Opracowanie narzędzia „iPSC” do badania funkcjonalnego mutacji odpowiedzialnych za upośledzenie umysłowe (Rementips)
9 października 2018 zaktualizowane przez: University Hospital, Grenoble
Opracowanie narzędzia „ iPSC ” (indukowane pluripotencjalne komórki macierzyste) do badania funkcjonalnego mutacji odpowiedzialnych za upośledzenie umysłowe - zastosowanie do rodzinnego badania mutacji genu MYT1L
Według Światowej Organizacji Zdrowia (WHO) upośledzenie umysłowe (MR) definiuje się jako iloraz inteligencji (IQ) < 70 i dotyka od 1 do 3% ogólnej populacji. Głębokie upośledzenie umysłowe (QI <25), ciężkie (IQ: 25-40) i umiarkowane (QI: 40-50) występuje z częstością 0,3-0,5%, podczas gdy częstość występowania łagodnej MR, zdefiniowanej przez IQ pomiędzy 50 i 70 szacuje się na około 1,5 %.
Pochodzenie MR może być zakaźne, toksyczne, traumatyczne, genetyczne lub środowiskowe. genetyczne przyczyny MR obejmują anomalie liczby i struktury chromosomów, mikroreorganizację genomu, choroby monogenowe i rzadziej inne anomalie niedziedziczone po mendlu, takie jak anomalie druku lub anomalie epigenetyczne, mutacje genomu mitochondrialnego itp. Przyczyny genetyczne stanowią 50% umiarkowana do ciężkiej, podczas gdy czynniki środowiskowe (niedożywienie, deprywacja kulturowa,...) odgrywają ważną rolę w łagodnej MR.
Głównym celem tego badania jest uzyskanie innowacyjnego narzędzia (neuronalnego rozróżnienia iPSC), które umożliwi badanie funkcjonalnego wpływu mutacji genów prawdopodobnie zaangażowanych w MR, takich jak MYT1L. Głównymi kryteriami związanymi z charakteryzacją narzędzia przez próbę jest badanie pluripotencji uzyskanego iPSC oraz podkreślenie mutacji genu MYT1L w iPSC.
Neurony z iPSC pacjenta i jego ojca również zostaną scharakteryzowane morfologicznie, ale także dzięki ekspresji genów specyficznie neuronalnych.
Charakterystyka iPSC i neuronów z d'iPSC z mutacją MYT1L zostanie porównana u pacjenta i jego ojca, w odniesieniu do tych samych komórek pochodzących od dwóch świadków.
Przegląd badań
Status
Zakończony
Interwencja / Leczenie
Typ studiów
Interwencyjne
Zapisy (Rzeczywisty)
4
Faza
- Nie dotyczy
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Lokalizacje studiów
-
-
-
La Tronche, Francja, 38700
- UniversityHospitalGrenoble
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Tak
Płeć kwalifikująca się do nauki
Wszystko
Opis
Kryteria przyjęcia :
- Pacjent z upośledzeniem umysłowym i/lub towarzyszącymi objawami, który został poddany analizie chromosomalnej za pomocą macierzy CGH, ujawniającej wariant o nieznanym znaczeniu obejmujący jeden lub więcej genów kandydujących do upośledzenia umysłowego.
- Zaświadczenie o poradni genetycznej i podpisana zgoda.
- Osoby poniżej 18 roku życia mogą być konieczne, ponieważ niepełnosprawność intelektualna jest często diagnozowana przed osiągnięciem wieku dorosłego.
- Liczba przypadków jest bardzo ograniczona w tym wstępnym badaniu i tylko jeden pacjent wykazujący rzadką mutację genu MYT1L i jego ojciec (bezobjawowy nosiciel tej samej mutacji) będą badani.
- Przynależność do systemu ubezpieczeń społecznych
Kryteria wyłączenia :
- Osoby wymienione od L1121-5 do L1121-8 CSP (wszystkie osoby chronione)
- Osoby cierpiące na ostre infekcje do wykonywania biopsji skóry w znieczuleniu miejscowym.
- Osoby wykazujące zaburzenia hemostazy nabyte lub wywołane
- Osoby z antykoagulantem przeciwzakrzepowym
- Osoby z mutacją w genie MYT1L
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Główny cel: Inny
- Przydział: Nielosowe
- Model interwencyjny: Przydział równoległy
- Maskowanie: Brak (otwarta etykieta)
Broń i interwencje
Grupa uczestników / Arm |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Inny: Pacjent
|
W znieczuleniu miejscowym
|
|
Inny: Nosiciel bezobjawowy
Ojciec pacjenta: bezobjawowy nosiciel tej samej mutacji
|
W znieczuleniu miejscowym
|
|
Inny: Dwóch pacjentów kontrolnych
|
W znieczuleniu miejscowym
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Charakterystyka iPSC z ludzkiego fibroblastu z mutacją MYT1L
Ramy czasowe: Pół godziny
|
Pobieranie próbek skóry w znieczuleniu miejscowym.
Ocena ekspresji genów iPSC pod kątem ich pluripotencji.
|
Pół godziny
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Sponsor
Śledczy
- Główny śledczy: Pierre Simon Jouk, Professor, Grenoble Hospital University
Publikacje i pomocne linki
Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.
Publikacje ogólne
- Bonnet C, Leheup B, Beri M, Philippe C, Gregoire MJ, Jonveaux P. Aberrant GRIA3 transcripts with multi-exon duplications in a family with X-linked mental retardation. Am J Med Genet A. 2009 Jun;149A(6):1280-9. doi: 10.1002/ajmg.a.32858.
- Brosco JP, Mattingly M, Sanders LM. Impact of specific medical interventions on reducing the prevalence of mental retardation. Arch Pediatr Adolesc Med. 2006 Mar;160(3):302-9. doi: 10.1001/archpedi.160.3.302.
- Chambers SM, Fasano CA, Papapetrou EP, Tomishima M, Sadelain M, Studer L. Highly efficient neural conversion of human ES and iPS cells by dual inhibition of SMAD signaling. Nat Biotechnol. 2009 Mar;27(3):275-80. doi: 10.1038/nbt.1529. Epub 2009 Mar 1. Erratum In: Nat Biotechnol. 2009 May;27(5):485.
- Chanda S, Marro S, Wernig M, Sudhof TC. Neurons generated by direct conversion of fibroblasts reproduce synaptic phenotype caused by autism-associated neuroligin-3 mutation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Oct 8;110(41):16622-7. doi: 10.1073/pnas.1316240110. Epub 2013 Sep 17.
- Chiurazzi P, Schwartz CE, Gecz J, Neri G. XLMR genes: update 2007. Eur J Hum Genet. 2008 Apr;16(4):422-34. doi: 10.1038/sj.ejhg.5201994. Epub 2008 Jan 16.
- Chiyonobu T, Hayashi S, Kobayashi K, Morimoto M, Miyanomae Y, Nishimura A, Nishimoto A, Ito C, Imoto I, Sugimoto T, Jia Z, Inazawa J, Toda T. Partial tandem duplication of GRIA3 in a male with mental retardation. Am J Med Genet A. 2007 Jul 1;143A(13):1448-55. doi: 10.1002/ajmg.a.31798.
- Cohn DM, Pagon RA, Hudgins L, Schwartz CE, Stevenson RE, Friez MJ. Partial ATRX gene duplication causes ATR-X syndrome. Am J Med Genet A. 2009 Oct;149A(10):2317-20. doi: 10.1002/ajmg.a.33006. No abstract available.
- Doco-Fenzy M, Leroy C, Schneider A, Petit F, Delrue MA, Andrieux J, Perrin-Sabourin L, Landais E, Aboura A, Puechberty J, Girard M, Tournaire M, Sanchez E, Rooryck C, Ameil A, Goossens M, Jonveaux P, Lefort G, Taine L, Cailley D, Gaillard D, Leheup B, Sarda P, Genevieve D. Early-onset obesity and paternal 2pter deletion encompassing the ACP1, TMEM18, and MYT1L genes. Eur J Hum Genet. 2014 Apr;22(4):471-9. doi: 10.1038/ejhg.2013.189. Epub 2013 Oct 16.
- Froyen G, Belet S, Martinez F, Santos-Reboucas CB, Declercq M, Verbeeck J, Donckers L, Berland S, Mayo S, Rosello M, Pimentel MM, Fintelman-Rodrigues N, Hovland R, Rodrigues dos Santos S, Raymond FL, Bose T, Corbett MA, Sheffield L, van Ravenswaaij-Arts CM, Dijkhuizen T, Coutton C, Satre V, Siu V, Marynen P. Copy-number gains of HUWE1 due to replication- and recombination-based rearrangements. Am J Hum Genet. 2012 Aug 10;91(2):252-64. doi: 10.1016/j.ajhg.2012.06.010. Epub 2012 Jul 26.
- Kearney HM, Thorland EC, Brown KK, Quintero-Rivera F, South ST; Working Group of the American College of Medical Genetics Laboratory Quality Assurance Committee. American College of Medical Genetics standards and guidelines for interpretation and reporting of postnatal constitutional copy number variants. Genet Med. 2011 Jul;13(7):680-5. doi: 10.1097/GIM.0b013e3182217a3a.
- Kleinjan DA, van Heyningen V. Long-range control of gene expression: emerging mechanisms and disruption in disease. Am J Hum Genet. 2005 Jan;76(1):8-32. doi: 10.1086/426833. Epub 2004 Nov 17.
- Larson SA, Lakin KC, Anderson L, Kwak N, Lee JH, Anderson D. Prevalence of mental retardation and developmental disabilities: estimates from the 1994/1995 National Health Interview Survey Disability Supplements. Am J Ment Retard. 2001 May;106(3):231-52.
- Lee C, Iafrate AJ, Brothman AR. Copy number variations and clinical cytogenetic diagnosis of constitutional disorders. Nat Genet. 2007 Jul;39(7 Suppl):S48-54. doi: 10.1038/ng2092.
- Lujan E, Chanda S, Ahlenius H, Sudhof TC, Wernig M. Direct conversion of mouse fibroblasts to self-renewing, tripotent neural precursor cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Feb 14;109(7):2527-32. doi: 10.1073/pnas.1121003109. Epub 2012 Jan 30.
- McLaren J, Bryson SE. Review of recent epidemiological studies of mental retardation: prevalence, associated disorders, and etiology. Am J Ment Retard. 1987 Nov;92(3):243-54.
- Raff ML, Craigen WJ, Smith LT, Keene DR, Byers PH. Partial COL1A2 gene duplication produces features of osteogenesis imperfecta and Ehlers-Danlos syndrome type VII. Hum Genet. 2000 Jan;106(1):19-28. doi: 10.1007/s004390051004.
- Pang ZP, Yang N, Vierbuchen T, Ostermeier A, Fuentes DR, Yang TQ, Citri A, Sebastiano V, Marro S, Sudhof TC, Wernig M. Induction of human neuronal cells by defined transcription factors. Nature. 2011 May 26;476(7359):220-3. doi: 10.1038/nature10202.
- Rodriguez-Revenga L, Mila M, Rosenberg C, Lamb A, Lee C. Structural variation in the human genome: the impact of copy number variants on clinical diagnosis. Genet Med. 2007 Sep;9(9):600-6. doi: 10.1097/gim.0b013e318149e1e3.
- Rooryck Thambo C. Analyse de réarrangements génomiques chez des patients atteints d'anomalies du développement embryonnaire. Retard mental et malformations multiples congénitales ; Spectre oculo-auriculo-vertébral. 2009. Thèse de science n°1675. Ecole doctorale des sciences de la vie et de la santé, université Bordeaux 2.
- Shimojima K, Inoue T, Imai Y, Arai Y, Komoike Y, Sugawara M, Fujita T, Ideguchi H, Yasumoto S, Kanno H, Hirose S, Yamamoto T. Reduced PLP1 expression in induced pluripotent stem cells derived from a Pelizaeus-Merzbacher disease patient with a partial PLP1 duplication. J Hum Genet. 2012 Sep;57(9):580-6. doi: 10.1038/jhg.2012.71. Epub 2012 Jun 14.
- Stankiewicz P, Beaudet AL. Use of array CGH in the evaluation of dysmorphology, malformations, developmental delay, and idiopathic mental retardation. Curr Opin Genet Dev. 2007 Jun;17(3):182-92. doi: 10.1016/j.gde.2007.04.009. Epub 2007 Apr 30.
- Stasia MJ, Mollin M, Martel C, Satre V, Coutton C, Amblard F, Vieville G, van Montfrans JM, Boelens JJ, Veenstra-Knol HE, van Leeuwen K, de Boer M, Brion JP, Roos D. Functional and genetic characterization of two extremely rare cases of Williams-Beuren syndrome associated with chronic granulomatous disease. Eur J Hum Genet. 2013 Oct;21(10):1079-84. doi: 10.1038/ejhg.2012.310. Epub 2013 Jan 23.
- Stevenson, R. E., Schwartz, C. E. & Schroer, R. J. X-Linked Mental Retardation. 2000. Oxford Univ. Press
- Takahashi K, Yamanaka S. Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined factors. Cell. 2006 Aug 25;126(4):663-76. doi: 10.1016/j.cell.2006.07.024. Epub 2006 Aug 10.
- Thienpont B, de Ravel T, Van Esch H, Van Schoubroeck D, Moerman P, Vermeesch JR, Fryns JP, Froyen G, Lacoste C, Badens C, Devriendt K. Partial duplications of the ATRX gene cause the ATR-X syndrome. Eur J Hum Genet. 2007 Oct;15(10):1094-7. doi: 10.1038/sj.ejhg.5201878. Epub 2007 Jun 20.
- Wapinski OL, Vierbuchen T, Qu K, Lee QY, Chanda S, Fuentes DR, Giresi PG, Ng YH, Marro S, Neff NF, Drechsel D, Martynoga B, Castro DS, Webb AE, Sudhof TC, Brunet A, Guillemot F, Chang HY, Wernig M. Hierarchical mechanisms for direct reprogramming of fibroblasts to neurons. Cell. 2013 Oct 24;155(3):621-35. doi: 10.1016/j.cell.2013.09.028. Epub 2013 Oct 24.
- Yanaba K, Nakagawa H, Takeda Y, Koyama N, Sugano K. Muir-Torre syndrome caused by partial duplication of MSH2 gene by Alu-mediated nonhomologous recombination. Br J Dermatol. 2008 Jan;158(1):150-6. doi: 10.1111/j.1365-2133.2007.08233.x. Epub 2007 Oct 17.
- Yang N, Ng YH, Pang ZP, Sudhof TC, Wernig M. Induced neuronal cells: how to make and define a neuron. Cell Stem Cell. 2011 Dec 2;9(6):517-25. doi: 10.1016/j.stem.2011.11.015.
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
1 września 2015
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
1 czerwca 2017
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
1 września 2017
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
28 lipca 2016
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
29 listopada 2016
Pierwszy wysłany (Oszacować)
2 grudnia 2016
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
12 października 2018
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
9 października 2018
Ostatnia weryfikacja
1 października 2018
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 38RC14.181
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .