Endometriose og peritoneal dysbiose

Hovedformålet med projektet er at analysere tarm-, peritoneal- og livmodermikrobiom hos kvinder, der gennemgår laparoskopi på grund af endometriose (arm 1) eller idiopatisk infertilitet (arm 2). Detaljerede mål er: i) analyse af sammenhængen mellem sammensætningen af ​​tarm-, peritoneal- og uterinmikrobiomet med endometriosestadiet ifølge ASRM, ii) kvalitativ sammenligning af tarm- og peritonealmikrobiomet til uterinhulemikrobiomet hos kvinder med endometriose vs. idiopatisk infertilitet, iii) analyse af sammenhængen mellem sammensætningen af ​​det intestinale, peritoneale og uterine mikrobiom med intensiteten af ​​smerte og infertilitet, iv) sammenligning af livskvaliteten i begge arme og vurdering af dens korrelation med det lokale mikrobiom. Livskvalitet vil blive vurderet i begge arme ved hjælp af SF-36 spørgeskemaet og derefter sammenlignet. Det selvrapporterede spørgeskema SF-36 dækker otte sundhedsdomæner: fysisk funktion (10 punkter), kropslige smerter (2 punkter), rollebegrænsninger på grund af fysiske helbredsproblemer (4 emner), rollebegrænsninger på grund af personlige eller følelsesmæssige problemer (4 emner). ), følelsesmæssigt velvære (5 punkter), social funktion (2 punkter), energi/træthed (4 punkter) og generelle sundhedsopfattelser (5 punkter). Scorer for hvert domæne varierer fra 0 til 100, med en højere score, der definerer en mere gunstig sundhedstilstand. Studiegruppen vil bestå af kvinder i den fødedygtige alder, som gennemgår kirurgisk behandling på grund af bækkenendometriose eller idiopatisk infertilitet. Inden operationen vil der blive taget en afføringsprøve til undersøgelse af tarmmikrobiom. Ved planlagt laparoskopi vil der udover det planlagte indgreb, som er formålet med indlæggelsen, blive udført en endometrieaspirationsbiopsi, og der vil blive opsamlet væske fra bughulen og/eller væske fra ovariecysten til analyse af det lokale mikrobiom. Biologiske materialer (afføring, peritoneal/ovariecystevæske, endometrieaspirat) vil blive sikret og derefter udsat for molekylær analyse ved brug af Next Generation Sequencing (NGS) metoden. Faserne vil omfatte: i) isolering af bakterielt DNA fra biologiske materialer, ii) forberedelse af biblioteker til sekventering, herunder udførelse af PCR og nested-PCR metoder på bakterielle DNA isolater fra de testede prøver af biologiske materialer, iii) oprensning af amplifikationsprodukter, indeksering, validering af koncentrationen af ​​amplikoner, pooling og denaturering af biblioteker, iv) standardisering og optimering af proceduren for isolering af bakterielt metagenomisk DNA fra biologiske materialer fra tarme, peritonealhule, livmoderhule og endometrievæv, v) standardisering af nested-PCR-metoden på bakterielle DNA-isolater fra de testede biologiske materialer, vi) indsendelse af prøver til sekventering. Sekvenseringsdata vil blive udsat for bioinformatikanalyse for at opnå bakterieprofiler (den procentvise sammensætning af den lokale bakteriepopulation efter phyla og slægter). Formålet er at karakterisere mikrobiomet i tarmene, bughinden og livmoderhulen hos kvinder, der gennemgår kirurgisk behandling for endometriose eller invasiv diagnostik for idiopatisk infertilitet, og at sammenligne bakteriepopulationerne på disse steder, hvilket også kan give information om bakteriernes oprindelse. i peritonealhulen.