NCCR AntiResist:: Nye tilgange til bekæmpelse af antibiotika-resistente bakterier (AntiResist)
NCCR AntiResist: Mono-center undersøgelse for at identificere nye tilgange til bekæmpelse af antibiotika-resistente bakterier.
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Det Nationale Center for Kompetence i Forskning (NCCR) AntiResist sigter mod at bruge patientprøver til at undersøge fysiologien af bakterielle patogener hos menneskelige patienter og etablere et unikt tværfagligt netværk af klinikere, biologer, ingeniører, kemikere, beregningsforskere og lægemiddeludviklere.
Målet med dette projekt er at belyse de fysiologiske egenskaber af bakterielle patogener i inficerede humane patienter for at give nye måder at bekæmpe superbugs på. Disse kliniske data vil blive brugt til at vejlede og benchmarke udvikling af patient-efterlignende og in vitro-modeller, accelerere søgningen efter nye bakterielle mål, antibakterielle forbindelser og ikke-konventionelle strategier.
I detaljer vil fokus være på tre kliniske manifestationer af infektionssygdomme forårsaget af fire kritiske bakterielle patogener, der tilhører WHO's liste over "prioriterede patogener": E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus og P. aeruginosa:
A) Urinvejsinfektion B) Lungebetændelse C) Dybtliggende infektioner D) Kontroller for A), B) og C) E) Kliniske kontroller for A), B) og C) uden indhentede prøver F) Analyse om anvendelse af art. . 34 HFV (Weiterverwendung biologischen Materials und/oder gesundheitsbezogener Personendaten für die Forschung bei fehlender Einwilligung und Information) kan undgå en bias.
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Nina Khanna, Prof.
- Telefonnummer: +41 61 328 73 25
- E-mail: nina.khanna@usb.ch
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Christoph Dehio, Prof.
Studiesteder
-
-
-
Basel, Schweiz, 4031
- Rekruttering
- University Hospital Basel
-
Kontakt:
- Nina Khanna, Prof. Dr. med.
- Telefonnummer: +41 61 328 73 25
- E-mail: nina.khanna@usb.ch
-
Kontakt:
- Richard Kühl, Dr. med.
- Telefonnummer: +41 61 328 65 45
- E-mail: richard.kuehl@usb.ch
-
Ledende efterforsker:
- Nina Khanna, Prof.
-
Underforsker:
- Richard Kühl, Dr.
-
Underforsker:
- Adrian Egli, Prof.
-
Underforsker:
- Christoph Dehio, Prof.
-
Underforsker:
- Mario Morgenstern, PD
-
Underforsker:
- Martin Siegemund, Prof.
-
Underforsker:
- Daiana Stolz, Prof.
-
Underforsker:
- Sarah Tschudin Sutter, Prof.
-
Underforsker:
- Bram Stieltjes, Dr.
-
Underforsker:
- Dirk Buman, Prof.
-
Underforsker:
- Urs Jenal, Prof.
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
Patienter med bekræftet (i) urinvejsinfektion, (ii) lungebetændelse (inklusive patienter efter lungetransplantation, cystisk fibrose) eller (iii) dybtliggende infektion med fokuspatogen:
- E coli
- Klebsiella art
- S. aureus
- P. aeruginosa
- Kontroller: ingen påviselige bakterier i rutinemæssigt mikrobiologisk laboratorium og intet andet infektionssted ved inklusion af prøven og opfølgning i 10 dage, underskrevet generelt samtykke
Kliniske kontroller uden opnåede prøver, men med bekræftet (i) urinvejsinfektion, (ii) lungebetændelse (inklusive patienter efter lungetransplantation, cystisk fibrose) eller (iii) dybtliggende infektion med fokuspatogen:
- E coli
- Klebsiella art
- S. aureus
- P. aeruginosa
Ekskluderingskriterier:
- Patienter, der har nægtet forskning og genbrug af deres data/prøver (f. generelt samtykke) eller enhver anden afvisning (f.eks. Patientenverfügung).
- andet end en af fokusbakterierne i rutinemæssigt mikrobiologilaboratorium
- Alder: <18 år
- Kontrollerer uden underskrevet generelt samtykke
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Antal grupper/kohorter
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorteGruppe / kohorte |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
A) Urinvejsinfektion
Behandling af resturin til proteomisk, metabolomisk og transkriptomisk analyse, immunocytokemisk eller fluorescens in-situ hybridisering (FISH) analyse, flowcytometri analyse (FACS), immunfænotyping.
Hvis positiv for målbakterier: prøve opbevaret i biobank.
Hvis tidligere antibiotikabehandling: Opbevaring af plasmaprøver.
Udforskning af bakterielle egenskaber (Højfølsom massespektrometri, helgenomsekventering), ekspression af virulensfaktorer, genomiske ændringer af bakteriearter, metabolisme, overflademolekyleekspression, genekspressionsniveauer, cytokinniveauer, immuncellebiologi, antibiotikakoncentration (kromatografi/massespektrometri) ).
Demografiske, kliniske, mikrobiologiske, laboratorie-, epidemiologiske og hospitalsrelaterede data vil blive analyseret.
500 prøver pr. målbakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-arter) inkluderet.
Først udføres et pilotstudie fra tilfældigt udvalgte patienter inden for hver bakterieart gruppe (n=50, hver).
|
I prøver fra patienter inficeret med et af fokuspatogenerne (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være: (i) isolerede og patogene bakterier karakteriseret; (ii) patogen in-situ egenskaber ved enkeltcelle- og bulk-gennemsnit bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakoncentration bestemt (v) bakteriel vækst overvåget Fratrækkes dataene:
Kliniske resultater (overlevelse/dødelighed) og behandlingsrespons (respons eller svigt) vil være korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata. |
|
B) Lungebetændelse
Behandling af restprøver (tracheal sekretion, bronchioalveolær lavage (BAL)) til proteomisk, metabolomisk, transkriptomisk og cytologisk analyse.
Hvis positiv for målbakterier: prøve opbevaret i biobank.
Hvis tidligere antibiotikabehandling: Opbevaring af plasmaprøver.
Udforskning af bakterielle egenskaber.
Demografiske, kliniske, mikrobiologiske, laboratorie-, epidemiologiske og hospitalsrelaterede data vil blive analyseret.
500 prøver pr. målbakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-arter) inkluderet.
|
I prøver fra patienter inficeret med et af fokuspatogenerne (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være: (i) isolerede og patogene bakterier karakteriseret; (ii) patogen in-situ egenskaber ved enkeltcelle- og bulk-gennemsnit bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakoncentration bestemt (v) bakteriel vækst overvåget Fratrækkes dataene:
Kliniske resultater (overlevelse/dødelighed) og behandlingsrespons (respons eller svigt) vil være korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata. |
|
C) Dybtliggende infektioner
Behandling af intraoperativt materialerestprøver til proteomisk, metabolomisk, transkriptomisk og cytologisk analyse.
Hvis positiv for målbakterier: prøve opbevaret i biobank.
Udforskning af bakterielle egenskaber.
Demografiske, kliniske, mikrobiologiske, laboratorie-, epidemiologiske og hospitalsrelaterede data vil blive analyseret.
500 prøver pr. målbakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-arter) inkluderet.
|
I prøver fra patienter inficeret med et af fokuspatogenerne (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være: (i) isolerede og patogene bakterier karakteriseret; (ii) patogen in-situ egenskaber ved enkeltcelle- og bulk-gennemsnit bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakoncentration bestemt (v) bakteriel vækst overvåget Fratrækkes dataene:
Kliniske resultater (overlevelse/dødelighed) og behandlingsrespons (respons eller svigt) vil være korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata. |
|
D) Kontrolelementer for A), B) og C)
Kontrolprøver stammer fra patienter med mistanke om infektion (infektionssted A), B) eller C), hvor der ikke er diagnosticeret en mikrobiologisk bekræftet infektion.
Opbevaring i biobank
|
I prøver fra patienter inficeret med et af fokuspatogenerne (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være: (i) isolerede og patogene bakterier karakteriseret; (ii) patogen in-situ egenskaber ved enkeltcelle- og bulk-gennemsnit bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakoncentration bestemt (v) bakteriel vækst overvåget Fratrækkes dataene:
Kliniske resultater (overlevelse/dødelighed) og behandlingsrespons (respons eller svigt) vil være korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata. |
|
E) Kliniske kontroller for A), B) og C) uden opnåede prøver
For kliniske kontroller vil kliniske karakteristika for patienter med påvisning af målpatogener i deres rutineprøver (men som ikke kunne inkluderes til prøveanalyse i denne undersøgelse) blive vurderet.
|
I prøver fra patienter inficeret med et af fokuspatogenerne (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være: (i) isolerede og patogene bakterier karakteriseret; (ii) patogen in-situ egenskaber ved enkeltcelle- og bulk-gennemsnit bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakoncentration bestemt (v) bakteriel vækst overvåget Fratrækkes dataene:
Kliniske resultater (overlevelse/dødelighed) og behandlingsrespons (respons eller svigt) vil være korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata. |
|
F) Kohorte med analyse, om anvendelsen af artikel (Art) 34 HFV kan undgå en bias
Da en del af data og prøver i denne undersøgelse er indsamlet med de etiske udvalgs repræsentative samtykke, undersøges det, om anvendelsen af art.
34 HFV forhindrer selektionsbias i forhold til undersøgelsespopulationen.
Til dette formål er forskelle mellem den faktiske undersøgelsespopulation ved brug af art.
34 HFV og undersøgelsespopulationen med givet forskningssamtykke vil blive undersøgt beskrivende i forhold til forekomsten af multiresistente bakterier og andre tilgængelige populationskarakteristika.
|
I prøver fra patienter inficeret med et af fokuspatogenerne (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være: (i) isolerede og patogene bakterier karakteriseret; (ii) patogen in-situ egenskaber ved enkeltcelle- og bulk-gennemsnit bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakoncentration bestemt (v) bakteriel vækst overvåget Fratrækkes dataene:
Kliniske resultater (overlevelse/dødelighed) og behandlingsrespons (respons eller svigt) vil være korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata. |
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Klinisk resultat: overlevelsesrate
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
|
Overlevelsesrate (korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata.
In vitro hentede værts- og bakteriedata omfatter: Proteomics, Metabolomics, FISH, Histologi, PCR/Mikrobiel genomsekventering, Mikrobielt transkriptom, Antibiotikakoncentration, Timelapse-undersøgelser, fænotypiske karakteriseringer, molekylær typning, medfødt immunresponskarakterisering, Antibiotikatolerance-testsystemer, 3-D-modeller, transkriptomik, flowcytometri (FACS))
|
engangsvurdering ved baseline
|
|
Klinisk resultat: dødelighed
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
|
Dødelighedsrate (korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata.
In vitro hentede værts- og bakteriedata omfatter: Proteomics, Metabolomics, FISH, Histologi, PCR/Mikrobiel genomsekventering, Mikrobielt transkriptom, Antibiotikakoncentration, Timelapse-undersøgelser, fænotypiske karakteriseringer, molekylær typning, medfødt immunresponskarakterisering, Antibiotikatolerance-testsystemer, 3-D-modeller, transkriptomik, flowcytometri (FACS))
|
engangsvurdering ved baseline
|
|
Behandlingsrespons (binært: ja/nej)
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
|
Behandlingsrespons (korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata.
In vitro hentede værts- og bakteriedata omfatter: Proteomics, Metabolomics, FISH, Histologi, PCR/Mikrobiel genomsekventering, Mikrobielt transkriptom, Antibiotikakoncentration, Timelapse-undersøgelser, fænotypiske karakteriseringer, molekylær typning, medfødt immunresponskarakterisering, Antibiotikatolerance-testsystemer, 3-D-modeller, transkriptomik, flowcytometri (FACS))
|
engangsvurdering ved baseline
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Samarbejdspartnere
Samarbejdspartnere
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Nina Khanna, Prof., University Hospital Basel, Division of Infectiology
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Anslået)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Anslået)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
- Lungebetændelse
- S. aureus
- E coli
- P. aeruginosa
- Ventilator-associeret lungebetændelse (VAP)
- Hospitalserhvervet lungebetændelse (HAP)
- Urinvejsinfektion (UTI)
- Klebsiella art
- Nationalt Center for Kompetence i Forskning (NCCR)
- Dybtliggende infektioner
- bakterielle egenskaber
- Fællesskabserhvervet lungebetændelse (CAP)
- cystisk fibrose (CF)
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- 2020-02588; pe20Khanna
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .