- ICH GCP
- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT04931446
Néoplasme neuroendocrinien basé sur l'analyse intégrée multi-omique
Recherche sur les néoplasmes neuroendocriniens dans un centre unique basée sur l'analyse intégrée multi-omique
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Ces dernières années, l'innovation de la technologie de séquençage à haut débit a grandement favorisé la compréhension des mécanismes de la maladie au niveau moléculaire. C'est un fait incontestable qu'il existe de grandes différences dans le pronostic des tumeurs avec le même type pathologique et le même stade clinique. Un grand nombre d'études ont prouvé que la différence de pronostic est étroitement liée à l'hétérogénéité de la tumeur. Au cours des dernières années, un traitement de précision individualisé peut grandement améliorer le pronostic des patients. Des études ont montré que la classification en sous-groupes du cancer colorectal basée sur les mutations somatiques et l'activation de la voie du signal dans la base de données TCGA a considérablement amélioré la précision du diagnostic et l'efficacité du traitement. L'équipe de Lehmann a divisé les échantillons en six types en fonction du profil d'expression génique du cancer du sein triple négatif : type immunomodulateur, type mésenchymateux, type de type tige mésenchymateuse, type de récepteur aux androgènes et deux types de type basal. Cette méthode de typage combine le rôle de la matrice normale et des niveaux de transcription des cellules immunitaires dans le microenvironnement tumoral, et explore leurs caractéristiques cliniques et leurs stratégies de traitement selon différents sous-types. Cependant, aucun omique seul n'est suffisant pour élucider la pathogenèse complexe des tumeurs. Par conséquent, l'analyse intégrée de multiples omiques est une tendance de développement, qui aidera à clarifier la pathogenèse des tumeurs et à découvrir des cibles potentielles de traitement médicamenteux. L'analyse interactive des données phénotypiques et des données d'omiques moléculaires peut non seulement nous aider à analyser la corrélation entre les phénotypes biologiques et les phénotypes moléculaires, mais aussi nous permettre de comprendre le mécanisme moléculaire microscopique des phénotypes macrobiologiques. Par exemple, les phénotypes d'imagerie basés sur la tomodensitométrie et l'IRM peuvent être utilisés pour explorer d'importants marqueurs protéiques qui leur sont liés, ce qui fournit une base expérimentale et théorique pour guider les futures thérapies cliniques ciblées sur les médicaments et la recherche sur les mécanismes de résistance aux médicaments. Ce qui est plus intéressant, c'est que la relation entre la classification moléculaire des tumeurs basée sur l'omique moléculaire et l'établissement de modèles de reconnaissance phénotypique tels que l'imagerie omique peut également faire des phénotypes tels que l'imagerie omique un guide pour la thérapie ciblée des tumeurs. Une méthode importante. Par conséquent, pour les tumeurs neuroendocrines à haut degré d'hétérogénéité, il est très nécessaire de les analyser du point de vue des omiques multiples. Cependant, dans les bases de données publiques actuelles TCGA et GEO, les données génomiques exclusives du NEN sont extrêmement rares et il n'y a presque pas de données telles que la protéomique, l'épiomique, la métabolomique et l'imagerie. Par conséquent, il est urgent d'effectuer une analyse exclusive des mégadonnées multi-omiques NEN pour étudier de manière complète et approfondie la genèse et le mécanisme de développement des tumeurs neuroendocrines.
Ce projet vise à analyser les caractéristiques biologiques moléculaires du NEN sur la base d'une analyse multi-omique, à développer une plate-forme exclusive de mégadonnées multi-omiques NEN et à réaliser des sous-types moléculaires. Nous espérons que cette étude pourra trouver le mécanisme moléculaire et les cibles d'intervention potentielles de la récidive et des métastases du NEN, et fournir aux cliniciens des stratégies de traitement sûres et efficaces, améliorant ainsi l'effet thérapeutique des tumeurs neuroendocrines.
