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Néoplasme neuroendocrinien basé sur l'analyse intégrée multi-omique

12 juin 2021 mis à jour par: Xian-Jun Yu

Recherche sur les néoplasmes neuroendocriniens dans un centre unique basée sur l'analyse intégrée multi-omique

Ce projet vise à analyser les caractéristiques biologiques moléculaires des NEN basées sur la multi-omique, à développer une plate-forme exclusive de mégadonnées multi-omiques NEN et à réaliser des prédictions de sous-types moléculaires et de cibles potentielles, afin d'améliorer l'effet thérapeutique des tumeurs neuroendocrines.

Aperçu de l'étude

Statut

Pas encore de recrutement

Les conditions

Description détaillée

Ces dernières années, l'innovation de la technologie de séquençage à haut débit a grandement favorisé la compréhension des mécanismes de la maladie au niveau moléculaire. C'est un fait incontestable qu'il existe de grandes différences dans le pronostic des tumeurs avec le même type pathologique et le même stade clinique. Un grand nombre d'études ont prouvé que la différence de pronostic est étroitement liée à l'hétérogénéité de la tumeur. Au cours des dernières années, un traitement de précision individualisé peut grandement améliorer le pronostic des patients. Des études ont montré que la classification en sous-groupes du cancer colorectal basée sur les mutations somatiques et l'activation de la voie du signal dans la base de données TCGA a considérablement amélioré la précision du diagnostic et l'efficacité du traitement. L'équipe de Lehmann a divisé les échantillons en six types en fonction du profil d'expression génique du cancer du sein triple négatif : type immunomodulateur, type mésenchymateux, type de type tige mésenchymateuse, type de récepteur aux androgènes et deux types de type basal. Cette méthode de typage combine le rôle de la matrice normale et des niveaux de transcription des cellules immunitaires dans le microenvironnement tumoral, et explore leurs caractéristiques cliniques et leurs stratégies de traitement selon différents sous-types. Cependant, aucun omique seul n'est suffisant pour élucider la pathogenèse complexe des tumeurs. Par conséquent, l'analyse intégrée de multiples omiques est une tendance de développement, qui aidera à clarifier la pathogenèse des tumeurs et à découvrir des cibles potentielles de traitement médicamenteux. L'analyse interactive des données phénotypiques et des données d'omiques moléculaires peut non seulement nous aider à analyser la corrélation entre les phénotypes biologiques et les phénotypes moléculaires, mais aussi nous permettre de comprendre le mécanisme moléculaire microscopique des phénotypes macrobiologiques. Par exemple, les phénotypes d'imagerie basés sur la tomodensitométrie et l'IRM peuvent être utilisés pour explorer d'importants marqueurs protéiques qui leur sont liés, ce qui fournit une base expérimentale et théorique pour guider les futures thérapies cliniques ciblées sur les médicaments et la recherche sur les mécanismes de résistance aux médicaments. Ce qui est plus intéressant, c'est que la relation entre la classification moléculaire des tumeurs basée sur l'omique moléculaire et l'établissement de modèles de reconnaissance phénotypique tels que l'imagerie omique peut également faire des phénotypes tels que l'imagerie omique un guide pour la thérapie ciblée des tumeurs. Une méthode importante. Par conséquent, pour les tumeurs neuroendocrines à haut degré d'hétérogénéité, il est très nécessaire de les analyser du point de vue des omiques multiples. Cependant, dans les bases de données publiques actuelles TCGA et GEO, les données génomiques exclusives du NEN sont extrêmement rares et il n'y a presque pas de données telles que la protéomique, l'épiomique, la métabolomique et l'imagerie. Par conséquent, il est urgent d'effectuer une analyse exclusive des mégadonnées multi-omiques NEN pour étudier de manière complète et approfondie la genèse et le mécanisme de développement des tumeurs neuroendocrines.

Ce projet vise à analyser les caractéristiques biologiques moléculaires du NEN sur la base d'une analyse multi-omique, à développer une plate-forme exclusive de mégadonnées multi-omiques NEN et à réaliser des sous-types moléculaires. Nous espérons que cette étude pourra trouver le mécanisme moléculaire et les cibles d'intervention potentielles de la récidive et des métastases du NEN, et fournir aux cliniciens des stratégies de traitement sûres et efficaces, améliorant ainsi l'effet thérapeutique des tumeurs neuroendocrines.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Anticipé)

200

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Lieux d'étude

    • Shanghai
      • Shanghai, Shanghai, Chine, 200032
        • Department of Pancreatic Surgery, Fudan University Shanghai Cancer Center; Pancreatic Cancer Institute, Fudan University

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans à 80 ans (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Recueillir des échantillons de tumeurs neuroendocrines pancréatiques gastro-intestinales stockés dans la banque de tissus de l'hôpital des tumeurs affilié à l'université de Fudan du 31 janvier 2010 au 31 mars 2021

La description

Critère d'intégration:

  1. A reçu un traitement chirurgical au Fudan University Affiliated Cancer Hospital de janvier 2010 à janvier 2021 ;
  2. La pathologie postopératoire s'est avérée être une tumeur neuroendocrinienne ;
  3. A signé un formulaire de consentement éclairé pour la collecte d'échantillons de la banque de tissus, acceptant d'utiliser les échantillons et les données cliniques connexes pour la recherche scientifique.

Critère d'exclusion:

  1. Fusionner d'autres tumeurs malignes ;
  2. Les données cliniques manquent.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Modèles d'observation: Cas uniquement
  • Perspectives temporelles: Rétrospective

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Tumeurs neuroendocrines gastro-entéropancréatiques
Récupérer les échantillons stockés dans la banque de tissus, les principaux types d'échantillons sont les échantillons RNAlater, les échantillons congelés à l'azote liquide et les échantillons de sang périphérique

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Analyse du mécanisme NEN basée sur Multi-omics
Délai: Un ans
Recueillir des échantillons de tissus NEN et des échantillons de sang périphérique pour la génomique, la transcriptomique, la protéomique, la phosphorylation, la métabolomique et d'autres analyses de séquençage d'omiques multiples, afin de trouver la relation entre ces omiques moléculaires et les phénotypes, explorer le mécanisme NEN, y compris les gènes conducteurs, l'activation des voies de signal , etc., et cribler les médicaments sensibles en fonction des cibles potentielles. Utilisez des données multi-omiques pour établir une plate-forme d'analyse de données volumineuses NEN, y compris la prédiction de cibles sensibles, la prédiction de gènes associés, l'analyse de survie, etc.
Un ans

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Analyse du microenvironnement immunitaire NEN
Délai: Un ans
Le logiciel GSVA et la méthode CIBORSORT sont utilisés pour prédire le contenu et le ratio de divers sous-types de cellules immunitaires en fonction de l'expression de l'ARNm NEN.
Un ans

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Xianjun Yu, MD, PhD, Fudan University

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Anticipé)

1 juillet 2021

Achèvement primaire (Anticipé)

1 mars 2022

Achèvement de l'étude (Anticipé)

1 décembre 2022

Dates d'inscription aux études

Première soumission

2 juin 2021

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

12 juin 2021

Première publication (Réel)

18 juin 2021

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

18 juin 2021

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

12 juin 2021

Dernière vérification

1 juin 2021

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

Non

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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