Spektroskopi og kunstig intelligens til at forstyrre status quo i livmoderhalskræftscreening

Efter at have indhentet informeret samtykke, vil der blive indhentet cervikal- og urinprøver fra alle tilmeldte deltagere. Cervikale biopsier i sygdomsgruppen vil blive udført efter udbydernes skøn i henhold til rutinemæssige kolposkopiprotokoller. Cervikale prøver vil blive indsamlet af de behandlende gynækologer, og urinprøver vil blive indsamlet af deltagerne. Alikvoter af urin- og livmoderhalsprøver vil blive testet for HPV-DNA med cobas 4800 HPV-test (Roche Diagnostics), der fungerer som guldstandarden på Newfoundland Public Health Laboratory, St. John's, Newfoundland. Cobas-testen identificerer dog kun to (type 16 og 18) af 14 højrisiko HPV-genotyper specifikt. Derfor vil et andet sæt alikvoter blive testet på Seegene laboratoriet i Kitchener, Ontario for at opnå fuldstændig genotypeprofil af alle 14 højrisiko genotyper samt kvantitative HPV-resultater ved hjælp af Anyplex HPV DNA-test (Seegene Inc), en næste generation af HPV-test . Urinprøver vil også blive testet uafhængigt af infrarød (IR) spektroskopi og signaler analyseret af Prof. Rehmans laboratorium, Department of Engineering, Lancaster University, Lancaster Storbritannien (UK) for at påvise HPV. Spektroskopiresultater vil blive sammenlignet med HPV-testresultater med genotyper for at bestemme overensstemmelse mellem prøvetyper og mellem testteknologierne, med en særlig reference til urintestning. Biopsi bekræftet CIN2+ vil tjene som det kliniske endepunkt til at bestemme sensitiviteten og specificiteten af ​​urinspektroskopitest i sammenligning med urin HPV-test; cervikale HPV-resultater vil tjene som referencemetode. Vi samarbejder med NSV-Tech, en bioteknologisk virksomhed baseret i USA og Indien, som har erfaring med kunstig intelligens og kræftscreening ved hjælp af tabletbaseret teknologi. Spektroskopisignaler vil blive delt med NSV-Tech for at udvikle kunstige neurale netværk (ANN). Spektroskopi-output, der er knyttet til grundsandheden (biopsi bekræftede abnorme cervikale celler (CIN2)+ histologi) vil blive brugt til at udvikle ANN for at forbedre diagnostisk nøjagtighed af dette klinisk relevante endepunkt og fjerne subjektivitet. Undersøgelsen er afhængig af spektroskopiens evne til at påvise HPV. Forskerholdet er overbevist om, at dette vil være muligt. Som nævnt gennemgår medlemmer af forskerholdet referenceurinprøver, der tidligere er analyseret ved hjælp af standard HPV-detektionsmetoder for at bekræfte, at spektroskopi er en brugbar metode. Indsamlingen og analysen af ​​kontrolprøver bruger standardmetoder. Dataindsamlingen vil finde sted i en akademisk kolposkopiklinik med tilstrækkelig patientvolumen og en dokumenteret track record i rekruttering af patienter til sådanne forsøg. Analysen af ​​spektroskopi i Storbritannien af ​​spektroskopi, er i laboratorier, der har betydelig erfaring med at vurdere biologiske prøver. Projektets internationale samarbejde er betydeligt og samler ledere i verdensklasse inden for forebyggelse af livmoderhalskræft, som alle har erfaring med ny teknologi og screeningsforsøg.