Diagnose af nedre luftvejsinfektioner ved hjælp af Biofire Filmarray

Akutte luftvejsinfektioner (ARI) er en førende årsag til morbiditet og dødelighed på verdensplan. Selvom det normalt er mere alvorligt hos børn, ældre og immunkompromitterede patienter, er alle populationer og aldersgrupper modtagelige.

Nedre luftvejsinfektioner er den tredje hyppigste dødsårsag på verdensplan, og næsten to millioner børnedødsfald på verdensplan kan tilskrives ARI, hvor langt størstedelen forekommer i udviklingslande. Verdenssundhedsorganisationen anslår, at i 2013 var over 8 % af alle dødsfald i det østlige Middelhavsregionen kunne tilskrives ARI'er. Regionale data om morbiditet og ætiologi af disse infektioner mangler dog.

Disse infektioner har en betydelig indvirkning på antimikrobielle recepter, indlæggelser og tabt tid fra arbejde og skole. De hyppigste midler, der er ansvarlige for ARI, er luftvejsvira efterfulgt af bakterier. Empirisk behandling med antibiotika påbegyndes ofte, selv når virusinfektion er en stor mulighed, hvilket fører til unødvendig antibiotikabrug. Den tidlige diagnose af patogenet er gavnlig for den præcise udvælgelse af medicin, som stort set kan undgå overforbrug eller endda misbrug af antibiotika og forbedre den kliniske pleje af patienter. Endnu vigtigere er den tidlige diagnose af smitsomme patogener, såsom Bordetella pertussis (B. pertussis) og influenzavirus, kan muliggøre tidlig isolering af patienter og dermed reducere spredningen af ​​patogener.

På nuværende tidspunkt er rutinepåvisningsmetoderne for respiratoriske patogener for det meste baseret på immunologiske metoder.

Direkte diagnose af respiratoriske vira ved antigendetektion ved hjælp af immunfluorescensassays (IFA), bruges stadig, men er typisk begrænset til otte vira (adenovirus [AdV], influenza A [FluA], influenza B [FluB], parainfluenza [PIV], humant metapneumovirus [HMPV] og respiratorisk syncytialvirus [RSV]) og kan mangle følsomhed afhængigt af viral titer, patientens alder og testtidspunkt i forhold til symptomernes begyndelse.

Molekylære metoder såsom polymerasekædereaktion (PCR) øger viral detektion på grund af en større analytisk følsomhed sammenlignet med konventionelle metoder såsom antigenpåvisning og/eller viral kultur.

Mikrobiologisk analyse og identifikation af organismer kan tage 48-72 timer, falsk negative resultater kan forekomme som følge af samtidig eller tidligere antibiotikabehandling, hvorimod falsk positiv kan repræsentere koloniserings- eller prøveudtagningsfejl.

VITEK 2 er et fuldt automatiseret system til mikrobiel identifikation og antimikrobiel modtagelighedstest (AST ), efter at et primært inokulum er blevet forberedt og standardiseret. Med sine kolorimetriske reagenskort tilbyder VITEK 2 en topmoderne teknologiplatform for fænotypiske identifikationsmetoder.(6) Anvendelsen af ​​FilmArray respiratorisk panel til diagnosticering af nedre luftvejsinfektioner er designet til at reducere tiden til identifikation af mikroorganismerne FilmArray er en lille, desktop, fuldautomatisk multiplex PCR-enhed. Det molekylære system inkluderer automatiseret nukleinsyreekstraktion, et indledende revers transkriptionstrin og multipleks nestet PCR, efterfulgt af en smeltekurveanalyse.

BIOFIRE® FILMARRAY® Pneumonia Panel plus tester for 18 bakterier (11 gram negative, 4 gram positive og 3 atypiske), 7 antibiotikaresistensmarkører og 9 vira, der forårsager lungebetændelse og andre infektioner i de nedre luftveje. Det giver en samlet sensitivitet og specificitet for bronkoalveolære (BAL)-lignende prøver på henholdsvis 96,2 % og 98,3 %, og for sputumprøver en sensitivitet og specificitet på henholdsvis 96,3 % og 97,2 %. Testen udføres i en lukket system, der kræver 5 min hands-on tid og 65 min instrumentering tid. Adskillige sammenligningsundersøgelser mellem FilmArray og andre tests for luftvejsorganismer viste sammenlignelige resultater.