Työkalun "iPSC" kehittäminen henkisestä kehitysvammaisuudesta vastuussa olevien mutaatioiden toiminnalliseen tutkimukseen (Rementips)
tiistai 9. lokakuuta 2018 päivittänyt: University Hospital, Grenoble
Työkalun "iPSC" (indusoidut pluripotentit kantasolut) kehittäminen henkisestä kehitysvammaisuudesta vastuussa olevien mutaatioiden toiminnalliseen tutkimukseen - Sovellus MYT1L-geenimutaatioiden perhetutkimukseen
Maailman terveysjärjestön (WHO) mukaan kehitysvammaisuus (MR) määritellään älykkyysosamäärällä (IQ) < 70, ja se koskettaa 1-3 % väestöstä. Syvällä kehitysvammaisella (QI <25), vakavalla (IQ: 25-40) ja keskivaikealla (QI: 40-50) esiintyvyys on 0,3-0,5 %, kun taas lievän MR:n esiintyvyys, joka määritellään älykkyysosamäärällä välillä 50 ja 70 arvioidaan noin 1,5 %:ksi.
MR:n alkuperä voi olla tarttuva, myrkyllinen, traumaattinen, geneettinen tai ympäristöllinen. MR:n geneettiset syyt keräävät kromosomien lukumäärän ja rakenteen poikkeavuuksia, genomisen mikroreorganisaatiota, monogeenisiä sairauksia ja harvemmin muita ei-Mendelin periytyviä poikkeavuuksia, kuten printti- tai epigeneettisiä poikkeavuuksia, mitokondrioiden genomin mutaatioita jne... Geneettiset syyt edustavat 50 %:sta kohtalaisesta vaikeaan, kun taas ympäristötekijöillä (aliravitsemus, kulttuurinen puute,...) on tärkeä rooli lievässä MR:ssä.
Tämän tutkimuksen päätavoitteena on saada innovatiivinen työkalu (iPSC:n neuronaalinen erottelu), jonka avulla voidaan tutkia mutaatioiden toiminnallista vaikutusta geenien, jotka ovat todennäköisesti mukana MR:ssä, kuten MYT1L:ssä. Tärkeimmät kriteerit, jotka liittyvät työkalun karakterisointiin kokeessa, on saadun iPSC:n pluripotenssin tutkimus ja MYT1L-geenin mutaation korostaminen iPSC:ssä.
Potilaan ja hänen isänsä du potilas Willen iPSC:n neuronit ovat myös morfologisesti karakterisoituja, mutta myös spesifisten hermogeenien ilmentymisen ansiosta.
iPSC:n ja d'iPSC:n hermosolujen ominaisuuksia, joissa on MYT1L-mutaatio, verrataan potilaan ja hänen isänsä kanssa suhteessa samoihin soluihin, jotka tulevat kahdelta todistajalta.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Valmis
Interventio / Hoito
Opintotyyppi
Interventio
Ilmoittautuminen (Todellinen)
4
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
-
La Tronche, Ranska, 38700
- UniversityHospitalGrenoble
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Joo
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Kaikki
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit :
- Potilas, jolla on älyllinen vajaatoiminta ja/tai siihen liittyviä merkkejä, jolle tehtiin CGH-array-kromosomianalyysi, joka paljasti muunnelman, jonka merkitys on tuntematon ja johon liittyy yksi tai useampi geeniehdokas henkiseen jälkeenjääneisyyteen.
- Todistus geneettisestä geneettisestä neuvonnasta ja allekirjoitettu suostumus.
- Alle 18-vuotiaat voivat olla tarpeen, koska älyllinen vajaatoiminta todetaan usein ennen aikuisikää.
- Tapausten määrä on tässä alustavassa tutkimuksessa hyvin rajallinen ja vain yksi potilas, jolla on harvinainen MYT1L-geenin mutaatio, ja hänen isänsä (saman mutaation oireeton kantaja) tullaan tutkimaan.
- Sosiaaliturvajärjestelmään kuuluminen
Poissulkemiskriteerit:
- CSP:n L1121-5–L1121-8 mainitut henkilöt (kaikki suojatut henkilöt)
- Akuuteista infektioista kärsiville henkilöille ihobiopsian ottaminen paikallispuudutuksessa.
- Henkilöt, joilla on hankittu tai aiheutettu hemostaasihäiriö
- Henkilöt sous traitement antiagrégant antikoagulantti
- Henkilöt, joilla on mutaatio geenissä MYT1L
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Muut
- Jako: Ei satunnaistettu
- Inventiomalli: Rinnakkaistehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / Arm |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Muut: Potilas
|
Paikallispuudutuksessa
|
|
Muut: Oireeton kantaja
Potilaan isä: oireeton saman mutaation kantaja
|
Paikallispuudutuksessa
|
|
Muut: Kaksi kontrollipotilasta
|
Paikallispuudutuksessa
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
iPSC-karakterointi ihmisen fibroblastista MYT1L-mutaatiolla
Aikaikkuna: Puoli tuntia
|
Ihonäytteenotto paikallispuudutuksessa.
IPSC-geenin ilmentymisen arviointi niiden pluripotenssin suhteen.
|
Puoli tuntia
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Pierre Simon Jouk, Professor, Grenoble Hospital University
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- Bonnet C, Leheup B, Beri M, Philippe C, Gregoire MJ, Jonveaux P. Aberrant GRIA3 transcripts with multi-exon duplications in a family with X-linked mental retardation. Am J Med Genet A. 2009 Jun;149A(6):1280-9. doi: 10.1002/ajmg.a.32858.
- Brosco JP, Mattingly M, Sanders LM. Impact of specific medical interventions on reducing the prevalence of mental retardation. Arch Pediatr Adolesc Med. 2006 Mar;160(3):302-9. doi: 10.1001/archpedi.160.3.302.
- Chambers SM, Fasano CA, Papapetrou EP, Tomishima M, Sadelain M, Studer L. Highly efficient neural conversion of human ES and iPS cells by dual inhibition of SMAD signaling. Nat Biotechnol. 2009 Mar;27(3):275-80. doi: 10.1038/nbt.1529. Epub 2009 Mar 1. Erratum In: Nat Biotechnol. 2009 May;27(5):485.
- Chanda S, Marro S, Wernig M, Sudhof TC. Neurons generated by direct conversion of fibroblasts reproduce synaptic phenotype caused by autism-associated neuroligin-3 mutation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Oct 8;110(41):16622-7. doi: 10.1073/pnas.1316240110. Epub 2013 Sep 17.
- Chiurazzi P, Schwartz CE, Gecz J, Neri G. XLMR genes: update 2007. Eur J Hum Genet. 2008 Apr;16(4):422-34. doi: 10.1038/sj.ejhg.5201994. Epub 2008 Jan 16.
- Chiyonobu T, Hayashi S, Kobayashi K, Morimoto M, Miyanomae Y, Nishimura A, Nishimoto A, Ito C, Imoto I, Sugimoto T, Jia Z, Inazawa J, Toda T. Partial tandem duplication of GRIA3 in a male with mental retardation. Am J Med Genet A. 2007 Jul 1;143A(13):1448-55. doi: 10.1002/ajmg.a.31798.
- Cohn DM, Pagon RA, Hudgins L, Schwartz CE, Stevenson RE, Friez MJ. Partial ATRX gene duplication causes ATR-X syndrome. Am J Med Genet A. 2009 Oct;149A(10):2317-20. doi: 10.1002/ajmg.a.33006. No abstract available.
- Doco-Fenzy M, Leroy C, Schneider A, Petit F, Delrue MA, Andrieux J, Perrin-Sabourin L, Landais E, Aboura A, Puechberty J, Girard M, Tournaire M, Sanchez E, Rooryck C, Ameil A, Goossens M, Jonveaux P, Lefort G, Taine L, Cailley D, Gaillard D, Leheup B, Sarda P, Genevieve D. Early-onset obesity and paternal 2pter deletion encompassing the ACP1, TMEM18, and MYT1L genes. Eur J Hum Genet. 2014 Apr;22(4):471-9. doi: 10.1038/ejhg.2013.189. Epub 2013 Oct 16.
- Froyen G, Belet S, Martinez F, Santos-Reboucas CB, Declercq M, Verbeeck J, Donckers L, Berland S, Mayo S, Rosello M, Pimentel MM, Fintelman-Rodrigues N, Hovland R, Rodrigues dos Santos S, Raymond FL, Bose T, Corbett MA, Sheffield L, van Ravenswaaij-Arts CM, Dijkhuizen T, Coutton C, Satre V, Siu V, Marynen P. Copy-number gains of HUWE1 due to replication- and recombination-based rearrangements. Am J Hum Genet. 2012 Aug 10;91(2):252-64. doi: 10.1016/j.ajhg.2012.06.010. Epub 2012 Jul 26.
- Kearney HM, Thorland EC, Brown KK, Quintero-Rivera F, South ST; Working Group of the American College of Medical Genetics Laboratory Quality Assurance Committee. American College of Medical Genetics standards and guidelines for interpretation and reporting of postnatal constitutional copy number variants. Genet Med. 2011 Jul;13(7):680-5. doi: 10.1097/GIM.0b013e3182217a3a.
- Kleinjan DA, van Heyningen V. Long-range control of gene expression: emerging mechanisms and disruption in disease. Am J Hum Genet. 2005 Jan;76(1):8-32. doi: 10.1086/426833. Epub 2004 Nov 17.
- Larson SA, Lakin KC, Anderson L, Kwak N, Lee JH, Anderson D. Prevalence of mental retardation and developmental disabilities: estimates from the 1994/1995 National Health Interview Survey Disability Supplements. Am J Ment Retard. 2001 May;106(3):231-52.
- Lee C, Iafrate AJ, Brothman AR. Copy number variations and clinical cytogenetic diagnosis of constitutional disorders. Nat Genet. 2007 Jul;39(7 Suppl):S48-54. doi: 10.1038/ng2092.
- Lujan E, Chanda S, Ahlenius H, Sudhof TC, Wernig M. Direct conversion of mouse fibroblasts to self-renewing, tripotent neural precursor cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Feb 14;109(7):2527-32. doi: 10.1073/pnas.1121003109. Epub 2012 Jan 30.
- McLaren J, Bryson SE. Review of recent epidemiological studies of mental retardation: prevalence, associated disorders, and etiology. Am J Ment Retard. 1987 Nov;92(3):243-54.
- Raff ML, Craigen WJ, Smith LT, Keene DR, Byers PH. Partial COL1A2 gene duplication produces features of osteogenesis imperfecta and Ehlers-Danlos syndrome type VII. Hum Genet. 2000 Jan;106(1):19-28. doi: 10.1007/s004390051004.
- Pang ZP, Yang N, Vierbuchen T, Ostermeier A, Fuentes DR, Yang TQ, Citri A, Sebastiano V, Marro S, Sudhof TC, Wernig M. Induction of human neuronal cells by defined transcription factors. Nature. 2011 May 26;476(7359):220-3. doi: 10.1038/nature10202.
- Rodriguez-Revenga L, Mila M, Rosenberg C, Lamb A, Lee C. Structural variation in the human genome: the impact of copy number variants on clinical diagnosis. Genet Med. 2007 Sep;9(9):600-6. doi: 10.1097/gim.0b013e318149e1e3.
- Rooryck Thambo C. Analyse de réarrangements génomiques chez des patients atteints d'anomalies du développement embryonnaire. Retard mental et malformations multiples congénitales ; Spectre oculo-auriculo-vertébral. 2009. Thèse de science n°1675. Ecole doctorale des sciences de la vie et de la santé, université Bordeaux 2.
- Shimojima K, Inoue T, Imai Y, Arai Y, Komoike Y, Sugawara M, Fujita T, Ideguchi H, Yasumoto S, Kanno H, Hirose S, Yamamoto T. Reduced PLP1 expression in induced pluripotent stem cells derived from a Pelizaeus-Merzbacher disease patient with a partial PLP1 duplication. J Hum Genet. 2012 Sep;57(9):580-6. doi: 10.1038/jhg.2012.71. Epub 2012 Jun 14.
- Stankiewicz P, Beaudet AL. Use of array CGH in the evaluation of dysmorphology, malformations, developmental delay, and idiopathic mental retardation. Curr Opin Genet Dev. 2007 Jun;17(3):182-92. doi: 10.1016/j.gde.2007.04.009. Epub 2007 Apr 30.
- Stasia MJ, Mollin M, Martel C, Satre V, Coutton C, Amblard F, Vieville G, van Montfrans JM, Boelens JJ, Veenstra-Knol HE, van Leeuwen K, de Boer M, Brion JP, Roos D. Functional and genetic characterization of two extremely rare cases of Williams-Beuren syndrome associated with chronic granulomatous disease. Eur J Hum Genet. 2013 Oct;21(10):1079-84. doi: 10.1038/ejhg.2012.310. Epub 2013 Jan 23.
- Stevenson, R. E., Schwartz, C. E. & Schroer, R. J. X-Linked Mental Retardation. 2000. Oxford Univ. Press
- Takahashi K, Yamanaka S. Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined factors. Cell. 2006 Aug 25;126(4):663-76. doi: 10.1016/j.cell.2006.07.024. Epub 2006 Aug 10.
- Thienpont B, de Ravel T, Van Esch H, Van Schoubroeck D, Moerman P, Vermeesch JR, Fryns JP, Froyen G, Lacoste C, Badens C, Devriendt K. Partial duplications of the ATRX gene cause the ATR-X syndrome. Eur J Hum Genet. 2007 Oct;15(10):1094-7. doi: 10.1038/sj.ejhg.5201878. Epub 2007 Jun 20.
- Wapinski OL, Vierbuchen T, Qu K, Lee QY, Chanda S, Fuentes DR, Giresi PG, Ng YH, Marro S, Neff NF, Drechsel D, Martynoga B, Castro DS, Webb AE, Sudhof TC, Brunet A, Guillemot F, Chang HY, Wernig M. Hierarchical mechanisms for direct reprogramming of fibroblasts to neurons. Cell. 2013 Oct 24;155(3):621-35. doi: 10.1016/j.cell.2013.09.028. Epub 2013 Oct 24.
- Yanaba K, Nakagawa H, Takeda Y, Koyama N, Sugano K. Muir-Torre syndrome caused by partial duplication of MSH2 gene by Alu-mediated nonhomologous recombination. Br J Dermatol. 2008 Jan;158(1):150-6. doi: 10.1111/j.1365-2133.2007.08233.x. Epub 2007 Oct 17.
- Yang N, Ng YH, Pang ZP, Sudhof TC, Wernig M. Induced neuronal cells: how to make and define a neuron. Cell Stem Cell. 2011 Dec 2;9(6):517-25. doi: 10.1016/j.stem.2011.11.015.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Tiistai 1. syyskuuta 2015
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Torstai 1. kesäkuuta 2017
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Perjantai 1. syyskuuta 2017
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Torstai 28. heinäkuuta 2016
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 29. marraskuuta 2016
Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)
Perjantai 2. joulukuuta 2016
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Perjantai 12. lokakuuta 2018
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 9. lokakuuta 2018
Viimeksi vahvistettu
Maanantai 1. lokakuuta 2018
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 38RC14.181
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .