Ontwikkeling van de tool "iPSC" voor de functionele studie van mutaties die verantwoordelijk zijn voor mentale retardatie (Rementips)
9 oktober 2018 bijgewerkt door: University Hospital, Grenoble
Ontwikkeling van de tool "iPSC" (geïnduceerde pluripotente stamcellen) voor de functionele studie van mutaties die verantwoordelijk zijn voor mentale retardatie - Toepassing op familiale studie van MYT1L-genmutaties
Volgens de Wereldgezondheidsorganisatie (WHO) wordt mentale retardatie (MR) gedefinieerd door een intelligentiequotiënt (IQ) < 70 en komt het voor bij 1 tot 3% van de algemene bevolking. Ernstige mentale retardatie (QI <25), ernstige (IQ: 25-40) en matige (QI: 40-50) hebben een prevalentie van 0,3-0,5%, terwijl de prevalentie van milde MR, gedefinieerd door een IQ tussen 50 en 70 wordt geschat op ongeveer 1,5 %.
De oorsprong van MR kan besmettelijk, toxisch, traumatisch, genetisch of omgevingsgebonden zijn. genetische oorzaken van MR omvatten het aantal en de structuur van anomalieën van de chromosomen, de genomische microreorganisatie, monogene ziekten en meer zelden andere niet-mendeliaanse overgeërfde anomalieën zoals print- of epigenetische anomalieën, mutaties van het mitochondriale genoom enz... Genetische oorzaken vertegenwoordigen 50% van de matig tot ernstig, terwijl omgevingsfactoren (ondervoeding, culturele deprivatie,...) een belangrijke rol spelen bij milde MR.
Het hoofddoel van deze studie is om een innovatieve tool te verkrijgen (neuronaal onderscheid van iPSC) die het mogelijk zal maken om de functionele impact te bestuderen van mutaties op genen die waarschijnlijk betrokken zijn bij MR zoals MYT1L. De belangrijkste criteria die verband houden met de karakterisering van de tool door de proef, zijn de studie van de pluripotentie van verkregen iPSC en het benadrukken van de mutatie van het gen MYT1L in de iPSC.
Neuronen uit de iPSC van de patiënt en zijn vader du patiënt zullen ook morfologisch gekarakteriseerd worden, maar ook dankzij de expressie van specifiek neurale genen.
Kenmerken van iPSC en neuronen van d'iPSC met MYT1L-mutatie zullen worden vergeleken tussen de patiënt en zijn vader, in relatie tot dezelfde cellen afkomstig van de twee getuigen.
Studie Overzicht
Toestand
Voltooid
Conditie
Interventie / Behandeling
Studietype
Ingrijpend
Inschrijving (Werkelijk)
4
Fase
- Niet toepasbaar
Contacten en locaties
In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.
Studie Locaties
-
-
-
La Tronche, Frankrijk, 38700
- UniversityHospitalGrenoble
-
-
Deelname Criteria
Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Kind
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Ja
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Allemaal
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Patiënt met een verstandelijke beperking en/of bijbehorende symptomen die een chromosomische analyse door CGH-array hebben ondergaan, waarbij een variant met onbekende betekenis werd onthuld waarbij een of meer genen betrokken waren die kandidaat zijn voor mentale retardatie.
- Certificaat van erfelijkheidsadvisering en ondertekende toestemming.
- Personen onder de 18 kunnen nodig zijn omdat een verstandelijke beperking vaak wordt gediagnosticeerd vóór de volwassen leeftijd.
- Het aantal gevallen is zeer beperkt in deze voorbereidende studie en slechts één patiënt met een zeldzame mutatie van het MYT1L-gen en zijn vader (asymptomatische drager van dezelfde mutatie) zullen worden bestudeerd.
- Aansluiting bij een socialezekerheidsstelsel
Uitsluitingscriteria :
- Personen genoemd L1121-5 tot L1121-8 van CSP (alle beschermde personen)
- Personen die lijden aan acute infecties voor de praktijk van huidbiopsie onder plaatselijke verdoving.
- Personen met een verworven of geïnduceerde hemostasestoornis
- Personen tegen anti-agrégant antistollingsmiddel
- Personen met een mutatie in het gen MYT1L
Studie plan
Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Primair doel: Ander
- Toewijzing: Niet-gerandomiseerd
- Interventioneel model: Parallelle opdracht
- Masker: Geen (open label)
Wapens en interventies
Deelnemersgroep / Arm |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Ander: Geduldig
|
Onder plaatselijke verdoving
|
|
Ander: Asymptomatische drager
Vader van de patiënt: asymptomatische drager van dezelfde mutatie
|
Onder plaatselijke verdoving
|
|
Ander: Twee controlepatiënten
|
Onder plaatselijke verdoving
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
iPSC-karakterisering van menselijke fibroblast met MYT1L-mutatie
Tijdsspanne: Een half uur
|
Huidafname onder plaatselijke verdoving.
Evaluatie van iPSC-genexpressie op hun pluripotentie.
|
Een half uur
|
Medewerkers en onderzoekers
Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Pierre Simon Jouk, Professor, Grenoble Hospital University
Publicaties en nuttige links
De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.
Algemene publicaties
- Bonnet C, Leheup B, Beri M, Philippe C, Gregoire MJ, Jonveaux P. Aberrant GRIA3 transcripts with multi-exon duplications in a family with X-linked mental retardation. Am J Med Genet A. 2009 Jun;149A(6):1280-9. doi: 10.1002/ajmg.a.32858.
- Brosco JP, Mattingly M, Sanders LM. Impact of specific medical interventions on reducing the prevalence of mental retardation. Arch Pediatr Adolesc Med. 2006 Mar;160(3):302-9. doi: 10.1001/archpedi.160.3.302.
- Chambers SM, Fasano CA, Papapetrou EP, Tomishima M, Sadelain M, Studer L. Highly efficient neural conversion of human ES and iPS cells by dual inhibition of SMAD signaling. Nat Biotechnol. 2009 Mar;27(3):275-80. doi: 10.1038/nbt.1529. Epub 2009 Mar 1. Erratum In: Nat Biotechnol. 2009 May;27(5):485.
- Chanda S, Marro S, Wernig M, Sudhof TC. Neurons generated by direct conversion of fibroblasts reproduce synaptic phenotype caused by autism-associated neuroligin-3 mutation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Oct 8;110(41):16622-7. doi: 10.1073/pnas.1316240110. Epub 2013 Sep 17.
- Chiurazzi P, Schwartz CE, Gecz J, Neri G. XLMR genes: update 2007. Eur J Hum Genet. 2008 Apr;16(4):422-34. doi: 10.1038/sj.ejhg.5201994. Epub 2008 Jan 16.
- Chiyonobu T, Hayashi S, Kobayashi K, Morimoto M, Miyanomae Y, Nishimura A, Nishimoto A, Ito C, Imoto I, Sugimoto T, Jia Z, Inazawa J, Toda T. Partial tandem duplication of GRIA3 in a male with mental retardation. Am J Med Genet A. 2007 Jul 1;143A(13):1448-55. doi: 10.1002/ajmg.a.31798.
- Cohn DM, Pagon RA, Hudgins L, Schwartz CE, Stevenson RE, Friez MJ. Partial ATRX gene duplication causes ATR-X syndrome. Am J Med Genet A. 2009 Oct;149A(10):2317-20. doi: 10.1002/ajmg.a.33006. No abstract available.
- Doco-Fenzy M, Leroy C, Schneider A, Petit F, Delrue MA, Andrieux J, Perrin-Sabourin L, Landais E, Aboura A, Puechberty J, Girard M, Tournaire M, Sanchez E, Rooryck C, Ameil A, Goossens M, Jonveaux P, Lefort G, Taine L, Cailley D, Gaillard D, Leheup B, Sarda P, Genevieve D. Early-onset obesity and paternal 2pter deletion encompassing the ACP1, TMEM18, and MYT1L genes. Eur J Hum Genet. 2014 Apr;22(4):471-9. doi: 10.1038/ejhg.2013.189. Epub 2013 Oct 16.
- Froyen G, Belet S, Martinez F, Santos-Reboucas CB, Declercq M, Verbeeck J, Donckers L, Berland S, Mayo S, Rosello M, Pimentel MM, Fintelman-Rodrigues N, Hovland R, Rodrigues dos Santos S, Raymond FL, Bose T, Corbett MA, Sheffield L, van Ravenswaaij-Arts CM, Dijkhuizen T, Coutton C, Satre V, Siu V, Marynen P. Copy-number gains of HUWE1 due to replication- and recombination-based rearrangements. Am J Hum Genet. 2012 Aug 10;91(2):252-64. doi: 10.1016/j.ajhg.2012.06.010. Epub 2012 Jul 26.
- Kearney HM, Thorland EC, Brown KK, Quintero-Rivera F, South ST; Working Group of the American College of Medical Genetics Laboratory Quality Assurance Committee. American College of Medical Genetics standards and guidelines for interpretation and reporting of postnatal constitutional copy number variants. Genet Med. 2011 Jul;13(7):680-5. doi: 10.1097/GIM.0b013e3182217a3a.
- Kleinjan DA, van Heyningen V. Long-range control of gene expression: emerging mechanisms and disruption in disease. Am J Hum Genet. 2005 Jan;76(1):8-32. doi: 10.1086/426833. Epub 2004 Nov 17.
- Larson SA, Lakin KC, Anderson L, Kwak N, Lee JH, Anderson D. Prevalence of mental retardation and developmental disabilities: estimates from the 1994/1995 National Health Interview Survey Disability Supplements. Am J Ment Retard. 2001 May;106(3):231-52.
- Lee C, Iafrate AJ, Brothman AR. Copy number variations and clinical cytogenetic diagnosis of constitutional disorders. Nat Genet. 2007 Jul;39(7 Suppl):S48-54. doi: 10.1038/ng2092.
- Lujan E, Chanda S, Ahlenius H, Sudhof TC, Wernig M. Direct conversion of mouse fibroblasts to self-renewing, tripotent neural precursor cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Feb 14;109(7):2527-32. doi: 10.1073/pnas.1121003109. Epub 2012 Jan 30.
- McLaren J, Bryson SE. Review of recent epidemiological studies of mental retardation: prevalence, associated disorders, and etiology. Am J Ment Retard. 1987 Nov;92(3):243-54.
- Raff ML, Craigen WJ, Smith LT, Keene DR, Byers PH. Partial COL1A2 gene duplication produces features of osteogenesis imperfecta and Ehlers-Danlos syndrome type VII. Hum Genet. 2000 Jan;106(1):19-28. doi: 10.1007/s004390051004.
- Pang ZP, Yang N, Vierbuchen T, Ostermeier A, Fuentes DR, Yang TQ, Citri A, Sebastiano V, Marro S, Sudhof TC, Wernig M. Induction of human neuronal cells by defined transcription factors. Nature. 2011 May 26;476(7359):220-3. doi: 10.1038/nature10202.
- Rodriguez-Revenga L, Mila M, Rosenberg C, Lamb A, Lee C. Structural variation in the human genome: the impact of copy number variants on clinical diagnosis. Genet Med. 2007 Sep;9(9):600-6. doi: 10.1097/gim.0b013e318149e1e3.
- Rooryck Thambo C. Analyse de réarrangements génomiques chez des patients atteints d'anomalies du développement embryonnaire. Retard mental et malformations multiples congénitales ; Spectre oculo-auriculo-vertébral. 2009. Thèse de science n°1675. Ecole doctorale des sciences de la vie et de la santé, université Bordeaux 2.
- Shimojima K, Inoue T, Imai Y, Arai Y, Komoike Y, Sugawara M, Fujita T, Ideguchi H, Yasumoto S, Kanno H, Hirose S, Yamamoto T. Reduced PLP1 expression in induced pluripotent stem cells derived from a Pelizaeus-Merzbacher disease patient with a partial PLP1 duplication. J Hum Genet. 2012 Sep;57(9):580-6. doi: 10.1038/jhg.2012.71. Epub 2012 Jun 14.
- Stankiewicz P, Beaudet AL. Use of array CGH in the evaluation of dysmorphology, malformations, developmental delay, and idiopathic mental retardation. Curr Opin Genet Dev. 2007 Jun;17(3):182-92. doi: 10.1016/j.gde.2007.04.009. Epub 2007 Apr 30.
- Stasia MJ, Mollin M, Martel C, Satre V, Coutton C, Amblard F, Vieville G, van Montfrans JM, Boelens JJ, Veenstra-Knol HE, van Leeuwen K, de Boer M, Brion JP, Roos D. Functional and genetic characterization of two extremely rare cases of Williams-Beuren syndrome associated with chronic granulomatous disease. Eur J Hum Genet. 2013 Oct;21(10):1079-84. doi: 10.1038/ejhg.2012.310. Epub 2013 Jan 23.
- Stevenson, R. E., Schwartz, C. E. & Schroer, R. J. X-Linked Mental Retardation. 2000. Oxford Univ. Press
- Takahashi K, Yamanaka S. Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined factors. Cell. 2006 Aug 25;126(4):663-76. doi: 10.1016/j.cell.2006.07.024. Epub 2006 Aug 10.
- Thienpont B, de Ravel T, Van Esch H, Van Schoubroeck D, Moerman P, Vermeesch JR, Fryns JP, Froyen G, Lacoste C, Badens C, Devriendt K. Partial duplications of the ATRX gene cause the ATR-X syndrome. Eur J Hum Genet. 2007 Oct;15(10):1094-7. doi: 10.1038/sj.ejhg.5201878. Epub 2007 Jun 20.
- Wapinski OL, Vierbuchen T, Qu K, Lee QY, Chanda S, Fuentes DR, Giresi PG, Ng YH, Marro S, Neff NF, Drechsel D, Martynoga B, Castro DS, Webb AE, Sudhof TC, Brunet A, Guillemot F, Chang HY, Wernig M. Hierarchical mechanisms for direct reprogramming of fibroblasts to neurons. Cell. 2013 Oct 24;155(3):621-35. doi: 10.1016/j.cell.2013.09.028. Epub 2013 Oct 24.
- Yanaba K, Nakagawa H, Takeda Y, Koyama N, Sugano K. Muir-Torre syndrome caused by partial duplication of MSH2 gene by Alu-mediated nonhomologous recombination. Br J Dermatol. 2008 Jan;158(1):150-6. doi: 10.1111/j.1365-2133.2007.08233.x. Epub 2007 Oct 17.
- Yang N, Ng YH, Pang ZP, Sudhof TC, Wernig M. Induced neuronal cells: how to make and define a neuron. Cell Stem Cell. 2011 Dec 2;9(6):517-25. doi: 10.1016/j.stem.2011.11.015.
Studie record data
Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
1 september 2015
Primaire voltooiing (Werkelijk)
1 juni 2017
Studie voltooiing (Werkelijk)
1 september 2017
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
28 juli 2016
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
29 november 2016
Eerst geplaatst (Schatting)
2 december 2016
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
12 oktober 2018
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
9 oktober 2018
Laatst geverifieerd
1 oktober 2018
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- 38RC14.181
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .