Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Integration of New Generation Multi-omics Analyses for the Diagnosis of Genetic Neurodevelomental Disorders (NEXTOMIX)

5. august 2026 opdateret af: Centre Hospitalier Universitaire Dijon

Neurodevelopmental disorders (NDDs), including intellectual disability (ID), represent the most common indication for genetic testing. Affecting up to 3% of the general population, NDDs are characterized by significant clinical and genetic heterogeneity. Although short-read genome sequencing (srGS) has driven major advances through the France Genomic Medicine 2025 Plan (PFMG2025), a substantial proportion of patients still lack a molecular diagnosis.

These results are partly explained by the limitations of short-read genome sequencing (srGS). Although effective in many cases, this technology performs poorly in detecting complex structural rearrangements, anomalies within repetitive or GC-rich regions, epigenetic variations, and certain intronic variants. Furthermore, srGS does not allow for the direct assessment of the functional impact of genetic variations on splicing or gene expression. Following a negative srGS result, periodic reanalysis of sequencing data via the PFMG2025 laboratories (AURAGEN and SeqOIA) is the only diagnostic option currently available in routine practice. However, these reanalyses are constrained by financial and staffing limitations as well as strict eligibility criteria, making it difficult for many patients-particularly those with stable neurodevelopmental disorders (NDDs)-to obtain a diagnosis. Moreover, they often consist merely of a data review without bioinformatic updates, and the turnaround times-frequently exceeding one year-contribute to the diagnostic odyssey. Utilizing updated pipelines tailored to the specific characteristics of NDDs for the re-examination of srGS data could serve as an initial source of new diagnoses.

Complementary technologies-such as messenger RNA sequencing (mRNA-seq), optical genome mapping (OGM), and long-read genome sequencing (lrGS)-are available and offer solutions to overcome the limitations of short-read genome sequencing (srGS). In particular, they enable the identification of complex structural variants and the assessment of the functional impact of point variants. Despite their potential, their routine use remains limited due to cost and technical complexity.

Our study proposes a combined strategy to address the limitations of current approaches and improve the diagnosis of neurodevelopmental disorders (NDDs) that remain unresolved after short-read genome sequencing (srGS). It begins with a re-analysis of sequencing data using customized bioinformatics pipelines tailored to the patients' specific clinical profiles. In cases of inconclusive results, innovative multi-omics analyses (mRNA-seq, OGM, and long-read genome sequencing/lrGS) will be employed to investigate complex genetic variants. As multi-omics approaches are not currently integrated into the PFMG2025 framework, the project's findings will be crucial in demonstrating their added value for NDD diagnosis and could pave the way for their inclusion in a future PFMG. By anticipating these developments, NextOmix will help define the diagnostic strategies of the future, aligned with technological advancements and patient needs.

Studieoversigt

Status

Status

Angiver den aktuelle rekrutteringsstatus eller den udvidede adgangsstatus.
Ikke rekrutterer endnu

Betingelser

Betingelser

Den sygdom, lidelse, syndrom, sygdom eller skade, der undersøges. På ClinicalTrials.gov kan tilstande også omfatte andre sundhedsrelaterede problemer, såsom levetid, livskvalitet og sundhedsrisici.

Intervention / Behandling

Intervention / Behandling

En proces eller handling, der er i fokus for en klinisk undersøgelse. Interventioner omfatter lægemidler, medicinsk udstyr, procedurer, vacciner og andre produkter, der enten er til undersøgelse eller allerede er tilgængelige. Interventioner kan også omfatte ikke-invasive tilgange, såsom uddannelse eller ændring af kost og motion.

Undersøgelsestype

Undersøgelsestype

Beskriver karakteren af ​​en klinisk undersøgelse. Undersøgelsestyper omfatter interventionelle undersøgelser (også kaldet kliniske forsøg), observationsundersøgelser (herunder patientregistre) og udvidet adgang.
Interventionel

Tilmelding (Anslået)

Tilmelding

Antallet af deltagere i en klinisk undersøgelse. Den "forventede" tilmelding er det mål for antallet af deltagere, som forskerne skal bruge til undersøgelsen.
132

Fase

Fase

Stadiet af et klinisk forsøg, der studerer et lægemiddel eller et biologisk produkt, baseret på definitioner udviklet af U.S. Food and Drug Administration (FDA). Fasen tager udgangspunkt i undersøgelsens formål, antallet af deltagere og andre karakteristika. Der er fem faser: Tidlig fase 1 (tidligere opført som fase 0), fase 1, fase 2, fase 3 og fase 4. Ikke relevant bruges til at beskrive forsøg uden FDA-definerede faser, herunder forsøg med enheder eller adfærdsmæssige indgreb.
  • Ikke anvendelig

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Studiekontakt

Navn og kontaktoplysninger for den person, der kan besvare spørgsmål om tilmelding til en klinisk undersøgelse. Hvert sted, hvor undersøgelsen udføres, kan også have en specifik kontaktperson, som kan være bedre i stand til at besvare disse spørgsmål.

Studiesteder

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Berettigelseskriterier

De nøglekrav, som personer, der ønsker at deltage i et klinisk studie, skal opfylde eller de egenskaber, de skal have. Kvalifikationskriterier består af både inklusionskriterier (som er nødvendige for at en person kan deltage i undersøgelsen) og eksklusionskriterier (som forhindrer en person i at deltage). Typer af berettigelseskriterier omfatter, om en undersøgelse accepterer raske frivillige, har alders- eller aldersgruppekrav eller er begrænset af køn.

Aldre berettiget til at studere

  • Barn
  • Voksen
  • Ældre voksen

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Beskrivelse

Inclusion Criteria:

  • Index case (minor or adult) with severe to profound intellectual disability or syndromic neurodevelopmental disorder without an identified molecular diagnosis. - Index case with a negative srGS result.
  • Sample collection possible from the index case (blood and skin biopsy) and their biological parent(s) (blood) if material is not otherwise available.
  • Signed consent from the adult index case, or from the legal representatives or guardian (as applicable) of a minor index case, and from their parent(s).

Exclusion Criteria:

  • - Index case or parent(s) not affiliated with or not covered by a social security scheme.
  • Diagnostic hypothesis considered highly probable, for which an available targeted molecular test costs less than the proposed strategy.
  • Suspicion of an acquired cause for the symptoms.
  • Minor parent(s).
  • Parent subject to a legal protection measure, or incapacitated or otherwise unable to provide informed consent.
  • Pregnant, birthing, or breastfeeding woman.
  • Participant (index case or parent) who has previously undergone allogeneic hematopoietic stem cell transplantation, rendering blood sample analysis uninformative.

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Primært formål: Diagnostisk
  • Tildeling: N/A
  • Interventionel model: Enkelt gruppeopgave
  • Maskning: Enkelt

Våben og indgreb

Deltagergruppe / Arm

Deltagergruppe / Arm

En gruppe eller undergruppe af deltagere i et klinisk forsøg, der modtager en specifik intervention/behandling eller ingen intervention i henhold til forsøgets protokol.
Intervention / Behandling

Intervention / Behandling

En proces eller handling, der er i fokus for en klinisk undersøgelse. Interventioner omfatter lægemidler, medicinsk udstyr, procedurer, vacciner og andre produkter, der enten er til undersøgelse eller allerede er tilgængelige. Interventioner kan også omfatte ikke-invasive tilgange, såsom uddannelse eller ændring af kost og motion.
Andet: Patient with severe to profound intellectual disability
Diagnostisk test: Re-analysis of available srGS data
Re-analysis of available srGS data without further analysis, as the results were positive for the causal diagnosis.
Diagnostisk test: Re-analysis of available srGS data, followed by complementary analyses (lrGS sequencing, mRNA, and GMOs)
Re-analysis of available srGS data followed by additional analyses (lrGS sequencing, mRNA-seq, and GMO testing), as the srGS data are negative for the causal diagnosis.
Diagnostisk test: srGS sequencing
New srGS sequencing without additional analyses, as it is positive for the causal diagnosis.
Diagnostisk test: Short-read sequencing (srGS) followed by long-read sequencing (lrGS,), mRNA-sequencing and GMO testing
New srGS sequencing followed by additional analyses (lrGS sequencing, mRNA-seq, and GMO testing) because the srGS data are negative for the causal diagnosis.
Andet: Patient with a syndromic neurodevelopmental disorder with intellectual disability
Diagnostisk test: Re-analysis of available srGS data
Re-analysis of available srGS data without further analysis, as the results were positive for the causal diagnosis.
Diagnostisk test: Re-analysis of available srGS data, followed by complementary analyses (lrGS sequencing, mRNA, and GMOs)
Re-analysis of available srGS data followed by additional analyses (lrGS sequencing, mRNA-seq, and GMO testing), as the srGS data are negative for the causal diagnosis.
Diagnostisk test: srGS sequencing
New srGS sequencing without additional analyses, as it is positive for the causal diagnosis.
Diagnostisk test: Short-read sequencing (srGS) followed by long-read sequencing (lrGS,), mRNA-sequencing and GMO testing
New srGS sequencing followed by additional analyses (lrGS sequencing, mRNA-seq, and GMO testing) because the srGS data are negative for the causal diagnosis.
Andet: Patient with a syndromic neurodevelopmental disorder without intellectual disability
Diagnostisk test: Re-analysis of available srGS data
Re-analysis of available srGS data without further analysis, as the results were positive for the causal diagnosis.
Diagnostisk test: Re-analysis of available srGS data, followed by complementary analyses (lrGS sequencing, mRNA, and GMOs)
Re-analysis of available srGS data followed by additional analyses (lrGS sequencing, mRNA-seq, and GMO testing), as the srGS data are negative for the causal diagnosis.
Diagnostisk test: srGS sequencing
New srGS sequencing without additional analyses, as it is positive for the causal diagnosis.
Diagnostisk test: Short-read sequencing (srGS) followed by long-read sequencing (lrGS,), mRNA-sequencing and GMO testing
New srGS sequencing followed by additional analyses (lrGS sequencing, mRNA-seq, and GMO testing) because the srGS data are negative for the causal diagnosis.

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Primære resultatmål

I et klinisk studies protokol er det planlagte resultatmål, der er det vigtigste for at evaluere effekten af ​​en intervention/behandling. De fleste kliniske undersøgelser har ét primært resultatmål, men nogle har mere end ét.
Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Identification of a causative diagnosis (class 4 or 5 variant according to American College of Medical Genetics criteria) explaining the phenotype and validated during a multidisciplinary team meeting.
Tidsramme: Between 4 and 12 months
Identification of a causative diagnosis (class 4 or 5 variant according to American College of Medical Genetics criteria) explaining the phenotype and validated during a multidisciplinary team meeting.
Between 4 and 12 months

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

Sponsor

Den organisation eller person, der igangsætter undersøgelsen, og som har myndighed og kontrol over undersøgelsen.
Centre Hospitalier Universitaire Dijon

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Anslået)

Studiestart

Den faktiske dato, hvor den første deltager blev tilmeldt en klinisk undersøgelse. Den "forventede" undersøgelses startdato er den dato, som forskerne tror vil være undersøgelsens startdato.
1. september 2026

Primær færdiggørelse (Anslået)

Primær færdiggørelse

Den dato, hvor den sidste deltager i et klinisk studie blev undersøgt eller modtog en intervention for at indsamle endelige data for det primære resultatmål. Hvorvidt det kliniske studie sluttede i henhold til protokollen eller blev afsluttet, påvirker ikke denne dato. For kliniske undersøgelser med mere end ét primært resultatmål med forskellige afslutningsdatoer refererer dette udtryk til den dato, hvor dataindsamlingen er afsluttet for alle de primære resultatmål. Den "forventede" primære afslutningsdato er den dato, som forskerne tror vil være den primære afslutningsdato for undersøgelsen.
1. marts 2029

Studieafslutning (Anslået)

Studieafslutning

Den dato, hvor den sidste deltager i et klinisk studie blev undersøgt eller modtog en intervention/behandling for at indsamle endelige data for de primære resultatmål, sekundære udfaldsmål og uønskede hændelser (det vil sige den sidste deltagers sidste besøg). Den "forventede" undersøgelses afslutningsdato er den dato, som forskerne tror vil være undersøgelsens afslutningsdato.
1. marts 2029

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

Først indsendt

Den dato, hvor undersøgelsens sponsor eller investigator første gang indsendte en undersøgelsespost til ClinicalTrials.gov. Der er typisk en forsinkelse på et par dage mellem den første indsendte dato og postens tilgængelighed på ClinicalTrials.gov (den første offentliggjorte dato).
5. august 2026

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

Den dato, hvor undersøgelsens sponsor eller investigator første gang indsender en undersøgelsespost, der er i overensstemmelse med National Library of Medicine (NLM) kvalitetskontrol (QC) gennemgangskriterier. Sponsoren eller investigatoren skal muligvis revidere og indsende en undersøgelsespost en eller flere gange, før NLM's kvalitetskontrolkriterier er opfyldt. Det er sponsorens eller investigatorens ansvar at sikre, at undersøgelsesposten er i overensstemmelse med NLM QC-gennemgangskriterierne.
5. august 2026

Først opslået (Faktiske)

Først opslået

Datoen, hvor undersøgelsesposten først var tilgængelig på ClinicalTrials.gov efter National Library of Medicine (NLM) kvalitetskontrol (QC) gennemgang er afsluttet. Der er typisk en forsinkelse på et par dage mellem den dato, hvor undersøgelsens sponsor eller investigator indsendte undersøgelsesposten, og den første offentliggjorte dato.
10. august 2026

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

Sidste opdatering sendt

Den seneste dato, hvor ændringer i en undersøgelsespost blev gjort tilgængelig på ClinicalTrials.gov. Der kan være en forsinkelse mellem det tidspunkt, hvornår ændringerne blev indsendt til ClinicalTrials.gov af undersøgelsens sponsor eller investigator (datoen for sidste opdatering afsendt) og den sidste opdatering, der blev sendt.
10. august 2026

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

Den seneste dato, hvor undersøgelsens sponsor eller investigator indsendte ændringer til en undersøgelsespost, der er i overensstemmelse med National Library of Medicine (NLM) kvalitetskontrol (QC) gennemgangskriterier. Det er sponsorens eller investigatorens ansvar at sikre, at undersøgelsesposten er i overensstemmelse med NLM QC-gennemgangskriterierne.
5. august 2026

Sidst verificeret

Sidst verificeret

Den seneste dato, hvor undersøgelsens sponsor eller investigator bekræftede oplysningerne om en klinisk undersøgelse på ClinicalTrials.gov som nøjagtige og aktuelle. Hvis en undersøgelse med rekrutteringsstatus som rekruttering; rekrutterer endnu ikke; eller aktiv, ikke rekruttering er ikke blevet bekræftet inden for de seneste 2 år, er undersøgelsens rekrutteringsstatus vist som ukendt.
1. august 2026

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

Andre undersøgelses-id-numre

Andre identifikatorer eller ID-numre end NCT-nummeret, der er tildelt til en klinisk undersøgelse af undersøgelsens sponsor, finansieringsgivere eller andre. Disse numre kan omfatte unikke identifikatorer fra andre forsøgsregistre og National Institutes of Health-bevillingsnumre.
  • MAZEL PHRCI 2024

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Cookieindstillinger

Vi bruger cookies for at sikre, at vi giver dig den bedste oplevelse på vores hjemmeside. For flere detaljer skal du læse omhyggeligt vores Politik om beskyttelse af personlige oplysninger og cookies. ...>>>Du kan når som helst ændre dine præferencer eller trække dit samtykke tilbage ved at slette cookies fra din hjemmeside eller computer som beskrevet i politikken. Accepter det og vælg dine præferencer ved at markere de tilsvarende felter i afsnittet "Administrer indstillinger" nedenfor. Læs vores servicevilkår omhyggeligt, inden du fortsætter med at bruge nogen del af dette websted.
«Administrer indstillinger