- ICH GCP
- Реестр клинических исследований США
- Клиническое испытание NCT04931446
Нейроэндокринное новообразование на основе комплексного мультиомного анализа
Исследование нейроэндокринных новообразований в одном центре на основе комплексного мультиомного анализа
Обзор исследования
Статус
Условия
Вмешательство/лечение
Подробное описание
В последние годы инновационная технология высокопроизводительного секвенирования значительно способствовала пониманию механизмов заболевания на молекулярном уровне. Неоспоримым фактом являются большие различия в прогнозе опухолей при одном и том же патологическом типе и клинической стадии. В большом количестве исследований доказано, что разница в прогнозе тесно связана с гетерогенностью опухоли. В последние несколько лет индивидуализированное прецизионное лечение может значительно улучшить прогноз пациентов. Исследования показали, что классификация колоректального рака на подгруппы на основе соматических мутаций и активации сигнального пути в базе данных TCGA значительно повысила точность диагностики и эффективность лечения. Команда Леманна разделила образцы на шесть типов на основе профиля экспрессии генов тройного негативного рака молочной железы: иммуномодулирующий тип, мезенхимальный тип, мезенхимальный стволоподобный тип, тип рецептора андрогена и два базальноподобных типа. Этот метод типирования сочетает в себе роль нормальных уровней транскрипции матрикса и иммунных клеток в микроокружении опухоли и исследует их клинические характеристики и стратегии лечения в соответствии с различными подтипами. Однако одного омика недостаточно для выяснения сложного патогенеза опухолей. Поэтому комплексный анализ множественных омиков является направлением развития, что позволит уточнить патогенез опухолей и выявить потенциальные мишени для медикаментозного лечения. Интерактивный анализ фенотипических данных и данных молекулярной омики может не только помочь нам проанализировать корреляцию между биологическими фенотипами и молекулярными фенотипами, но также позволить нам понять микроскопический молекулярный механизм макробиологических фенотипов. Например, визуализация фенотипов, основанная на КТ и МРТ, может быть использована для изучения важных белковых маркеров, связанных с ними, что обеспечивает экспериментальную и теоретическую основу для руководства будущей клинической таргетной лекарственной терапией и исследования механизма лекарственной устойчивости. Более интересно то, что взаимосвязь между молекулярной классификацией опухолей, основанной на молекулярной омике, и созданием моделей фенотипического распознавания, таких как визуализирующие омики, также может сделать фенотипы, такие как визуализирующие омики, руководством для таргетной терапии опухолей. Важный метод. Поэтому для нейроэндокринных опухолей с высокой степенью гетерогенности очень необходим их анализ с позиции множественных омиков. Однако в текущих общедоступных базах данных TCGA и GEO эксклюзивные данные по геномике NEN крайне скудны, а такие данные, как протеомика, эпиомика, метаболомика и визуализомика, почти отсутствуют. Поэтому необходимо срочно провести эксклюзивный мультиомный анализ больших данных NEN для всестороннего и глубокого изучения генеза и механизма развития нейроэндокринных опухолей.
Этот проект предназначен для анализа молекулярно-биологических характеристик NEN на основе мультиомного анализа, разработки эксклюзивной мультиомной платформы больших данных NEN и проведения молекулярных подтипов. Мы надеемся, что это исследование сможет найти молекулярный механизм и потенциальные мишени вмешательства для рецидива и метастазирования НЭН, а также предоставить клиницистам безопасные и эффективные стратегии лечения, тем самым улучшая терапевтический эффект нейроэндокринных опухолей.
Тип исследования
Регистрация (Ожидаемый)
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Xianjun Yu, MD, PhD
- Номер телефона: +86-13801669875
- Электронная почта: yuxianjun@fudanpci.org
Места учебы
-
-
Shanghai
-
Shanghai, Shanghai, Китай, 200032
- Department of Pancreatic Surgery, Fudan University Shanghai Cancer Center; Pancreatic Cancer Institute, Fudan University
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Полы, имеющие право на обучение
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- С января 2010 г. по январь 2021 г. проходил хирургическое лечение в онкологической больнице при Университете Фудань;
- Послеоперационная патология оказалась нейроэндокринной опухолью;
- Подписал форму информированного согласия на сбор образцов в банке тканей, соглашаясь использовать образцы и связанные с ними клинические данные для научных исследований.
Критерий исключения:
- Слияние других злокачественных опухолей;
- Клинические данные отсутствуют.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Только для случая
- Временные перспективы: Ретроспектива
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Гастроэнтеропанкреатические нейроэндокринные новообразования
|
Получить образцы, хранящиеся в банке тканей, основными типами образцов являются образцы RNAlater, образцы, замороженные жидким азотом, и образцы периферической крови.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Анализ механизма NEN на основе Multi-omics
Временное ограничение: Один год
|
Соберите образцы тканей NEN и образцы периферической крови для анализа геномики, транскриптомики, протеомики, фосфорилирования, метаболомики и других множественных омиков, чтобы найти взаимосвязь между этими молекулярными омиками и фенотипами, изучить механизм NEN, включая управляющие гены, активацию сигнальных путей. и т. д., а также проводить скрининг чувствительных препаратов на основе потенциальных мишеней.
Используйте мультиомные данные для создания платформы анализа больших данных NEN, включая прогнозирование чувствительных целей, прогнозирование родственных генов, анализ выживаемости и т. д.
|
Один год
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
NEN анализ иммунного микроокружения
Временное ограничение: Один год
|
Программное обеспечение GSVA и метод CIBORSORT используются для прогнозирования содержания и соотношения различных подтипов иммунных клеток на основе экспрессии мРНК NEN.
|
Один год
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Xianjun Yu, MD, PhD, Fudan University
Публикации и полезные ссылки
Общие публикации
- Lehmann BD, Jovanovic B, Chen X, Estrada MV, Johnson KN, Shyr Y, Moses HL, Sanders ME, Pietenpol JA. Refinement of Triple-Negative Breast Cancer Molecular Subtypes: Implications for Neoadjuvant Chemotherapy Selection. PLoS One. 2016 Jun 16;11(6):e0157368. doi: 10.1371/journal.pone.0157368. eCollection 2016.
- Cancer Genome Atlas Network. Comprehensive molecular characterization of human colon and rectal cancer. Nature. 2012 Jul 18;487(7407):330-7. doi: 10.1038/nature11252.
- Pavel M, Baudin E, Couvelard A, Krenning E, Oberg K, Steinmuller T, Anlauf M, Wiedenmann B, Salazar R; Barcelona Consensus Conference participants. ENETS Consensus Guidelines for the management of patients with liver and other distant metastases from neuroendocrine neoplasms of foregut, midgut, hindgut, and unknown primary. Neuroendocrinology. 2012;95(2):157-76. doi: 10.1159/000335597. Epub 2012 Feb 15. No abstract available.
- Alizadeh AA, Aranda V, Bardelli A, Blanpain C, Bock C, Borowski C, Caldas C, Califano A, Doherty M, Elsner M, Esteller M, Fitzgerald R, Korbel JO, Lichter P, Mason CE, Navin N, Pe'er D, Polyak K, Roberts CW, Siu L, Snyder A, Stower H, Swanton C, Verhaak RG, Zenklusen JC, Zuber J, Zucman-Rossi J. Toward understanding and exploiting tumor heterogeneity. Nat Med. 2015 Aug;21(8):846-53. doi: 10.1038/nm.3915.
- Hausser J, Alon U. Tumour heterogeneity and the evolutionary trade-offs of cancer. Nat Rev Cancer. 2020 Apr;20(4):247-257. doi: 10.1038/s41568-020-0241-6. Epub 2020 Feb 24.
- Halaburkova A, Cahais V, Novoloaca A, Araujo MGDS, Khoueiry R, Ghantous A, Herceg Z. Pan-cancer multi-omics analysis and orthogonal experimental assessment of epigenetic driver genes. Genome Res. 2020 Oct;30(10):1517-1532. doi: 10.1101/gr.268292.120. Epub 2020 Sep 22.
- Taber A, Christensen E, Lamy P, Nordentoft I, Prip F, Lindskrog SV, Birkenkamp-Demtroder K, Okholm TLH, Knudsen M, Pedersen JS, Steiniche T, Agerbaek M, Jensen JB, Dyrskjot L. Molecular correlates of cisplatin-based chemotherapy response in muscle invasive bladder cancer by integrated multi-omics analysis. Nat Commun. 2020 Sep 25;11(1):4858. doi: 10.1038/s41467-020-18640-0. Erratum In: Nat Commun. 2022 Apr 4;13(1):1916.
- Sailem HZ, Bakal C. Identification of clinically predictive metagenes that encode components of a network coupling cell shape to transcription by image-omics. Genome Res. 2017 Feb;27(2):196-207. doi: 10.1101/gr.202028.115. Epub 2016 Nov 18.
- Su H, Shen Y, Xing F, Qi X, Hirshfield KM, Yang L, Foran DJ. Robust automatic breast cancer staging using a combination of functional genomics and image-omics. Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2015;2015:7226-9. doi: 10.1109/EMBC.2015.7320059.
- Frilling A, Modlin IM, Kidd M, Russell C, Breitenstein S, Salem R, Kwekkeboom D, Lau WY, Klersy C, Vilgrain V, Davidson B, Siegler M, Caplin M, Solcia E, Schilsky R; Working Group on Neuroendocrine Liver Metastases. Recommendations for management of patients with neuroendocrine liver metastases. Lancet Oncol. 2014 Jan;15(1):e8-21. doi: 10.1016/S1470-2045(13)70362-0.
- Mayo SC, de Jong MC, Pulitano C, Clary BM, Reddy SK, Gamblin TC, Celinksi SA, Kooby DA, Staley CA, Stokes JB, Chu CK, Ferrero A, Schulick RD, Choti MA, Mentha G, Strub J, Bauer TW, Adams RB, Aldrighetti L, Capussotti L, Pawlik TM. Surgical management of hepatic neuroendocrine tumor metastasis: results from an international multi-institutional analysis. Ann Surg Oncol. 2010 Dec;17(12):3129-36. doi: 10.1245/s10434-010-1154-5. Epub 2010 Jun 29.
- Rindi G, D'Adda T, Froio E, Fellegara G, Bordi C. Prognostic factors in gastrointestinal endocrine tumors. Endocr Pathol. 2007 Fall;18(3):145-9. doi: 10.1007/s12022-007-0020-x.
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Ожидаемый)
Первичное завершение (Ожидаемый)
Завершение исследования (Ожидаемый)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- CSPAC-NEN-2
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .