Methyleringsspecifik PCR-test til tidlig screening og tidlig diagnose af nasopharyngeal carcinom
Nasopharyngeal carcinom er en af de mest almindelige ondartede tumorer i Kina, med fremskridt inden for radiokemisk omfattende behandling, tidligt stadium. 5-års overlevelsesraten for nasopharyngeal cancer er mere end 95%. Men på grund af det skjulte sted for nasopharyngeal carcinom og manglen på tydelige tidlige kliniske symptomer, tilhører mere end 70 % af de 87.000 nydiagnosticerede tilfælde hvert år det fremskredne stadium af nasopharyngeal carcinom, og 5-års overlevelsesraten for fremskreden nasopharyngeal carcinom er kun omkring 70%. Derfor er tidlig screening og diagnose og tidlig behandling nøglen til at forbedre overlevelsen for patienter med nasopharyngeal cancer. At vælge en følsom og nøjagtig biomarkør for nasopharynxcancer og stole på en enkel og gennemførlig undersøgelsesmetode til prøveudtagning vil i høj grad forbedre den tidlige diagnosticering af nasopharyngeal cancer.
DNA-methylering er en form for kemisk modifikation af DNA, der kan udføres uden at ændre DNA-sekvensændringerne i genetisk ekspression. Hovedrollen for DNA-methylering er at regulere genekspression. Tumorsuppressorgener spiller funktionerne til at regulere celledifferentiering, modning og programmeret død. Hvis der imidlertid forekommer methylering af promotorregionen, hæmmes ekspressionen af tumorsuppressorgener, og funktionen går tabt, hvilket resulterer i, at celler forbliver i stadiet med lav differentiering og proliferation, hæmning af apoptose, dannelse af blodkar af klyngeceller, tab af celleadhæsion og dannelse af tumorer. Det kan ses, at DNA-methylering forekommer i det tidlige stadie af tumor, og dette biologiske træk gør det til et stærkt anvendelsesperspektiv i tidlig tumorscreening.
Der er mange metoder til at detektere DNA-methylering, blandt hvilke methyleringsspecifik PCR (MSP) nemt og hurtigt kan bestemme methyleringsstatus for et specifikt gen, der opfylder de overkommelige, bekvemme og nemme at generalisere karakteristika, der kræves til screeningstests. I kombination med tidligere MSP-eksperimenter og tidligere rapporter fandt vi, at methyleringsniveauerne af promotorfragmenter af H4C6-, Septin9- og RASSF1A-gener i nasopharyngealt carcinomvæv var signifikant højere end dem i sunde humane nasopharyngeale væv. Dette tyder på, at methylering af disse tre gener kan bruges som biomarkører til tidlig screening og diagnosticering af nasopharyngeal carcinom.
Derfor har denne undersøgelse til hensigt at detektere methyleringsstatus af H4C6, Septin9 og RASSF1A gener baseret på MSP metode med enkel betjening og lave omkostninger. Ved at bruge klinikopatologisk diagnose som guldstandarden blev værdien af dette gen-methyleringsindeks i tidlig screening og tidlig diagnose af nasopharyngeal cancer verificeret, hvilket giver et nyt detektionsindeks og metode til at forbedre den tidlige diagnosticeringsrate for nasopharyngeal cancer.
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
Guangdong
-
Guangzhou, Guangdong, Kina, 510060
- Sun Yat-sen University Cancer Center
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Casegruppe (nasopharyngeal carcinoma gruppe): nasopharyngeal carcinom bekræftet ved histologi eller cytologi. Kontrolgruppe (non-nasopharyngeal carcinoma gruppe): ingen nasopharyngeal carcinoma forsøgspersoner.
- Alder ≥18 år og ≤70 år.
- Ingen tidligere historie med andre tumorer, og ingen nuværende tumorer.
Ekskluderingskriterier:
- Karnofsky scorer ≤70 point eller Zubrod scorer >2 point.
- Der er alvorlige medicinske komplikationer, dysfunktion af vigtige organer (hjerte, lunge, lever, nyre) eller neuropsykiatriske lidelser.
- Andre patienter eller frivillige, som den tilsynsførende læge vurderer som uegnede til inklusion.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Antal grupper/kohorter
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorteGruppe / kohorte |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Patientgruppe
Prøvetagning af deres nasopharyngeale podningsprøver og perifere blodprøver.
|
Methyleringsspecifik PCR er den enkleste og hurtigste metode til kvalitativ påvisning af methyleringsstatus. Den umethylerede C-base omdannes til U ved bisulfitomdannelse, som efterfølgende amplificeres ved PCR med primere (methyleringsspecifikke og ikke-methyleringsspecifikke primere) og efterfølgende påvises ved agarosegelelektroforese eller en probe. Nøglen til MSP er at designe PCR-primere til specifikke genregioner. Forskerholdet i dette projekt har tidligere fundet sekvenssteder for methylering af H4C6-, Septin9- og RASSF1A-gener i nasopharyngealt carcinomvæv gennem methyleringssekventering og designet specifikke MSP-amplifikationsprimere og prober i overensstemmelse hermed, som kan udføre methyleringsdetektion nemt og hurtigt. |
|
Ikke-patient gruppe
Prøvetagning af deres nasopharyngeale podningsprøver og perifere blodprøver.
|
Methyleringsspecifik PCR er den enkleste og hurtigste metode til kvalitativ påvisning af methyleringsstatus. Den umethylerede C-base omdannes til U ved bisulfitomdannelse, som efterfølgende amplificeres ved PCR med primere (methyleringsspecifikke og ikke-methyleringsspecifikke primere) og efterfølgende påvises ved agarosegelelektroforese eller en probe. Nøglen til MSP er at designe PCR-primere til specifikke genregioner. Forskerholdet i dette projekt har tidligere fundet sekvenssteder for methylering af H4C6-, Septin9- og RASSF1A-gener i nasopharyngealt carcinomvæv gennem methyleringssekventering og designet specifikke MSP-amplifikationsprimere og prober i overensstemmelse hermed, som kan udføre methyleringsdetektion nemt og hurtigt. |
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Følsomhed
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 1 år
|
Andelen af patienter med patologisk diagnose af nasopharyngeal carcinom med positivt methyleringsindeks.
|
gennem studieafslutning, i gennemsnit 1 år
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Specificitet
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 1 år
|
Andelen af non-nasopharyngeale carcinompatienter med negativt methyleringsindeks.
|
gennem studieafslutning, i gennemsnit 1 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Samarbejdspartnere
Samarbejdspartnere
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Yi-Jun Hua, Phd, Sun Yat-sen University
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Chan KCA, Woo JKS, King A, Zee BCY, Lam WKJ, Chan SL, Chu SWI, Mak C, Tse IOL, Leung SYM, Chan G, Hui EP, Ma BBY, Chiu RWK, Leung SF, van Hasselt AC, Chan ATC, Lo YMD. Analysis of Plasma Epstein-Barr Virus DNA to Screen for Nasopharyngeal Cancer. N Engl J Med. 2017 Aug 10;377(6):513-522. doi: 10.1056/NEJMoa1701717. Erratum In: N Engl J Med. 2018 Mar 8;378(10 ):973.
- Zhang MX, Li J, Shen GP, Zou X, Xu JJ, Jiang R, You R, Hua YJ, Sun Y, Ma J, Hong MH, Chen MY. Intensity-modulated radiotherapy prolongs the survival of patients with nasopharyngeal carcinoma compared with conventional two-dimensional radiotherapy: A 10-year experience with a large cohort and long follow-up. Eur J Cancer. 2015 Nov;51(17):2587-95. doi: 10.1016/j.ejca.2015.08.006. Epub 2015 Aug 26.
- Zeng Y, Zhang LG, Wu YC, Huang YS, Huang NQ, Li JY, Wang YB, Jiang MK, Fang Z, Meng NN. Prospective studies on nasopharyngeal carcinoma in Epstein-Barr virus IgA/VCA antibody-positive persons in Wuzhou City, China. Int J Cancer. 1985 Nov 15;36(5):545-7. doi: 10.1002/ijc.2910360505.
- Ji MF, Sheng W, Cheng WM, Ng MH, Wu BH, Yu X, Wei KR, Li FG, Lian SF, Wang PP, Quan W, Deng L, Li XH, Liu XD, Xie YL, Huang SJ, Ge SX, Huang SL, Liang XJ, He SM, Huang HW, Xia SL, Ng PS, Chen HL, Xie SH, Liu Q, Hong MH, Ma J, Yuan Y, Xia NS, Zhang J, Cao SM. Incidence and mortality of nasopharyngeal carcinoma: interim analysis of a cluster randomized controlled screening trial (PRO-NPC-001) in southern China. Ann Oncol. 2019 Oct 1;30(10):1630-1637. doi: 10.1093/annonc/mdz231.
- Karimi M, Johansson S, Stach D, Corcoran M, Grander D, Schalling M, Bakalkin G, Lyko F, Larsson C, Ekstrom TJ. LUMA (LUminometric Methylation Assay)--a high throughput method to the analysis of genomic DNA methylation. Exp Cell Res. 2006 Jul 1;312(11):1989-95. doi: 10.1016/j.yexcr.2006.03.006. Epub 2006 Apr 19.
- Lyu JY, Chen JY, Zhang XJ, Zhang MW, Yu GS, Zhang L, Wen Z. Septin 9 Methylation in Nasopharyngeal Swabs: A Potential Minimally Invasive Biomarker for the Early Detection of Nasopharyngeal Carcinoma. Dis Markers. 2020 May 5;2020:7253531. doi: 10.1155/2020/7253531. eCollection 2020.
- Chang HW, Chan A, Kwong DL, Wei WI, Sham JS, Yuen AP. Evaluation of hypermethylated tumor suppressor genes as tumor markers in mouth and throat rinsing fluid, nasopharyngeal swab and peripheral blood of nasopharygeal carcinoma patient. Int J Cancer. 2003 Jul 20;105(6):851-5. doi: 10.1002/ijc.11162. Erratum In: Int J Cancer. 2003 Oct 10;106(6):984.
- Wong TS, Kwong DL, Sham JS, Wei WI, Kwong YL, Yuen AP. Quantitative plasma hypermethylated DNA markers of undifferentiated nasopharyngeal carcinoma. Clin Cancer Res. 2004 Apr 1;10(7):2401-6. doi: 10.1158/1078-0432.ccr-03-0139.
- Hutajulu SH, Indrasari SR, Indrawati LP, Harijadi A, Duin S, Haryana SM, Steenbergen RD, Greijer AE, Middeldorp JM. Epigenetic markers for early detection of nasopharyngeal carcinoma in a high risk population. Mol Cancer. 2011 May 2;10:48. doi: 10.1186/1476-4598-10-48.
- Ye M, Huang T, Ni C, Yang P, Chen S. Diagnostic Capacity of RASSF1A Promoter Methylation as a Biomarker in Tissue, Brushing, and Blood Samples of Nasopharyngeal Carcinoma. EBioMedicine. 2017 Apr;18:32-40. doi: 10.1016/j.ebiom.2017.03.038. Epub 2017 Apr 2.
- Li Y, Yang X, Du X, Lei Y, He Q, Hong X, Tang X, Wen X, Zhang P, Sun Y, Zhang J, Wang Y, Ma J, Liu N. RAB37 Hypermethylation Regulates Metastasis and Resistance to Docetaxel-Based Induction Chemotherapy in Nasopharyngeal Carcinoma. Clin Cancer Res. 2018 Dec 15;24(24):6495-6508. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-18-0532. Epub 2018 Aug 21. Erratum In: Clin Cancer Res. 2022 Jan 15;28(2):430.
- Shi F, Zhou M, Shang L, Du Q, Li Y, Xie L, Liu X, Tang M, Luo X, Fan J, Zhou J, Gao Q, Qiu S, Wu W, Zhang X, Bode AM, Cao Y. EBV(LMP1)-induced metabolic reprogramming inhibits necroptosis through the hypermethylation of the RIP3 promoter. Theranostics. 2019 Apr 13;9(9):2424-2438. doi: 10.7150/thno.30941. eCollection 2019.
- Zhao Y, Hong XH, Li K, Li YQ, Li YQ, He SW, Zhang PP, Li JY, Li Q, Liang YL, Chen Y, Ma J, Liu N, Chen YP. ZNF582 hypermethylation promotes metastasis of nasopharyngeal carcinoma by regulating the transcription of adhesion molecules Nectin-3 and NRXN3. Cancer Commun (Lond). 2020 Dec;40(12):721-737. doi: 10.1002/cac2.12104. Epub 2020 Oct 10. Erratum In: Cancer Commun (Lond). 2022 Mar;42(3):281-283.
- Chen Y, Zhao Y, Yang X, Ren X, Huang S, Gong S, Tan X, Li J, He S, Li Y, Hong X, Li Q, Ding C, Fang X, Ma J, Liu N. USP44 regulates irradiation-induced DNA double-strand break repair and suppresses tumorigenesis in nasopharyngeal carcinoma. Nat Commun. 2022 Jan 25;13(1):501. doi: 10.1038/s41467-022-28158-2.
- Papanicolau-Sengos A, Aldape K. DNA Methylation Profiling: An Emerging Paradigm for Cancer Diagnosis. Annu Rev Pathol. 2022 Jan 24;17:295-321. doi: 10.1146/annurev-pathol-042220-022304. Epub 2021 Nov 4.
- Roy D, Tiirikainen M. Diagnostic Power of DNA Methylation Classifiers for Early Detection of Cancer. Trends Cancer. 2020 Feb;6(2):78-81. doi: 10.1016/j.trecan.2019.12.006. Epub 2020 Feb 3.
- Widschwendter M, Zikan M, Wahl B, Lempiainen H, Paprotka T, Evans I, Jones A, Ghazali S, Reisel D, Eichner J, Rujan T, Yang Z, Teschendorff AE, Ryan A, Cibula D, Menon U, Wittenberger T. The potential of circulating tumor DNA methylation analysis for the early detection and management of ovarian cancer. Genome Med. 2017 Dec 22;9(1):116. doi: 10.1186/s13073-017-0500-7.
- Sung CK, Yim H. CRISPR-mediated promoter de/methylation technologies for gene regulation. Arch Pharm Res. 2020 Jul;43(7):705-713. doi: 10.1007/s12272-020-01257-8. Epub 2020 Jul 28.
- Mattei AL, Bailly N, Meissner A. DNA methylation: a historical perspective. Trends Genet. 2022 Jul;38(7):676-707. doi: 10.1016/j.tig.2022.03.010. Epub 2022 Apr 30.
- Liu YP, Lv X, Zou X, Hua YJ, You R, Yang Q, Xia L, Guo SY, Hu W, Zhang MX, Chen SY, Lin M, Xie YL, Liu LZ, Sun R, Huang PY, Fan W, Guo X, Hong MH, Chen MY. Minimally invasive surgery alone compared with intensity-modulated radiotherapy for primary stage I nasopharyngeal carcinoma. Cancer Commun (Lond). 2019 Nov 15;39(1):75. doi: 10.1186/s40880-019-0415-3.
- Chan KC, Lo YM. Circulating EBV DNA as a tumor marker for nasopharyngeal carcinoma. Semin Cancer Biol. 2002 Dec;12(6):489-96. doi: 10.1016/s1044579x02000913.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Faktiske)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
- Patologiske processer
- Neoplasmer efter histologisk type
- Neoplasmer
- Neoplasmer efter sted
- Neoplasmer, kirtel og epitel
- Pharyngeale neoplasmer
- Otorhinolaryngologiske neoplasmer
- Neoplasmer i hoved og hals
- Nasopharyngeale sygdomme
- Pharyngeale sygdomme
- Stomatognatiske sygdomme
- Otorhinolaryngologiske sygdomme
- Nasopharyngeale neoplasmer
- Karcinom
- Nasopharyngealt karcinom
- Sygdom
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- 2023-FXY-230-NPC
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .