- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT04931446
Neuroendokrin neoplasma baseret på multi-omics integreret analyse
Forskning i neuroendokrin neoplasma i et enkelt center baseret på multi-omics integreret analyse
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
I de senere år har innovationen af high-throughput sekventeringsteknologi i høj grad fremmet forståelsen af sygdomsmekanismer på molekylært niveau. Det er et ubestrideligt faktum, at der er store forskelle i prognosen for tumorer med samme patologiske type og stadium klinisk. Et stort antal undersøgelser har vist, at forskellen i prognose er tæt forbundet med tumorens heterogenitet. I de seneste par år har individualiseret præcisionsbehandling i høj grad kunne forbedre patienternes prognose. Undersøgelser har vist, at undergruppeklassificering af tyktarmskræft baseret på somatiske mutationer og signalvejsaktivering i TCGA-databasen i høj grad har forbedret nøjagtigheden af diagnosen og behandlingens effektivitet. Lehmanns team opdelte prøverne i seks typer baseret på genekspressionsprofilen for triple-negativ brystkræft: immunmodulerende type, mesenchymal type, mesenchymal stilklignende type, androgenreceptortype og to basallignende typer. Denne typebestemmelsesmetode kombinerer rollen som normale matrix- og immuncelletransskriptionsniveauer i tumormikromiljøet og udforsker deres kliniske karakteristika og behandlingsstrategier i henhold til forskellige undertyper. Imidlertid er ingen enkelt omics tilstrækkelig til at belyse den komplekse patogenese af tumorer. Derfor er den integrerede analyse af flere omics en udviklingstendens, som vil hjælpe med at afklare patogenesen af tumorer og opdage potentielle lægemiddelbehandlingsmål. Den interaktive analyse af fænotypiske data og molekylære omics-data kan ikke kun hjælpe os med at analysere sammenhængen mellem biologiske fænotyper og molekylære fænotyper, men også give os mulighed for at forstå den mikroskopiske molekylære mekanisme af makrobiologiske fænotyper. For eksempel kan billeddannelsesfænotyper baseret på CT og MRI bruges til at udforske vigtige proteinmarkører relateret til dem, hvilket giver eksperimentelt og teoretisk grundlag for at vejlede fremtidig klinisk lægemiddelmålrettet terapi og forskning i lægemiddelresistensmekanismer. Hvad der er mere interessant er, at forholdet mellem molekylær klassificering af tumorer baseret på molekylær omics og etableringen af fænotypiske genkendelsesmodeller såsom billeddiagnostik også kan få fænotypi såsom billeddiagnostik til at blive en guide for målrettet tumorterapi. En vigtig metode. For neuroendokrine tumorer med en høj grad af heterogenitet er det derfor meget nødvendigt at analysere dem fra flere omics perspektiv. Men i de nuværende offentlige databaser TCGA og GEO er de eksklusive NEN-genomiske data ekstremt knappe, og der er næsten ingen data såsom proteomics, epiomics, metabolomics og imagingomics. Derfor er det presserende at udføre eksklusiv NEN multi-omics big data-analyse for omfattende og dybdegående undersøgelse af genese og udviklingsmekanisme af neuroendokrine tumorer.
Dette projekt har til hensigt at analysere NENs molekylærbiologiske karakteristika baseret på multi-omics analyse, udvikle en eksklusiv NEN multi-omics big data platform og udføre molekylære subtyper. Vi håber, at denne undersøgelse kan finde den molekylære mekanisme og potentielle interventionsmål for NEN-tilbagefald og metastaser og give klinikere sikre og effektive behandlingsstrategier og derved forbedre den terapeutiske effekt af neuroendokrine tumorer.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Forventet)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: Xianjun Yu, MD, PhD
- Telefonnummer: +86-13801669875
- E-mail: yuxianjun@fudanpci.org
Studiesteder
-
-
Shanghai
-
Shanghai, Shanghai, Kina, 200032
- Department of Pancreatic Surgery, Fudan University Shanghai Cancer Center; Pancreatic Cancer Institute, Fudan University
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Modtog kirurgisk behandling på Fudan University Affiliated Cancer Hospital fra januar 2010 til januar 2021;
- Postoperativ patologi viste sig at være neuroendokrin tumor;
- Har underskrevet en informeret samtykkeformular til indsamling af vævsbankprøver og accepterer at bruge prøverne og relaterede kliniske data til videnskabelig forskning.
Ekskluderingskriterier:
- Sammenflet andre ondartede tumorer;
- De kliniske data mangler.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kun etui
- Tidsperspektiver: Tilbagevirkende kraft
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Gastroenteropancreatiske neuroendokrine neoplasmer
|
Hent prøver gemt i vævsbanken, hovedtyperne af prøver er RNAlatere prøver, flydende nitrogen frosne prøver og perifere blodprøver
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
NEN-mekanismeanalyse baseret på Multi-omics
Tidsramme: Et år
|
Indsaml NEN-vævsprøver og perifere blodprøver til genomik, transkriptomik, proteomik, phosphorylering, metabolomics og andre multiple omics-sekventeringsanalyser for at finde forholdet mellem disse molekylære omics og fænotyper, udforske NEN-mekanismen, herunder drivergener, aktivering af signalveje osv., og screene følsomme lægemidler baseret på potentielle mål.
Brug multi-omics-data til at etablere NEN big data-analyseplatform, herunder forudsigelse af sensitive mål, relateret genforudsigelse, overlevelsesanalyse og så videre.
|
Et år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
NEN immun mikromiljøanalyse
Tidsramme: Et år
|
GSVA-softwaren og CIBORSORT-metoden bruges til at forudsige indholdet og forholdet mellem forskellige immuncelleundertyper baseret på NEN-mRNA-ekspression.
|
Et år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Xianjun Yu, MD, PhD, Fudan University
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Lehmann BD, Jovanovic B, Chen X, Estrada MV, Johnson KN, Shyr Y, Moses HL, Sanders ME, Pietenpol JA. Refinement of Triple-Negative Breast Cancer Molecular Subtypes: Implications for Neoadjuvant Chemotherapy Selection. PLoS One. 2016 Jun 16;11(6):e0157368. doi: 10.1371/journal.pone.0157368. eCollection 2016.
- Cancer Genome Atlas Network. Comprehensive molecular characterization of human colon and rectal cancer. Nature. 2012 Jul 18;487(7407):330-7. doi: 10.1038/nature11252.
- Pavel M, Baudin E, Couvelard A, Krenning E, Oberg K, Steinmuller T, Anlauf M, Wiedenmann B, Salazar R; Barcelona Consensus Conference participants. ENETS Consensus Guidelines for the management of patients with liver and other distant metastases from neuroendocrine neoplasms of foregut, midgut, hindgut, and unknown primary. Neuroendocrinology. 2012;95(2):157-76. doi: 10.1159/000335597. Epub 2012 Feb 15. No abstract available.
- Alizadeh AA, Aranda V, Bardelli A, Blanpain C, Bock C, Borowski C, Caldas C, Califano A, Doherty M, Elsner M, Esteller M, Fitzgerald R, Korbel JO, Lichter P, Mason CE, Navin N, Pe'er D, Polyak K, Roberts CW, Siu L, Snyder A, Stower H, Swanton C, Verhaak RG, Zenklusen JC, Zuber J, Zucman-Rossi J. Toward understanding and exploiting tumor heterogeneity. Nat Med. 2015 Aug;21(8):846-53. doi: 10.1038/nm.3915.
- Hausser J, Alon U. Tumour heterogeneity and the evolutionary trade-offs of cancer. Nat Rev Cancer. 2020 Apr;20(4):247-257. doi: 10.1038/s41568-020-0241-6. Epub 2020 Feb 24.
- Halaburkova A, Cahais V, Novoloaca A, Araujo MGDS, Khoueiry R, Ghantous A, Herceg Z. Pan-cancer multi-omics analysis and orthogonal experimental assessment of epigenetic driver genes. Genome Res. 2020 Oct;30(10):1517-1532. doi: 10.1101/gr.268292.120. Epub 2020 Sep 22.
- Taber A, Christensen E, Lamy P, Nordentoft I, Prip F, Lindskrog SV, Birkenkamp-Demtroder K, Okholm TLH, Knudsen M, Pedersen JS, Steiniche T, Agerbaek M, Jensen JB, Dyrskjot L. Molecular correlates of cisplatin-based chemotherapy response in muscle invasive bladder cancer by integrated multi-omics analysis. Nat Commun. 2020 Sep 25;11(1):4858. doi: 10.1038/s41467-020-18640-0. Erratum In: Nat Commun. 2022 Apr 4;13(1):1916.
- Sailem HZ, Bakal C. Identification of clinically predictive metagenes that encode components of a network coupling cell shape to transcription by image-omics. Genome Res. 2017 Feb;27(2):196-207. doi: 10.1101/gr.202028.115. Epub 2016 Nov 18.
- Su H, Shen Y, Xing F, Qi X, Hirshfield KM, Yang L, Foran DJ. Robust automatic breast cancer staging using a combination of functional genomics and image-omics. Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2015;2015:7226-9. doi: 10.1109/EMBC.2015.7320059.
- Frilling A, Modlin IM, Kidd M, Russell C, Breitenstein S, Salem R, Kwekkeboom D, Lau WY, Klersy C, Vilgrain V, Davidson B, Siegler M, Caplin M, Solcia E, Schilsky R; Working Group on Neuroendocrine Liver Metastases. Recommendations for management of patients with neuroendocrine liver metastases. Lancet Oncol. 2014 Jan;15(1):e8-21. doi: 10.1016/S1470-2045(13)70362-0.
- Mayo SC, de Jong MC, Pulitano C, Clary BM, Reddy SK, Gamblin TC, Celinksi SA, Kooby DA, Staley CA, Stokes JB, Chu CK, Ferrero A, Schulick RD, Choti MA, Mentha G, Strub J, Bauer TW, Adams RB, Aldrighetti L, Capussotti L, Pawlik TM. Surgical management of hepatic neuroendocrine tumor metastasis: results from an international multi-institutional analysis. Ann Surg Oncol. 2010 Dec;17(12):3129-36. doi: 10.1245/s10434-010-1154-5. Epub 2010 Jun 29.
- Rindi G, D'Adda T, Froio E, Fellegara G, Bordi C. Prognostic factors in gastrointestinal endocrine tumors. Endocr Pathol. 2007 Fall;18(3):145-9. doi: 10.1007/s12022-007-0020-x.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Forventet)
Primær færdiggørelse (Forventet)
Studieafslutning (Forventet)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- CSPAC-NEN-2
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .