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Integration of New Generation Multi-omics Analyses for the Diagnosis of Genetic Neurodevelomental Disorders (NEXTOMIX)

5. August 2026 aktualisiert von: Centre Hospitalier Universitaire Dijon

Neurodevelopmental disorders (NDDs), including intellectual disability (ID), represent the most common indication for genetic testing. Affecting up to 3% of the general population, NDDs are characterized by significant clinical and genetic heterogeneity. Although short-read genome sequencing (srGS) has driven major advances through the France Genomic Medicine 2025 Plan (PFMG2025), a substantial proportion of patients still lack a molecular diagnosis.

These results are partly explained by the limitations of short-read genome sequencing (srGS). Although effective in many cases, this technology performs poorly in detecting complex structural rearrangements, anomalies within repetitive or GC-rich regions, epigenetic variations, and certain intronic variants. Furthermore, srGS does not allow for the direct assessment of the functional impact of genetic variations on splicing or gene expression. Following a negative srGS result, periodic reanalysis of sequencing data via the PFMG2025 laboratories (AURAGEN and SeqOIA) is the only diagnostic option currently available in routine practice. However, these reanalyses are constrained by financial and staffing limitations as well as strict eligibility criteria, making it difficult for many patients-particularly those with stable neurodevelopmental disorders (NDDs)-to obtain a diagnosis. Moreover, they often consist merely of a data review without bioinformatic updates, and the turnaround times-frequently exceeding one year-contribute to the diagnostic odyssey. Utilizing updated pipelines tailored to the specific characteristics of NDDs for the re-examination of srGS data could serve as an initial source of new diagnoses.

Complementary technologies-such as messenger RNA sequencing (mRNA-seq), optical genome mapping (OGM), and long-read genome sequencing (lrGS)-are available and offer solutions to overcome the limitations of short-read genome sequencing (srGS). In particular, they enable the identification of complex structural variants and the assessment of the functional impact of point variants. Despite their potential, their routine use remains limited due to cost and technical complexity.

Our study proposes a combined strategy to address the limitations of current approaches and improve the diagnosis of neurodevelopmental disorders (NDDs) that remain unresolved after short-read genome sequencing (srGS). It begins with a re-analysis of sequencing data using customized bioinformatics pipelines tailored to the patients' specific clinical profiles. In cases of inconclusive results, innovative multi-omics analyses (mRNA-seq, OGM, and long-read genome sequencing/lrGS) will be employed to investigate complex genetic variants. As multi-omics approaches are not currently integrated into the PFMG2025 framework, the project's findings will be crucial in demonstrating their added value for NDD diagnosis and could pave the way for their inclusion in a future PFMG. By anticipating these developments, NextOmix will help define the diagnostic strategies of the future, aligned with technological advancements and patient needs.

Studienübersicht

Status

Status

Zeigt den aktuellen Rekrutierungsstatus oder den erweiterten Zugriffsstatus an.
Noch keine Rekrutierung

Bedingungen

Bedingungen

Die Krankheit, Störung, das Syndrom, die Krankheit oder die Verletzung, die untersucht wird. Auf ClinicalTrials.gov können die Bedingungen auch andere gesundheitsbezogene Themen wie Lebensdauer, Lebensqualität und Gesundheitsrisiken umfassen.

Intervention / Behandlung

Intervention / Behandlung

Ein Prozess oder eine Handlung, die im Mittelpunkt einer klinischen Studie steht. Interventionen umfassen Medikamente, medizinische Geräte, Verfahren, Impfstoffe und andere Produkte, die entweder in der Erprobungsphase oder bereits verfügbar sind. Interventionen können auch nicht-invasive Ansätze umfassen, wie z. B. Aufklärung oder eine Änderung der Ernährung und Bewegung.

Studientyp

Studientyp

Beschreibt die Art einer klinischen Studie. Zu den Studientypen gehören Interventionsstudien (auch klinische Studien genannt), Beobachtungsstudien (einschließlich Patientenregister) und erweiterter Zugang.
Interventionell

Einschreibung (Geschätzt)

Einschreibung

Die Anzahl der Teilnehmer an einer klinischen Studie. Die „erwartete“ Einschreibung ist die Zielzahl an Teilnehmern, die die Forscher für die Studie benötigen.
132

Phase

Phase

Das Stadium einer klinischen Studie, in der ein Medikament oder ein biologisches Produkt untersucht wird, basierend auf Definitionen, die von der U.S. Food and Drug Administration (FDA) entwickelt wurden. Die Phase richtet sich nach dem Ziel der Studie, der Anzahl der Teilnehmer und anderen Merkmalen. Es gibt fünf Phasen: Frühe Phase 1 (früher als Phase 0 aufgeführt), Phase 1, Phase 2, Phase 3 und Phase 4. Nicht zutreffend wird verwendet, um Studien ohne von der FDA definierte Phasen zu beschreiben, einschließlich Studien zu Geräten oder Verhaltensinterventionen.
  • Unzutreffend

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienkontakt

Studienkontakt

Der Name und die Kontaktinformationen der Person, die Fragen zur Registrierung für eine klinische Studie beantworten kann. Jeder Standort, an dem die Studie durchgeführt wird, kann auch einen bestimmten Ansprechpartner haben, der diese Fragen möglicherweise besser beantworten kann.

Studienorte

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Zulassungskriterien

Die wichtigsten Voraussetzungen, die Personen erfüllen müssen, die an einer klinischen Studie teilnehmen möchten, bzw. welche Eigenschaften sie mitbringen müssen. Auswahlkriterien bestehen sowohl aus Einschlusskriterien (die erforderlich sind, damit eine Person an der Studie teilnehmen kann) als auch aus Ausschlusskriterien (die eine Person an der Teilnahme hindern). Arten von Zulassungskriterien umfassen, ob eine Studie gesunde Freiwillige akzeptiert, Alters- oder Altersgruppenanforderungen hat oder durch das Geschlecht begrenzt ist.

Studienberechtigtes Alter

  • Kind
  • Erwachsene
  • Älterer Erwachsener

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Beschreibung

Inclusion Criteria:

  • Index case (minor or adult) with severe to profound intellectual disability or syndromic neurodevelopmental disorder without an identified molecular diagnosis. - Index case with a negative srGS result.
  • Sample collection possible from the index case (blood and skin biopsy) and their biological parent(s) (blood) if material is not otherwise available.
  • Signed consent from the adult index case, or from the legal representatives or guardian (as applicable) of a minor index case, and from their parent(s).

Exclusion Criteria:

  • - Index case or parent(s) not affiliated with or not covered by a social security scheme.
  • Diagnostic hypothesis considered highly probable, for which an available targeted molecular test costs less than the proposed strategy.
  • Suspicion of an acquired cause for the symptoms.
  • Minor parent(s).
  • Parent subject to a legal protection measure, or incapacitated or otherwise unable to provide informed consent.
  • Pregnant, birthing, or breastfeeding woman.
  • Participant (index case or parent) who has previously undergone allogeneic hematopoietic stem cell transplantation, rendering blood sample analysis uninformative.

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

  • Hauptzweck: Diagnose
  • Zuteilung: N / A
  • Interventionsmodell: Einzelgruppenzuweisung
  • Maskierung: Single

Waffen und Interventionen

Teilnehmergruppe / Arm

Teilnehmergruppe / Arm

Eine Gruppe oder Untergruppe von Teilnehmern an einer klinischen Studie, die gemäß dem Protokoll der Studie eine bestimmte Intervention/Behandlung oder keine Intervention erhält.
Intervention / Behandlung

Intervention / Behandlung

Ein Prozess oder eine Handlung, die im Mittelpunkt einer klinischen Studie steht. Interventionen umfassen Medikamente, medizinische Geräte, Verfahren, Impfstoffe und andere Produkte, die entweder in der Erprobungsphase oder bereits verfügbar sind. Interventionen können auch nicht-invasive Ansätze umfassen, wie z. B. Aufklärung oder eine Änderung der Ernährung und Bewegung.
Sonstiges: Patient with severe to profound intellectual disability
Diagnosetest: Re-analysis of available srGS data
Re-analysis of available srGS data without further analysis, as the results were positive for the causal diagnosis.
Diagnosetest: Re-analysis of available srGS data, followed by complementary analyses (lrGS sequencing, mRNA, and GMOs)
Re-analysis of available srGS data followed by additional analyses (lrGS sequencing, mRNA-seq, and GMO testing), as the srGS data are negative for the causal diagnosis.
Diagnosetest: srGS sequencing
New srGS sequencing without additional analyses, as it is positive for the causal diagnosis.
Diagnosetest: Short-read sequencing (srGS) followed by long-read sequencing (lrGS,), mRNA-sequencing and GMO testing
New srGS sequencing followed by additional analyses (lrGS sequencing, mRNA-seq, and GMO testing) because the srGS data are negative for the causal diagnosis.
Sonstiges: Patient with a syndromic neurodevelopmental disorder with intellectual disability
Diagnosetest: Re-analysis of available srGS data
Re-analysis of available srGS data without further analysis, as the results were positive for the causal diagnosis.
Diagnosetest: Re-analysis of available srGS data, followed by complementary analyses (lrGS sequencing, mRNA, and GMOs)
Re-analysis of available srGS data followed by additional analyses (lrGS sequencing, mRNA-seq, and GMO testing), as the srGS data are negative for the causal diagnosis.
Diagnosetest: srGS sequencing
New srGS sequencing without additional analyses, as it is positive for the causal diagnosis.
Diagnosetest: Short-read sequencing (srGS) followed by long-read sequencing (lrGS,), mRNA-sequencing and GMO testing
New srGS sequencing followed by additional analyses (lrGS sequencing, mRNA-seq, and GMO testing) because the srGS data are negative for the causal diagnosis.
Sonstiges: Patient with a syndromic neurodevelopmental disorder without intellectual disability
Diagnosetest: Re-analysis of available srGS data
Re-analysis of available srGS data without further analysis, as the results were positive for the causal diagnosis.
Diagnosetest: Re-analysis of available srGS data, followed by complementary analyses (lrGS sequencing, mRNA, and GMOs)
Re-analysis of available srGS data followed by additional analyses (lrGS sequencing, mRNA-seq, and GMO testing), as the srGS data are negative for the causal diagnosis.
Diagnosetest: srGS sequencing
New srGS sequencing without additional analyses, as it is positive for the causal diagnosis.
Diagnosetest: Short-read sequencing (srGS) followed by long-read sequencing (lrGS,), mRNA-sequencing and GMO testing
New srGS sequencing followed by additional analyses (lrGS sequencing, mRNA-seq, and GMO testing) because the srGS data are negative for the causal diagnosis.

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Primäre Ergebnismessungen

Im Protokoll einer klinischen Studie die geplante Ergebnismessung, die für die Bewertung der Wirkung einer Intervention/Behandlung am wichtigsten ist. Die meisten klinischen Studien haben einen primären Endpunkt, aber einige haben mehr als einen.
Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Identification of a causative diagnosis (class 4 or 5 variant according to American College of Medical Genetics criteria) explaining the phenotype and validated during a multidisciplinary team meeting.
Zeitfenster: Between 4 and 12 months
Identification of a causative diagnosis (class 4 or 5 variant according to American College of Medical Genetics criteria) explaining the phenotype and validated during a multidisciplinary team meeting.
Between 4 and 12 months

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Sponsor

Die Organisation oder Person, die die Studie initiiert und die Autorität und Kontrolle über die Studie hat.
Centre Hospitalier Universitaire Dijon

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Geschätzt)

Studienbeginn

Das tatsächliche Datum, an dem der erste Teilnehmer in eine klinische Studie aufgenommen wurde. Das „voraussichtliche“ Studienstartdatum ist das Datum, von dem die Forscher glauben, dass es das Studienstartdatum sein wird.
1. September 2026

Primärer Abschluss (Geschätzt)

Primärer Abschluss

Das Datum, an dem der letzte Teilnehmer einer klinischen Studie untersucht wurde oder eine Intervention erhalten hat, um endgültige Daten für das primäre Ergebnis zu sammeln. Ob die klinische Studie protokollgemäß endete oder beendet wurde, hat keinen Einfluss auf dieses Datum. Bei klinischen Studien mit mehr als einem primären Ergebnismaß mit unterschiedlichen Abschlussdaten bezieht sich dieser Begriff auf das Datum, an dem die Datenerhebung für alle primären Ergebnismaße abgeschlossen ist. Das „erwartete“ primäre Abschlussdatum ist das Datum, von dem die Forscher glauben, dass es das primäre Abschlussdatum für die Studie sein wird.
1. März 2029

Studienabschluss (Geschätzt)

Studienabschluss

Das Datum, an dem der letzte Teilnehmer an einer klinischen Studie untersucht wurde oder eine Intervention/Behandlung erhielt, um endgültige Daten für die primären Ergebnismaße, sekundären Ergebnismaße und Nebenwirkungen zu sammeln (d. h. der letzte Besuch des letzten Teilnehmers). Das „voraussichtliche“ Abschlussdatum der Studie ist das Datum, von dem die Forscher glauben, dass es das Abschlussdatum der Studie sein wird.
1. März 2029

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

Zuerst eingereicht

Das Datum, an dem der Studiensponsor oder Prüfer zum ersten Mal einen Studienbericht bei ClinicalTrials.gov eingereicht hat. Zwischen dem Datum der ersten Einreichung und der Verfügbarkeit des Datensatzes auf ClinicalTrials.gov (dem ersten veröffentlichten Datum) liegt in der Regel eine Verzögerung von einigen Tagen.
5. August 2026

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

Das Datum, an dem der Studiensponsor oder Prüfer zum ersten Mal einen Studienbericht einreicht, der den Qualitätskontrollkriterien (QC) der National Library of Medicine (NLM) entspricht. Der Sponsor oder Prüfer muss möglicherweise einen Studienbericht ein- oder mehrmals überarbeiten und einreichen, bevor die QC-Überprüfungskriterien von NLM erfüllt sind. Es liegt in der Verantwortung des Sponsors oder Prüfers, sicherzustellen, dass die Studienaufzeichnung mit den NLM-QC-Überprüfungskriterien übereinstimmt.
5. August 2026

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

Zuerst gepostet

Das Datum, an dem der Studienbericht zum ersten Mal auf ClinicalTrials.gov verfügbar war, nachdem die Qualitätskontrolle (QC) der National Library of Medicine (NLM) abgeschlossen wurde. Zwischen dem Datum, an dem der Studiensponsor oder Prüfer den Studienbericht eingereicht hat, und dem ersten veröffentlichten Datum liegt in der Regel eine Verzögerung von einigen Tagen.
10. August 2026

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

Letztes Update gepostet

Das letzte Datum, an dem Änderungen an einem Studienbericht auf ClinicalTrials.gov verfügbar gemacht wurden. Es kann eine Verzögerung zwischen der Übermittlung der Änderungen an ClinicalTrials.gov durch den Sponsor oder Prüfer der Studie (Datum der letzten eingereichten Aktualisierung) und dem Datum der letzten Veröffentlichung der Aktualisierung geben.
10. August 2026

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

Das letzte Datum, an dem der Studiensponsor oder Prüfer Änderungen an einem Studienbericht eingereicht hat, die mit den Qualitätskontrollkriterien (QC) der National Library of Medicine (NLM) übereinstimmen. Es liegt in der Verantwortung des Sponsors oder Prüfers, sicherzustellen, dass die Studienaufzeichnung mit den NLM-QC-Überprüfungskriterien übereinstimmt.
5. August 2026

Zuletzt verifiziert

Zuletzt verifiziert

Das letzte Datum, an dem der Studiensponsor oder Prüfer die Informationen über eine klinische Studie auf ClinicalTrials.gov als richtig und aktuell bestätigt hat. Wenn eine Studie den Rekrutierungsstatus Recruiting hat; noch keine Rekrutierung; oder aktiv, keine Rekrutierung wurde innerhalb der letzten 2 Jahre nicht bestätigt, der Rekrutierungsstatus der Studie wird als unbekannt angezeigt.
1. August 2026

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

Andere Studien-ID-Nummern

Andere Identifikatoren oder ID-Nummern als die NCT-Nummer, die einer klinischen Studie vom Sponsor der Studie, Geldgebern oder anderen zugewiesen werden. Diese Nummern können eindeutige Kennungen von anderen Studienregistern und Zuschussnummern der National Institutes of Health enthalten.
  • MAZEL PHRCI 2024

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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