- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT04931446
Nevroendokrin neoplasma basert på multi-omics integrert analyse
Forskning på nevroendokrin neoplasma i et enkelt senter basert på multi-omics integrert analyse
Studieoversikt
Status
Forhold
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
De siste årene har innovasjonen av høykapasitets sekvenseringsteknologi i stor grad fremmet forståelsen av sykdomsmekanismer på molekylært nivå. Det er et udiskutabelt faktum at det er store forskjeller i prognosen for svulster med samme patologiske type og stadium klinisk. Et stort antall studier har vist at forskjellen i prognose er nært knyttet til svulstens heterogenitet. I løpet av de siste årene har individualisert presisjonsbehandling i stor grad forbedret prognosen til pasienter. Studier har vist at undergruppeklassifisering av tykktarmskreft basert på somatiske mutasjoner og signalveiaktivering i TCGA-databasen har forbedret nøyaktigheten av diagnosen og effektiviteten av behandlingen. Lehmanns team delte prøvene inn i seks typer basert på genekspresjonsprofilen til trippelnegativ brystkreft: immunmodulerende type, mesenkymal type, mesenkymal stammelignende type, androgenreseptortype og to basallignende typer. Denne typemetoden kombinerer rollen til normale matrise- og immuncelletranskripsjonsnivåer i tumormikromiljøet, og utforsker deres kliniske egenskaper og behandlingsstrategier i henhold til forskjellige undertyper. Imidlertid er ingen enkelt omics tilstrekkelig til å belyse den komplekse patogenesen til svulster. Derfor er den integrerte analysen av flere omics en utviklingstrend, som vil bidra til å klargjøre patogenesen til svulster og oppdage potensielle mål for medikamentell behandling. Den interaktive analysen av fenotypiske data og molekylære omikkdata kan ikke bare hjelpe oss med å analysere sammenhengen mellom biologiske fenotyper og molekylære fenotyper, men også tillate oss å forstå den mikroskopiske molekylære mekanismen til makrobiologiske fenotyper. For eksempel kan avbildningsfenotyper basert på CT og MR brukes til å utforske viktige proteinmarkører relatert til dem, noe som gir eksperimentelt og teoretisk grunnlag for å veilede fremtidig klinisk medikamentmålrettet terapi og forskning på legemiddelresistensmekanismer. Det som er mer interessant er at forholdet mellom molekylær klassifisering av svulster basert på molekylær omics og etablering av fenotypiske gjenkjennelsesmodeller som imaging omics også kan gjøre at fenotypiske som imaging omics blir en guide for målrettet tumorterapi. En viktig metode. Derfor, for nevroendokrine svulster med høy grad av heterogenitet, er det svært nødvendig å analysere dem fra perspektivet til flere omics. I de nåværende offentlige databasene TCGA og GEO er imidlertid de eksklusive NEN-genomikkdataene ekstremt knappe, og det er nesten ingen data som proteomikk, epiomikk, metabolomikk og imagingomikk. Derfor haster det med å utføre eksklusiv NEN multi-omics big data-analyse for omfattende og dyptgående studier av opprinnelsen og utviklingsmekanismen til nevroendokrine svulster.
Dette prosjektet har til hensikt å analysere de molekylærbiologiske egenskapene til NEN basert på multi-omics-analyse, utvikle en eksklusiv NEN multi-omics big data-plattform og utføre molekylære subtyper. Vi håper at denne studien kan finne den molekylære mekanismen og potensielle intervensjonsmål for NEN-residiv og metastaser, og gi klinikere sikre og effektive behandlingsstrategier, og dermed forbedre den terapeutiske effekten av nevroendokrine svulster.
Studietype
Registrering (Forventet)
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
- Navn: Xianjun Yu, MD, PhD
- Telefonnummer: +86-13801669875
- E-post: yuxianjun@fudanpci.org
Studiesteder
-
-
Shanghai
-
Shanghai, Shanghai, Kina, 200032
- Department of Pancreatic Surgery, Fudan University Shanghai Cancer Center; Pancreatic Cancer Institute, Fudan University
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
Tar imot friske frivillige
Kjønn som er kvalifisert for studier
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Mottok kirurgisk behandling ved Fudan University Affiliated Cancer Hospital fra januar 2010 til januar 2021;
- Postoperativ patologi viste seg å være nevroendokrin svulst;
- Har signert et informert samtykkeskjema for innsamling av vevsbankprøver, og godtar å bruke prøvene og relaterte kliniske data til vitenskapelig forskning.
Ekskluderingskriterier:
- Slå sammen andre ondartede svulster;
- De kliniske dataene mangler.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Bare etui
- Tidsperspektiver: Retrospektiv
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Gastroenteropankreatiske nevroendokrine neoplasmer
|
Hent prøver lagret i vevsbanken, hovedtypene av prøver er RNAlater-prøver, flytende nitrogen frosne prøver og perifere blodprøver
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
NEN-mekanismeanalyse basert på Multi-omics
Tidsramme: Ett år
|
Samle NEN-vevsprøver og perifere blodprøver for genomikk, transkriptomikk, proteomikk, fosforylering, metabolomikk og annen multippel omics-sekvenseringsanalyse, for å finne forholdet mellom disse molekylære omics og fenotyper, utforske NEN-mekanismen, inkludert drivergener, aktivering av signalveier , etc., og screene sensitive legemidler basert på potensielle mål.
Bruk multi-omics-data for å etablere NEN stordataanalyseplattform, inkludert sensitiv målprediksjon, relatert genprediksjon, overlevelsesanalyse og så videre.
|
Ett år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
NEN immunmikromiljøanalyse
Tidsramme: Ett år
|
GSVA-programvaren og CIBORSORT-metoden brukes til å forutsi innholdet og forholdet til ulike immuncellesubtyper basert på NEN mRNA-ekspresjon.
|
Ett år
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Xianjun Yu, MD, PhD, Fudan University
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Lehmann BD, Jovanovic B, Chen X, Estrada MV, Johnson KN, Shyr Y, Moses HL, Sanders ME, Pietenpol JA. Refinement of Triple-Negative Breast Cancer Molecular Subtypes: Implications for Neoadjuvant Chemotherapy Selection. PLoS One. 2016 Jun 16;11(6):e0157368. doi: 10.1371/journal.pone.0157368. eCollection 2016.
- Cancer Genome Atlas Network. Comprehensive molecular characterization of human colon and rectal cancer. Nature. 2012 Jul 18;487(7407):330-7. doi: 10.1038/nature11252.
- Pavel M, Baudin E, Couvelard A, Krenning E, Oberg K, Steinmuller T, Anlauf M, Wiedenmann B, Salazar R; Barcelona Consensus Conference participants. ENETS Consensus Guidelines for the management of patients with liver and other distant metastases from neuroendocrine neoplasms of foregut, midgut, hindgut, and unknown primary. Neuroendocrinology. 2012;95(2):157-76. doi: 10.1159/000335597. Epub 2012 Feb 15. No abstract available.
- Alizadeh AA, Aranda V, Bardelli A, Blanpain C, Bock C, Borowski C, Caldas C, Califano A, Doherty M, Elsner M, Esteller M, Fitzgerald R, Korbel JO, Lichter P, Mason CE, Navin N, Pe'er D, Polyak K, Roberts CW, Siu L, Snyder A, Stower H, Swanton C, Verhaak RG, Zenklusen JC, Zuber J, Zucman-Rossi J. Toward understanding and exploiting tumor heterogeneity. Nat Med. 2015 Aug;21(8):846-53. doi: 10.1038/nm.3915.
- Hausser J, Alon U. Tumour heterogeneity and the evolutionary trade-offs of cancer. Nat Rev Cancer. 2020 Apr;20(4):247-257. doi: 10.1038/s41568-020-0241-6. Epub 2020 Feb 24.
- Halaburkova A, Cahais V, Novoloaca A, Araujo MGDS, Khoueiry R, Ghantous A, Herceg Z. Pan-cancer multi-omics analysis and orthogonal experimental assessment of epigenetic driver genes. Genome Res. 2020 Oct;30(10):1517-1532. doi: 10.1101/gr.268292.120. Epub 2020 Sep 22.
- Taber A, Christensen E, Lamy P, Nordentoft I, Prip F, Lindskrog SV, Birkenkamp-Demtroder K, Okholm TLH, Knudsen M, Pedersen JS, Steiniche T, Agerbaek M, Jensen JB, Dyrskjot L. Molecular correlates of cisplatin-based chemotherapy response in muscle invasive bladder cancer by integrated multi-omics analysis. Nat Commun. 2020 Sep 25;11(1):4858. doi: 10.1038/s41467-020-18640-0. Erratum In: Nat Commun. 2022 Apr 4;13(1):1916.
- Sailem HZ, Bakal C. Identification of clinically predictive metagenes that encode components of a network coupling cell shape to transcription by image-omics. Genome Res. 2017 Feb;27(2):196-207. doi: 10.1101/gr.202028.115. Epub 2016 Nov 18.
- Su H, Shen Y, Xing F, Qi X, Hirshfield KM, Yang L, Foran DJ. Robust automatic breast cancer staging using a combination of functional genomics and image-omics. Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2015;2015:7226-9. doi: 10.1109/EMBC.2015.7320059.
- Frilling A, Modlin IM, Kidd M, Russell C, Breitenstein S, Salem R, Kwekkeboom D, Lau WY, Klersy C, Vilgrain V, Davidson B, Siegler M, Caplin M, Solcia E, Schilsky R; Working Group on Neuroendocrine Liver Metastases. Recommendations for management of patients with neuroendocrine liver metastases. Lancet Oncol. 2014 Jan;15(1):e8-21. doi: 10.1016/S1470-2045(13)70362-0.
- Mayo SC, de Jong MC, Pulitano C, Clary BM, Reddy SK, Gamblin TC, Celinksi SA, Kooby DA, Staley CA, Stokes JB, Chu CK, Ferrero A, Schulick RD, Choti MA, Mentha G, Strub J, Bauer TW, Adams RB, Aldrighetti L, Capussotti L, Pawlik TM. Surgical management of hepatic neuroendocrine tumor metastasis: results from an international multi-institutional analysis. Ann Surg Oncol. 2010 Dec;17(12):3129-36. doi: 10.1245/s10434-010-1154-5. Epub 2010 Jun 29.
- Rindi G, D'Adda T, Froio E, Fellegara G, Bordi C. Prognostic factors in gastrointestinal endocrine tumors. Endocr Pathol. 2007 Fall;18(3):145-9. doi: 10.1007/s12022-007-0020-x.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Forventet)
Primær fullføring (Forventet)
Studiet fullført (Forventet)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- CSPAC-NEN-2
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .