Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Funkcjonalne badanie mikrobiomu dyspepsji

2 października 2020 zaktualizowane przez: Craig A. Friesen, MD, Children's Mercy Hospital Kansas City

Ocena mikrobiomu dwunastnicy w dyspepsji czynnościowej u dzieci

Nawracający ból brzucha od dawna uznawany jest za najczęstszą przewlekłą jednostkę bólową u dzieci. Celem tego badania jest opisanie mikrobiomu u dzieci z FD i zbadanie związków między mikrobiomem a zespołem stresu poposiłkowego, wynikami lęku i biomarkerami śluzówkowymi lub lękiem. Szczegółowe cele tego badania to: 1) Określenie częstości i względnych proporcji dla określonych bakterii lub typów bakterii u dzieci z FD zarówno w próbkach błony śluzowej dwunastnicy, jak iw próbkach kału. 2) Określ, czy częstość lub proporcje określonych bakterii lub typów bakterii różnią się między dziećmi z PDS i bez PDS. 3) Określ dwuwymiarowe korelacje odpowiednio między częstością bakterii/typów, proporcjami bakterii/typów, wynikami lęku i biomarkerami błony śluzowej.

Przegląd badań

Status

Zakończony

Szczegółowy opis

Celem obecnego badania jest opisanie mikrobiomu u dzieci z FD i zbadanie związków między mikrobiomem a zespołem stresu poposiłkowego, wynikami lęku i biomarkerami śluzówkowymi lub lękiem.

SZCZEGÓLNE CELE

  1. Określenie częstości i względnych proporcji dla określonych bakterii lub typów bakterii u dzieci z FD zarówno w próbkach błony śluzowej dwunastnicy, jak iw próbkach kału.
  2. Aby określić, czy częstość lub proporcje określonych bakterii lub typów bakterii różnią się między dziećmi z PDS i bez PDS.
  3. Aby określić korelacje dwuwymiarowe między częstotliwością bakterii / typów, proporcjami bakterii / typów, wynikami lęku i biomarkerami błony śluzowej, odpowiednio.

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Rzeczywisty)

40

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Lokalizacje studiów

    • Missouri
      • Kansas City, Missouri, Stany Zjednoczone, 64108
        • The Children's Mercy Hospital

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

8 lat do 17 lat (Dziecko)

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Płeć kwalifikująca się do nauki

Wszystko

Metoda próbkowania

Próbka bez prawdopodobieństwa

Badana populacja

Dzieci i młodzież w wieku od 8 do 17 lat włącznie, u których zdiagnozowano dyspepsję czynnościową i u których zaplanowano wykonanie EGD z biopsją.

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • Rozpoznanie FD ustalone przez lekarza GI zgodnie z kryteriami rzymskimi III
  • Wiek 8-17 lat włącznie
  • Zaplanowany do endoskopii górnego odcinka przewodu pokarmowego w ramach rutynowej opieki po nieudanej reakcji na terapię hamującą wydzielanie kwasu

Kryteria wyłączenia:

  • Stosowanie doustnego antybiotyku lub probiotyku w ciągu 8 tygodni przed włączeniem
  • Stosowanie ogólnoustrojowego steroidu lub leku immunomodulującego w ciągu 8 tygodni od włączenia

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Analiza mikrobiomu
Ramy czasowe: w ciągu 12 miesięcy od pobrania
Od każdego pacjenta zostaną pobrane próbki kału i 8 biopsji błony śluzowej (zstępującej z dwunastnicy). Próbki będą przetwarzane i izolowane DNA zgodnie ze standardowymi technikami laboratoryjnymi.16S Analiza sekwencji rDNA zbiorowisk drobnoustrojów w próbkach pacjentów zostanie przeanalizowana z wykorzystaniem naszych szybkich technologii HiSeq 1500. Przeprowadzimy sekwencjonowanie sparowanych końców 2 X 150 pz, co zapewni wyjątkowe pokrycie (odczyty > 30 000). Zsekwencjonujemy region V4 16s RNA (E. coli 515-806), co jest obecnie metodą zoptymalizowaną dla Illumina HiSeq 1500. Będziemy również sekwencjonować jednocześnie region V3 16s RNA, aby zapewnić analizę próbek z podwójną kontrolą. W razie potrzeby zostanie zastosowany potwierdzający PCR. Dane zostaną przedstawione jako całkowita liczba dla każdego zidentyfikowanego gatunku bakterii.
w ciągu 12 miesięcy od pobrania
Gęstość komórek zapalnych
Ramy czasowe: w ciągu 12 miesięcy od pobrania

Rutynowe szkiełka histologiczne uprzednio barwione hematoksyliną i eozyną zostaną wykorzystane do określenia gęstości eozynofili.

Techniki IHC zostaną wykorzystane do określenia gęstości komórek tucznych. Seryjne skrawki parafinowe o grubości 3 μm zostaną wysuszone na powietrzu i utrwalone na gorąco na szkiełkach. Skrawki zostaną odparafinowane ksylenem i jodem oraz ponownie uwodnione w stopniowanej serii alkoholi. Wykorzystując mysie przeciwciało monoklonalne tryptazy przeciw ludzkiej tryptazie z komórek tucznych (klon AA1, Dako, Carpinteria, CA), skrawki zostaną wybarwione na automatycznym urządzeniu Dako Autostainer 3400 przy użyciu zestawu Dako LSAB+ ze streptawidyną skoniugowaną z peroksydazą chrzanową.

Aby określić gęstość dla każdego typu komórek, cała próbka zostanie zeskanowana w celu określenia subiektywnego obszaru największego zaangażowania. Gęstość zostanie określona przez zliczenie komórek w 5 kolejnych polach o dużej mocy (powiększenie 400X). Określone zostaną szczytowe i średnie gęstości komórek wyrażone jako komórki/hpf. Zostanie to zakończone przed końcem studiów.

w ciągu 12 miesięcy od pobrania
Immunohistochemia (IHC)
Ramy czasowe: w ciągu 12 miesięcy od pobrania
Barwienie IHC zostanie przeprowadzone i może obejmować odpowiednio DCLK1, BDNF, TRPV1 i/lub CRH-R1, w zależności od wyników trwającego badania pilotażowego. Intensywność barwienia zostanie oceniona w sposób zaślepiony przez patologa w celu przypisania wyników dla średniej intensywności sygnału IHC (tj. 0 = brak, 1 = łagodna, 2 = umiarkowana i 3 = silna), jak również odsetek komórek tkankowych lub włókien wykazujących dodatnią immunoreaktywność. Zastosowany zostanie półilościowy system punktacji, w którym końcowy wynik immunoreaktywny będzie równy iloczynowi procentu komórek dodatnich pomnożonego przez średnią intensywność barwienia. Procent dodatnich komórek lub włókien zostanie oceniony w następujący sposób: 0 = ujemne - 10%, 1 = 11-33%, 2 = 33-66% i 3 = > 67%. Immunoreaktywność zostanie uznana za pozytywną, gdy łączny wynik mieści się w zakresie od 2-6 do negatywnego z wynikiem 0-1. Można wykonać inne barwienia IHC, jeśli staną się istotne, jak wskazano w literaturze. Zostanie to przeprowadzone przed zakończeniem studiów.
w ciągu 12 miesięcy od pobrania

Miary wyników drugorzędnych

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Wyniki T-score dla BASC zostaną zebrane w ramach tego badania na formularzu zbierania danych.
Ramy czasowe: w ciągu 6 miesięcy od zakończenia
Informacje te są wykorzystywane do oceny informacji psychospołecznych pacjenta. Zostaną one zebrane i zapisane przed zakończeniem badania.
w ciągu 6 miesięcy od zakończenia

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Śledczy

  • Główny śledczy: Craig A Friesen, MD, Children's Mercy Hospital Kansas City

Publikacje i pomocne linki

Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.

Publikacje ogólne

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów

1 stycznia 2015

Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)

1 września 2018

Ukończenie studiów (Rzeczywisty)

1 września 2018

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

15 grudnia 2014

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

13 stycznia 2015

Pierwszy wysłany (Oszacować)

16 stycznia 2015

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

6 października 2020

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

2 października 2020

Ostatnia weryfikacja

1 października 2020

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Dodatkowe istotne warunki MeSH

Inne numery identyfikacyjne badania

  • 490390

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Subskrybuj