Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

NCCR AntiResist:: Nye tilgange til bekæmpelse af antibiotika-resistente bakterier (AntiResist)

27. februar 2025 opdateret af: University Hospital, Basel, Switzerland

NCCR AntiResist: Mono-center undersøgelse for at identificere nye tilgange til bekæmpelse af antibiotika-resistente bakterier.

Dette er en eksplorativ, mono-center undersøgelse, der inkluderer prospektivt indsamlede patientprøver fra universitetshospitalet i Basel. Det skal undersøge antimikrobiel resistens (AMR), herunder tre kliniske manifestationer af infektionssygdomme: urinvejsinfektion, lungebetændelse og dybtliggende infektioner. Fokus er på fire bakterier (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa), som er en del af Verdenssundhedsorganisationens (WHO) højprioritetsliste. Resterende patientprøver analyseres til proteomisk, metabolomisk og transkriptomisk analyse, immunocytokemisk eller fluorescens in-situ hybridisering (FISH) analyse, flowcytometri analyse (FACS) og immunfænotyping og udforskning af bakterielle egenskaber.

Studieoversigt

Status

Rekruttering

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljeret beskrivelse

Det Nationale Center for Kompetence i Forskning (NCCR) AntiResist sigter mod at bruge patientprøver til at undersøge fysiologien af ​​bakterielle patogener hos menneskelige patienter og etablere et unikt tværfagligt netværk af klinikere, biologer, ingeniører, kemikere, beregningsforskere og lægemiddeludviklere.

Målet med dette projekt er at belyse de fysiologiske egenskaber af bakterielle patogener i inficerede humane patienter for at give nye måder at bekæmpe superbugs på. Disse kliniske data vil blive brugt til at vejlede og benchmarke udvikling af patient-efterlignende og in vitro-modeller, accelerere søgningen efter nye bakterielle mål, antibakterielle forbindelser og ikke-konventionelle strategier.

I detaljer vil fokus være på tre kliniske manifestationer af infektionssygdomme forårsaget af fire kritiske bakterielle patogener, der tilhører WHO's liste over "prioriterede patogener": E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus og P. aeruginosa:

A) Urinvejsinfektion B) Lungebetændelse C) Dybtliggende infektioner D) Kontroller for A), B) og C) E) Kliniske kontroller for A), B) og C) uden indhentede prøver F) Analyse om anvendelse af art. . 34 HFV (Weiterverwendung biologischen Materials und/oder gesundheitsbezogener Personendaten für die Forschung bei fehlender Einwilligung und Information) kan undgå en bias.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Anslået)

8000

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Undersøgelse Kontakt Backup

  • Navn: Christoph Dehio, Prof.

Studiesteder

  • Schweiz
      • Basel, Schweiz, 4031
        • Rekruttering
        • University Hospital Basel
        • Kontakt:
        • Kontakt:
        • Ledende efterforsker:
          • Nina Khanna, Prof.
        • Underforsker:
          • Richard Kühl, Dr.
        • Underforsker:
          • Adrian Egli, Prof.
        • Underforsker:
          • Christoph Dehio, Prof.
        • Underforsker:
          • Mario Morgenstern, PD
        • Underforsker:
          • Martin Siegemund, Prof.
        • Underforsker:
          • Daiana Stolz, Prof.
        • Underforsker:
          • Sarah Tschudin Sutter, Prof.
        • Underforsker:
          • Bram Stieltjes, Dr.
        • Underforsker:
          • Dirk Buman, Prof.
        • Underforsker:
          • Urs Jenal, Prof.

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

18 år og ældre (Voksen, Ældre voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ja

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Patientprøver under rutinemæssig indsamling på universitetshospitalet i Basel fra november 2020 til cirka december 2024.

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Patienter med bekræftet (i) urinvejsinfektion, (ii) lungebetændelse (inklusive patienter efter lungetransplantation, cystisk fibrose) eller (iii) dybtliggende infektion med fokuspatogen:

    • E coli
    • Klebsiella art
    • S. aureus
    • P. aeruginosa
  • Kontroller: ingen påviselige bakterier i rutinemæssigt mikrobiologisk laboratorium og intet andet infektionssted ved inklusion af prøven og opfølgning i 10 dage, underskrevet generelt samtykke

  • Kliniske kontroller uden opnåede prøver, men med bekræftet (i) urinvejsinfektion, (ii) lungebetændelse (inklusive patienter efter lungetransplantation, cystisk fibrose) eller (iii) dybtliggende infektion med fokuspatogen:

    • E coli
    • Klebsiella art
    • S. aureus
    • P. aeruginosa

Ekskluderingskriterier:

  • Patienter, der har nægtet forskning og genbrug af deres data/prøver (f. generelt samtykke) eller enhver anden afvisning (f.eks. Patientenverfügung).
  • andet end en af ​​fokusbakterierne i rutinemæssigt mikrobiologilaboratorium
  • Alder: <18 år
  • Kontrollerer uden underskrevet generelt samtykke

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
A) Urinvejsinfektion
Behandling af resturin til proteomisk, metabolomisk og transkriptomisk analyse, immunocytokemisk eller fluorescens in-situ hybridisering (FISH) analyse, flowcytometri analyse (FACS), immunfænotyping. Hvis positiv for målbakterier: prøve opbevaret i biobank. Hvis tidligere antibiotikabehandling: Opbevaring af plasmaprøver. Udforskning af bakterielle egenskaber (Højfølsom massespektrometri, helgenomsekventering), ekspression af virulensfaktorer, genomiske ændringer af bakteriearter, metabolisme, overflademolekyleekspression, genekspressionsniveauer, cytokinniveauer, immuncellebiologi, antibiotikakoncentration (kromatografi/massespektrometri) ). Demografiske, kliniske, mikrobiologiske, laboratorie-, epidemiologiske og hospitalsrelaterede data vil blive analyseret. 500 prøver pr. målbakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-arter) inkluderet. Først udføres et pilotstudie fra tilfældigt udvalgte patienter inden for hver bakterieart gruppe (n=50, hver).
Andet: analyse af antimikrobiel resistens

I prøver fra patienter inficeret med et af fokuspatogenerne (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være:

(i) isolerede og patogene bakterier karakteriseret; (ii) patogen in-situ egenskaber ved enkeltcelle- og bulk-gennemsnit bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakoncentration bestemt (v) bakteriel vækst overvåget

Fratrækkes dataene:

  1. relevante menneskelige komponenter og patogenegenskaber, der er fælles for de fleste patienter med lignende indikation
  2. underliggende regulatoriske netværk og triggere i patogene celler og humant væv.

Kliniske resultater (overlevelse/dødelighed) og behandlingsrespons (respons eller svigt) vil være korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata.
B) Lungebetændelse
Behandling af restprøver (tracheal sekretion, bronchioalveolær lavage (BAL)) til proteomisk, metabolomisk, transkriptomisk og cytologisk analyse. Hvis positiv for målbakterier: prøve opbevaret i biobank. Hvis tidligere antibiotikabehandling: Opbevaring af plasmaprøver. Udforskning af bakterielle egenskaber. Demografiske, kliniske, mikrobiologiske, laboratorie-, epidemiologiske og hospitalsrelaterede data vil blive analyseret. 500 prøver pr. målbakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-arter) inkluderet.
Andet: analyse af antimikrobiel resistens

I prøver fra patienter inficeret med et af fokuspatogenerne (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være:

(i) isolerede og patogene bakterier karakteriseret; (ii) patogen in-situ egenskaber ved enkeltcelle- og bulk-gennemsnit bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakoncentration bestemt (v) bakteriel vækst overvåget

Fratrækkes dataene:

  1. relevante menneskelige komponenter og patogenegenskaber, der er fælles for de fleste patienter med lignende indikation
  2. underliggende regulatoriske netværk og triggere i patogene celler og humant væv.

Kliniske resultater (overlevelse/dødelighed) og behandlingsrespons (respons eller svigt) vil være korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata.
C) Dybtliggende infektioner
Behandling af intraoperativt materialerestprøver til proteomisk, metabolomisk, transkriptomisk og cytologisk analyse. Hvis positiv for målbakterier: prøve opbevaret i biobank. Udforskning af bakterielle egenskaber. Demografiske, kliniske, mikrobiologiske, laboratorie-, epidemiologiske og hospitalsrelaterede data vil blive analyseret. 500 prøver pr. målbakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-arter) inkluderet.
Andet: analyse af antimikrobiel resistens

I prøver fra patienter inficeret med et af fokuspatogenerne (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være:

(i) isolerede og patogene bakterier karakteriseret; (ii) patogen in-situ egenskaber ved enkeltcelle- og bulk-gennemsnit bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakoncentration bestemt (v) bakteriel vækst overvåget

Fratrækkes dataene:

  1. relevante menneskelige komponenter og patogenegenskaber, der er fælles for de fleste patienter med lignende indikation
  2. underliggende regulatoriske netværk og triggere i patogene celler og humant væv.

Kliniske resultater (overlevelse/dødelighed) og behandlingsrespons (respons eller svigt) vil være korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata.
D) Kontrolelementer for A), B) og C)
Kontrolprøver stammer fra patienter med mistanke om infektion (infektionssted A), B) eller C), hvor der ikke er diagnosticeret en mikrobiologisk bekræftet infektion. Opbevaring i biobank
Andet: analyse af antimikrobiel resistens

I prøver fra patienter inficeret med et af fokuspatogenerne (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være:

(i) isolerede og patogene bakterier karakteriseret; (ii) patogen in-situ egenskaber ved enkeltcelle- og bulk-gennemsnit bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakoncentration bestemt (v) bakteriel vækst overvåget

Fratrækkes dataene:

  1. relevante menneskelige komponenter og patogenegenskaber, der er fælles for de fleste patienter med lignende indikation
  2. underliggende regulatoriske netværk og triggere i patogene celler og humant væv.

Kliniske resultater (overlevelse/dødelighed) og behandlingsrespons (respons eller svigt) vil være korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata.
E) Kliniske kontroller for A), B) og C) uden opnåede prøver
For kliniske kontroller vil kliniske karakteristika for patienter med påvisning af målpatogener i deres rutineprøver (men som ikke kunne inkluderes til prøveanalyse i denne undersøgelse) blive vurderet.
Andet: analyse af antimikrobiel resistens

I prøver fra patienter inficeret med et af fokuspatogenerne (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være:

(i) isolerede og patogene bakterier karakteriseret; (ii) patogen in-situ egenskaber ved enkeltcelle- og bulk-gennemsnit bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakoncentration bestemt (v) bakteriel vækst overvåget

Fratrækkes dataene:

  1. relevante menneskelige komponenter og patogenegenskaber, der er fælles for de fleste patienter med lignende indikation
  2. underliggende regulatoriske netværk og triggere i patogene celler og humant væv.

Kliniske resultater (overlevelse/dødelighed) og behandlingsrespons (respons eller svigt) vil være korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata.
F) Kohorte med analyse, om anvendelsen af ​​artikel (Art) 34 HFV kan undgå en bias
Da en del af data og prøver i denne undersøgelse er indsamlet med de etiske udvalgs repræsentative samtykke, undersøges det, om anvendelsen af ​​art. 34 HFV forhindrer selektionsbias i forhold til undersøgelsespopulationen. Til dette formål er forskelle mellem den faktiske undersøgelsespopulation ved brug af art. 34 HFV og undersøgelsespopulationen med givet forskningssamtykke vil blive undersøgt beskrivende i forhold til forekomsten af ​​multiresistente bakterier og andre tilgængelige populationskarakteristika.
Andet: analyse af antimikrobiel resistens

I prøver fra patienter inficeret med et af fokuspatogenerne (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være:

(i) isolerede og patogene bakterier karakteriseret; (ii) patogen in-situ egenskaber ved enkeltcelle- og bulk-gennemsnit bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakoncentration bestemt (v) bakteriel vækst overvåget

Fratrækkes dataene:

  1. relevante menneskelige komponenter og patogenegenskaber, der er fælles for de fleste patienter med lignende indikation
  2. underliggende regulatoriske netværk og triggere i patogene celler og humant væv.

Kliniske resultater (overlevelse/dødelighed) og behandlingsrespons (respons eller svigt) vil være korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata.

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Klinisk resultat: overlevelsesrate
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
Overlevelsesrate (korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata. In vitro hentede værts- og bakteriedata omfatter: Proteomics, Metabolomics, FISH, Histologi, PCR/Mikrobiel genomsekventering, Mikrobielt transkriptom, Antibiotikakoncentration, Timelapse-undersøgelser, fænotypiske karakteriseringer, molekylær typning, medfødt immunresponskarakterisering, Antibiotikatolerance-testsystemer, 3-D-modeller, transkriptomik, flowcytometri (FACS))
engangsvurdering ved baseline
Klinisk resultat: dødelighed
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
Dødelighedsrate (korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata. In vitro hentede værts- og bakteriedata omfatter: Proteomics, Metabolomics, FISH, Histologi, PCR/Mikrobiel genomsekventering, Mikrobielt transkriptom, Antibiotikakoncentration, Timelapse-undersøgelser, fænotypiske karakteriseringer, molekylær typning, medfødt immunresponskarakterisering, Antibiotikatolerance-testsystemer, 3-D-modeller, transkriptomik, flowcytometri (FACS))
engangsvurdering ved baseline
Behandlingsrespons (binært: ja/nej)
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
Behandlingsrespons (korreleret til de in vitro-hentede værts- og bakteriedata. In vitro hentede værts- og bakteriedata omfatter: Proteomics, Metabolomics, FISH, Histologi, PCR/Mikrobiel genomsekventering, Mikrobielt transkriptom, Antibiotikakoncentration, Timelapse-undersøgelser, fænotypiske karakteriseringer, molekylær typning, medfødt immunresponskarakterisering, Antibiotikatolerance-testsystemer, 3-D-modeller, transkriptomik, flowcytometri (FACS))
engangsvurdering ved baseline

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

University Hospital, Basel, Switzerland

Samarbejdspartnere

Swiss National Science Foundation

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Nina Khanna, Prof., University Hospital Basel, Division of Infectiology

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

3. december 2020

Primær færdiggørelse (Anslået)

1. december 2028

Studieafslutning (Anslået)

1. december 2028

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

26. juli 2021

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

18. august 2021

Først opslået (Faktiske)

24. august 2021

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

25. marts 2025

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

27. februar 2025

Sidst verificeret

1. februar 2025

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Nøgleord

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • 2020-02588; pe20Khanna

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Antimikrobiel resistens (AMR)

Søg i lignende forsøg

Sponsorer og samarbejdspartnere

Medicinske tilstande

Narkotikainterventioner

CROs by country

CROs in Guatemala

Betingelser

Sjældne sygdomme

Narkotikainterventioner

Kosttilskud

Sponsor / samarbejdspartnere

Placeringer

Abonner