Type d'étude
Inscription (Anticipé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Xianjun Yu, MD, PhD
- Numéro de téléphone: +86-13801669875
- E-mail: yuxianjun@fudanpci.org
Lieux d'étude
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Shanghai
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Shanghai, Shanghai, Chine, 200032
- Department of Pancreatic Surgery, Fudan University Shanghai Cancer Center; Pancreatic Cancer Institute, Fudan University
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- A reçu un traitement chirurgical au Fudan University Affiliated Cancer Hospital de janvier 2010 à janvier 2021 ;
- La pathologie postopératoire s'est avérée être une tumeur neuroendocrinienne ;
- A signé un formulaire de consentement éclairé pour la collecte d'échantillons de la banque de tissus, acceptant d'utiliser les échantillons et les données cliniques connexes pour la recherche scientifique.
Critère d'exclusion:
- Fusionner d'autres tumeurs malignes ;
- Les données cliniques manquent.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cas uniquement
- Perspectives temporelles: Rétrospective
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Tumeurs neuroendocrines gastro-entéropancréatiques
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Récupérer les échantillons stockés dans la banque de tissus, les principaux types d'échantillons sont les échantillons RNAlater, les échantillons congelés à l'azote liquide et les échantillons de sang périphérique
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Analyse du mécanisme NEN basée sur Multi-omics
Délai: Un ans
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Recueillir des échantillons de tissus NEN et des échantillons de sang périphérique pour la génomique, la transcriptomique, la protéomique, la phosphorylation, la métabolomique et d'autres analyses de séquençage d'omiques multiples, afin de trouver la relation entre ces omiques moléculaires et les phénotypes, explorer le mécanisme NEN, y compris les gènes conducteurs, l'activation des voies de signal , etc., et cribler les médicaments sensibles en fonction des cibles potentielles.
Utilisez des données multi-omiques pour établir une plate-forme d'analyse de données volumineuses NEN, y compris la prédiction de cibles sensibles, la prédiction de gènes associés, l'analyse de survie, etc.
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Un ans
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Analyse du microenvironnement immunitaire NEN
Délai: Un ans
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Le logiciel GSVA et la méthode CIBORSORT sont utilisés pour prédire le contenu et le ratio de divers sous-types de cellules immunitaires en fonction de l'expression de l'ARNm NEN.
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Un ans
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Xianjun Yu, MD, PhD, Fudan University
Publications et liens utiles
Publications générales
- Lehmann BD, Jovanovic B, Chen X, Estrada MV, Johnson KN, Shyr Y, Moses HL, Sanders ME, Pietenpol JA. Refinement of Triple-Negative Breast Cancer Molecular Subtypes: Implications for Neoadjuvant Chemotherapy Selection. PLoS One. 2016 Jun 16;11(6):e0157368. doi: 10.1371/journal.pone.0157368. eCollection 2016.
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- Alizadeh AA, Aranda V, Bardelli A, Blanpain C, Bock C, Borowski C, Caldas C, Califano A, Doherty M, Elsner M, Esteller M, Fitzgerald R, Korbel JO, Lichter P, Mason CE, Navin N, Pe'er D, Polyak K, Roberts CW, Siu L, Snyder A, Stower H, Swanton C, Verhaak RG, Zenklusen JC, Zuber J, Zucman-Rossi J. Toward understanding and exploiting tumor heterogeneity. Nat Med. 2015 Aug;21(8):846-53. doi: 10.1038/nm.3915.
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- Mayo SC, de Jong MC, Pulitano C, Clary BM, Reddy SK, Gamblin TC, Celinksi SA, Kooby DA, Staley CA, Stokes JB, Chu CK, Ferrero A, Schulick RD, Choti MA, Mentha G, Strub J, Bauer TW, Adams RB, Aldrighetti L, Capussotti L, Pawlik TM. Surgical management of hepatic neuroendocrine tumor metastasis: results from an international multi-institutional analysis. Ann Surg Oncol. 2010 Dec;17(12):3129-36. doi: 10.1245/s10434-010-1154-5. Epub 2010 Jun 29.
- Rindi G, D'Adda T, Froio E, Fellegara G, Bordi C. Prognostic factors in gastrointestinal endocrine tumors. Endocr Pathol. 2007 Fall;18(3):145-9. doi: 10.1007/s12022-007-0020-x.
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Anticipé)
Achèvement primaire (Anticipé)
Achèvement de l'étude (Anticipé)
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Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
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Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
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- CSPAC-NEN-2
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