Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Returnering af genomiske resultater og aggregeret penetrering i befolkningsbaserede kohorter (PopSeq)

8. juli 2026 opdateret af: Robert C. Green, MD, MPH, Brigham and Women's Hospital
PopSeq-projektet er et prospektivt kohortestudie, der vil udvikle og implementere en genomisk returnering af resultater (gRoR) proces i Framingham Heart Study (FHS) og Jackson Heart Study (JHS) kohorter og udforske associerede medicinske, adfærdsmæssige og økonomiske resultater. Undersøgelsen vil fortolke de genomiske sekvenser af JHS/FHS-deltagere tidligere sekventeret af TOPMed, som har givet samtykke til genomisk returnering af resultater og/eller genetisk testning. Vi vil udvikle og anvende nye metoder til skalerbar screening/klassificering af genomiske varianter og vil udforske genomisk penetrering ved at fænotypebestemme en undergruppe af deltagere i FHS og JHS.

Studieoversigt

Status

Afsluttet

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljeret beskrivelse

Formålet med dette projekt er at: 1) Returnere klinisk brugbare genomiske resultater til deltagerne og spore resultater. Blandt nulevende FHS/JHS-deltagere, som har givet samtykke til gRoR, vil vi kontakte dem, hos hvem der opdages en skadelig handlingsbar variant i et af generne, der er noteret på ACMG's anbefalede sekundære fundliste (estimeret 2% af deltagerne). 2) Forbedre high-throughput metoder til at identificere valid patogen variation. Forfin og anvende metoder til screening med høj kapacitet af FHS/JHS-genomer på en måde, der bevarer høj følsomhed til påvisning af skadelige varianter i ~3500 gener, der er forbundet med Mendelian sygdom, samtidig med at den falske opdagelsesrate af varianter, der ikke er patogene/sandsynligt patogene, reduceres. 3) Udforsk samlet penetrering for Mendelske sygdomme. Gennemgå fænotypedata fra en undergruppe af FHS- og JHS-deltagere og sammenlign dette med genotypiske data.

Data, der skal indsamles, omfatter udfald og fænotypiske data om de personer, der accepterer gRoR, og som erfarer, at de har en skadelig variant i et af generne på ACMG-listen. Disse data vil blive selvrapporteret gennem undersøgelser, og tilgængelige lægejournaler vil blive gennemgået. Yderligere fænotypiske data kan indsamles og gennemgås for andre ikke-handlingsbare mendelske sygdomsgener for at udforske genomisk penetrans.

Forskningsdeltagere, som er identificeret med en skadelig variant i et handlingsbart gen, kan få direkte sundhedsmæssige fordele ved at lære denne information; dog kan returnering af genomiske resultater til raske individer, der ikke præsenterer for en medicinsk indikation, udgøre uventede skader relateret til variant-rettede stigninger i screening og behandling. Denne undersøgelse er fokuseret på at udforske fordelene og eventuelle skader relateret til returnering af genomisk information i populationsbaserede kohorter. Det vil også give os mulighed for bedre at forstå penetreringen af ​​disse varianter i to populationer, der ikke er udvalgt til sygdomsstatus, og vil give os mulighed for at sammenligne resultater i en primært afroamerikansk befolkning vs en kaukasisk befolkning. Udvikling af metoder til at strømline variantanalyse vil hjælpe med at forbedre laboratorieeffektiviteten og vil fremskride inden for variantkuration og analyse.

Undersøgelsestype

Interventionel

Tilmelding (Faktiske)

7603

Fase

  • Ikke anvendelig

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

    • Massachusetts
      • Framingham, Massachusetts, Forenede Stater, 01702
        • Framingham Heart Study
    • Mississippi
      • Jackson, Mississippi, Forenede Stater, 39213
        • Jackson Heart Study

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

18 år til 100 år (Voksen, Ældre voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Levende individer tilmeldt Framingham Heart Study og Jackson Heart Study, som har fået sekventeret deres genomer som en del af TOPMed-programmet.
  • Voksne over 18 år
  • Dem, der har givet samtykke til at få deres DNA-prøver brugt til forskningsformål (og dem, der deltager i gRoR, som har givet samtykke til at modtage genomisk information).

Ekskluderingskriterier:

  • Deltagere i Framingham Heart Study eller Jackson Heart Study, som ikke har fået sekventeret deres genomer som en del af TOPMed
  • Deltagere, der ikke valgte genomisk/genetisk forskning
  • Deltagere, der har/ikke har givet samtykke til at modtage et genomisk resultat (kun for denne undersøgelses gRoR-del)

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Primært formål: Forebyggelse
  • Tildeling: N/A
  • Interventionel model: Enkelt gruppeopgave
  • Maskning: Ingen (Åben etiket)

Våben og indgreb

Deltagergruppe / Arm
Intervention / Behandling
Eksperimentel: FHS & JHS deltagere med et handlingsdygtigt genomisk fund
Deltagere i Framingham og Jackson Heart Study, som har fået sekventeret deres genomer som en del af TOPMed, vil blive underrettet, hvis et handlingsegnet genetisk resultat i et ACMG v2.0-gen identificeres, og vil blive tilbudt muligheden for at få deres forskningsresultat klinisk bekræftet af undersøgelsen.
Helgenomsekventering og rapportering af handlingsegnede genomiske resultater for gener inkluderet på ACMG's sekundære fundliste.

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Follow Through With Disclosure
Tidsramme: From genetic result notification to 8 months post-disclosure
Living JHS/FHS participants sequenced as part of the TOPMed program who were notified about an actionable genetic result that warranted having the research result verified who followed through with having their result confirmed and disclosed to their health care provider.
From genetic result notification to 8 months post-disclosure
Total Costs of Program Implementation
Tidsramme: From the initiation of bioinformatics analysis to disclosure of confirmed actionable genetic finding (approximately 6 months).
We will determine the costs and associated time demands of implementing gRoR using a microcosting approach in which study staff track the amount of time they spend and the resources they use for each step of the protocol. Ranges are based on 50% to 200% of point estimates given variability in wages and prices of services.
From the initiation of bioinformatics analysis to disclosure of confirmed actionable genetic finding (approximately 6 months).
Costs of Follow-Up Care
Tidsramme: 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
For follow-up medical care, we use a gross costing approach where we apply Centers for Medicare and Medicaid fee schedules to participant-reported referrals and tests.
1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Guideline Compliance
Tidsramme: At the time of disclosure of confirmed findings (approximately 3 months after initial results notification)
Number of participants with actionable genetic results who, per the judgement of a genetic specialist, had already met clinical criteria for genetic testing based on their personal and family histories of disease.
At the time of disclosure of confirmed findings (approximately 3 months after initial results notification)
New and Modified Diagnoses
Tidsramme: 6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results);1 Year Post-Disclosure Survey (from 1 year to 15 months after disclosure of confirmed results)
We will examine cases to determine the percentage of individuals who report a new or modified diagnosis attributed to results disclosure.
6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results);1 Year Post-Disclosure Survey (from 1 year to 15 months after disclosure of confirmed results)
Self-Rated Health
Tidsramme: Post Disclosure Survey (up to 1 month from disclosure of confirmed results); 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
A single item of self rated health derived from the SF-12v2.
Post Disclosure Survey (up to 1 month from disclosure of confirmed results); 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
Number of Participants With Recommendations to Referrals or Services During Clinical Disclosure Sessions
Tidsramme: From disclosure to 1 month post-disclosure
We reviewed chart notes from results disclosure sessions to determine whether referrals or services were recommended in response to genetic findings.
From disclosure to 1 month post-disclosure
Health Care Utilization
Tidsramme: 1 year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
Health care utilization in response to results disclosure reported by participants in the one year follow-up survey, including referrals, tests and/or procedures, and changes to medications.
1 year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)

Andre resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Self-Reported Changes to Health Behaviors
Tidsramme: 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
A series of standardized yes/no questions that assess whether disclosed genetic information motivated participants to make changes to health behaviors, including diet, exercise, dietary supplements use, alcohol use, stress management, and smoking.
1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
Disclosure-specific Impact
Tidsramme: 6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results)
The survey assessed the disclosure-specific impact of information on distress and positive emotions using an adapted 12-item version of the FaCTOR, a validated instrument developed for genomic sequencing that is sensitive to responses to high- and low-risk genetic risk results. Subscales assess negative emotions (range: 3 to 15), positive feelings (reverse-scored, range: 4 to 20), uncertainty (range: 3 to 15), and privacy concerns (range: 2 to 10), with higher scores on each subscale indicating more negative experiences.
6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results)
Satisfaction With Disclosure
Tidsramme: 6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results); 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
Surveys assessed how helpful participants felt the results disclosure session was using a novel single question.
6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results); 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
Decisional Regret
Tidsramme: 6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results); 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
Surveys assessed if participants regretted their decisions to receive their genetic findings using a novel single question.
6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results); 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
Sharing With Relatives
Tidsramme: 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
The survey assessed with whether participants shared their genetic information with relatives .
1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
Family Testing
Tidsramme: 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
The survey assessed whether participants had relatives that received genetic testing based on disclosure to the participant.
1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
General Anxiety
Tidsramme: Post Disclosure Survey (up to 1 month from disclosure of confirmed results); 6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results)
We measure general anxiety using a 4-item version of the General Anxiety Disorder Scale, a validated scale that allows investigators to identify individuals with a potential mood disorder. Scores range from 4 to 16, with higher scores indicating greater anxiety.
Post Disclosure Survey (up to 1 month from disclosure of confirmed results); 6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results)

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

Samarbejdspartnere

Publikationer og nyttige links

Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.

Generelle publikationer

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

9. juni 2021

Primær færdiggørelse (Faktiske)

30. maj 2025

Studieafslutning (Faktiske)

30. maj 2025

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

10. december 2019

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

10. december 2019

Først opslået (Faktiske)

12. december 2019

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

3. august 2026

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

8. juli 2026

Sidst verificeret

1. juli 2026

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Andre undersøgelses-id-numre

  • R01HL143295 (U.S. NIH-bevilling/kontrakt)

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

INGEN

IPD-planbeskrivelse

Individuelle deltagerdata vil ikke blive delt. Samlede data vil blive delt gennem offentliggørelse og vil blive overvejet efter anmodning.

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .