Avancerede terapier for levermetastaser (LiMeT)

Baggrund og begrundelse - CRC og PDAC er henholdsvis den anden og fjerde hyppigste årsag til kræftdød. Patienter ramt af disse kræftformer dør af lever-MTS. Konventionelle terapier er aktive i begge primære tumorer, men mislykkes ved metastatisk sygdom. Effektiviteten af ​​immunterapi ved blokade af immuncheckpoint og adoptiv celleterapi med tumorspecifikke T-celler er kun delvis eller midlertidig i MTS fra solide tumorer på grund af lokale immunsuppressive mekanismer. Dette er især relevant for hepatisk MTS, hvor et naturligt tolerogent miljø yderligere kan opretholde immunsuppression induceret af cancerceller og infiltrerende immunceller, såsom tumorassocierede makrofager (TAM'er), myeloid-afledte suppressorceller (MDSC'er), neutrofiler og regulatorisk T eller B-celler.

I denne henseende tyder beviser på, at progression af primær eller metastatisk CRC korrelerer med dårlig immuninfiltration og inflammation. Desuden understøtter vores offentliggjorte resultater i primær PDAC en sammenhæng mellem tumorprogression og en stærk type 2 antiinflammatorisk/immunsuppressiv signatur. Effekten af ​​kemoterapi vides også at være afhængig af reaktivering og/eller repolarisering af tumormålrettede immunresponser. Præ-kirurgisk kemoterapi kan inducere gavnlige virkninger og potentielt målrettede ændringer i immunprofilen af ​​CRC eller PDAC MTS.

Forskerne antager, at en kombination af: i) direkte cancercelledrab ved adoptivt overførte tumorspecifikke T-celler og ii) indirekte kontrol af tumorprogression via omprogrammering af tumormikromiljøet ville kontrollere hepatisk MTS af CRC og PDAC.

Således foreslår efterforskerne en grundig karakterisering af det metastatiske miljø i disse to cancertyper for rationelt at forme, på grundlag af ligheder og forskelle, innovative ATMP'er.

Eksperimentelle resultater opnået fra biologiske prøver vil blive korreleret: i) med kliniske data fra patienter på tidspunktet for indskrivning og under deres opfølgning; og ii) for en undergruppe af patienter med biokemiske og immunologiske data fra perifere blodprøver, der rutinemæssigt er indsamlet som en del af deres kliniske opfølgning, med det yderligere formål at identificere nye biologiske parametre og/eller signaturer for at hjælpe med stratificering af patienter og skræddersyet behandlinger.

Mål - Efterforskerne ønsker at studere:

1. tumormutationsbyrden og sammensætningen af ​​det metastatiske tumormikromiljø i leveren;
2. de hæmmende veje, der begrænser immunitet i lever-MTS;
3. den antigene og klonale bredde af antitumor-T-celleresponser;
4. de rumlige-temporale variationer af effektor- og regulatoriske immunceller efter terapi;
5. tumorcellernes karakteristika og deres mikromiljø i lever-MTS versus (vs) primær tumor;
6. de longitudinelle variationer af kliniske parametre samt blodafledte biologiske og immunologiske markører under den medicinske opfølgning af patienter.
7. Desuden ønsker de at indsamle og biobank patienters prøver for at understøtte valideringen og udvælgelsen af ​​de nye ATMP'er udviklet af de andre partnere i det translationelle program.

De primære mål vil være:

1. at identificere immunsuppressive/udmattelsesveje
2. at udvikle et bibliotek af tumorspecifik TCR (N≥5/tumortype) og identificere nye CAR-mål (N≥1/tumortype) i CRC og PDAC MTS

Studiedesign - Denne kliniske protokol sigter mod dybt at karakterisere MTS-tumorceller og deres mikromiljø, herunder muligvis informative dynamiske modifikationer fra pro-tumor til anti-tumor-profiler, der kan følge kemoterapi, som administreres før kirurgi (neo-adjuvans) til en væsentlig brøkdel af patienterne. PDAC- og CRC MTS-patienter vil derfor blive karakteriseret ved enten tværsnits- eller longitudinelle undersøgelser på kemoterapi-naive vs -behandlede patienter.

Derudover sigter efterforskerne på at sammenligne hepatisk MTS med primær tumor for at fremhæve dynamiske kvalitative modifikationer i cancerceller, immuninfiltrater og ikke-immun mikromiljø, der kunne lette sygdomsprogression mod metastatisk spredning. Disse ændringer kan give mulighed for optimal anvendelse af vores ATMP'er. Til dette formål vil primære ikke-metastatiske PDAC-patienter, der gennemgår kirurgisk resektion, blive optaget i denne undersøgelse og følges op til overvågning af udviklingen af ​​metakron lever-MTS, der, når det er muligt, vil blive karakteriseret og sammenlignet med deres matchede/ikke matchede, tidligere indsamlede primære tumorprøver. Perifere blodprøver på tidspunktet for lever-MTS-diagnose vil også blive indsamlet og analyseret. Også hos de CRC MTS-patienter, der gennemgår synkron resektion af primær CRC og hepatisk MTS, vil der blive udført sammenlignende analyser på tumor fra begge steder, hvilket muliggør intra- og inter-patientprofilering af begge tumornicher.

Desuden vil resultater fra forskningsanalyser på flere niveauer blive korreleret med kliniske data indsamlet fra alle patienter på tidspunktet for indskrivning i undersøgelsen og under deres kliniske opfølgning, når det er muligt i op til 2 år, PDAC-patienter taget i betragtning, og 3 år , i betragtning af CRC.

Især for metastaserende CRC-patienter vil den kliniske opfølgning være forbundet med samtidig indsamling af blodprøver på serielle tidspunkter, som prospektivt vil blive biobanket til yderligere analyser rettet mod: i) at studere biologiske og immunologiske korrelater af patientens kliniske status; ii) evaluering af nøglediskriminanter, der tidligere er identificeret i blodprøver analyseret på tidspunktet for lever-MTS-kirurgi, for at tjene som tidlige forudsigere for leverprogression eller -tilbagefald og muligvis som indikatorer for terapeutisk stratificering.

Efterforskerne forventer at indsamle vævs-/blodprøver og kliniske data fra mindst:

• 200 metastatiske CRC-patienter (enten synkrone eller metakrone);
• 150 ikke-metastaserende PDAC-patienter;
• 75 synkrone PDAC MTS-patienter og omkring 20 metakrone PDAC MTS-patienter, sidstnævnte oprindeligt indskrevet som primære ikke-metastatiske patienter til det longitudinelle studie, for i alt 95 metastaserende PDAC-patienter;
• 30 raske frivillige, som negative kontroller.

Forskellige biologiske prøver (perifert blod, primært og/eller metastatisk tumorvæv, portalblod) vil blive indsamlet i løbet af den standarddiagnostiske og terapeutiske behandling af disse patienter og vil delvis blive analyseret direkte og delvist biobanket til yderligere undersøgelser . Parallelt hermed vil der blive indsamlet kliniske data fra patienter på tidspunktet for optagelse i undersøgelsen og, når det er muligt, for en opfølgningsperiode på op til 2 år for PDAC-patienter og 3 år for CRC-patienter.

Den statistiske analyse af indsamlede data vil blive udført gennem hele det kliniske studie, startende 6 måneder efter indskrivningen af ​​den første patient til 6 måneder efter afslutningen af ​​patienternes opfølgning, i i alt 7 år. Studiet vil vare 7 år.

Forskellige biologiske prøver (perifert blod, primært og/eller metastatisk tumorvæv, portalblod) vil blive indsamlet i løbet af den standarddiagnostiske og terapeutiske behandling af disse patienter og vil delvis blive analyseret direkte og delvist biobanket til yderligere undersøgelser . Sideløbende hermed vil kliniske data blive indsamlet fra patienter siden indskrivningstidspunktet i undersøgelsen i en opfølgningsperiode på 2 år for PDAC-patienter og 3 år for CRC-patienter.

Den statistiske analyse af de indsamlede kliniske og eksperimentelle data vil blive udført under hele det kliniske studie, startende 6 måneder efter indskrivningen af ​​den første patient indtil afslutningen af ​​patienternes opfølgning, i i alt 7 år. Studiet vil vare 7 år.

Forskningsaktiviteterne vil blive organiseret og integreret i 6 arbejdspakker (WP'er):

1. Indsamling og biobanking af materialet fra patienter med CRC og PDAC MTS til leveren og med primær ikke-metastatisk resektabel PDAC.
2. Definition af tumormutationsbyrden, epigenetisk og genekspressionsprofil af CRC- og PDAC-metastatisk lever på bulk- og enkeltcelleniveau.
3. Evaluering af den molekylære og cellulære sammensætning af CRC og, hvis muligt, PDAC-lever MTS ved hjælp af rumlige transkriptomiske teknologier (NICHE-seq og Visium).
4. Karakterisering af immunlandskaberne i CRC og, hvis muligt, PDAC-lever MTS ved højdimensionel flowcytometri.
5. Validering af de molekylære resultater opnået i 2) og 4).
6. Definition af det antigene landskab og TCR-repertoire af CRC og PDAC lever MTS.

Resultaterne opnået af de ovennævnte WP'er vil blive krydset med kliniske opfølgningsdata og tjene til at kalibrere programaktiviteterne fokuseret på udvikling af nye ATMP'er.