- ICH GCP
- Register voor klinische proeven in de VS.
- Klinische proef NCT04931446
Neuro-endocrien neoplasma op basis van multi-omics geïntegreerde analyse
Onderzoek naar neuro-endocrien neoplasma in een enkel centrum op basis van multi-omics geïntegreerde analyse
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
In de afgelopen jaren heeft de innovatie van high-throughput sequencing-technologie het begrip van ziektemechanismen op moleculair niveau enorm bevorderd. Het is een onbetwistbaar feit dat er grote verschillen zijn in de prognose van tumoren met hetzelfde pathologische type en klinisch stadium. Een groot aantal studies heeft aangetoond dat het verschil in prognose nauw verband houdt met de heterogeniteit van de tumor. In de afgelopen jaren kan geïndividualiseerde precisiebehandeling de prognose van patiënten aanzienlijk verbeteren. Studies hebben aangetoond dat subgroepclassificatie van colorectale kanker op basis van somatische mutaties en activering van signaalroutes in de TCGA-database de nauwkeurigheid van de diagnose en de effectiviteit van de behandeling aanzienlijk heeft verbeterd. Het team van Lehmann verdeelde de monsters in zes typen op basis van het genexpressieprofiel van triple-negatieve borstkanker: immunomodulerend type, mesenchymaal type, mesenchymaal stamachtig type, androgeenreceptortype en twee basaalachtige typen. Deze typeringsmethode combineert de rol van normale matrix- en immuunceltranscriptieniveaus in de micro-omgeving van de tumor en onderzoekt hun klinische kenmerken en behandelingsstrategieën volgens verschillende subtypes. Geen enkele omics is echter voldoende om de complexe pathogenese van tumoren op te helderen. Daarom is de geïntegreerde analyse van meerdere omics een ontwikkelingstrend, die zal helpen de pathogenese van tumoren te verduidelijken en potentiële medicamenteuze behandelingsdoelen te ontdekken. De interactieve analyse van fenotypische gegevens en moleculaire omics-gegevens kan ons niet alleen helpen de correlatie tussen biologische fenotypes en moleculaire fenotypes te analyseren, maar stelt ons ook in staat het microscopische moleculaire mechanisme van macrobiologische fenotypes te begrijpen. Beeldvormende fenotypes op basis van CT en MRI kunnen bijvoorbeeld worden gebruikt om belangrijke eiwitmarkers te verkennen die daarmee verband houden, wat een experimentele en theoretische basis vormt voor het begeleiden van toekomstige klinische geneesmiddelengerichte therapie en onderzoek naar geneesmiddelenresistentiemechanismen. Wat interessanter is, is dat de relatie tussen moleculaire classificatie van tumoren op basis van moleculaire omics en het opzetten van fenotypische herkenningsmodellen zoals imaging omics er ook voor kan zorgen dat fenotypics zoals imaging omics een leidraad worden voor gerichte tumortherapie. Een belangrijke methode. Daarom is het voor neuro-endocriene tumoren met een hoge mate van heterogeniteit zeer noodzakelijk om ze te analyseren vanuit het perspectief van meerdere omics. In de huidige openbare databases TCGA en GEO zijn de exclusieve NEN-genomics-gegevens echter uiterst schaars en zijn er bijna geen gegevens zoals proteomics, epiomics, metabolomics en imagingomics. Daarom is het dringend noodzakelijk om exclusieve NEN multi-omics big data-analyse uit te voeren om het ontstaans- en ontwikkelingsmechanisme van neuro-endocriene tumoren uitgebreid en diepgaand te bestuderen.
Dit project heeft tot doel de moleculair biologische kenmerken van NEN te analyseren op basis van multi-omics analyse, een exclusief NEN multi-omics big data platform te ontwikkelen en moleculaire subtypes uit te voeren. We hopen dat deze studie het moleculaire mechanisme en mogelijke interventiedoelen van NEN-recidief en metastase kan vinden, en clinici veilige en effectieve behandelstrategieën kan bieden, waardoor het therapeutische effect van neuro-endocriene tumoren wordt verbeterd.
Studietype
Inschrijving (Verwacht)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Xianjun Yu, MD, PhD
- Telefoonnummer: +86-13801669875
- E-mail: yuxianjun@fudanpci.org
Studie Locaties
-
-
Shanghai
-
Shanghai, Shanghai, China, 200032
- Department of Pancreatic Surgery, Fudan University Shanghai Cancer Center; Pancreatic Cancer Institute, Fudan University
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Chirurgische behandeling ondergaan in het Fudan University Affiliated Cancer Hospital van januari 2010 tot januari 2021;
- Postoperatieve pathologie bleek een neuro-endocriene tumor te zijn;
- Heeft een formulier voor geïnformeerde toestemming ondertekend voor het verzamelen van weefselbankmonsters, waarmee hij ermee instemt de monsters en gerelateerde klinische gegevens te gebruiken voor wetenschappelijk onderzoek.
Uitsluitingscriteria:
- Voeg andere kwaadaardige tumoren samen;
- De klinische gegevens ontbreken.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Case-Alleen
- Tijdsperspectieven: Retrospectief
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Gastro-enteropancreatische neuro-endocriene neoplasmata
|
Monsters ophalen die zijn opgeslagen in de weefselbank, de belangrijkste typen monsters zijn RNAlater-monsters, met vloeibare stikstof ingevroren monsters en perifere bloedmonsters
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
NEN mechanisme analyse op basis van Multi-omics
Tijdsspanne: Een jaar
|
Verzamel NEN-weefselspecimens en perifere bloedspecimens voor genomics, transcriptomics, proteomics, fosforylering, metabolomics en andere multiple omics sequencing-analyse, om de relatie tussen deze moleculaire omics en fenotypes te vinden, verken het NEN-mechanisme, inclusief drivergenen, activering van signaalroutes , enz., en gevoelige medicijnen screenen op basis van potentiële doelwitten.
Gebruik multi-omics-gegevens om het NEN-analyseplatform voor big data op te zetten, inclusief gevoelige doelvoorspelling, gerelateerde genvoorspelling, overlevingsanalyse, enzovoort.
|
Een jaar
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
NEN immuun micro-omgevingsanalyse
Tijdsspanne: Een jaar
|
De GSVA-software en de CIBORSORT-methode worden gebruikt om de inhoud en verhouding van verschillende immuuncelsubtypen te voorspellen op basis van NEN-mRNA-expressie.
|
Een jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Xianjun Yu, MD, PhD, Fudan University
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Lehmann BD, Jovanovic B, Chen X, Estrada MV, Johnson KN, Shyr Y, Moses HL, Sanders ME, Pietenpol JA. Refinement of Triple-Negative Breast Cancer Molecular Subtypes: Implications for Neoadjuvant Chemotherapy Selection. PLoS One. 2016 Jun 16;11(6):e0157368. doi: 10.1371/journal.pone.0157368. eCollection 2016.
- Cancer Genome Atlas Network. Comprehensive molecular characterization of human colon and rectal cancer. Nature. 2012 Jul 18;487(7407):330-7. doi: 10.1038/nature11252.
- Pavel M, Baudin E, Couvelard A, Krenning E, Oberg K, Steinmuller T, Anlauf M, Wiedenmann B, Salazar R; Barcelona Consensus Conference participants. ENETS Consensus Guidelines for the management of patients with liver and other distant metastases from neuroendocrine neoplasms of foregut, midgut, hindgut, and unknown primary. Neuroendocrinology. 2012;95(2):157-76. doi: 10.1159/000335597. Epub 2012 Feb 15. No abstract available.
- Alizadeh AA, Aranda V, Bardelli A, Blanpain C, Bock C, Borowski C, Caldas C, Califano A, Doherty M, Elsner M, Esteller M, Fitzgerald R, Korbel JO, Lichter P, Mason CE, Navin N, Pe'er D, Polyak K, Roberts CW, Siu L, Snyder A, Stower H, Swanton C, Verhaak RG, Zenklusen JC, Zuber J, Zucman-Rossi J. Toward understanding and exploiting tumor heterogeneity. Nat Med. 2015 Aug;21(8):846-53. doi: 10.1038/nm.3915.
- Hausser J, Alon U. Tumour heterogeneity and the evolutionary trade-offs of cancer. Nat Rev Cancer. 2020 Apr;20(4):247-257. doi: 10.1038/s41568-020-0241-6. Epub 2020 Feb 24.
- Halaburkova A, Cahais V, Novoloaca A, Araujo MGDS, Khoueiry R, Ghantous A, Herceg Z. Pan-cancer multi-omics analysis and orthogonal experimental assessment of epigenetic driver genes. Genome Res. 2020 Oct;30(10):1517-1532. doi: 10.1101/gr.268292.120. Epub 2020 Sep 22.
- Taber A, Christensen E, Lamy P, Nordentoft I, Prip F, Lindskrog SV, Birkenkamp-Demtroder K, Okholm TLH, Knudsen M, Pedersen JS, Steiniche T, Agerbaek M, Jensen JB, Dyrskjot L. Molecular correlates of cisplatin-based chemotherapy response in muscle invasive bladder cancer by integrated multi-omics analysis. Nat Commun. 2020 Sep 25;11(1):4858. doi: 10.1038/s41467-020-18640-0. Erratum In: Nat Commun. 2022 Apr 4;13(1):1916.
- Sailem HZ, Bakal C. Identification of clinically predictive metagenes that encode components of a network coupling cell shape to transcription by image-omics. Genome Res. 2017 Feb;27(2):196-207. doi: 10.1101/gr.202028.115. Epub 2016 Nov 18.
- Su H, Shen Y, Xing F, Qi X, Hirshfield KM, Yang L, Foran DJ. Robust automatic breast cancer staging using a combination of functional genomics and image-omics. Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2015;2015:7226-9. doi: 10.1109/EMBC.2015.7320059.
- Frilling A, Modlin IM, Kidd M, Russell C, Breitenstein S, Salem R, Kwekkeboom D, Lau WY, Klersy C, Vilgrain V, Davidson B, Siegler M, Caplin M, Solcia E, Schilsky R; Working Group on Neuroendocrine Liver Metastases. Recommendations for management of patients with neuroendocrine liver metastases. Lancet Oncol. 2014 Jan;15(1):e8-21. doi: 10.1016/S1470-2045(13)70362-0.
- Mayo SC, de Jong MC, Pulitano C, Clary BM, Reddy SK, Gamblin TC, Celinksi SA, Kooby DA, Staley CA, Stokes JB, Chu CK, Ferrero A, Schulick RD, Choti MA, Mentha G, Strub J, Bauer TW, Adams RB, Aldrighetti L, Capussotti L, Pawlik TM. Surgical management of hepatic neuroendocrine tumor metastasis: results from an international multi-institutional analysis. Ann Surg Oncol. 2010 Dec;17(12):3129-36. doi: 10.1245/s10434-010-1154-5. Epub 2010 Jun 29.
- Rindi G, D'Adda T, Froio E, Fellegara G, Bordi C. Prognostic factors in gastrointestinal endocrine tumors. Endocr Pathol. 2007 Fall;18(3):145-9. doi: 10.1007/s12022-007-0020-x.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Verwacht)
Primaire voltooiing (Verwacht)
Studie voltooiing (Verwacht)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- CSPAC-NEN-2
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .