Kehittyneet terapiat maksametastaaseihin (LiMeT)

Tausta ja perustelut - CRC ja PDAC ovat toiseksi ja neljänneksi yleisin syöpäkuolemien syy. Näihin syöpiin sairastuneet potilaat kuolevat maksan MTS:ään. Perinteiset hoidot ovat aktiivisia joko primaarisissa kasvaimissa, mutta epäonnistuvat metastaattisissa taudeissa. Immuunitarkistuspisteen salpauksen ja adoptiivisen soluhoidon tehokkuus kasvainspesifisillä T-soluilla on vain osittainen tai tilapäinen kiinteiden kasvaimien MTS:ssä paikallisten immunosuppressiivisten mekanismien vuoksi. Tämä on erityisen merkityksellistä maksan MTS:lle, jossa luonnollinen tolerogeeninen ympäristö voi edelleen ylläpitää syöpäsolujen ja tunkeutuvien immuunisolujen, kuten kasvaimeen liittyvien makrofagien (TAM), myeloidista peräisin olevien suppressorisolujen (MDSC), neutrofiilien ja säätely-T:n, indusoimaa immunosuppressiota. tai B-soluja.

Tässä suhteessa todisteet viittaavat siihen, että primaarisen tai metastaattisen CRC:n eteneminen korreloi huonon immuuni-infiltraation ja tulehduksen kanssa. Lisäksi julkaisemamme tulokset primaarisesta PDAC:sta tukevat korrelaatiota kasvaimen etenemisen ja vahvan tyypin 2 anti-inflammatorisen/immunosuppressiivisen allekirjoituksen välillä. Kemoterapian tehokkuuden tiedetään riippuvan myös kasvaimeen kohdistuvien immuunivasteiden uudelleenaktivaatiosta ja/tai repolarisaatiosta. Leikkausta edeltävä kemoterapia voi aiheuttaa edullisia vaikutuksia ja mahdollisesti kohdistettavia muutoksia CRC:n tai PDAC MTS:n immuuniprofiilissa.

Tutkijat olettavat, että yhdistelmä: i) suora syöpäsolujen tappaminen adoptiivisesti siirretyillä kasvainspesifisillä T-soluilla ja ii) tuumorin etenemisen epäsuora kontrollointi tuumorin mikroympäristön uudelleenohjelmoinnin avulla ohjaisi CRC:n ja PDAC:n maksan MTS:ää.

Siten tutkijat ehdottavat näiden kahden syöpätyypin metastaattisen ympäristön perusteellista karakterisointia innovatiivisten ATMP-lääkkeiden rationaaliseksi muodostamiseksi yhtäläisyyksien ja erojen perusteella.

Biologisista näytteistä saadut kokeelliset tulokset korreloidaan: i) potilaiden kliinisten tietojen kanssa ilmoittautumishetkellä ja heidän seurannassaan; ja ii) potilaiden alaryhmälle biokemialliset ja immunologiset tiedot perifeerisistä verinäytteistä, jotka on kerätty rutiininomaisesti osana kliinistä seurantaa, lisätavoitteena tunnistaa uusia biologisia parametreja ja/tai allekirjoituksia, jotka helpottavat potilaiden kerrostumista ja hoitojen räätälöintiä.

Tavoitteet – Tutkijat haluavat tutkia:

1. kasvaimen mutaatiotaakka ja metastaattisen kasvaimen mikroympäristön koostumus maksassa;
2. estoreitit, jotka rajoittavat immuniteettia maksan MTS:ssä;
3. tuumorin vastaisten T-soluvasteiden antigeeninen ja klooninen laajuus;
4. efektori- ja säätely-immuunisolujen tila-ajalliset vaihtelut hoidon aikana;
5. kasvainsolujen ja niiden mikroympäristön ominaisuudet maksan MTS:ssä vs. primaarinen kasvain;
6. kliinisten parametrien pituussuuntaiset vaihtelut sekä verestä peräisin olevat biologiset ja immunologiset markkerit potilaiden lääketieteellisen seurannan aikana.
7. Lisäksi he haluavat kerätä ja biopankkia potilaiden näytteitä tukeakseen muiden translaatioohjelman kumppaneiden kehittämien uusien ATMP-lääkkeiden validointia ja valintaa.

Ensisijaiset tavoitteet ovat:

1. immuunisuppressiivisten/uupumusreittien tunnistamiseen
2. kehittää kasvainspesifisen TCR-kirjaston (N≥5/kasvaintyyppi) ja tunnistaa uusia CAR-kohteita (N≥1/kasvaintyyppi) CRC:ssä ja PDAC MTS:ssä

Tutkimussuunnitelma – Tämän kliinisen protokollan tavoitteena on MTS-kasvainsolujen ja niiden mikroympäristön syvällinen karakterisointi, mukaan lukien mahdollisesti informatiiviset dynaamiset modifikaatiot kasvainta edistävistä kasvainten vastaisiksi profiileiksi, jotka voivat seurata kemoterapiaa, joka annetaan ennen leikkausta (neoadjuvantti) osa potilaista. Siksi PDAC- ja CRC MTS-potilaille tehdään joko poikkileikkaus- tai pitkittäistutkimukset kemoterapiaa aiemmin saamattomista vs. hoidetuista potilaista.

Lisäksi tutkijat pyrkivät vertaamaan maksan MTS:ää primaariseen kasvaimeen korostaakseen dynaamisia kvalitatiivisia muutoksia syöpäsoluissa, immuuni-infiltraateissa ja ei-immuunisessa mikroympäristössä, jotka voisivat helpottaa taudin etenemistä kohti metastaattista leviämistä. Nämä muutokset voivat tarjota mahdollisuuden ATMP:idemme optimaaliseen käyttöön. Tätä tarkoitusta varten primaariset ei-metastaattiset PDAC-potilaat, joille tehdään kirurginen resektio, otetaan mukaan tähän tutkimukseen ja niitä seurataan metakronisen maksan MTS:n kehittymisen seuraamiseksi. Aina kun mahdollista, ne karakterisoidaan ja verrataan aiemmin vastaaviin/ei-sovitettuihin potilaaseen. kerätyt primaariset kasvainnäytteet. Myös perifeeriset verinäytteet maksan MTS-diagnoosin aikana kerätään ja analysoidaan. Myös niillä CRC MTS -potilailla, joille tehdään synkroninen primaarisen CRC:n ja maksan MTS:n resektio, molemmista kohdista tehdään vertailevia analyyseja, jotka mahdollistavat molempien kasvainrakojen profiloinnin potilaiden sisällä ja välillä.

Lisäksi monitasoisten tutkimusanalyysien tulokset korreloidaan kliinisen datan kanssa, joka on kerätty kaikilta potilailta tutkimukseen ilmoittautumisen yhteydessä ja kliinisen seurannan aikana, aina kun mahdollista, PDAC-potilaat huomioon ottaen enintään 2 vuotta ja 3 vuotta. , ottaen huomioon CRC.

Erityisesti metastasoituneiden CRC-potilaiden kliininen seuranta liittyy samanaikaiseen verinäytteiden keräämiseen peräkkäisinä aikapisteinä, jotka biopankoidaan tulevia analyysejä varten, joiden tarkoituksena on: i) tutkia potilaan kliinisen tilan biologisia ja immunologisia korrelaatioita; ii) arvioida avaintekijät, jotka on tunnistettu aiemmin maksan MTS-leikkauksen yhteydessä analysoiduissa verinäytteissä, toimiakseen maksan etenemisen tai uusiutumisen varhaisina ennustajina ja mahdollisesti indikaattoreina terapeuttiselle kerrostumiselle.

Tutkijat odottavat keräävänsä kudos-/verinäytteitä ja kliinisiä tietoja ainakin:

• 200 metastaattista CRC-potilasta (joko synkroninen tai metakroninen);
• 150 ei-metastaattista PDAC-potilasta;
• 75 synkronista PDAC MTS -potilasta ja noin 20 metakronista PDAC MTS -potilasta, jälkimmäiset otettiin alun perin mukaan pitkittäistutkimukseen ensisijaisesti ei-metastaattisina potilaina, yhteensä 95 metastaattista PDAC-potilasta;
• 30 tervettä vapaaehtoista negatiivisina kontrolleina.

Erilaisia ​​biologisia näytteitä (perifeerinen veri, primaarinen ja/tai metastaattinen kasvainkudos, portaaliveri) kerätään näiden potilaiden tavanomaisen diagnostisen ja terapeuttisen hoidon aikana, ja ne analysoidaan osittain suoraan ja osittain biopankkiin lisätutkimuksia varten. . Samanaikaisesti kliinisiä tietoja kerätään potilaista tutkimukseen ilmoittautumisen yhteydessä ja aina kun mahdollista, jopa 2 vuoden seurantajaksolta PDAC-potilailta ja 3 vuoden seurantajaksolta CRC-potilailta.

Kerättyjen tietojen tilastollinen analyysi suoritetaan koko kliinisen tutkimuksen ajan, alkaen 6 kuukautta ensimmäisen potilaan rekisteröinnistä ja 6 kuukautta potilaiden seurannan päättymisen jälkeen, yhteensä 7 vuoden ajan. Opiskelu kestää 7 vuotta.

Erilaisia ​​biologisia näytteitä (perifeerinen veri, primaarinen ja/tai metastaattinen kasvainkudos, portaaliveri) kerätään näiden potilaiden tavanomaisen diagnostisen ja terapeuttisen hoidon aikana, ja ne analysoidaan osittain suoraan ja osittain biopankkiin lisätutkimuksia varten. . Samanaikaisesti kliinisiä tietoja kerätään potilaista tutkimukseen ilmoittautumisesta lähtien PDAC-potilaiden 2 vuoden ja CRC-potilaiden 3 vuoden seurantajakson ajan.

Kerätyn kliinisen ja kokeellisen tiedon tilastollinen analyysi suoritetaan koko kliinisen tutkimuksen ajan, alkaen 6 kuukautta ensimmäisen potilaan rekisteröinnistä potilaiden seurannan loppuun, yhteensä 7 vuoden ajan. Opiskelu kestää 7 vuotta.

Tutkimustoiminta organisoidaan ja integroidaan kuuteen työpakettiin (WP):

1. Materiaalin kerääminen ja biopankki CRC- ja PDAC MTS -potilailta maksaan ja primaarisella ei-metastaattisella resektoitavalla PDAC:lla.
2. CRC:n ja PDAC:n metastaattisen maksan kasvaimen mutaatiotaakan, epigeneettisen ja geeniekspressioprofiilin määrittely massa- ja yksisolutasolla.
3. CRC:n ja, jos mahdollista, PDAC-maksa-MTS:n molekyyli- ja solukoostumuksen arviointi spatiaalisen transkriptomiikan tekniikoilla (NICHE-seq ja Visium).
4. CRC:n ja, jos mahdollista, PDAC-maksa-MTS:n immuunimaisemien karakterisointi korkean ulottuvuuden virtaussytometrialla.
5. Kohdissa 2) ja 4) saatujen molekyylitulosten validointi.
6. CRC- ja PDAC-maksa-MTS:n antigeenisen maiseman ja TCR-valikoiman määritelmä.

Edellä mainittujen työryhmien tulokset risteytetään kliinisen seurantatietojen kanssa, ja ne auttavat kalibroimaan ohjelman toimintoja, jotka keskittyvät uusien ATMP-kehitykseen.