449.
- Fukudo S, Nomura T, Hongo M. Impact of corticotropin-releasing hormone on gastrointestinal motility and adrenocorticotropic hormone in normal controls and patients with irritable bowel syndrome. Gut. 1998 Jun;42(6):845-9. doi: 10.1136/gut.42.6.845.
- Dinan TG, Quigley EM, Ahmed SM, Scully P, O'Brien S, O'Mahony L, O'Mahony S, Shanahan F, Keeling PW. Hypothalamic-pituitary-gut axis dysregulation in irritable bowel syndrome: plasma cytokines as a potential biomarker? Gastroenterology. 2006 Feb;130(2):304-11. doi: 10.1053/j.gastro.2005.11.033.
- Posserud I, Agerforz P, Ekman R, Bjornsson ES, Abrahamsson H, Simren M. Altered visceral perceptual and neuroendocrine response in patients with irritable bowel syndrome during mental stress. Gut. 2004 Aug;53(8):1102-8. doi: 10.1136/gut.2003.017962.
- Bohmelt AH, Nater UM, Franke S, Hellhammer DH, Ehlert U. Basal and stimulated hypothalamic-pituitary-adrenal axis activity in patients with functional gastrointestinal disorders and healthy controls. Psychosom Med. 2005 Mar-Apr;67(2):288-94. doi: 10.1097/01.psy.0000157064.72831.ba.
- Dickhaus B, Mayer EA, Firooz N, Stains J, Conde F, Olivas TI, Fass R, Chang L, Mayer M, Naliboff BD. Irritable bowel syndrome patients show enhanced modulation of visceral perception by auditory stress. Am J Gastroenterol. 2003 Jan;98(1):135-43. doi: 10.1111/j.1572-0241.2003.07156.x.
- La JH, Sung TS, Kim HJ, Kim TW, Kang TM, Yang IS. Peripheral corticotropin releasing hormone mediates post-inflammatory visceral hypersensitivity in rats. World J Gastroenterol. 2008 Feb 7;14(5):731-6. doi: 10.3748/wjg.14.731.
- Wood JD. Enteric neuroimmunophysiology and pathophysiology. Gastroenterology. 2004 Aug;127(2):635-57. doi: 10.1053/j.gastro.2004.02.017.
- He SH. Key role of mast cells and their major secretory products in inflammatory bowel disease. World J Gastroenterol. 2004 Feb 1;10(3):309-18. doi: 10.3748/wjg.v10.i3.309.
- Friesen CA, Lin Z, Hyman PE, Andre L, Welchert E, Schurman JV, Cocjin JT, Burchell N, Pulliam S, Moore A, Lavenbarg T, McCallum RW. Electrogastrography in pediatric functional dyspepsia: relationship to gastric emptying and symptom severity. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2006 Mar;42(3):265-9. doi: 10.1097/01.mpg.0000189367.99416.5e.
- Friesen CA, Sandridge L, Andre L, Roberts CC, Abdel-Rahman SM. Mucosal eosinophilia and response to H1/H2 antagonist and cromolyn therapy in pediatric dyspepsia. Clin Pediatr (Phila). 2006 Mar;45(2):143-7. doi: 10.1177/000992280604500205.
- Talley NJ, Walker MM, Aro P, Ronkainen J, Storskrubb T, Hindley LA, Harmsen WS, Zinsmeister AR, Agreus L. Non-ulcer dyspepsia and duodenal eosinophilia: an adult endoscopic population-based case-control study. Clin Gastroenterol Hepatol. 2007 Oct;5(10):1175-83. doi: 10.1016/j.cgh.2007.05.015. Epub 2007 Aug 7.
- Friesen CA, Andre L, Garola R, Hodge C, Roberts C. Activated duodenal mucosal eosinophils in children with dyspepsia: a pilot transmission electron microscopic study. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2002 Sep;35(3):329-33. doi: 10.1097/00005176-200209000-00017.
- Friesen CA, Kearns GL, Andre L, Neustrom M, Roberts CC, Abdel-Rahman SM. Clinical efficacy and pharmacokinetics of montelukast in dyspeptic children with duodenal eosinophilia. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2004 Mar;38(3):343-51. doi: 10.1097/00005176-200403000-00021.
- Chrousos GP. Stress, chronic inflammation, and emotional and physical well-being: concurrent effects and chronic sequelae. J Allergy Clin Immunol. 2000 Nov;106(5 Suppl):S275-91. doi: 10.1067/mai.2000.110163.
- Kokkotou E, Torres D, Moss AC, O'Brien M, Grigoriadis DE, Karalis K, Pothoulakis C. Corticotropin-releasing hormone receptor 2-deficient mice have reduced intestinal inflammatory responses. J Immunol. 2006 Sep 1;177(5):3355-61. doi: 10.4049/jimmunol.177.5.3355.
- Leung L, Cahill CM. TNF-alpha and neuropathic pain--a review. J Neuroinflammation. 2010 Apr 16;7:27. doi: 10.1186/1742-2094-7-27.
- White FA, Feldman P, Miller RJ. Chemokine signaling and the management of neuropathic pain. Mol Interv. 2009 Aug;9(4):188-95. doi: 10.1124/mi.9.4.7.
- Caporaso JG, Bittinger K, Bushman FD, DeSantis TZ, Andersen GL, Knight R. PyNAST: a flexible tool for aligning sequences to a template alignment. Bioinformatics. 2010 Jan 15;26(2):266-7. doi: 10.1093/bioinformatics/btp636. Epub 2009 Nov 13.
- Price MN, Dehal PS, Arkin AP. FastTree: computing large minimum evolution trees with profiles instead of a distance matrix. Mol Biol Evol. 2009 Jul;26(7):1641-50. doi: 10.1093/molbev/msp077. Epub 2009 Apr 17.
- Helmus MR, Bland TJ, Williams CK, Ives AR. Phylogenetic measures of biodiversity. Am Nat. 2007 Mar;169(3):E68-83. doi: 10.1086/511334. Epub 2007 Jan 17.
- Friesen CA, Schurman JV, Qadeer A, Andre L, Welchert E, Cocjin J. Relationship between mucosal eosinophils and anxiety in pediatric dyspepsia. Gastroenterology 2005; 129:A-158
- Carpenter S. That gut feeling. Monitor on Psychol 2012; 43:51-55
- Bienenstock J, Collins S. 99th Dahlem conference on infection, inflammation and chronic inflammatory disorders: psycho-neuroimmunology and the intestinal microbiota: clinical observations and basic mechanisms. Clin Exp Immunol. 2010 Apr;160(1):85-91. doi: 10.1111/j.1365-2249.2010.04124.x.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Anslag)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 490390
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .