- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT04931446
Neuroendokrinní novotvar založený na multi-omické integrované analýze
Výzkum neuroendokrinního novotvaru v jediném centru na základě integrované analýzy multiomik
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Intervence / Léčba
Detailní popis
V posledních letech inovace vysoce výkonné sekvenační technologie výrazně podpořily pochopení mechanismů onemocnění na molekulární úrovni. Je nesporným faktem, že u nádorů stejného patologického typu a stadia klinicky existují velké rozdíly v prognóze. Velké množství studií prokázalo, že rozdíl v prognóze úzce souvisí s heterogenitou nádoru. V posledních několika letech může individualizovaná precizní léčba výrazně zlepšit prognózu pacientů. Studie ukázaly, že klasifikace podskupin kolorektálního karcinomu na základě somatických mutací a aktivace signálních drah v databázi TCGA výrazně zlepšila přesnost diagnózy a účinnost léčby. Lehmannův tým rozdělil vzorky do šesti typů na základě profilu genové exprese trojitě negativního karcinomu prsu: imunomodulační typ, mezenchymální typ, mezenchymální kmenový typ, typ androgenního receptoru a dva bazální typy. Tato typizační metoda kombinuje úlohu normálních úrovní transkripce matrice a imunitních buněk v mikroprostředí nádoru a zkoumá jejich klinické charakteristiky a léčebné strategie podle různých podtypů. K objasnění komplexní patogeneze nádorů však žádná jediná omika nestačí. Proto je integrovaná analýza mnohočetných omik vývojovým trendem, který pomůže objasnit patogenezi nádorů a objevit potenciální cíle lékové léčby. Interaktivní analýza fenotypových dat a molekulárních omických dat nám může nejen pomoci analyzovat korelaci mezi biologickými fenotypy a molekulárními fenotypy, ale také nám umožní porozumět mikroskopickému molekulárnímu mechanismu makrobiologických fenotypů. Například zobrazovací fenotypy založené na CT a MRI mohou být použity k prozkoumání důležitých proteinových markerů s nimi souvisejících, což poskytuje experimentální a teoretický základ pro vedení budoucí klinické farmakoterapie a výzkumu mechanismu rezistence na léky. Zajímavější je, že vztah mezi molekulární klasifikací nádorů na základě molekulární omiky a vytvořením modelů rozpoznávání fenotypů, jako je zobrazovací omika, může také učinit fenotypy, jako je zobrazovací omika, stát se vodítkem pro cílenou terapii nádorů. Důležitá metoda. U neuroendokrinních nádorů s vysokou mírou heterogenity je proto velmi nutné je analyzovat z pohledu více omik. V současných veřejných databázích TCGA a GEO jsou však exkluzivní data o genomice NEN extrémně vzácná a neexistují téměř žádná data, jako je proteomika, epiomika, metabolomika a imagingomika. Proto je naléhavě nutné provést exkluzivní analýzu velkých dat NEN multi-omics pro komplexní a hloubkové studium geneze a mechanismu vývoje neuroendokrinních nádorů.
Tento projekt má v úmyslu analyzovat molekulárně biologické charakteristiky NEN na základě multi-omické analýzy, vyvinout exkluzivní platformu NEN multi-omics pro velká data a provádět molekulární podtypy. Doufáme, že tato studie dokáže najít molekulární mechanismus a potenciální intervenční cíle recidivy a metastázy NEN a poskytnout lékařům bezpečné a účinné léčebné strategie, a tím zlepšit terapeutický účinek neuroendokrinních nádorů.
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Xianjun Yu, MD, PhD
- Telefonní číslo: +86-13801669875
- E-mail: yuxianjun@fudanpci.org
Studijní místa
-
-
Shanghai
-
Shanghai, Shanghai, Čína, 200032
- Department of Pancreatic Surgery, Fudan University Shanghai Cancer Center; Pancreatic Cancer Institute, Fudan University
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Od ledna 2010 do ledna 2021 podstoupil chirurgickou léčbu v přidružené onkologické nemocnici Fudan University;
- Pooperační patologie se ukázala jako neuroendokrinní nádor;
- Podepsal formulář informovaného souhlasu s odběrem vzorků tkáňové banky a souhlasí s použitím vzorků a souvisejících klinických dat pro vědecký výzkum.
Kritéria vyloučení:
- Sloučit další maligní nádory;
- Klinická data chybí.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Pouze případ
- Časové perspektivy: Retrospektivní
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Gastroenteropankreatické neuroendokrinní novotvary
|
Získejte vzorky uložené v tkáňové bance, hlavními typy vzorků jsou vzorky RNAlater, vzorky zmrazené tekutým dusíkem a vzorky periferní krve
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Analýza mechanismu NEN založená na Multi-omics
Časové okno: Jeden rok
|
Odebírejte vzorky tkání NEN a vzorky periferní krve pro genomiku, transkriptomiku, proteomiku, fosforylaci, metabolomiku a další sekvenační analýzu více omik, abyste našli vztah mezi těmito molekulárními omiky a fenotypy, prozkoumali mechanismus NEN, včetně hnacích genů, aktivace signálních drah atd. a prověřují citlivé léky na základě potenciálních cílů.
Použijte multi-omics data k vytvoření platformy pro analýzu velkých dat NEN, včetně citlivé predikce cíle, predikce souvisejících genů, analýzy přežití a tak dále.
|
Jeden rok
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Analýza imunitního mikroprostředí NEN
Časové okno: Jeden rok
|
Software GSVA a metoda CIBORSORT se používají k predikci obsahu a poměru různých subtypů imunitních buněk na základě exprese mRNA NEN.
|
Jeden rok
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Xianjun Yu, MD, PhD, Fudan University
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Lehmann BD, Jovanovic B, Chen X, Estrada MV, Johnson KN, Shyr Y, Moses HL, Sanders ME, Pietenpol JA. Refinement of Triple-Negative Breast Cancer Molecular Subtypes: Implications for Neoadjuvant Chemotherapy Selection. PLoS One. 2016 Jun 16;11(6):e0157368. doi: 10.1371/journal.pone.0157368. eCollection 2016.
- Cancer Genome Atlas Network. Comprehensive molecular characterization of human colon and rectal cancer. Nature. 2012 Jul 18;487(7407):330-7. doi: 10.1038/nature11252.
- Pavel M, Baudin E, Couvelard A, Krenning E, Oberg K, Steinmuller T, Anlauf M, Wiedenmann B, Salazar R; Barcelona Consensus Conference participants. ENETS Consensus Guidelines for the management of patients with liver and other distant metastases from neuroendocrine neoplasms of foregut, midgut, hindgut, and unknown primary. Neuroendocrinology. 2012;95(2):157-76. doi: 10.1159/000335597. Epub 2012 Feb 15. No abstract available.
- Alizadeh AA, Aranda V, Bardelli A, Blanpain C, Bock C, Borowski C, Caldas C, Califano A, Doherty M, Elsner M, Esteller M, Fitzgerald R, Korbel JO, Lichter P, Mason CE, Navin N, Pe'er D, Polyak K, Roberts CW, Siu L, Snyder A, Stower H, Swanton C, Verhaak RG, Zenklusen JC, Zuber J, Zucman-Rossi J. Toward understanding and exploiting tumor heterogeneity. Nat Med. 2015 Aug;21(8):846-53. doi: 10.1038/nm.3915.
- Hausser J, Alon U. Tumour heterogeneity and the evolutionary trade-offs of cancer. Nat Rev Cancer. 2020 Apr;20(4):247-257. doi: 10.1038/s41568-020-0241-6. Epub 2020 Feb 24.
- Halaburkova A, Cahais V, Novoloaca A, Araujo MGDS, Khoueiry R, Ghantous A, Herceg Z. Pan-cancer multi-omics analysis and orthogonal experimental assessment of epigenetic driver genes. Genome Res. 2020 Oct;30(10):1517-1532. doi: 10.1101/gr.268292.120. Epub 2020 Sep 22.
- Taber A, Christensen E, Lamy P, Nordentoft I, Prip F, Lindskrog SV, Birkenkamp-Demtroder K, Okholm TLH, Knudsen M, Pedersen JS, Steiniche T, Agerbaek M, Jensen JB, Dyrskjot L. Molecular correlates of cisplatin-based chemotherapy response in muscle invasive bladder cancer by integrated multi-omics analysis. Nat Commun. 2020 Sep 25;11(1):4858. doi: 10.1038/s41467-020-18640-0. Erratum In: Nat Commun. 2022 Apr 4;13(1):1916.
- Sailem HZ, Bakal C. Identification of clinically predictive metagenes that encode components of a network coupling cell shape to transcription by image-omics. Genome Res. 2017 Feb;27(2):196-207. doi: 10.1101/gr.202028.115. Epub 2016 Nov 18.
- Su H, Shen Y, Xing F, Qi X, Hirshfield KM, Yang L, Foran DJ. Robust automatic breast cancer staging using a combination of functional genomics and image-omics. Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2015;2015:7226-9. doi: 10.1109/EMBC.2015.7320059.
- Frilling A, Modlin IM, Kidd M, Russell C, Breitenstein S, Salem R, Kwekkeboom D, Lau WY, Klersy C, Vilgrain V, Davidson B, Siegler M, Caplin M, Solcia E, Schilsky R; Working Group on Neuroendocrine Liver Metastases. Recommendations for management of patients with neuroendocrine liver metastases. Lancet Oncol. 2014 Jan;15(1):e8-21. doi: 10.1016/S1470-2045(13)70362-0.
- Mayo SC, de Jong MC, Pulitano C, Clary BM, Reddy SK, Gamblin TC, Celinksi SA, Kooby DA, Staley CA, Stokes JB, Chu CK, Ferrero A, Schulick RD, Choti MA, Mentha G, Strub J, Bauer TW, Adams RB, Aldrighetti L, Capussotti L, Pawlik TM. Surgical management of hepatic neuroendocrine tumor metastasis: results from an international multi-institutional analysis. Ann Surg Oncol. 2010 Dec;17(12):3129-36. doi: 10.1245/s10434-010-1154-5. Epub 2010 Jun 29.
- Rindi G, D'Adda T, Froio E, Fellegara G, Bordi C. Prognostic factors in gastrointestinal endocrine tumors. Endocr Pathol. 2007 Fall;18(3):145-9. doi: 10.1007/s12022-007-0020-x.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Očekávaný)
Primární dokončení (Očekávaný)
Dokončení studie (Očekávaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- CSPAC-NEN-2
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .