Geavanceerde therapieën voor levermetastasen (LiMeT)

Achtergrond en grondgedachte - CRC en PDAC zijn respectievelijk de tweede en vierde meest voorkomende doodsoorzaak door kanker. Patiënten die door deze vormen van kanker zijn getroffen, sterven aan MTS in de lever. Conventionele therapieën zijn actief bij beide primaire tumoren, maar falen bij gemetastaseerde ziekte. De effectiviteit van immunotherapie door immuuncheckpointblokkade en adoptieve celtherapie met tumorspecifieke T-cellen is slechts gedeeltelijk of tijdelijk bij MTS van solide tumoren, vanwege lokale immunosuppressieve mechanismen. Dit is met name relevant voor MTS in de lever, waarin een natuurlijk tolerogeen milieu de door kankercellen geïnduceerde immunosuppressie en infiltrerende immuuncellen verder kan ondersteunen, zoals tumor-geassocieerde macrofagen (TAM's), van myeloïde afgeleide suppressorcellen (MDSC's), neutrofielen en regulatoire T of B-cellen.

In dit opzicht suggereert bewijs dat progressie van primaire of gemetastaseerde CRC correleert met slechte immuuninfiltratie en ontsteking. Bovendien ondersteunen onze gepubliceerde resultaten in primaire PDAC een correlatie tussen tumorprogressie en een sterke type 2 ontstekingsremmende / immunosuppressieve signatuur. Het is bekend dat de werkzaamheid van chemotherapie ook afhankelijk is van reactivering en/of repolarisatie van op de tumor gerichte immuunresponsen. Pre-chirurgische chemotherapie kan gunstige effecten en mogelijk richtbare veranderingen in het immuunprofiel van CRC of PDAC MTS veroorzaken.

De onderzoekers veronderstellen dat een combinatie van: i) directe kankerceldoding door adoptief overgedragen tumorspecifieke T-cellen en ii) indirecte controle van tumorprogressie via herprogrammering van de tumormicro-omgeving hepatische MTS van CRC en PDAC zou beheersen.

Daarom stellen de onderzoekers een grondige karakterisering voor van het metastatische milieu in deze twee soorten kanker om op basis van overeenkomsten en verschillen innovatieve ATMP's rationeel vorm te geven.

Experimentele resultaten verkregen uit biologische monsters zullen worden gecorreleerd: i) met klinische gegevens van patiënten op het moment van inschrijving en tijdens hun follow-up; en ii) voor een subgroep van patiënten, met biochemische en immunologische gegevens uit perifere bloedmonsters die routinematig worden verzameld als onderdeel van hun klinische follow-up, met als bijkomend doel nieuwe biologische parameters en/of handtekeningen te identificeren om de stratificatie van patiënten te helpen en het afstemmen van behandelingen.

Doelstellingen - De onderzoekers willen bestuderen:

1. de tumormutatielast en de samenstelling van de uitgezaaide tumormicro-omgeving in de lever;
2. de remmende routes die de immuniteit in MTS in de lever beperken;
3. de antigene en klonale breedte van antitumor-T-celreacties;
4. de ruimtelijk-temporele variaties van effector- en regulerende immuuncellen na therapie;
5. de kenmerken van tumorcellen en hun micro-omgeving in MTS in de lever versus (versus) primaire tumor;
6. de longitudinale variaties van klinische parameters evenals bloedafgeleide biologische en immunologische markers tijdens de medische follow-up van patiënten.
7. Bovendien willen ze stalen van patiënten verzamelen en biobankieren ter ondersteuning van de validatie en selectie van de nieuwe ATMP's ontwikkeld door de andere partners van het translationele programma.

De primaire doelstellingen zullen zijn:

1. om immuunonderdrukkende / uitputtingsroutes te identificeren
2. een bibliotheek van tumorspecifieke TCR (N≥5/tumortype) ontwikkelen en nieuwe CAR-doelen (N≥1/tumortype) in CRC en PDAC MTS identificeren

Onderzoeksopzet - Dit klinische protocol is gericht op een grondige karakterisering van MTS-tumorcellen en hun micro-omgeving, inclusief mogelijk informatieve dynamische modificaties van protumor- naar antitumorprofielen die kunnen volgen op chemotherapie, die pre-operatief (neo-adjuvans) wordt toegediend aan een substantiële fractie van de patiënten. PDAC- en CRC MTS-patiënten zullen daarom worden gekarakteriseerd door cross-sectioneel of longitudinaal onderzoek bij chemotherapie-naïeve versus behandelde patiënten.

Bovendien willen de onderzoekers hepatische MTS vergelijken met primaire tumor, om dynamische kwalitatieve modificaties in kankercellen, immuuninfiltraten en niet-immune micro-omgevingen te benadrukken die ziekteprogressie naar metastatische verspreiding zouden kunnen vergemakkelijken. Deze aanpassingen kunnen een kans bieden voor een optimale toepassing van onze ATMP's. Hiertoe zullen primaire niet-gemetastaseerde PDAC-patiënten die chirurgische resectie ondergaan, worden opgenomen in deze studie en worden gevolgd voor het monitoren van de ontwikkeling van metachrone lever-MTS, die, waar mogelijk, zal worden gekarakteriseerd en vergeleken met hun gematchte/niet-gematchte, eerder verzamelde, primaire tumormonsters. Perifere bloedmonsters op het moment van lever-MTS-diagnose zullen ook worden verzameld en geanalyseerd. Ook zullen bij die CRC MTS-patiënten die synchrone resectie van primair CRC en hepatisch MTS ondergaan, vergelijkende analyses worden uitgevoerd op de tumor van beide locaties, waardoor intra- en interpatiëntprofilering van beide tumorniches mogelijk wordt.

Bovendien zullen de resultaten van onderzoeksanalyses op meerdere niveaus worden gecorreleerd met klinische gegevens die van alle patiënten zijn verzameld op het moment van inschrijving in het onderzoek en tijdens hun klinische follow-up, waar mogelijk tot 2 jaar, rekening houdend met PDAC-patiënten, en 3 jaar , rekening houdend met CRC.

Met name voor patiënten met gemetastaseerde CRC zal de klinische follow-up gepaard gaan met gelijktijdige verzameling van bloedmonsters op seriële tijdstippen, die prospectief in een biobank zullen worden opgeslagen voor verdere analyses gericht op: i) het bestuderen van biologische en immunologische correlaten van de klinische status van de patiënt; ii) het evalueren van belangrijke discriminanten die eerder zijn geïdentificeerd in bloedmonsters die zijn geanalyseerd op het moment van MTS-operatie aan de lever, om te dienen als vroege voorspellers van leverprogressie of -recidief en mogelijk als indicatoren voor therapeutische stratificatie.

De onderzoekers verwachten weefsel-/bloedmonsters en klinische gegevens te verzamelen van ten minste:

• 200 gemetastaseerde CRC-patiënten (synchroon of metachroon);
• 150 niet-gemetastaseerde PDAC-patiënten;
• 75 synchrone PDAC MTS-patiënten en ongeveer 20 metachrone PDAC MTS-patiënten, de laatsten waren oorspronkelijk ingeschreven als primaire niet-gemetastaseerde patiënten voor de longitudinale studie, voor een totaal van 95 gemetastaseerde PDAC-patiënten;
• 30 gezonde vrijwilligers, als negatieve controles.

Verschillende biologische monsters (perifeer bloed, primair en/of gemetastaseerd tumorweefsel, portaalbloed) zullen worden verzameld tijdens de standaard diagnostische en therapeutische zorg van die patiënten, en zullen deels direct worden geanalyseerd en deels in een biobank worden opgeslagen voor verder onderzoek. . Tegelijkertijd zullen klinische gegevens van patiënten worden verzameld op het moment van deelname aan het onderzoek en, waar mogelijk, gedurende een follow-upperiode van maximaal 2 jaar voor PDAC-patiënten en 3 jaar voor CRC-patiënten.

De statistische analyse van de verzamelde gegevens zal gedurende de hele klinische studie worden uitgevoerd, te beginnen 6 maanden na de inschrijving van de eerste patiënt tot 6 maanden na het einde van de follow-up van de patiënt, voor een totaal van 7 jaar. De studie duurt 7 jaar.

Verschillende biologische monsters (perifeer bloed, primair en/of gemetastaseerd tumorweefsel, portaalbloed) zullen worden verzameld tijdens de standaard diagnostische en therapeutische zorg van die patiënten, en zullen deels direct worden geanalyseerd en deels in een biobank worden opgeslagen voor verder onderzoek. . Tegelijkertijd zullen klinische gegevens worden verzameld van patiënten vanaf het moment van inschrijving in de studie voor een follow-upperiode van 2 jaar voor PDAC-patiënten en van 3 jaar voor CRC-patiënten.

De statistische analyse van de verzamelde klinische en experimentele gegevens zal gedurende de gehele duur van de klinische studie worden uitgevoerd, te beginnen 6 maanden na de rekrutering van de eerste patiënt tot het einde van de follow-up van de patiënt, gedurende in totaal 7 jaar. De studie duurt 7 jaar.

De onderzoeksactiviteiten zullen worden georganiseerd en geïntegreerd in 6 werkpakketten (WP's):

1. Verzameling en biobanking van het materiaal van patiënten met CRC en PDAC MTS naar de lever en met primaire niet-metastatische reseceerbare PDAC.
2. Definitie van de tumormutatielast, epigenetisch en genexpressieprofiel van de CRC en PDAC metastatische lever op bulk- en op eencellig niveau.
3. Evaluatie van de moleculaire en cellulaire samenstelling van CRC en, indien mogelijk, PDAC-lever-MTS door ruimtelijke transcriptomics-technologieën (NICHE-seq en Visium).
4. Karakterisering van de immuunlandschappen van CRC en, indien mogelijk, PDAC-lever-MTS door hoogdimensionale flowcytometrie.
5. Validatie van de moleculaire resultaten verkregen in 2) en 4).
6. Definitie van het antigene landschap en het TCR-repertoire van CRC en PDAC-lever MTS.

De resultaten verkregen door de bovengenoemde WP's zullen worden gekruist met klinische follow-upgegevens en dienen om de programma-activiteiten gericht op de ontwikkeling van nieuwe ATMP's te kalibreren.