Mikrobiom i hoved- og halspladecellekarcinom
Humant mikrobioms rolle i hoved- og halskræft
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Kristi Engle Folchert
- Telefonnummer: (303) 724-9528
- E-mail: kristi.englefolchert@cuanschutz.edu
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Yosr Doghri
- Telefonnummer: (303) 724-6550
- E-mail: yosr.doghri@cuanschutz.edu
Studiesteder
-
-
Colorado
-
Aurora, Colorado, Forenede Stater, 80045
- Rekruttering
- University of Colorado Cancer Center
-
Ledende efterforsker:
- Shi-Long Lu, MD, PhD
-
Kontakt:
- Yosr Doghri
- Telefonnummer: (303) 724-6550
- E-mail: yosr.doghri@cuanschutz.edu
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Emner svarende til eller over 18 år.
- Patienter, der ses og evalueres af en udbyder i den voksne Otolaryngology-klinik ved University of Colorado Health.
- Patienter med diagnosen OSCC.
- Lige så mange aldersmatchede patienter, der besøger klinikken af andre årsager end OSCC-diagnoser, som kontrolgruppen.
- Evne til at forstå og villighed til at underskrive et skriftligt informeret samtykkedokument
Ekskluderingskriterier:
- Forsøgspersoner under 18 år eller over 100 år
- Emner, der ikke ønsker at deltage
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Antal grupper/kohorter
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorteGruppe / kohorte |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Oral planocellulært karcinom spytprøvegruppe
Spyt vil blive opsamlet mindst 30 minutter efter forsøgspersoner holder op med at spise, drikke, tygge tyggegummi og ryge. Forsøgspersoner vil blive instrueret i at spytte spyt i et opsamlingsrør. Spyttet vil blive delt i to portioner, en der straks fryses kl -80C og en, der er blandet 1:1 med præreduceret tryptisk sojabouillon, L-cystein og glycerol og derefter frosset ved -80C for at bevare levedygtigheden af mikroorganismer. |
Metagenomisk sekvensering af haglgevær vil karakterisere kræftassocierede ændringer i mikrobiel funktionel kapacitet og taksonomiske profiler på art/stammeniveau.
Metagenomics vil give data om mikrobiel funktionel kapacitet sammen med bredere taksonomiske klassifikationer.
Metabolisk analyse vil blive udført ved hjælp af LC/MS-baseret metabolisk analyse.
En målrettet tilgang vil kvantificere et panel af 30 forbindelser, herunder Trp pathway-produkter, mens en ikke-målrettet tilgang, når den anvendes på både lipid- og vandfaseforbindelser, vil profilere relative ændringer i forbindelser, der kan påvirke værten
|
|
Ikke oral planocellulært karcinom spytprøvegruppe
Spyt vil blive opsamlet mindst 30 minutter efter forsøgspersoner holder op med at spise, drikke, tygge tyggegummi og ryge. Forsøgspersoner vil blive instrueret i at spytte spyt i et opsamlingsrør. Spyttet vil blive delt i to portioner, en der straks fryses kl -80C og en, der er blandet 1:1 med præreduceret tryptisk sojabouillon, L-cystein og glycerol og derefter frosset ved -80C for at bevare levedygtigheden af mikroorganismer. |
Metagenomisk sekvensering af haglgevær vil karakterisere kræftassocierede ændringer i mikrobiel funktionel kapacitet og taksonomiske profiler på art/stammeniveau.
Metagenomics vil give data om mikrobiel funktionel kapacitet sammen med bredere taksonomiske klassifikationer.
Metabolisk analyse vil blive udført ved hjælp af LC/MS-baseret metabolisk analyse.
En målrettet tilgang vil kvantificere et panel af 30 forbindelser, herunder Trp pathway-produkter, mens en ikke-målrettet tilgang, når den anvendes på både lipid- og vandfaseforbindelser, vil profilere relative ændringer i forbindelser, der kan påvirke værten
|
|
Oral planocellulært karcinom afføringsprøvegruppe
Afføringsmetoderne kan variere afhængigt af patienten.
Målet er at indsamle friske afføringsprøver, de der er tilgængelige vil blive indsamlet under studiebesøget.
Hvis en patient ikke er i stand til at give en prøve ved besøget, kan prøver indsamles hjemme ved hjælp af OMNIgene-GUT og OMNImet-GUT kits (DNA Genotek, Inc.).
|
Metagenomisk sekvensering af haglgevær vil karakterisere kræftassocierede ændringer i mikrobiel funktionel kapacitet og taksonomiske profiler på art/stammeniveau.
Metagenomics vil give data om mikrobiel funktionel kapacitet sammen med bredere taksonomiske klassifikationer.
Metabolisk analyse vil blive udført ved hjælp af LC/MS-baseret metabolisk analyse.
En målrettet tilgang vil kvantificere et panel af 30 forbindelser, herunder Trp pathway-produkter, mens en ikke-målrettet tilgang, når den anvendes på både lipid- og vandfaseforbindelser, vil profilere relative ændringer i forbindelser, der kan påvirke værten
|
|
Ikke oral planocellulært karcinom afføringsprøvegruppe
Afføringsmetoderne kan variere afhængigt af patienten.
Målet er at indsamle friske afføringsprøver, de der er tilgængelige vil blive indsamlet under studiebesøget.
Hvis en patient ikke er i stand til at give en prøve ved besøget, kan prøver indsamles hjemme ved hjælp af OMNIgene-GUT og OMNImet-GUT kits (DNA Genotek, Inc.).
|
Metagenomisk sekvensering af haglgevær vil karakterisere kræftassocierede ændringer i mikrobiel funktionel kapacitet og taksonomiske profiler på art/stammeniveau.
Metagenomics vil give data om mikrobiel funktionel kapacitet sammen med bredere taksonomiske klassifikationer.
Metabolisk analyse vil blive udført ved hjælp af LC/MS-baseret metabolisk analyse.
En målrettet tilgang vil kvantificere et panel af 30 forbindelser, herunder Trp pathway-produkter, mens en ikke-målrettet tilgang, når den anvendes på både lipid- og vandfaseforbindelser, vil profilere relative ændringer i forbindelser, der kan påvirke værten
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Karakteriser menneskelig dysbiose
Tidsramme: Dag 1
|
Afførings- og spytprøver vil blive indsamlet fra deltagerne, hvilket giver os mulighed for at reproducere menneskelig dysbiose og analysere, om HNSCC påvirker ens mikrobiomsammensætning.
Metagenomisk sekventering vil blive udført ved brug af DNA-ekstraktion, biblioteksgenerering og Illumina-sekventering.
Mindst 30 millioner parrede 2x150bp metagenomiske aflæsninger vil blive genereret pr. prøve ved hjælp af Illumina NovaSeq-platformen.
|
Dag 1
|
|
Karakteriser menneskelig metabolomik
Tidsramme: Dag 1
|
Gennem vores afførings- og spytprøver vil vi være i stand til at karakterisere metagenomiske og metaboliske signaturer hos behandlingsnaive OSCC- og ikke-OSCC-patienter.
Metabolisk analyse vil blive udført ved hjælp af LC/MS-baseret metabolisk analyse.
En målrettet tilgang vil kvantificere et panel på 30 forbindelser inklusive Trp-pathway-produkter, mens en ikke-målrettet tilgang, når den anvendes på både lipid- og vandfaseforbindelser, vil profilere relative ændringer i forbindelser, der kan påvirke værts- og metaboliske og immunstatus.
|
Dag 1
|
|
Integrativ multiomisk dataanalyse og biomarkøropdagelse
Tidsramme: Dag 365
|
Vi forventer at finde ud af, at specifikke sæt af mikrobielle og værtsfaktorer interagerer med hinanden for at fremme OSCC.
|
Dag 365
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Indvirkning af human dysbiose på OSCC-udvikling hos mus
Tidsramme: Dag 10 - Dag 100
|
Frisk indsamlede spyt- og afføringsprøver fra 10 forsøgspersoner i hver behandlingskategori vil blive brugt til at rekonstituere mikrobiota.
|
Dag 10 - Dag 100
|
|
Overvåg tumorstørrelse
Tidsramme: Dag 10 - Dag 100
|
Tumorstørrelse (både vægt og størrelse) vil blive overvåget ved hjælp af Bli-billeddannelse.
Disse mål vil blive vurderet mellem behandlingsgrupper ved ANOVA eller variansanalyse.
|
Dag 10 - Dag 100
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Samarbejdspartnere
Samarbejdspartnere
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Shi-Long E Lu, MD, PhD, University of Colorado, Denver
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Anslået)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Anslået)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
- Mundsygdomme
- Stomatognatiske sygdomme
- Neoplasmer efter sted
- Neoplasmer
- Otorhinolaryngologiske sygdomme
- Otorhinolaryngologiske neoplasmer
- Pharyngeale sygdomme
- Læbesygdomme
- Neoplasmer i hoved og hals
- Mundens neoplasmer
- Neoplasmer i læberne
- Pharyngeale neoplasmer
- Undersøgelsesteknikker
- Kliniske laboratorieteknikker
- Diagnostiske teknikker og procedurer
- Diagnose
- Cytologiske teknikker
- Metabolisk Flux Analyse
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- 23-0016.cc
- P50CA261605 (U.S. NIH-bevilling/kontrakt)
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .