Udvikling af værktøjet "iPSC" til den funktionelle undersøgelse af mutationer med ansvar for mental retardering (Rementips)
9. oktober 2018 opdateret af: University Hospital, Grenoble
Udvikling af værktøjet "iPSC" (inducerede pluripotente stamceller) til den funktionelle undersøgelse af mutationer, der er ansvarlige for mental retardering - Anvendelse til familiær undersøgelse af MYT1L-genmutationer
Ifølge Verdenssundhedsorganisationen (WHO) er mental retardering (MR) defineret ved en intelligenskvotient (IQ) < 70 og berører mellem 1 og 3 % af befolkningen generelt. Dybtgående mental retardering (QI <25), svær (IQ: 25-40) og moderat (QI: 40-50) har en prævalens på 0,3-0,5 %, mens prævalensen af mild MR, defineret ved en IQ mellem 50 og 70 vurderes til ca. 1,5 %.
Oprindelsen af MR kan være infektiøs, giftig, traumatisk, genetisk eller miljømæssig. genetiske årsager til MR samler antallet og strukturanomalier af kromosomerne, den genomiske mikroreorganisering, monogene sygdomme og sjældnere andre ikke-mendelske arvelige anomalier som print eller epigenetiske anomalier, mutationer i mitokondriegenomet osv... Genetiske årsager repræsenterer 50 % af moderat til svær, hvorimod miljøfaktorer (underernæring, kulturel afsavn,...) spiller en vigtig rolle ved mild MR.
Hovedmålet med denne undersøgelse er at få et innovativt værktøj (neuronal skelnen af iPSC), der vil gøre det muligt at studere den funktionelle virkning af mutationer på gener, der sandsynligvis er involveret i MR som MYT1L. De vigtigste kriterier forbundet med karakterisering af værktøjet ved forsøget er undersøgelsen af pluripotensen af iPSC opnået og at fremhæve mutationen af genet MYT1L i iPSC.
Neuroner fra iPSC af patienten og hans far du patient vil også være morfologisk karakteriseret, men også takket være ekspressionen af specifikt neurale gener.
Karakteristika for iPSC og neuroner fra d'iPSC med MYT1L-mutation vil blive sammenlignet mellem patienten og hans far i forhold til de samme celler, der kommer fra de to vidner.
Studieoversigt
Status
Afsluttet
Intervention / Behandling
Undersøgelsestype
Interventionel
Tilmelding (Faktiske)
4
Fase
- Ikke anvendelig
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiesteder
-
-
-
La Tronche, Frankrig, 38700
- UniversityHospitalGrenoble
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Ja
Køn, der er berettiget til at studere
Alle
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Patient med en intellektuel mangel og/eller associerede tegn, der modtog en kromosomanalyse af CGH-array, der afslørede en variant af ukendt betydning, der involverer en eller flere genkandidater for mental retardering.
- Attest for genetisk genetisk rådgivning og underskrevet samtykke.
- Under 18 personer kan være nødvendige, fordi intellektuel mangel ofte diagnosticeres før voksenalderen.
- Antallet af tilfælde er meget begrænset i denne foreløbige undersøgelse, og kun én patient, der viser en sjælden mutation af MYT1L-genet, og hans far (asymptomatisk bærer af samme mutation) vil blive undersøgt.
- Tilslutning til et socialt sikringssystem
Eksklusionskriterier:
- Personer nævnt L1121-5 til L1121-8 i CSP (alle beskyttede personer)
- Personer, der lider af akutte infektioner til udøvelse af kutan biopsi under lokalbedøvelse.
- Personer, der viser en hæmostaseforstyrrelse erhvervet eller induceret
- Persons sous traitement antiagrégant antikoagulant
- Personer med en mutation i genet MYT1L
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Primært formål: Andet
- Tildeling: Ikke-randomiseret
- Interventionel model: Parallel tildeling
- Maskning: Ingen (Åben etiket)
Våben og indgreb
Deltagergruppe / Arm |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Andet: Patient
|
Under lokalbedøvelse
|
|
Andet: Asymptomatisk bærer
Patientens far: asymptomatisk bærer af samme mutation
|
Under lokalbedøvelse
|
|
Andet: To kontrolpatienter
|
Under lokalbedøvelse
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
iPSC-karakterisering fra human fibroblast med MYT1L-mutation
Tidsramme: En halv time
|
Hudprøvetagning under lokalbedøvelse.
Evaluering af iPSC-genekspression for deres pluripotens.
|
En halv time
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Sponsor
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Pierre Simon Jouk, Professor, Grenoble Hospital University
Publikationer og nyttige links
Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.
Generelle publikationer
- Bonnet C, Leheup B, Beri M, Philippe C, Gregoire MJ, Jonveaux P. Aberrant GRIA3 transcripts with multi-exon duplications in a family with X-linked mental retardation. Am J Med Genet A. 2009 Jun;149A(6):1280-9. doi: 10.1002/ajmg.a.32858.
- Brosco JP, Mattingly M, Sanders LM. Impact of specific medical interventions on reducing the prevalence of mental retardation. Arch Pediatr Adolesc Med. 2006 Mar;160(3):302-9. doi: 10.1001/archpedi.160.3.302.
- Chambers SM, Fasano CA, Papapetrou EP, Tomishima M, Sadelain M, Studer L. Highly efficient neural conversion of human ES and iPS cells by dual inhibition of SMAD signaling. Nat Biotechnol. 2009 Mar;27(3):275-80. doi: 10.1038/nbt.1529. Epub 2009 Mar 1. Erratum In: Nat Biotechnol. 2009 May;27(5):485.
- Chanda S, Marro S, Wernig M, Sudhof TC. Neurons generated by direct conversion of fibroblasts reproduce synaptic phenotype caused by autism-associated neuroligin-3 mutation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Oct 8;110(41):16622-7. doi: 10.1073/pnas.1316240110. Epub 2013 Sep 17.
- Chiurazzi P, Schwartz CE, Gecz J, Neri G. XLMR genes: update 2007. Eur J Hum Genet. 2008 Apr;16(4):422-34. doi: 10.1038/sj.ejhg.5201994. Epub 2008 Jan 16.
- Chiyonobu T, Hayashi S, Kobayashi K, Morimoto M, Miyanomae Y, Nishimura A, Nishimoto A, Ito C, Imoto I, Sugimoto T, Jia Z, Inazawa J, Toda T. Partial tandem duplication of GRIA3 in a male with mental retardation. Am J Med Genet A. 2007 Jul 1;143A(13):1448-55. doi: 10.1002/ajmg.a.31798.
- Cohn DM, Pagon RA, Hudgins L, Schwartz CE, Stevenson RE, Friez MJ. Partial ATRX gene duplication causes ATR-X syndrome. Am J Med Genet A. 2009 Oct;149A(10):2317-20. doi: 10.1002/ajmg.a.33006. No abstract available.
- Doco-Fenzy M, Leroy C, Schneider A, Petit F, Delrue MA, Andrieux J, Perrin-Sabourin L, Landais E, Aboura A, Puechberty J, Girard M, Tournaire M, Sanchez E, Rooryck C, Ameil A, Goossens M, Jonveaux P, Lefort G, Taine L, Cailley D, Gaillard D, Leheup B, Sarda P, Genevieve D. Early-onset obesity and paternal 2pter deletion encompassing the ACP1, TMEM18, and MYT1L genes. Eur J Hum Genet. 2014 Apr;22(4):471-9. doi: 10.1038/ejhg.2013.189. Epub 2013 Oct 16.
- Froyen G, Belet S, Martinez F, Santos-Reboucas CB, Declercq M, Verbeeck J, Donckers L, Berland S, Mayo S, Rosello M, Pimentel MM, Fintelman-Rodrigues N, Hovland R, Rodrigues dos Santos S, Raymond FL, Bose T, Corbett MA, Sheffield L, van Ravenswaaij-Arts CM, Dijkhuizen T, Coutton C, Satre V, Siu V, Marynen P. Copy-number gains of HUWE1 due to replication- and recombination-based rearrangements. Am J Hum Genet. 2012 Aug 10;91(2):252-64. doi: 10.1016/j.ajhg.2012.06.010. Epub 2012 Jul 26.
- Kearney HM, Thorland EC, Brown KK, Quintero-Rivera F, South ST; Working Group of the American College of Medical Genetics Laboratory Quality Assurance Committee. American College of Medical Genetics standards and guidelines for interpretation and reporting of postnatal constitutional copy number variants. Genet Med. 2011 Jul;13(7):680-5. doi: 10.1097/GIM.0b013e3182217a3a.
- Kleinjan DA, van Heyningen V. Long-range control of gene expression: emerging mechanisms and disruption in disease. Am J Hum Genet. 2005 Jan;76(1):8-32. doi: 10.1086/426833. Epub 2004 Nov 17.
- Larson SA, Lakin KC, Anderson L, Kwak N, Lee JH, Anderson D. Prevalence of mental retardation and developmental disabilities: estimates from the 1994/1995 National Health Interview Survey Disability Supplements. Am J Ment Retard. 2001 May;106(3):231-52.
- Lee C, Iafrate AJ, Brothman AR. Copy number variations and clinical cytogenetic diagnosis of constitutional disorders. Nat Genet. 2007 Jul;39(7 Suppl):S48-54. doi: 10.1038/ng2092.
- Lujan E, Chanda S, Ahlenius H, Sudhof TC, Wernig M. Direct conversion of mouse fibroblasts to self-renewing, tripotent neural precursor cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Feb 14;109(7):2527-32. doi: 10.1073/pnas.1121003109. Epub 2012 Jan 30.
- McLaren J, Bryson SE. Review of recent epidemiological studies of mental retardation: prevalence, associated disorders, and etiology. Am J Ment Retard. 1987 Nov;92(3):243-54.
- Raff ML, Craigen WJ, Smith LT, Keene DR, Byers PH. Partial COL1A2 gene duplication produces features of osteogenesis imperfecta and Ehlers-Danlos syndrome type VII. Hum Genet. 2000 Jan;106(1):19-28. doi: 10.1007/s004390051004.
- Pang ZP, Yang N, Vierbuchen T, Ostermeier A, Fuentes DR, Yang TQ, Citri A, Sebastiano V, Marro S, Sudhof TC, Wernig M. Induction of human neuronal cells by defined transcription factors. Nature. 2011 May 26;476(7359):220-3. doi: 10.1038/nature10202.
- Rodriguez-Revenga L, Mila M, Rosenberg C, Lamb A, Lee C. Structural variation in the human genome: the impact of copy number variants on clinical diagnosis. Genet Med. 2007 Sep;9(9):600-6. doi: 10.1097/gim.0b013e318149e1e3.
- Rooryck Thambo C. Analyse de réarrangements génomiques chez des patients atteints d'anomalies du développement embryonnaire. Retard mental et malformations multiples congénitales ; Spectre oculo-auriculo-vertébral. 2009. Thèse de science n°1675. Ecole doctorale des sciences de la vie et de la santé, université Bordeaux 2.
- Shimojima K, Inoue T, Imai Y, Arai Y, Komoike Y, Sugawara M, Fujita T, Ideguchi H, Yasumoto S, Kanno H, Hirose S, Yamamoto T. Reduced PLP1 expression in induced pluripotent stem cells derived from a Pelizaeus-Merzbacher disease patient with a partial PLP1 duplication. J Hum Genet. 2012 Sep;57(9):580-6. doi: 10.1038/jhg.2012.71. Epub 2012 Jun 14.
- Stankiewicz P, Beaudet AL. Use of array CGH in the evaluation of dysmorphology, malformations, developmental delay, and idiopathic mental retardation. Curr Opin Genet Dev. 2007 Jun;17(3):182-92. doi: 10.1016/j.gde.2007.04.009. Epub 2007 Apr 30.
- Stasia MJ, Mollin M, Martel C, Satre V, Coutton C, Amblard F, Vieville G, van Montfrans JM, Boelens JJ, Veenstra-Knol HE, van Leeuwen K, de Boer M, Brion JP, Roos D. Functional and genetic characterization of two extremely rare cases of Williams-Beuren syndrome associated with chronic granulomatous disease. Eur J Hum Genet. 2013 Oct;21(10):1079-84. doi: 10.1038/ejhg.2012.310. Epub 2013 Jan 23.
- Stevenson, R. E., Schwartz, C. E. & Schroer, R. J. X-Linked Mental Retardation. 2000. Oxford Univ. Press
- Takahashi K, Yamanaka S. Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined factors. Cell. 2006 Aug 25;126(4):663-76. doi: 10.1016/j.cell.2006.07.024. Epub 2006 Aug 10.
- Thienpont B, de Ravel T, Van Esch H, Van Schoubroeck D, Moerman P, Vermeesch JR, Fryns JP, Froyen G, Lacoste C, Badens C, Devriendt K. Partial duplications of the ATRX gene cause the ATR-X syndrome. Eur J Hum Genet. 2007 Oct;15(10):1094-7. doi: 10.1038/sj.ejhg.5201878. Epub 2007 Jun 20.
- Wapinski OL, Vierbuchen T, Qu K, Lee QY, Chanda S, Fuentes DR, Giresi PG, Ng YH, Marro S, Neff NF, Drechsel D, Martynoga B, Castro DS, Webb AE, Sudhof TC, Brunet A, Guillemot F, Chang HY, Wernig M. Hierarchical mechanisms for direct reprogramming of fibroblasts to neurons. Cell. 2013 Oct 24;155(3):621-35. doi: 10.1016/j.cell.2013.09.028. Epub 2013 Oct 24.
- Yanaba K, Nakagawa H, Takeda Y, Koyama N, Sugano K. Muir-Torre syndrome caused by partial duplication of MSH2 gene by Alu-mediated nonhomologous recombination. Br J Dermatol. 2008 Jan;158(1):150-6. doi: 10.1111/j.1365-2133.2007.08233.x. Epub 2007 Oct 17.
- Yang N, Ng YH, Pang ZP, Sudhof TC, Wernig M. Induced neuronal cells: how to make and define a neuron. Cell Stem Cell. 2011 Dec 2;9(6):517-25. doi: 10.1016/j.stem.2011.11.015.
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
1. september 2015
Primær færdiggørelse (Faktiske)
1. juni 2017
Studieafslutning (Faktiske)
1. september 2017
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
28. juli 2016
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
29. november 2016
Først opslået (Skøn)
2. december 2016
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
12. oktober 2018
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
9. oktober 2018
Sidst verificeret
1. oktober 2018
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 38RC14.181
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Kutan biopsi
-
Novartis PharmaceuticalsAfsluttetKutan pladecellecarcinom in situ (CSCCis)Belgien, Australien, Forenede Stater
-
Memorial Sloan Kettering Cancer CenterComprehensive Cancer Centre The NetherlandsRekrutteringKræft | Dermatologiske tilstandeForenede Stater