- ICH GCP
- USA klinikai vizsgálatok nyilvántartása
- Klinikai vizsgálat NCT04931446
Neuroendokrin neoplazma Multi-omics integrált elemzés alapján
Neuroendokrin neoplazma kutatása egyetlen központban multi-omics integrált elemzés alapján
A tanulmány áttekintése
Állapot
Körülmények
Beavatkozás / kezelés
Részletes leírás
Az elmúlt években a nagy áteresztőképességű szekvenálási technológia innovációja nagyban elősegítette a betegségmechanizmusok molekuláris szintű megértését. Vitathatatlan tény, hogy a klinikailag azonos patológiás típusú és stádiumú daganatok prognózisában nagy különbségek vannak. Számos tanulmány igazolta, hogy a prognózisbeli különbség szorosan összefügg a daganat heterogenitásával. Az elmúlt néhány évben az egyénre szabott precíziós kezelés nagymértékben javíthatja a betegek prognózisát. Tanulmányok kimutatták, hogy a vastagbélrák szomatikus mutációk és szignálút aktiválás alapján történő alcsoportos osztályozása a TCGA adatbázisban nagymértékben javította a diagnózis pontosságát és a kezelés hatékonyságát. Lehmann csapata a mintákat hat típusra osztotta a hármas negatív emlőrák génexpressziós profilja alapján: immunmodulátor típusú, mezenchimális típus, mezenchimális szár-szerű típus, androgén receptor típusú és két bazális típusú típus. Ez a tipizálási módszer egyesíti a normál mátrix és az immunsejtek transzkripciós szintjének szerepét a tumor mikrokörnyezetében, és feltárja ezek klinikai jellemzőit és kezelési stratégiáit különböző altípusok szerint. Azonban egyetlen ómikus sem elegendő a daganatok összetett patogenezisének tisztázásához. Ezért a többszörös omika integrált elemzése olyan fejlődési irány, amely segít tisztázni a daganatok patogenezisét és feltárni a lehetséges gyógyszeres kezelési célpontokat. A fenotípusos adatok és a molekuláris omikai adatok interaktív elemzése nemcsak a biológiai fenotípusok és a molekuláris fenotípusok közötti összefüggések elemzésében segíthet, hanem lehetővé teszi a makrobiológiai fenotípusok mikroszkopikus molekuláris mechanizmusának megértését is. A CT-n és MRI-n alapuló képalkotó fenotípusok például felhasználhatók a velük kapcsolatos fontos fehérjemarkerek feltárására, ami kísérleti és elméleti alapot ad a jövőbeni klinikai gyógyszer-célzott terápia és gyógyszerrezisztencia-mechanizmus kutatásának iránymutatásához. Ami még érdekesebb, hogy a daganatok molekuláris omika alapján történő molekuláris osztályozása és a fenotípusos felismerési modellek, például a képalkotó omika létrehozása közötti kapcsolat az olyan fenotípusokat, mint a képalkotó omika, a célzott tumorterápia útmutatójává is teheti. Fontos módszer. Ezért a nagyfokú heterogenitású neuroendokrin daganatok esetében nagyon szükséges a többszörös omika szemszögéből történő elemzésük. A jelenlegi nyilvános adatbázisokban (TCGA és GEO) azonban az exkluzív NEN genomikai adatok rendkívül szűkösek, és szinte nincsenek olyan adatok, mint a proteomika, epiomika, metabolomika és képalkotás. Ezért sürgősen exkluzív NEN multi-omics big data elemzést kell végezni a neuroendokrin daganatok genezisének és fejlődési mechanizmusának átfogó és mélyreható tanulmányozása érdekében.
A projekt célja a NEN molekuláris biológiai jellemzőinek multi-omics elemzésen alapuló elemzése, exkluzív NEN multi-omics big data platform kifejlesztése, valamint molekuláris altípusok kivitelezése. Reméljük, hogy ez a tanulmány megtalálja az NEN kiújulásának és metasztázisának molekuláris mechanizmusát és lehetséges beavatkozási célpontjait, és biztonságos és hatékony kezelési stratégiákat kínál a klinikusok számára, ezáltal javítva a neuroendokrin daganatok terápiás hatását.
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Várható)
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi kapcsolat
- Név: Xianjun Yu, MD, PhD
- Telefonszám: +86-13801669875
- E-mail: yuxianjun@fudanpci.org
Tanulmányi helyek
-
-
Shanghai
-
Shanghai, Shanghai, Kína, 200032
- Department of Pancreatic Surgery, Fudan University Shanghai Cancer Center; Pancreatic Cancer Institute, Fudan University
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
Egészséges önkénteseket fogad
Tanulmányozható nemek
Mintavételi módszer
Tanulmányi populáció
Leírás
Bevételi kritériumok:
- 2010 januárja és 2021 januárja között sebészeti kezelésben részesült a Fudan Egyetemi Rákkórházban;
- A posztoperatív patológia neuroendokrin daganatnak bizonyult;
- Aláírt egy tájékozott beleegyező nyilatkozatot a szövetbanki mintagyűjtéshez, és beleegyezik abba, hogy a mintákat és a kapcsolódó klinikai adatokat tudományos kutatáshoz felhasználja.
Kizárási kritériumok:
- Más rosszindulatú daganatok egyesítése;
- Hiányoznak a klinikai adatok.
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
- Megfigyelési modellek: Csak esetre
- Időperspektívák: Visszatekintő
Kohorszok és beavatkozások
Csoport / Kohorsz |
Beavatkozás / kezelés |
---|---|
Gastroenteropancreas neuroendokrin neoplazmák
|
A szövetbankban tárolt minták lekérése, a fő minták az RNAlater minták, a folyékony nitrogénnel fagyasztott minták és a perifériás vérminták
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
---|---|---|
NEN mechanizmus elemzés Multi-omics alapján
Időkeret: Egy év
|
Gyűjtsön NEN szövetmintákat és perifériás vérmintákat genomika, transzkriptomika, proteomika, foszforiláció, metabolomika és más többszörös omika szekvenálási elemzéshez, hogy megtalálja a kapcsolatot e molekuláris omikák és fenotípusok között, feltárja a NEN mechanizmust, beleértve a vezető géneket, és a jelutak aktiválását stb., és szűrje ki az érzékeny gyógyszereket a lehetséges célpontok alapján.
Használjon multi-omics adatokat a NEN big data elemzési platform létrehozásához, beleértve az érzékeny célpont előrejelzését, a kapcsolódó gén-előrejelzést, a túlélési elemzést és így tovább.
|
Egy év
|
Másodlagos eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
---|---|---|
NEN immun mikrokörnyezet elemzés
Időkeret: Egy év
|
A GSVA szoftverrel és a CIBORSORT módszerrel a NEN mRNS expressziója alapján megjósolják a különböző immunsejt-altípusok tartalmát és arányát.
|
Egy év
|
Együttműködők és nyomozók
Szponzor
Nyomozók
- Kutatásvezető: Xianjun Yu, MD, PhD, Fudan University
Publikációk és hasznos linkek
Általános kiadványok
- Lehmann BD, Jovanovic B, Chen X, Estrada MV, Johnson KN, Shyr Y, Moses HL, Sanders ME, Pietenpol JA. Refinement of Triple-Negative Breast Cancer Molecular Subtypes: Implications for Neoadjuvant Chemotherapy Selection. PLoS One. 2016 Jun 16;11(6):e0157368. doi: 10.1371/journal.pone.0157368. eCollection 2016.
- Cancer Genome Atlas Network. Comprehensive molecular characterization of human colon and rectal cancer. Nature. 2012 Jul 18;487(7407):330-7. doi: 10.1038/nature11252.
- Pavel M, Baudin E, Couvelard A, Krenning E, Oberg K, Steinmuller T, Anlauf M, Wiedenmann B, Salazar R; Barcelona Consensus Conference participants. ENETS Consensus Guidelines for the management of patients with liver and other distant metastases from neuroendocrine neoplasms of foregut, midgut, hindgut, and unknown primary. Neuroendocrinology. 2012;95(2):157-76. doi: 10.1159/000335597. Epub 2012 Feb 15. No abstract available.
- Alizadeh AA, Aranda V, Bardelli A, Blanpain C, Bock C, Borowski C, Caldas C, Califano A, Doherty M, Elsner M, Esteller M, Fitzgerald R, Korbel JO, Lichter P, Mason CE, Navin N, Pe'er D, Polyak K, Roberts CW, Siu L, Snyder A, Stower H, Swanton C, Verhaak RG, Zenklusen JC, Zuber J, Zucman-Rossi J. Toward understanding and exploiting tumor heterogeneity. Nat Med. 2015 Aug;21(8):846-53. doi: 10.1038/nm.3915.
- Hausser J, Alon U. Tumour heterogeneity and the evolutionary trade-offs of cancer. Nat Rev Cancer. 2020 Apr;20(4):247-257. doi: 10.1038/s41568-020-0241-6. Epub 2020 Feb 24.
- Halaburkova A, Cahais V, Novoloaca A, Araujo MGDS, Khoueiry R, Ghantous A, Herceg Z. Pan-cancer multi-omics analysis and orthogonal experimental assessment of epigenetic driver genes. Genome Res. 2020 Oct;30(10):1517-1532. doi: 10.1101/gr.268292.120. Epub 2020 Sep 22.
- Taber A, Christensen E, Lamy P, Nordentoft I, Prip F, Lindskrog SV, Birkenkamp-Demtroder K, Okholm TLH, Knudsen M, Pedersen JS, Steiniche T, Agerbaek M, Jensen JB, Dyrskjot L. Molecular correlates of cisplatin-based chemotherapy response in muscle invasive bladder cancer by integrated multi-omics analysis. Nat Commun. 2020 Sep 25;11(1):4858. doi: 10.1038/s41467-020-18640-0. Erratum In: Nat Commun. 2022 Apr 4;13(1):1916.
- Sailem HZ, Bakal C. Identification of clinically predictive metagenes that encode components of a network coupling cell shape to transcription by image-omics. Genome Res. 2017 Feb;27(2):196-207. doi: 10.1101/gr.202028.115. Epub 2016 Nov 18.
- Su H, Shen Y, Xing F, Qi X, Hirshfield KM, Yang L, Foran DJ. Robust automatic breast cancer staging using a combination of functional genomics and image-omics. Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2015;2015:7226-9. doi: 10.1109/EMBC.2015.7320059.
- Frilling A, Modlin IM, Kidd M, Russell C, Breitenstein S, Salem R, Kwekkeboom D, Lau WY, Klersy C, Vilgrain V, Davidson B, Siegler M, Caplin M, Solcia E, Schilsky R; Working Group on Neuroendocrine Liver Metastases. Recommendations for management of patients with neuroendocrine liver metastases. Lancet Oncol. 2014 Jan;15(1):e8-21. doi: 10.1016/S1470-2045(13)70362-0.
- Mayo SC, de Jong MC, Pulitano C, Clary BM, Reddy SK, Gamblin TC, Celinksi SA, Kooby DA, Staley CA, Stokes JB, Chu CK, Ferrero A, Schulick RD, Choti MA, Mentha G, Strub J, Bauer TW, Adams RB, Aldrighetti L, Capussotti L, Pawlik TM. Surgical management of hepatic neuroendocrine tumor metastasis: results from an international multi-institutional analysis. Ann Surg Oncol. 2010 Dec;17(12):3129-36. doi: 10.1245/s10434-010-1154-5. Epub 2010 Jun 29.
- Rindi G, D'Adda T, Froio E, Fellegara G, Bordi C. Prognostic factors in gastrointestinal endocrine tumors. Endocr Pathol. 2007 Fall;18(3):145-9. doi: 10.1007/s12022-007-0020-x.
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Várható)
Elsődleges befejezés (Várható)
A tanulmány befejezése (Várható)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (Tényleges)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- CSPAC-NEN-2
Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)
Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .