Exome-analyse hos hørehæmmede patienter (NGS-NSHL)
Exome-analyse på hørehæmmede patienter
Hørenedsættelse er det hyppigste sensoriske underskud hos mennesker og rammer én nyfødt ud af 500. Prævalensen stiger til 3,5/1000 hos teenagere på grund af retarderede former. De fleste hørenedsættelser (ca. to tredjedele) har en genetisk oprindelse med recessiv, dominant eller X-bundet nedarvningsmåde. Nogle sjældne former kan være forbundet med mitokondrielt DNA. Molekylær diagnose (dvs. at definere det molekylære grundlag for sygdommen, gener og præcise DNA-varianter) er afgørende for opfølgningen af patienter og familier.
Projektet har til hensigt at udføre exome-sekventering på 30 prøver af familier med hørenedsættelse. Familier er blevet inkluderet baseret på den genetiske oprindelse af hørenedsættelsen (familietilfælde) og udelukkelse af involvering af 74 kendte døvegener. Exom-sekventering (sekventering af de kodende regioner af alle kendte gener, ca. 22.000) kan i disse tilfælde ligge til grund for nye gen/sygdomsforhold.
Studieoversigt
Detaljeret beskrivelse
Exome-sekventering vil blive udført af 10 trioer, der hver omfatter to berørte og et ikke-berørt medlem af en familie. Filtrering af varianter vil blive udført baseret på frekvens. For hver trio vil data blive analyseret parallelt for at følge adskillelse af varianten/varianterne i kandidatgener. De udvalgte kandidatgener vil blive yderligere karakteriseret for at fastslå deres involvering i hørefunktionen.
Endelig, når disse nye gener er veldefinerede som "døvhedsgener", vil deres screening blive tilføjet til eksisterende diagnostiske paneler.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
-
Montpellier, Frankrig, 34295
- Uhmontpellier
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Familier med familiær hørenedsættelse, der ligger til grund for det genetiske grundlag, for hvem 74 døvhedsgener allerede er blevet udelukket (ingen tegn på patogen genotype)
Ekskluderingskriterier:
- sporadiske tilfælde af hørenedsættelse, eller løste familiesager
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Familiebaseret
- Tidsperspektiver: Tilbagevirkende kraft
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Hørehæmmede familier
Prøver fra familier med familiær hørenedsættelse, der ligger til grund for det genetiske grundlag, for hvem 74 døvhedsgener allerede er blevet udelukket (ingen tegn på patogen genotype)
|
DNA ekstraheret fra prøver vil gennemgå exome-sekventering, dvs. sekventering af de kodende regioner af alle kendte humane gener (ca. 22.000)
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
identifikation af kandidatgener
Tidsramme: 1 dag
|
Beskrivelse: et kandidatgen vil præsentere en genotype (kombination af DNA-varianter), der er kompatibel med transmissionsmåden og flere bevislinjer for den patogene virkning af DNA-varianterne
|
1 dag
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Kvalitetsvurdering af exome-sekventeringen
Tidsramme: 1 dag
|
Kvalitetsvurdering af exome-sekventeringen
|
1 dag
|
|
Kvalitetsvurdering af de anvendte bioinformatikpipelines
Tidsramme: 1 dag
|
Kvalitetsvurdering af de anvendte bioinformatikpipelines
|
1 dag
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Efterforskere
- Studieleder: Anne Françoise ROUX, University Hospital, Montpellier
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Forventet)
Studieafslutning (Forventet)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- UF96802
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .