- ICH GCP
- 미국 임상 시험 레지스트리
- 임상시험 NCT04931446
다중오믹스 통합분석 기반 신경내분비종양
다중오믹스 통합분석 기반 단일센터 신경내분비종양 연구
연구 개요
상세 설명
최근 몇 년 동안, 높은 처리량 시퀀싱 기술의 혁신은 분자 수준에서 질병 메커니즘에 대한 이해를 크게 촉진했습니다. 임상적으로 동일한 병리학적 유형과 병기를 가진 종양의 예후에 큰 차이가 있다는 것은 부인할 수 없는 사실입니다. 많은 연구에서 예후의 차이가 종양의 이질성과 밀접한 관련이 있음이 입증되었습니다. 지난 몇 년 동안 개별화된 정밀 치료는 환자의 예후를 크게 향상시킬 수 있습니다. 연구에 따르면 TCGA 데이터베이스에서 체세포 돌연변이 및 신호 경로 활성화를 기반으로 대장암을 하위 그룹으로 분류하면 진단의 정확도와 치료 효과가 크게 향상되었습니다. Lehmann의 팀은 샘플을 삼중음성 유방암의 유전자 발현 프로필에 따라 면역조절형, 중간엽형, 중간엽 줄기형, 안드로겐 수용체형 및 2개의 기저형과 같은 6가지 유형으로 나누었습니다. 이 타이핑 방법은 종양 미세 환경에서 정상적인 기질과 면역 세포 전사 수준의 역할을 결합하고 다양한 하위 유형에 따라 임상 특성과 치료 전략을 탐구합니다. 그러나 단일 omics만으로는 종양의 복잡한 병인을 밝히기에 충분하지 않습니다. 따라서 다중 omics의 통합 분석은 종양의 병인을 밝히고 잠재적인 약물 치료 대상을 발견하는 데 도움이 되는 개발 추세입니다. 표현형 데이터와 분자 오믹스 데이터의 상호 작용 분석은 생물학적 표현형과 분자 표현형 간의 상관관계를 분석하는 데 도움이 될 뿐만 아니라 거시생물학적 표현형의 미시적 분자 메커니즘을 이해할 수 있게 해줍니다. 예를 들어, CT 및 MRI를 기반으로 하는 이미징 표현형은 이와 관련된 중요한 단백질 마커를 탐색하는 데 사용할 수 있으며, 이는 향후 임상 약물 표적 치료 및 약물 내성 메커니즘 연구를 안내하기 위한 실험적 및 이론적 기반을 제공합니다. 더 흥미로운 것은 분자 오믹스에 기반한 종양의 분자 분류와 이미징 오믹스와 같은 표현형 인식 모델의 확립 사이의 관계가 이미징 오믹스와 같은 표현형이 표적 종양 치료의 지침이 될 수 있다는 것입니다. 중요한 방법. 따라서 이질성이 높은 신경내분비종양에 대해서는 다중오믹스 관점에서 분석하는 것이 매우 필요하다. 그러나 현재 공개 데이터베이스인 TCGA와 GEO에는 NEN만의 유전체학 데이터가 극히 드물고 proteomics, epiomics, metabolomics, Imagingomics 등의 데이터가 거의 없다. 따라서 신경내분비종양의 발생과 발생 기전을 종합적이고 심층적으로 연구하기 위해서는 NEN만의 다중오믹스 빅데이터 분석이 시급하다.
본 프로젝트는 다중오믹스 분석을 기반으로 NEN의 분자생물학적 특성을 분석하고 NEN만의 다중오믹스 빅데이터 플랫폼을 개발하여 분자 아형을 수행하고자 합니다. 본 연구를 통해 NEN 재발 및 전이의 분자적 기전과 잠재적 중재 대상을 찾고 임상의에게 안전하고 효과적인 치료 전략을 제공하여 신경내분비종양의 치료 효과를 향상시킬 수 있기를 바랍니다.
연구 유형
등록 (예상)
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: Xianjun Yu, MD, PhD
- 전화번호: +86-13801669875
- 이메일: yuxianjun@fudanpci.org
연구 장소
-
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Shanghai
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Shanghai, Shanghai, 중국, 200032
- Department of Pancreatic Surgery, Fudan University Shanghai Cancer Center; Pancreatic Cancer Institute, Fudan University
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
연구 대상 성별
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 2010년 1월부터 2021년 1월까지 Fudan University 부속 암 병원에서 수술 치료를 받았습니다.
- 수술 후 병리학은 신경 내분비 종양으로 판명되었습니다.
- 과학 연구를 위해 표본 및 관련 임상 데이터를 사용하는 데 동의하는 조직 은행 샘플 수집에 대한 정보에 입각한 동의서에 서명했습니다.
제외 기준:
- 다른 악성 종양 병합;
- 임상 데이터가 누락되었습니다.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 관찰 모델: 케이스 전용
- 시간 관점: 회고전
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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위장췌장 신경내분비 신생물
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조직은행에 보관된 검체 회수, 주요 검체 종류는 RNAlater 검체, 액체질소 동결검체, 말초혈액 검체
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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Multi-omics 기반 NEN 메커니즘 분석
기간: 1년
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유전체학, transcriptomics, proteomics, 인산화, metabolomics 및 기타 다중 omics 시퀀싱 분석을 위해 NEN 조직 표본 및 말초 혈액 표본을 수집하여 이러한 분자 omics와 표현형 간의 관계를 찾고 드라이버 유전자, 신호 경로 활성화를 포함한 NEN 메커니즘을 탐색합니다. 등, 잠재적 표적을 기반으로 민감한 약물을 선별합니다.
다중 오믹스 데이터를 사용하여 민감한 표적 예측, 관련 유전자 예측, 생존 분석 등을 포함한 NEN 빅 데이터 분석 플랫폼을 구축하십시오.
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1년
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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NEN 면역 미세 환경 분석
기간: 1년
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GSVA 소프트웨어 및 CIBORSORT 방법은 NEN mRNA 발현을 기반으로 다양한 면역 세포 아형의 함량 및 비율을 예측하는 데 사용됩니다.
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1년
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공동 작업자 및 조사자
스폰서
수사관
- 수석 연구원: Xianjun Yu, MD, PhD, Fudan University
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
- Lehmann BD, Jovanovic B, Chen X, Estrada MV, Johnson KN, Shyr Y, Moses HL, Sanders ME, Pietenpol JA. Refinement of Triple-Negative Breast Cancer Molecular Subtypes: Implications for Neoadjuvant Chemotherapy Selection. PLoS One. 2016 Jun 16;11(6):e0157368. doi: 10.1371/journal.pone.0157368. eCollection 2016.
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