- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT02340312
Funktionel dyspepsi mikrobiom undersøgelse
Evaluering af duodenalmikrobiomet ved pædiatrisk funktionel dyspepsi
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Formålet med det aktuelle studie er at beskrive mikrobiomet hos børn med FD og at udforske sammenhænge mellem mikrobiomet og postprandialt distress-syndrom, angstscorer og slimhindebiomarkører eller angst.
SPECIFIKKE MÅL
- At bestemme frekvenser og relative proportioner for specifikke bakterier eller bakteriephyla hos børn med FD i både duodenale slimhindeprøver og afføringsprøver.
- For at bestemme, om frekvenserne eller proportionerne af specifikke bakterier eller bakteriefyla er forskellige mellem børn med og uden PDS.
- At bestemme bi-variate korrelationer mellem bakterier/phyla frekvens, bakterier/phyla proportion, angstscore og slimhindebiomarkører.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
Missouri
-
Kansas City, Missouri, Forenede Stater, 64108
- The Children's Mercy Hospital
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Diagnose af FD som bestemt af GI-lægen i overensstemmelse med Rom III-kriterier
- Alder 8-17 år inklusive
- Planlagt til øvre endoskopi som en del af rutinepleje efter manglende respons på syreundertrykkelsesbehandling
Ekskluderingskriterier:
- Brug af oralt antibiotikum eller probiotika inden for 8 uger før tilmelding
- Brug af systemisk steroid eller immunmodulerende lægemiddel inden for 8 uger efter tilmelding
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Mikrobiom analyse
Tidsramme: inden for 12 måneder fra afhentning
|
Fækale prøver og 8 slimhindebiopsier (faldende tolvfingertarmen) vil blive opnået fra hvert individ.
Prøver vil blive behandlet og DNA isoleret i henhold til standard laboratorieteknikker.16S
rDNA-sekvensanalyse af mikrobielle samfund i patientprøver vil blive analyseret ved hjælp af vores HiSeq 1500-hurtige teknologier.
Vi vil udføre 2 X 150 bp parret endesekventering, som vil give enestående dækning (læser > 30.000).
Vi vil sekventere V4-regionen af 16s RNA (E. coli 515-806), som er den metode, der er optimeret til Illumina HiSeq 1500 i øjeblikket.
Vi vil også sekventere V3-regionen af 16s RNA samtidigt for at give en dobbeltkontrolanalyse af prøver.
Bekræftende PCR vil blive anvendt, når det er relevant.
Data vil blive rapporteret som samlede tællinger for hver identificeret bakterieart.
|
inden for 12 måneder fra afhentning
|
|
Inflammatorisk celletæthed
Tidsramme: inden for 12 måneder fra afhentning
|
Rutinemæssige histologiske objektglas tidligere farvet med hæmatoxylin og eosin vil blive brugt til bestemmelse af eosinofildensitet. IHC-teknikker vil blive brugt til bestemmelse af mastcelletæthed. Serielle 3-μm paraffinsektioner lufttørres og varmefikseres på objektglas. Sektionerne vil blive afparaffineret med xylen og jod og rehydreret i en gradueret serie af alkohol. Ved at bruge tryptase monoklonalt muse-antihumant mastcelle tryptase-antistof (klon AA1, Dako, Carpinteria, CA), vil sektioner blive farvet på en automatiseret Dako Autostainer 3400 ved hjælp af Dakos LSAB+ kit med streptavidin konjugeret til peberrodsperoxidase. For at bestemme tætheden for hver celletype vil hele prøven blive scannet for at bestemme det subjektive område med størst involvering. Tætheden vil blive bestemt ved at tælle celler inden for 5 på hinanden følgende højeffektfelter (400X forstørrelse). Peak og middel celletæthed udtrykt som celler/hpf vil blive bestemt. Dette vil blive afsluttet inden studiet slutter. |
inden for 12 måneder fra afhentning
|
|
Immunhistokemi (IHC)
Tidsramme: inden for 12 måneder fra afhentning
|
IHC-farvning vil blive udført og kan omfatte henholdsvis DCLK1, BDNF, TRPV1 og/eller CRH-R1, afhængigt af resultaterne af en igangværende pilotundersøgelse.
Farvningsintensiteten vil blive evalueret på en blind måde af en patolog for at tildele scores for gennemsnitlig IHC-signalintensitet (dvs.
0= ingen, 1= mild, 2= moderat og 3= stærk) samt procentdelen af vævsceller eller fibre, der viser positiv immunreaktivitet.
Et sem-kvantitativt scoringssystem vil blive anvendt, hvor den endelige immunoreaktive score vil svare til produktet af procentdelen af positive celler gange den gennemsnitlige farvningsintensitet.
Procentdelen af positive celler eller fibre vil blive klassificeret som følger: 0= negativ-10 %, 1= 11-33 %, 2= 33-66 % og 3= > 67 %.
Immunreaktivitet vil blive betragtet som positiv, når den kombinerede score ligger mellem 2-6 og negativ med en score på 0-1.
Andre IHC-farvninger kan udføres, hvis de bliver relevante som angivet af litteraturen.
Dette vil blive udført inden undersøgelsens afslutning.
|
inden for 12 måneder fra afhentning
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
T-score for BASC vil blive indsamlet som en del af denne undersøgelse på dataindsamlingsformularen.
Tidsramme: inden for 6 måneder fra færdiggørelsen
|
Denne information bruges til at vurdere psykosocial information fra patienten. Denne vil blive indsamlet og registreret inden undersøgelsens afslutning.
|
inden for 6 måneder fra færdiggørelsen
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Samarbejdspartnere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Craig A Friesen, MD, Children's Mercy Hospital Kansas City
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Youssef NN, Murphy TG, Langseder AL, Rosh JR. Quality of life for children with functional abdominal pain: a comparison study of patients' and parents' perceptions. Pediatrics. 2006 Jan;117(1):54-9. doi: 10.1542/peds.2005-0114.
- Grenham S, Clarke G, Cryan JF, Dinan TG. Brain-gut-microbe communication in health and disease. Front Physiol. 2011 Dec 7;2:94. doi: 10.3389/fphys.2011.00094. eCollection 2011.
- Neufeld KM, Kang N, Bienenstock J, Foster JA. Reduced anxiety-like behavior and central neurochemical change in germ-free mice. Neurogastroenterol Motil. 2011 Mar;23(3):255-64, e119. doi: 10.1111/j.1365-2982.2010.01620.x. Epub 2010 Nov 5.
- Rao AV, Bested AC, Beaulne TM, Katzman MA, Iorio C, Berardi JM, Logan AC. A randomized, double-blind, placebo-controlled pilot study of a probiotic in emotional symptoms of chronic fatigue syndrome. Gut Pathog. 2009 Mar 19;1(1):6. doi: 10.1186/1757-4749-1-6.
- Cryan JF, O'Mahony SM. The microbiome-gut-brain axis: from bowel to behavior. Neurogastroenterol Motil. 2011 Mar;23(3):187-92. doi: 10.1111/j.1365-2982.2010.01664.x.
- Lyte M, Li W, Opitz N, Gaykema RP, Goehler LE. Induction of anxiety-like behavior in mice during the initial stages of infection with the agent of murine colonic hyperplasia Citrobacter rodentium. Physiol Behav. 2006 Oct 30;89(3):350-7. doi: 10.1016/j.physbeh.2006.06.019. Epub 2006 Aug 2.
- Rasquin A, Di Lorenzo C, Forbes D, Guiraldes E, Hyams JS, Staiano A, Walker LS. Childhood functional gastrointestinal disorders: child/adolescent. Gastroenterology. 2006 Apr;130(5):1527-37. doi: 10.1053/j.gastro.2005.08.063.
- Schurman JV, Singh M, Singh V, Neilan N, Friesen CA. Symptoms and subtypes in pediatric functional dyspepsia: relation to mucosal inflammation and psychological functioning. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2010 Sep;51(3):298-303. doi: 10.1097/MPG.0b013e3181d1363c.
- Hall W, Buckley M, Crotty P, O'Morain CA. Gastric mucosal mast cells are increased in Helicobacter pylori-negative functional dyspepsia. Clin Gastroenterol Hepatol. 2003 Sep;1(5):363-9. doi: 10.1053/s1542-3565(03)00184-8.
- Friesen CA, Lin Z, Singh M, Singh V, Schurman JV, Burchell N, Cocjin JT, McCallum RW. Antral inflammatory cells, gastric emptying, and electrogastrography in pediatric functional dyspepsia. Dig Dis Sci. 2008 Oct;53(10):2634-40. doi: 10.1007/s10620-008-0207-0. Epub 2008 Mar 5.
- Santos J, Saperas E, Nogueiras C, Mourelle M, Antolin M, Cadahia A, Malagelada JR. Release of mast cell mediators into the jejunum by cold pain stress in humans. Gastroenterology. 1998 Apr;114(4):640-8. doi: 10.1016/s0016-5085(98)70577-3.
- Lozupone C, Knight R. UniFrac: a new phylogenetic method for comparing microbial communities. Appl Environ Microbiol. 2005 Dec;71(12):8228-35. doi: 10.1128/AEM.71.12.8228-8235.2005.
- Schurman JV, Friesen CA, Danda CE, Andre L, Welchert E, Lavenbarg T, Cocjin JT, Hyman PE. Diagnosing functional abdominal pain with the Rome II criteria: parent, child, and clinician agreement. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2005 Sep;41(3):291-5. doi: 10.1097/01.mpg.0000178438.64675.c4.
- Edgar RC. Search and clustering orders of magnitude faster than BLAST. Bioinformatics. 2010 Oct 1;26(19):2460-1. doi: 10.1093/bioinformatics/btq461. Epub 2010 Aug 12.
- DeSantis TZ, Hugenholtz P, Larsen N, Rojas M, Brodie EL, Keller K, Huber T, Dalevi D, Hu P, Andersen GL. Greengenes, a chimera-checked 16S rRNA gene database and workbench compatible with ARB. Appl Environ Microbiol. 2006 Jul;72(7):5069-72. doi: 10.1128/AEM.03006-05.
- Lozupone C, Lladser ME, Knights D, Stombaugh J, Knight R. UniFrac: an effective distance metric for microbial community comparison. ISME J. 2011 Feb;5(2):169-72. doi: 10.1038/ismej.2010.133. Epub 2010 Sep 9. No abstract available.
- Hyams JS, Davis P, Sylvester FA, Zeiter DK, Justinich CJ, Lerer T. Dyspepsia in children and adolescents: a prospective study. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2000 Apr;30(4):413-8. doi: 10.1097/00005176-200004000-00012.
- Walker LS, Garber J, Van Slyke DA, Greene JW. Long-term health outcomes in patients with recurrent abdominal pain. J Pediatr Psychol. 1995 Apr;20(2):233-45. doi: 10.1093/jpepsy/20.2.233.
- Gieteling MJ, Bierma-Zeinstra SM, Passchier J, Berger MY. Prognosis of chronic or recurrent abdominal pain in children. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2008 Sep;47(3):316-26. doi: 10.1097/MPG.0b013e31815bc1c1.
- Konturek PC, Brzozowski T, Konturek SJ. Stress and the gut: pathophysiology, clinical consequences, diagnostic approach and treatment options. J Physiol Pharmacol. 2011 Dec;62(6):591-9.
- Gabel LA, Marin I, LoTurco JJ, Che A, Murphy C, Manglani M, Kass S. Mutation of the dyslexia-associated gene Dcdc2 impairs LTM and visuo-spatial performance in mice. Genes Brain Behav. 2011 Nov;10(8):868-75. doi: 10.1111/j.1601-183X.2011.00727.x. Epub 2011 Oct 19.
- Li Y, Ji YJ, Jiang H, Liu DX, Zhang Q, Fan SJ, Pan F. Effects of unpredictable chronic stress on behavior and brain-derived neurotrophic factor expression in CA3 subfield and dentate gyrus of the hippocampus in different aged rats. Chin Med J (Engl). 2009 Jul 5;122(13):1564-9.
- Shi SS, Shao SH, Yuan BP, Pan F, Li ZL. Acute stress and chronic stress change brain-derived neurotrophic factor (BDNF) and tyrosine kinase-coupled receptor (TrkB) expression in both young and aged rat hippocampus. Yonsei Med J. 2010 Sep;51(5):661-71. doi: 10.3349/ymj.2010.51.5.661.
- Yang J, Yu Y, Yu H, Zuo X, Liu C, Gao L, Chen ZY, Li Y. The role of brain-derived neurotrophic factor in experimental inflammation of mouse gut. Eur J Pain. 2010 Jul;14(6):574-9. doi: 10.1016/j.ejpain.2009.10.007. Epub 2009 Nov 20.
- Yu YB, Zuo XL, Zhao QJ, Chen FX, Yang J, Dong YY, Wang P, Li YQ. Brain-derived neurotrophic factor contributes to abdominal pain in irritable bowel syndrome. Gut. 2012 May;61(5):685-94. doi: 10.1136/gutjnl-2011-300265. Epub 2011 Oct 13.
- Akbar A, Yiangou Y, Facer P, Walters JR, Anand P, Ghosh S. Increased capsaicin receptor TRPV1-expressing sensory fibres in irritable bowel syndrome and their correlation with abdominal pain. Gut. 2008 Jul;57(7):923-9. doi: 10.1136/gut.2007.138982. Epub 2008 Feb 5.
- Miranda A, Nordstrom E, Mannem A, Smith C, Banerjee B, Sengupta JN. The role of transient receptor potential vanilloid 1 in mechanical and chemical visceral hyperalgesia following experimental colitis. Neuroscience. 2007 Sep 21;148(4):1021-32. doi: 10.1016/j.neuroscience.2007.05.034. Epub 2007 Aug 23.
- Matsumoto K, Lo MW, Hosoya T, Tashima K, Takayama H, Murayama T, Horie S. Experimental colitis alters expression of 5-HT receptors and transient receptor potential vanilloid 1 leading to visceral hypersensitivity in mice. Lab Invest. 2012 May;92(5):769-82. doi: 10.1038/labinvest.2012.14. Epub 2012 Feb 13.
- Yang CQ, Wei YY, Zhong CJ, Duan LP. Essential role of mast cells in the visceral hyperalgesia induced by T. spiralis infection and stress in rats. Mediators Inflamm. 2012;2012:294070. doi: 10.1155/2012/294070. Epub 2012 Mar 7.
- Akbar A, Yiangou Y, Facer P, Brydon WG, Walters JR, Anand P, Ghosh S. Expression of the TRPV1 receptor differs in quiescent inflammatory bowel disease with or without abdominal pain. Gut. 2010 Jun;59(6):767-74. doi: 10.1136/gut.2009.194449.
- Fukudo S, Nomura T, Hongo M. Impact of corticotropin-releasing hormone on gastrointestinal motility and adrenocorticotropic hormone in normal controls and patients with irritable bowel syndrome. Gut. 1998 Jun;42(6):845-9. doi: 10.1136/gut.42.6.845.
- Dinan TG, Quigley EM, Ahmed SM, Scully P, O'Brien S, O'Mahony L, O'Mahony S, Shanahan F, Keeling PW. Hypothalamic-pituitary-gut axis dysregulation in irritable bowel syndrome: plasma cytokines as a potential biomarker? Gastroenterology. 2006 Feb;130(2):304-11. doi: 10.1053/j.gastro.2005.11.033.
- Posserud I, Agerforz P, Ekman R, Bjornsson ES, Abrahamsson H, Simren M. Altered visceral perceptual and neuroendocrine response in patients with irritable bowel syndrome during mental stress. Gut. 2004 Aug;53(8):1102-8. doi: 10.1136/gut.2003.017962.
- Bohmelt AH, Nater UM, Franke S, Hellhammer DH, Ehlert U. Basal and stimulated hypothalamic-pituitary-adrenal axis activity in patients with functional gastrointestinal disorders and healthy controls. Psychosom Med. 2005 Mar-Apr;67(2):288-94. doi: 10.1097/01.psy.0000157064.72831.ba.
- Dickhaus B, Mayer EA, Firooz N, Stains J, Conde F, Olivas TI, Fass R, Chang L, Mayer M, Naliboff BD. Irritable bowel syndrome patients show enhanced modulation of visceral perception by auditory stress. Am J Gastroenterol. 2003 Jan;98(1):135-43. doi: 10.1111/j.1572-0241.2003.07156.x.
- La JH, Sung TS, Kim HJ, Kim TW, Kang TM, Yang IS. Peripheral corticotropin releasing hormone mediates post-inflammatory visceral hypersensitivity in rats. World J Gastroenterol. 2008 Feb 7;14(5):731-6. doi: 10.3748/wjg.14.731.
- Wood JD. Enteric neuroimmunophysiology and pathophysiology. Gastroenterology. 2004 Aug;127(2):635-57. doi: 10.1053/j.gastro.2004.02.017.
- He SH. Key role of mast cells and their major secretory products in inflammatory bowel disease. World J Gastroenterol. 2004 Feb 1;10(3):309-18. doi: 10.3748/wjg.v10.i3.309.
- Friesen CA, Lin Z, Hyman PE, Andre L, Welchert E, Schurman JV, Cocjin JT, Burchell N, Pulliam S, Moore A, Lavenbarg T, McCallum RW. Electrogastrography in pediatric functional dyspepsia: relationship to gastric emptying and symptom severity. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2006 Mar;42(3):265-9. doi: 10.1097/01.mpg.0000189367.99416.5e.
- Friesen CA, Sandridge L, Andre L, Roberts CC, Abdel-Rahman SM. Mucosal eosinophilia and response to H1/H2 antagonist and cromolyn therapy in pediatric dyspepsia. Clin Pediatr (Phila). 2006 Mar;45(2):143-7. doi: 10.1177/000992280604500205.
- Talley NJ, Walker MM, Aro P, Ronkainen J, Storskrubb T, Hindley LA, Harmsen WS, Zinsmeister AR, Agreus L. Non-ulcer dyspepsia and duodenal eosinophilia: an adult endoscopic population-based case-control study. Clin Gastroenterol Hepatol. 2007 Oct;5(10):1175-83. doi: 10.1016/j.cgh.2007.05.015. Epub 2007 Aug 7.
- Friesen CA, Andre L, Garola R, Hodge C, Roberts C. Activated duodenal mucosal eosinophils in children with dyspepsia: a pilot transmission electron microscopic study. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2002 Sep;35(3):329-33. doi: 10.1097/00005176-200209000-00017.
- Friesen CA, Kearns GL, Andre L, Neustrom M, Roberts CC, Abdel-Rahman SM. Clinical efficacy and pharmacokinetics of montelukast in dyspeptic children with duodenal eosinophilia. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2004 Mar;38(3):343-51. doi: 10.1097/00005176-200403000-00021.
- Chrousos GP. Stress, chronic inflammation, and emotional and physical well-being: concurrent effects and chronic sequelae. J Allergy Clin Immunol. 2000 Nov;106(5 Suppl):S275-91. doi: 10.1067/mai.2000.110163.
- Kokkotou E, Torres D, Moss AC, O'Brien M, Grigoriadis DE, Karalis K, Pothoulakis C. Corticotropin-releasing hormone receptor 2-deficient mice have reduced intestinal inflammatory responses. J Immunol. 2006 Sep 1;177(5):3355-61. doi: 10.4049/jimmunol.177.5.3355.
- Leung L, Cahill CM. TNF-alpha and neuropathic pain--a review. J Neuroinflammation. 2010 Apr 16;7:27. doi: 10.1186/1742-2094-7-27.
- White FA, Feldman P, Miller RJ. Chemokine signaling and the management of neuropathic pain. Mol Interv. 2009 Aug;9(4):188-95. doi: 10.1124/mi.9.4.7.
- Caporaso JG, Bittinger K, Bushman FD, DeSantis TZ, Andersen GL, Knight R. PyNAST: a flexible tool for aligning sequences to a template alignment. Bioinformatics. 2010 Jan 15;26(2):266-7. doi: 10.1093/bioinformatics/btp636. Epub 2009 Nov 13.
- Price MN, Dehal PS, Arkin AP. FastTree: computing large minimum evolution trees with profiles instead of a distance matrix. Mol Biol Evol. 2009 Jul;26(7):1641-50. doi: 10.1093/molbev/msp077. Epub 2009 Apr 17.
- Helmus MR, Bland TJ, Williams CK, Ives AR. Phylogenetic measures of biodiversity. Am Nat. 2007 Mar;169(3):E68-83. doi: 10.1086/511334. Epub 2007 Jan 17.
- Friesen CA, Schurman JV, Qadeer A, Andre L, Welchert E, Cocjin J. Relationship between mucosal eosinophils and anxiety in pediatric dyspepsia. Gastroenterology 2005; 129:A-158
- Carpenter S. That gut feeling. Monitor on Psychol 2012; 43:51-55
- Bienenstock J, Collins S. 99th Dahlem conference on infection, inflammation and chronic inflammatory disorders: psycho-neuroimmunology and the intestinal microbiota: clinical observations and basic mechanisms. Clin Exp Immunol. 2010 Apr;160(1):85-91. doi: 10.1111/j.1365-2249.2010.04124.x.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Studieafslutning (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Skøn)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 490390
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .