Endometrios och peritoneal dysbios

Huvudsyftet med projektet är att analysera tarm-, peritoneal- och livmodermikrobiom hos kvinnor som genomgår laparoskopi på grund av endometrios (arm 1) eller idiopatisk infertilitet (arm 2). Detaljerade mål är: i) analys av korrelationen mellan sammansättningen av tarm-, peritoneal- och livmodermikrobiomet med stadium av endometrios enligt ASRM, ii) kvalitativ jämförelse av tarm- och peritonealmikrobiomet till livmoderhålans mikrobiomet hos kvinnor med endometrios vs. idiopatisk infertilitet, iii) analys av korrelationen mellan sammansättningen av tarm-, peritoneal- och livmodermikrobiomet med intensiteten av smärta och infertilitet, iv) jämförelse av livskvaliteten i båda armarna och bedömning av dess korrelation med den lokala mikrobiomet. Livskvalitet kommer att bedömas i båda armarna med hjälp av SF-36 frågeformuläret och sedan jämföras. Det självrapporterade frågeformuläret SF-36 täcker åtta hälsodomäner: fysisk funktion (10 artiklar), kroppslig smärta (2 artiklar), rollbegränsningar på grund av fysiska hälsoproblem (4 artiklar), rollbegränsningar på grund av personliga eller känslomässiga problem (4 artiklar). ), känslomässigt välbefinnande (5 artiklar), social funktion (2 artiklar), energi/trötthet (4 artiklar) och allmänna hälsouppfattningar (5 artiklar). Poäng för varje domän sträcker sig från 0 till 100, med en högre poäng definierar ett mer gynnsamt hälsotillstånd. Studiegruppen kommer att bestå av kvinnor i fertil ålder, som genomgår kirurgisk behandling på grund av bäckenendometrios eller idiopatisk infertilitet. Före operationen kommer ett avföringsprov att tas för undersökning av tarmmikrobiom. Vid schemalagd laparoskopi kommer, utöver det planerade ingreppet, som är syftet med sjukhusvistelsen, en endometrieaspirationsbiopsi att utföras och vätska från bukhålan och/eller vätska från ovariecystan kommer att samlas upp för analys av den lokala mikrobiomet. Biologiska material (avföring, peritoneal/ovariecystavätska, endometrieaspirat) kommer att säkras och sedan utsättas för molekylär analys med hjälp av Next Generation Sequencing-metoden (NGS). Stadierna kommer att innefatta: i) isolering av bakteriellt DNA från biologiskt material, ii) förberedelse av bibliotek för sekvensering, inklusive utförande av PCR och kapslade-PCR-metoder på bakteriellt DNA-isolat från de testade proverna av biologiskt material, iii) rening av amplifieringsprodukter, indexering, validering av koncentrationen av amplikoner, pooling och denaturering av bibliotek, iv) standardisering och optimering av proceduren för isolering av bakteriellt metagenomiskt DNA från biologiskt material från tarmar, peritonealhåla, livmoderhåla och endometrievävnader, v) standardisering av Nested-PCR-metoden på bakteriellt DNA-isolat från de testade biologiska materialen, vi) inlämnande av prover för sekvensering. Sekvenseringsdata kommer att utsättas för bioinformatisk analys för att erhålla bakterieprofiler (den procentuella sammansättningen av den lokala bakteriepopulationen efter fyla och släkten). Syftet är att karakterisera mikrobiomet i tarmarna, bukhålan och livmoderhålan hos kvinnor som genomgår kirurgisk behandling för endometrios eller invasiv diagnostik för idiopatisk infertilitet, och att jämföra bakteriepopulationerna på dessa platser, vilket också kan ge information om bakteriernas ursprung. i peritonealhålan.