Передовые методы лечения метастазов в печени (LiMeT)

Предыстория и обоснование. CRC и PDAC являются второй и четвертой по частоте причиной смерти от рака соответственно. Пациенты, пораженные этими видами рака, умирают от MTS печени. Обычные методы лечения эффективны при первичных опухолях, но неэффективны при метастатическом заболевании. Эффективность иммунотерапии путем блокады иммунных контрольных точек и адоптивной клеточной терапии опухолеспецифическими Т-клетками является лишь частичной или временной при MTS из солидных опухолей из-за местных иммуносупрессивных механизмов. Это особенно актуально для MTS печени, при котором естественная толерогенная среда может дополнительно поддерживать иммуносупрессию, вызванную раковыми клетками и инфильтрирующими иммунными клетками, такими как опухолеассоциированные макрофаги (TAM), супрессорные клетки миелоидного происхождения (MDSC), нейтрофилы и регуляторные T. или В-клеток.

В связи с этим данные свидетельствуют о том, что прогрессирование первичного или метастатического КРР коррелирует со слабой иммунной инфильтрацией и воспалением. Более того, наши опубликованные результаты по первичному PDAC подтверждают корреляцию между прогрессированием опухоли и выраженным противовоспалительным/иммуносупрессивным действием 2-го типа. Известно, что эффективность химиотерапии зависит также от реактивации и/или реполяризации опухоли, направленной на иммунный ответ. Предоперационная химиотерапия может вызывать положительные эффекты и потенциально целевые изменения в иммунном профиле CRC или PDAC MTS.

Исследователи предполагают, что комбинация: i) прямого уничтожения раковых клеток с помощью адоптивно перенесенных опухолеспецифических Т-клеток и ii) косвенного контроля прогрессирования опухоли посредством перепрограммирования микроокружения опухоли будет контролировать MTS CRC и PDAC в печени.

Таким образом, исследователи предлагают тщательную характеристику метастатической среды при этих двух типах рака, чтобы рационально сформировать инновационные ATMP на основе сходств и различий.

Экспериментальные результаты, полученные из биологических образцов, будут коррелированы: i) с клиническими данными пациентов на момент включения и во время их последующего наблюдения; и ii) для подгруппы пациентов с биохимическими и иммунологическими данными из образцов периферической крови, регулярно собираемых в рамках их клинического наблюдения, с дополнительной целью выявления новых биологических параметров и/или признаков, чтобы помочь стратификации пациентов и подбор процедур.

Задачи - Исследователи хотят изучить:

1. мутационная нагрузка опухоли и состав микроокружения метастатической опухоли в печени;
2. ингибирующие пути, ограничивающие иммунитет при MTS печени;
3. антигенная и клональная широта противоопухолевых Т-клеточных ответов;
4. пространственно-временные изменения эффекторных и регуляторных иммунных клеток при терапии;
5. характеристики опухолевых клеток и их микроокружения в MTS печени по сравнению с первичной опухолью;
6. лонгитюдные вариации клинических параметров, а также биологических и иммунологических маркеров крови при диспансерном наблюдении за пациентами.
7. Кроме того, они хотят собирать и создавать биобанки образцов пациентов для поддержки проверки и выбора новых ATMP, разработанных другими партнерами программы трансляции.

Основными целями будут:

1. для выявления путей иммуносупрессии/истощения
2. разработать библиотеку опухолеспецифических TCR (N ≥ 5 / тип опухоли) и идентифицировать новые мишени CAR (N ≥ 1 / тип опухоли) при CRC и PDAC MTS.

Дизайн исследования. Этот клинический протокол направлен на глубокое описание опухолевых клеток MTS и их микроокружения, включая, возможно, информативные динамические модификации от проопухолевых к противоопухолевым профилям, которые могут следовать за химиотерапией, которую вводят до операции (неоадъювантно) в существенной степени. долю больных. Таким образом, пациенты с PDAC и CRC MTS будут характеризоваться либо поперечными, либо продольными исследованиями пациентов, ранее не получавших химиотерапию, по сравнению с пациентами, получавшими лечение.

Кроме того, исследователи стремятся сравнить MTS печени с первичной опухолью, чтобы выделить динамические качественные изменения в раковых клетках, иммунных инфильтратах и ​​неиммунном микроокружении, которые могут способствовать прогрессированию заболевания в сторону метастатического распространения. Эти модификации могут открыть окно возможностей для оптимального применения наших ATMP. С этой целью пациенты с первичным неметастатическим PDAC, перенесшие хирургическую резекцию, будут включены в это исследование и будут наблюдаться для мониторинга развития метахронного MTS печени, который, по возможности, будет охарактеризован и сравнен с их сопоставимыми / несовместимыми ранее собранные образцы первичной опухоли. Образцы периферической крови во время диагностики MTS печени также будут собраны и проанализированы. Кроме того, у тех пациентов с CRC MTS, которым проводится синхронная резекция первичного CRC и MTS печени, будет проведен сравнительный анализ опухоли из обеих локализаций, что позволит профилировать обе ниши опухоли внутри и между пациентами.

Кроме того, результаты многоуровневого анализа исследований будут сопоставлены с клиническими данными, собранными у всех пациентов на момент включения в исследование и во время их клинического наблюдения, по возможности, до 2 лет, с учетом пациентов с PDAC, и 3 лет. , с учетом CRC.

В частности, для пациентов с метастатическим КРР клиническое наблюдение будет связано с одновременным сбором образцов крови в последовательные моменты времени, которые будут проспективно храниться в биобанках для дальнейших анализов, направленных на: i) изучение биологических и иммунологических коррелятов клинического состояния пациента; ii) оценка ключевых дискриминантов, ранее идентифицированных в образцах крови, проанализированных во время операции MTS печени, для использования в качестве ранних предикторов прогрессирования или рецидива заболевания печени и, возможно, в качестве индикаторов для терапевтической стратификации.

Исследователи рассчитывают собрать образцы тканей/крови и клинические данные, по крайней мере, из:

• 200 пациентов с метастатическим КРР (синхронным или метахронным);
• 150 пациентов с неметастатическим PDAC;
• 75 пациентов с синхронным PDAC MTS и около 20 пациентов с метахронным PDAC MTS, последние первоначально были зарегистрированы как первичные неметастатические пациенты для продольного исследования, всего 95 пациентов с метастатическим PDAC;
• 30 здоровых добровольцев в качестве отрицательного контроля.

Различные биологические образцы (периферическая кровь, первичная и/или метастатическая опухолевая ткань, портальная кровь) будут собраны в ходе стандартной диагностической и терапевтической помощи этим пациентам и будут частично проанализированы напрямую, а частично сохранены в биобанках для дальнейших исследований. . Параллельно будут собираться клинические данные пациентов на момент включения в исследование и, по возможности, в течение периода наблюдения до 2 лет для пациентов с PDAC и до 3 лет для пациентов с CRC.

Статистический анализ собранных данных будет проводиться на протяжении всего клинического исследования, начиная с 6 месяцев после включения первого пациента и до 6 месяцев после окончания наблюдения за пациентами, в общей сложности 7 лет. Обучение продлится 7 лет.

Различные биологические образцы (периферическая кровь, первичная и/или метастатическая опухолевая ткань, портальная кровь) будут собраны в ходе стандартной диагностической и терапевтической помощи этим пациентам и будут частично проанализированы напрямую, а частично сохранены в биобанках для дальнейших исследований. . Параллельно будут собираться клинические данные пациентов с момента включения в исследование в течение 2 лет для пациентов с PDAC и 3 лет для пациентов с CRC.

Статистический анализ собранных клинических и экспериментальных данных будет проводиться на протяжении всего клинического исследования, начиная с 6 месяцев после включения первого пациента до окончания наблюдения за пациентами, в общей сложности 7 лет. Обучение продлится 7 лет.

Исследовательская деятельность будет организована и объединена в 6 рабочих пакетов (РП):

1. Сбор и биобанкирование материала от пациентов с CRC и PDAC MTS в печень и с первичной неметастатической резектабельной PDAC.
2. Определение мутационного бремени опухоли, эпигенетического профиля и профиля экспрессии генов метастатической печени CRC и PDAC в массе и на уровне отдельных клеток.
3. Оценка молекулярно-клеточного состава CRC и, по возможности, PDAC МТС печени с помощью технологий пространственной транскриптомики (NICHE-seq и Visium).
4. Характеристика иммунных ландшафтов CRC и, если возможно, MTS печени PDAC с помощью высокоразмерной проточной цитометрии.
5. Валидация молекулярных результатов, полученных в 2) и 4).
6. Определение антигенного ландшафта и репертуара TCR MTS печени CRC и PDAC.

Результаты, полученные вышеупомянутыми WP, будут сопоставлены с данными клинического наблюдения и будут служить для калибровки программных мероприятий, направленных на разработку новых ATMP.