Vývoj nástroje „iPSC“ pro funkční studium mutací odpovědných za mentální retardaci (Rementips)
9. října 2018 aktualizováno: University Hospital, Grenoble
Vývoj nástroje "iPSC" (indukované pluripotentní kmenové buňky) pro funkční studium mutací odpovědných za mentální retardaci - aplikace na familiární studium mutací genu MYT1L
Podle Světové zdravotnické organizace (WHO) je mentální retardace (MR) definována inteligenčním kvocientem (IQ) < 70 a týká se 1 až 3 % běžné populace. Hluboká mentální retardace (QI <25), těžká (IQ: 25-40) a střední (QI: 40-50) mají prevalenci 0,3-0,5 %, zatímco prevalence mírné MR, definovaná IQ mezi 50 a 70 je hodnoceno na asi 1,5 %.
Původ MR může být infekční, toxický, traumatický, genetický nebo environmentální. genetické příčiny MR shromažďují počet a strukturní anomálie chromozomů, genomová mikroreorganizace, monogenní onemocnění a vzácněji další nemendelovsky dědičné anomálie jako tiskové nebo epigenetické anomálie, mutace mitochondriálního genomu atd... Genetické příčiny představují 50 % střední až závažná, zatímco u mírné MR hrají důležitou roli faktory prostředí (podvýživa, kulturní deprivace,...).
Hlavním cílem této studie je získat inovativní nástroj (neuronové rozlišení iPSC), který umožní studovat funkční dopad mutací na geny pravděpodobně zapojené do MR, jako je MYT1L. Hlavním kritériem spojeným s charakterizací nástroje ve studii je studium získané pluripotence iPSC a zvýraznění mutace genu MYT1L v iPSC.
Neurony z iPSC pacienta a jeho otce du pacienta budou také morfologicky charakterizovány, ale také díky expresi specificky neurálních genů.
Charakteristiky iPSC a neuronů z d'iPSC s mutací MYT1L budou porovnány mezi pacientem a jeho otcem ve vztahu ke stejným buňkám pocházejícím od dvou svědků.
Přehled studie
Postavení
Dokončeno
Intervence / Léčba
Typ studie
Intervenční
Zápis (Aktuální)
4
Fáze
- Nelze použít
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní místa
-
-
-
La Tronche, Francie, 38700
- UniversityHospitalGrenoble
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ano
Pohlaví způsobilá ke studiu
Všechno
Popis
Kritéria pro zařazení :
- Pacient s intelektuální nedostatečností a/nebo souvisejícími příznaky, u kterého byla provedena chromozomická analýza pomocí CGH-array odhalující variantu neznámého významu zahrnující jeden nebo více genů kandidátů na mentální retardaci.
- Osvědčení o genetickém genetickém poradenství a podepsaný souhlas.
- Osoby mladší 18 let mohou být nezbytné, protože intelektový deficit je často diagnostikován před dosažením dospělosti.
- Počet případů je v této předběžné studii velmi omezený a bude studován pouze jeden pacient vykazující vzácnou mutaci genu MYT1L a jeho otec (asymptomatický přenašeč stejné mutace).
- Příslušnost k systému sociálního zabezpečení
Kritéria vyloučení:
- Osoby uvedené L1121-5 až L1121-8 CSP (všechny chráněné osoby)
- Osoby trpící akutními infekcemi pro provádění kožní biopsie v lokální anestezii.
- Osoby vykazující získanou nebo vyvolanou poruchu hemostázy
- Osoby sous traitement antiagrégant antikoagulans
- Osoby s mutací v genu MYT1L
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Primární účel: Jiný
- Přidělení: Nerandomizované
- Intervenční model: Paralelní přiřazení
- Maskování: Žádné (otevřený štítek)
Zbraně a zásahy
Skupina účastníků / Arm |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Jiný: Trpěliví
|
V lokální anestezii
|
|
Jiný: Asymptomatický nosič
Otec pacienta: asymptomatický nosič stejné mutace
|
V lokální anestezii
|
|
Jiný: Dva kontrolní pacienti
|
V lokální anestezii
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Charakterizace iPSC z lidského fibroblastu s mutací MYT1L
Časové okno: Půl hodiny
|
Odběr vzorků kůže v lokální anestezii.
Hodnocení exprese genů iPSC na jejich pluripotenci.
|
Půl hodiny
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Pierre Simon Jouk, Professor, Grenoble Hospital University
Publikace a užitečné odkazy
Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.
Obecné publikace
- Bonnet C, Leheup B, Beri M, Philippe C, Gregoire MJ, Jonveaux P. Aberrant GRIA3 transcripts with multi-exon duplications in a family with X-linked mental retardation. Am J Med Genet A. 2009 Jun;149A(6):1280-9. doi: 10.1002/ajmg.a.32858.
- Brosco JP, Mattingly M, Sanders LM. Impact of specific medical interventions on reducing the prevalence of mental retardation. Arch Pediatr Adolesc Med. 2006 Mar;160(3):302-9. doi: 10.1001/archpedi.160.3.302.
- Chambers SM, Fasano CA, Papapetrou EP, Tomishima M, Sadelain M, Studer L. Highly efficient neural conversion of human ES and iPS cells by dual inhibition of SMAD signaling. Nat Biotechnol. 2009 Mar;27(3):275-80. doi: 10.1038/nbt.1529. Epub 2009 Mar 1. Erratum In: Nat Biotechnol. 2009 May;27(5):485.
- Chanda S, Marro S, Wernig M, Sudhof TC. Neurons generated by direct conversion of fibroblasts reproduce synaptic phenotype caused by autism-associated neuroligin-3 mutation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Oct 8;110(41):16622-7. doi: 10.1073/pnas.1316240110. Epub 2013 Sep 17.
- Chiurazzi P, Schwartz CE, Gecz J, Neri G. XLMR genes: update 2007. Eur J Hum Genet. 2008 Apr;16(4):422-34. doi: 10.1038/sj.ejhg.5201994. Epub 2008 Jan 16.
- Chiyonobu T, Hayashi S, Kobayashi K, Morimoto M, Miyanomae Y, Nishimura A, Nishimoto A, Ito C, Imoto I, Sugimoto T, Jia Z, Inazawa J, Toda T. Partial tandem duplication of GRIA3 in a male with mental retardation. Am J Med Genet A. 2007 Jul 1;143A(13):1448-55. doi: 10.1002/ajmg.a.31798.
- Cohn DM, Pagon RA, Hudgins L, Schwartz CE, Stevenson RE, Friez MJ. Partial ATRX gene duplication causes ATR-X syndrome. Am J Med Genet A. 2009 Oct;149A(10):2317-20. doi: 10.1002/ajmg.a.33006. No abstract available.
- Doco-Fenzy M, Leroy C, Schneider A, Petit F, Delrue MA, Andrieux J, Perrin-Sabourin L, Landais E, Aboura A, Puechberty J, Girard M, Tournaire M, Sanchez E, Rooryck C, Ameil A, Goossens M, Jonveaux P, Lefort G, Taine L, Cailley D, Gaillard D, Leheup B, Sarda P, Genevieve D. Early-onset obesity and paternal 2pter deletion encompassing the ACP1, TMEM18, and MYT1L genes. Eur J Hum Genet. 2014 Apr;22(4):471-9. doi: 10.1038/ejhg.2013.189. Epub 2013 Oct 16.
- Froyen G, Belet S, Martinez F, Santos-Reboucas CB, Declercq M, Verbeeck J, Donckers L, Berland S, Mayo S, Rosello M, Pimentel MM, Fintelman-Rodrigues N, Hovland R, Rodrigues dos Santos S, Raymond FL, Bose T, Corbett MA, Sheffield L, van Ravenswaaij-Arts CM, Dijkhuizen T, Coutton C, Satre V, Siu V, Marynen P. Copy-number gains of HUWE1 due to replication- and recombination-based rearrangements. Am J Hum Genet. 2012 Aug 10;91(2):252-64. doi: 10.1016/j.ajhg.2012.06.010. Epub 2012 Jul 26.
- Kearney HM, Thorland EC, Brown KK, Quintero-Rivera F, South ST; Working Group of the American College of Medical Genetics Laboratory Quality Assurance Committee. American College of Medical Genetics standards and guidelines for interpretation and reporting of postnatal constitutional copy number variants. Genet Med. 2011 Jul;13(7):680-5. doi: 10.1097/GIM.0b013e3182217a3a.
- Kleinjan DA, van Heyningen V. Long-range control of gene expression: emerging mechanisms and disruption in disease. Am J Hum Genet. 2005 Jan;76(1):8-32. doi: 10.1086/426833. Epub 2004 Nov 17.
- Larson SA, Lakin KC, Anderson L, Kwak N, Lee JH, Anderson D. Prevalence of mental retardation and developmental disabilities: estimates from the 1994/1995 National Health Interview Survey Disability Supplements. Am J Ment Retard. 2001 May;106(3):231-52.
- Lee C, Iafrate AJ, Brothman AR. Copy number variations and clinical cytogenetic diagnosis of constitutional disorders. Nat Genet. 2007 Jul;39(7 Suppl):S48-54. doi: 10.1038/ng2092.
- Lujan E, Chanda S, Ahlenius H, Sudhof TC, Wernig M. Direct conversion of mouse fibroblasts to self-renewing, tripotent neural precursor cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Feb 14;109(7):2527-32. doi: 10.1073/pnas.1121003109. Epub 2012 Jan 30.
- McLaren J, Bryson SE. Review of recent epidemiological studies of mental retardation: prevalence, associated disorders, and etiology. Am J Ment Retard. 1987 Nov;92(3):243-54.
- Raff ML, Craigen WJ, Smith LT, Keene DR, Byers PH. Partial COL1A2 gene duplication produces features of osteogenesis imperfecta and Ehlers-Danlos syndrome type VII. Hum Genet. 2000 Jan;106(1):19-28. doi: 10.1007/s004390051004.
- Pang ZP, Yang N, Vierbuchen T, Ostermeier A, Fuentes DR, Yang TQ, Citri A, Sebastiano V, Marro S, Sudhof TC, Wernig M. Induction of human neuronal cells by defined transcription factors. Nature. 2011 May 26;476(7359):220-3. doi: 10.1038/nature10202.
- Rodriguez-Revenga L, Mila M, Rosenberg C, Lamb A, Lee C. Structural variation in the human genome: the impact of copy number variants on clinical diagnosis. Genet Med. 2007 Sep;9(9):600-6. doi: 10.1097/gim.0b013e318149e1e3.
- Rooryck Thambo C. Analyse de réarrangements génomiques chez des patients atteints d'anomalies du développement embryonnaire. Retard mental et malformations multiples congénitales ; Spectre oculo-auriculo-vertébral. 2009. Thèse de science n°1675. Ecole doctorale des sciences de la vie et de la santé, université Bordeaux 2.
- Shimojima K, Inoue T, Imai Y, Arai Y, Komoike Y, Sugawara M, Fujita T, Ideguchi H, Yasumoto S, Kanno H, Hirose S, Yamamoto T. Reduced PLP1 expression in induced pluripotent stem cells derived from a Pelizaeus-Merzbacher disease patient with a partial PLP1 duplication. J Hum Genet. 2012 Sep;57(9):580-6. doi: 10.1038/jhg.2012.71. Epub 2012 Jun 14.
- Stankiewicz P, Beaudet AL. Use of array CGH in the evaluation of dysmorphology, malformations, developmental delay, and idiopathic mental retardation. Curr Opin Genet Dev. 2007 Jun;17(3):182-92. doi: 10.1016/j.gde.2007.04.009. Epub 2007 Apr 30.
- Stasia MJ, Mollin M, Martel C, Satre V, Coutton C, Amblard F, Vieville G, van Montfrans JM, Boelens JJ, Veenstra-Knol HE, van Leeuwen K, de Boer M, Brion JP, Roos D. Functional and genetic characterization of two extremely rare cases of Williams-Beuren syndrome associated with chronic granulomatous disease. Eur J Hum Genet. 2013 Oct;21(10):1079-84. doi: 10.1038/ejhg.2012.310. Epub 2013 Jan 23.
- Stevenson, R. E., Schwartz, C. E. & Schroer, R. J. X-Linked Mental Retardation. 2000. Oxford Univ. Press
- Takahashi K, Yamanaka S. Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined factors. Cell. 2006 Aug 25;126(4):663-76. doi: 10.1016/j.cell.2006.07.024. Epub 2006 Aug 10.
- Thienpont B, de Ravel T, Van Esch H, Van Schoubroeck D, Moerman P, Vermeesch JR, Fryns JP, Froyen G, Lacoste C, Badens C, Devriendt K. Partial duplications of the ATRX gene cause the ATR-X syndrome. Eur J Hum Genet. 2007 Oct;15(10):1094-7. doi: 10.1038/sj.ejhg.5201878. Epub 2007 Jun 20.
- Wapinski OL, Vierbuchen T, Qu K, Lee QY, Chanda S, Fuentes DR, Giresi PG, Ng YH, Marro S, Neff NF, Drechsel D, Martynoga B, Castro DS, Webb AE, Sudhof TC, Brunet A, Guillemot F, Chang HY, Wernig M. Hierarchical mechanisms for direct reprogramming of fibroblasts to neurons. Cell. 2013 Oct 24;155(3):621-35. doi: 10.1016/j.cell.2013.09.028. Epub 2013 Oct 24.
- Yanaba K, Nakagawa H, Takeda Y, Koyama N, Sugano K. Muir-Torre syndrome caused by partial duplication of MSH2 gene by Alu-mediated nonhomologous recombination. Br J Dermatol. 2008 Jan;158(1):150-6. doi: 10.1111/j.1365-2133.2007.08233.x. Epub 2007 Oct 17.
- Yang N, Ng YH, Pang ZP, Sudhof TC, Wernig M. Induced neuronal cells: how to make and define a neuron. Cell Stem Cell. 2011 Dec 2;9(6):517-25. doi: 10.1016/j.stem.2011.11.015.
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
1. září 2015
Primární dokončení (Aktuální)
1. června 2017
Dokončení studie (Aktuální)
1. září 2017
Termíny zápisu do studia
První předloženo
28. července 2016
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
29. listopadu 2016
První zveřejněno (Odhad)
2. prosince 2016
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
12. října 2018
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
9. října 2018
Naposledy ověřeno
1. října 2018
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 38RC14.181
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .