- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT04931446
Neoplasia neuroendocrina basata sull'analisi integrata multi-omica
Ricerca sulle neoplasie neuroendocrine in un unico centro basata sull'analisi integrata multi-omica
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Negli ultimi anni, l'innovazione della tecnologia di sequenziamento ad alto rendimento ha notevolmente promosso la comprensione dei meccanismi della malattia a livello molecolare. È un fatto indiscutibile che esistono grandi differenze nella prognosi dei tumori con lo stesso tipo patologico e lo stesso stadio clinico. Un gran numero di studi ha dimostrato che la differenza nella prognosi è strettamente correlata all'eterogeneità del tumore. Negli ultimi anni, il trattamento di precisione individualizzato può migliorare notevolmente la prognosi dei pazienti. Gli studi hanno dimostrato che la classificazione dei sottogruppi del cancro del colon-retto basata su mutazioni somatiche e attivazione del percorso del segnale nel database TCGA ha notevolmente migliorato l'accuratezza della diagnosi e l'efficacia del trattamento. Il team di Lehmann ha diviso i campioni in sei tipi in base al profilo di espressione genica del carcinoma mammario triplo negativo: tipo immunomodulatore, tipo mesenchimale, tipo mesenchimale simile a stelo, tipo di recettore degli androgeni e due tipi di tipo basale. Questo metodo di tipizzazione combina il ruolo della matrice normale e dei livelli di trascrizione delle cellule immunitarie nel microambiente tumorale ed esplora le loro caratteristiche cliniche e strategie di trattamento in base a diversi sottotipi. Tuttavia, nessuna singola omica è sufficiente per chiarire la complessa patogenesi dei tumori. Pertanto, l'analisi integrata di più omiche è una tendenza di sviluppo, che aiuterà a chiarire la patogenesi dei tumori e scoprire potenziali bersagli di trattamento farmacologico. L'analisi interattiva dei dati fenotipici e dei dati omici molecolari può non solo aiutarci ad analizzare la correlazione tra fenotipi biologici e fenotipi molecolari, ma anche permetterci di comprendere il meccanismo molecolare microscopico dei fenotipi macrobiologici. Ad esempio, i fenotipi di imaging basati su CT e MRI possono essere utilizzati per esplorare importanti marcatori proteici ad essi correlati, che forniscono basi sperimentali e teoriche per guidare la futura terapia clinica mirata ai farmaci e la ricerca sui meccanismi di resistenza ai farmaci. La cosa più interessante è che la relazione tra la classificazione molecolare dei tumori basata sull'omica molecolare e l'istituzione di modelli di riconoscimento fenotipico come l'omica per immagini può anche far sì che fenotipici come l'omica per immagini diventino una guida per la terapia tumorale mirata. Un metodo importante. Pertanto, per i tumori neuroendocrini con un alto grado di eterogeneità, è molto necessario analizzarli dal punto di vista delle omiche multiple. Tuttavia, negli attuali database pubblici TCGA e GEO, i dati esclusivi di genomica NEN sono estremamente scarsi e non ci sono quasi dati come proteomica, epiomica, metabolomica e imagingomica. Pertanto, è urgente eseguire un'analisi di big data multi-omics esclusiva NEN per studiare in modo completo e approfondito la genesi e il meccanismo di sviluppo dei tumori neuroendocrini.
Questo progetto intende analizzare le caratteristiche biologiche molecolari di NEN sulla base dell'analisi multi-omica, sviluppare un'esclusiva piattaforma di big data multi-omica NEN ed eseguire sottotipi molecolari. Ci auguriamo che questo studio possa trovare il meccanismo molecolare e i potenziali obiettivi di intervento della recidiva e delle metastasi di NEN e fornire ai medici strategie di trattamento sicure ed efficaci, migliorando così l'effetto terapeutico dei tumori neuroendocrini.
Tipo di studio
Iscrizione (Anticipato)
Contatti e Sedi
Contatto studio
- Nome: Xianjun Yu, MD, PhD
- Numero di telefono: +86-13801669875
- Email: yuxianjun@fudanpci.org
Luoghi di studio
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Shanghai
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Shanghai, Shanghai, Cina, 200032
- Department of Pancreatic Surgery, Fudan University Shanghai Cancer Center; Pancreatic Cancer Institute, Fudan University
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Ha ricevuto cure chirurgiche presso il Fudan University Affiliated Cancer Hospital da gennaio 2010 a gennaio 2021;
- La patologia postoperatoria si è rivelata essere un tumore neuroendocrino;
- Ha firmato un modulo di consenso informato per la raccolta di campioni della banca dei tessuti, accettando di utilizzare i campioni e i relativi dati clinici per la ricerca scientifica.
Criteri di esclusione:
- Unire altri tumori maligni;
- Mancano i dati clinici.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Solo caso
- Prospettive temporali: Retrospettiva
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
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Neoplasie neuroendocrine gastroenteropancreatiche
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Recupera i campioni conservati nella banca dei tessuti, i principali tipi di campioni sono campioni RNAlater, campioni congelati con azoto liquido e campioni di sangue periferico
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Analisi del meccanismo NEN basata su Multi-omics
Lasso di tempo: Un anno
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Raccogli campioni di tessuto NEN e campioni di sangue periferico per genomica, trascrittomica, proteomica, fosforilazione, metabolomica e altre analisi di sequenziamento di omiche multiple, in modo da trovare la relazione tra questi omici e fenotipi molecolari, esplorare il meccanismo NEN, inclusi i geni driver, l'attivazione delle vie del segnale , ecc., e vagliare i farmaci sensibili in base a potenziali bersagli.
Usa i dati multi-omics per stabilire la piattaforma di analisi dei big data NEN, inclusa la previsione di target sensibili, la previsione di geni correlati, l'analisi di sopravvivenza e così via.
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Un anno
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Analisi del microambiente immunitario NEN
Lasso di tempo: Un anno
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Il software GSVA e il metodo CIBORSORT vengono utilizzati per prevedere il contenuto e il rapporto di vari sottotipi di cellule immunitarie in base all'espressione dell'mRNA NEN.
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Un anno
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Investigatori
- Investigatore principale: Xianjun Yu, MD, PhD, Fudan University
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Lehmann BD, Jovanovic B, Chen X, Estrada MV, Johnson KN, Shyr Y, Moses HL, Sanders ME, Pietenpol JA. Refinement of Triple-Negative Breast Cancer Molecular Subtypes: Implications for Neoadjuvant Chemotherapy Selection. PLoS One. 2016 Jun 16;11(6):e0157368. doi: 10.1371/journal.pone.0157368. eCollection 2016.
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- Alizadeh AA, Aranda V, Bardelli A, Blanpain C, Bock C, Borowski C, Caldas C, Califano A, Doherty M, Elsner M, Esteller M, Fitzgerald R, Korbel JO, Lichter P, Mason CE, Navin N, Pe'er D, Polyak K, Roberts CW, Siu L, Snyder A, Stower H, Swanton C, Verhaak RG, Zenklusen JC, Zuber J, Zucman-Rossi J. Toward understanding and exploiting tumor heterogeneity. Nat Med. 2015 Aug;21(8):846-53. doi: 10.1038/nm.3915.
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Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
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Parole chiave
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- CSPAC-NEN-2
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