Microbioma nel carcinoma a cellule squamose della testa e del collo
Ruolo del microbioma umano nel cancro della testa e del collo
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Intervento / Trattamento
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Iscrizione
Contatti e Sedi
Contatto studio
Contatto studio
- Nome: Kristi Engle Folchert
- Numero di telefono: (303) 724-9528
- Email: kristi.englefolchert@cuanschutz.edu
Backup dei contatti dello studio
- Nome: Yosr Doghri
- Numero di telefono: (303) 724-6550
- Email: yosr.doghri@cuanschutz.edu
Luoghi di studio
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Colorado
-
Aurora, Colorado, Stati Uniti, 80045
- Reclutamento
- University of Colorado Cancer Center
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Investigatore principale:
- Shi-Long Lu, MD, PhD
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Contatto:
- Yosr Doghri
- Numero di telefono: (303) 724-6550
- Email: yosr.doghri@cuanschutz.edu
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Soggetti di età pari o superiore a 18 anni.
- Pazienti che vengono visti e valutati da un fornitore all'interno della clinica di otorinolaringoiatria per adulti presso l'Università del Colorado Health.
- Pazienti che presentano una diagnosi di OSCC.
- Un numero uguale di pazienti della stessa età che visitano la clinica per motivi diversi dalle diagnosi di OSCC, come gruppo di controllo.
- Capacità di comprensione e disponibilità a firmare un documento di consenso informato scritto
Criteri di esclusione:
- Soggetti di età inferiore ai 18 anni o superiore ai 100 anni
- Soggetti non disposti a partecipare
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Numero di gruppi/coorti
Coorti e interventi
Gruppo / CoorteGruppo / Coorte |
Intervento / TrattamentoIntervento / Trattamento |
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Gruppo di campioni di saliva per carcinoma a cellule squamose orale
La saliva verrà raccolta almeno 30 minuti dopo che i soggetti smettono di mangiare, bere, masticare gomme e fumare. I soggetti verranno istruiti a sputare la saliva in un tubo di raccolta. La saliva verrà divisa in due aliquote, una che verrà immediatamente congelata -80°C e uno che viene miscelato 1:1 con brodo di soia triptico pre-ridotto, L-cisteina e glicerolo quindi congelato a -80°C per preservare la vitalità dei microrganismi. |
Il sequenziamento metagenomico shotgun caratterizzerà i cambiamenti associati al cancro nella capacità funzionale microbica e nei profili tassonomici a livello di specie/ceppo.
La metagenomica fornirà dati sulla capacità funzionale microbica insieme a classificazioni tassonomiche più ampie.
L'analisi metabolica sarà condotta utilizzando l'analisi metabolica basata su LC/MS.
Un approccio mirato quantificherà un pannello di 30 composti inclusi i prodotti del percorso Trp mentre un approccio non mirato, se applicato sia ai composti della fase lipidica che acquosa, descriverà i cambiamenti relativi nei composti che possono influenzare l'ospite
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Gruppo di campioni di saliva di carcinoma a cellule squamose non orale
La saliva verrà raccolta almeno 30 minuti dopo che i soggetti smettono di mangiare, bere, masticare gomme e fumare. I soggetti verranno istruiti a sputare la saliva in un tubo di raccolta. La saliva verrà divisa in due aliquote, una che verrà immediatamente congelata -80°C e uno che viene miscelato 1:1 con brodo di soia triptico pre-ridotto, L-cisteina e glicerolo quindi congelato a -80°C per preservare la vitalità dei microrganismi. |
Il sequenziamento metagenomico shotgun caratterizzerà i cambiamenti associati al cancro nella capacità funzionale microbica e nei profili tassonomici a livello di specie/ceppo.
La metagenomica fornirà dati sulla capacità funzionale microbica insieme a classificazioni tassonomiche più ampie.
L'analisi metabolica sarà condotta utilizzando l'analisi metabolica basata su LC/MS.
Un approccio mirato quantificherà un pannello di 30 composti inclusi i prodotti del percorso Trp mentre un approccio non mirato, se applicato sia ai composti della fase lipidica che acquosa, descriverà i cambiamenti relativi nei composti che possono influenzare l'ospite
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Gruppo campione di feci di carcinoma a cellule squamose orale
I metodi di raccolta delle feci possono variare a seconda del paziente.
L'obiettivo è raccogliere campioni di feci fresche, quelli disponibili verranno raccolti durante la visita di studio.
Se un paziente non è in grado di fornire un campione durante la visita, i campioni possono essere raccolti a casa utilizzando i kit OMNIgene-GUT e OMNImet-GUT (DNA Genotek, Inc.).
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Il sequenziamento metagenomico shotgun caratterizzerà i cambiamenti associati al cancro nella capacità funzionale microbica e nei profili tassonomici a livello di specie/ceppo.
La metagenomica fornirà dati sulla capacità funzionale microbica insieme a classificazioni tassonomiche più ampie.
L'analisi metabolica sarà condotta utilizzando l'analisi metabolica basata su LC/MS.
Un approccio mirato quantificherà un pannello di 30 composti inclusi i prodotti del percorso Trp mentre un approccio non mirato, se applicato sia ai composti della fase lipidica che acquosa, descriverà i cambiamenti relativi nei composti che possono influenzare l'ospite
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Gruppo campione di feci di carcinoma a cellule squamose non orale
I metodi di raccolta delle feci possono variare a seconda del paziente.
L'obiettivo è raccogliere campioni di feci fresche, quelli disponibili verranno raccolti durante la visita di studio.
Se un paziente non è in grado di fornire un campione durante la visita, i campioni possono essere raccolti a casa utilizzando i kit OMNIgene-GUT e OMNImet-GUT (DNA Genotek, Inc.).
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Il sequenziamento metagenomico shotgun caratterizzerà i cambiamenti associati al cancro nella capacità funzionale microbica e nei profili tassonomici a livello di specie/ceppo.
La metagenomica fornirà dati sulla capacità funzionale microbica insieme a classificazioni tassonomiche più ampie.
L'analisi metabolica sarà condotta utilizzando l'analisi metabolica basata su LC/MS.
Un approccio mirato quantificherà un pannello di 30 composti inclusi i prodotti del percorso Trp mentre un approccio non mirato, se applicato sia ai composti della fase lipidica che acquosa, descriverà i cambiamenti relativi nei composti che possono influenzare l'ospite
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Caratterizza la disbiosi umana
Lasso di tempo: Giorno 1
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I campioni di feci e saliva saranno raccolti dai partecipanti, permettendoci di riprodurre la disbiosi umana e analizzare se l'HNSCC influisce sulla composizione del proprio microbioma.
Il sequenziamento metagenomico sarà condotto attraverso l'uso di estrazione del DNA, generazione di librerie e sequenziamento Illumina.
Saranno generate almeno 30 milioni di letture metagenomiche paired-end 2x150bp per campione utilizzando la piattaforma Illumina NovaSeq.
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Giorno 1
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Caratterizzare la metabolomica umana
Lasso di tempo: Giorno 1
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Attraverso i nostri campioni di feci e saliva saremo in grado di caratterizzare le firme metagenomiche e metaboliche in pazienti OSCC e non OSCC naïve al trattamento.
L'analisi metabolica sarà condotta utilizzando l'analisi metabolica basata su LC/MS.
Un approccio mirato quantificherà un pannello di 30 composti inclusi i prodotti del percorso Trp, mentre un approccio non mirato, se applicato sia ai composti della fase lipidica che acquosa, descriverà i cambiamenti relativi nei composti che possono influenzare l'ospite, gli stati metabolici e immunitari.
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Giorno 1
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Analisi dei dati multi-omica integrativa e scoperta di biomarcatori
Lasso di tempo: Giorno 365
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Ci aspettiamo di scoprire che gruppi specifici di fattori microbici e dell'ospite interagiscono tra loro per promuovere l'OSCC.
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Giorno 365
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Misure di risultato secondarie
Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Impatto della disbiosi umana sullo sviluppo dell'OSCC nei topi
Lasso di tempo: Giorno 10-Giorno 100
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Campioni di saliva e feci appena raccolti da 10 soggetti di ciascuna categoria di trattamento verranno utilizzati per ricostituire il microbiota.
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Giorno 10-Giorno 100
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Monitorare le dimensioni del tumore
Lasso di tempo: Giorno 10-Giorno 100
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Le dimensioni del tumore (sia peso che dimensione) saranno monitorate mediante Bli-imaging.
Queste misure saranno valutate tra i gruppi di trattamento mediante ANOVA o analisi del test della varianza.
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Giorno 10-Giorno 100
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Collaboratori
Collaboratori
Investigatori
Investigatori
- Investigatore principale: Shi-Long E Lu, MD, PhD, University of Colorado, Denver
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Inizio studio
Completamento primario (Stimato)
Completamento primario
Completamento dello studio (Stimato)
Completamento dello studio
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Primo Inserito
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento pubblicato
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
- Malattie della bocca
- Malattie stomatognatiche
- Neoplasie per sede
- Neoplasie
- Malattie otorinolaringoiatriche
- Neoplasie otorinolaringoiatriche
- Malattie faringee
- Malattie delle labbra
- Neoplasie della testa e del collo
- Neoplasie della bocca
- Neoplasie labiali
- Neoplasie faringee
- Tecniche investigative
- Tecniche di laboratorio clinico
- Tecniche e procedure diagnostiche
- Diagnosi
- Tecniche citologiche
- Analisi del Flusso Metabolico
Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- 23-0016.cc
- P50CA261605 (Sovvenzione/contratto NIH degli Stati Uniti)
Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
prodotto fabbricato ed esportato dagli Stati Uniti
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