Endometrioosi ja peritoneaalinen dysbioosi

Hankkeen päätavoitteena on analysoida suoliston, vatsakalvon ja kohdun mikrobiomia naisilla, joille tehdään laparoskopia endometrioosin (käsi 1) tai idiopaattisen hedelmättömyyden (käsi 2) vuoksi. Yksityiskohtaiset tavoitteet ovat: i) suoliston, vatsakalvon ja kohdun mikrobiomin koostumuksen ja endometrioosivaiheen välisen korrelaation analysointi ASRM:n mukaan, ii) suoliston ja vatsakalvon mikrobiomin kvalitatiivinen vertailu kohdun ontelon mikrobiomiin endometrioosia sairastavilla naisilla vs. idiopaattinen hedelmättömyys, iii) suoliston, vatsakalvon ja kohdun mikrobiomin koostumuksen ja kivun ja hedelmättömyyden välisen korrelaation analyysi, iv) molempien käsivarsien elämänlaadun vertaaminen ja sen korrelaation paikallisen mikrobiomin kanssa arvioiminen. Elämänlaatua arvioidaan molemmissa käsissä SF-36-kyselylomakkeella ja verrataan. SF-36 itseraportoitu kyselylomake kattaa kahdeksan terveyden osa-aluetta: fyysinen toiminta (10 kohtaa), kehon kipu (2 kohtaa), fyysisistä terveysongelmista johtuvat roolirajoitukset (4 kohtaa), henkilökohtaisista tai henkisistä ongelmista johtuvat roolirajoitukset (4 kohtaa) ), emotionaalinen hyvinvointi (5 kohdetta), sosiaalinen toiminta (2 kohdetta), energia/väsymys (4 kohdetta) ja yleinen terveyskäsitys (5 kohtaa). Kunkin verkkotunnuksen pisteet vaihtelevat 0–100, ja korkeampi pistemäärä määrittelee suotuisamman terveydentilan. Tutkimusryhmä koostuu hedelmällisessä iässä olevista naisista, jotka ovat leikkaushoidossa lantion endometrioosin tai idiopaattisen hedelmättömyyden vuoksi. Ennen leikkausta otetaan ulostenäyte suoliston mikrobiomin tutkimiseksi. Suunnitellun laparoskopian aikana suunnitellun toimenpiteen lisäksi, joka on sairaalahoidon tarkoitus, tehdään endometriumin aspiraatiobiopsia ja nestettä vatsaontelosta ja/tai nestettä munasarjakystasta kerätään paikallisen mikrobiomin analysointia varten. Biologiset materiaalit (uloste, vatsakalvon/munasarjan kystaneste, kohdun limakalvon aspiraatti) kiinnitetään ja niille suoritetaan sitten molekyylianalyysi käyttämällä seuraavan sukupolven sekvensointimenetelmää (NGS). Vaiheisiin kuuluu: i) bakteeri-DNA:n eristäminen biologisista materiaaleista, ii) kirjastojen valmistelu sekvensointia varten, mukaan lukien PCR- ja nested-PCR-menetelmien suorittaminen bakteeri-DNA-isolaateille testatuista biologisten materiaalien näytteistä, iii) monistustuotteet, indeksointi, amplikonikonsentraation validointi, kirjastojen yhdistäminen ja denaturointi, iv) bakteerien metagenomisen DNA:n eristämismenettelyn standardointi ja optimointi biologisista materiaaleista suolistosta, vatsaontelosta, kohdun ontelosta ja kohdun limakalvon kudoksista, v) Nested-PCR-menetelmän standardointi testatuista biologisista materiaaleista peräisin oleville bakteeri-DNA-isolaateille, vi) näytteiden toimittaminen sekvensointia varten. Sekvensointitiedoille suoritetaan bioinformatiikkaanalyysi bakteeriprofiilien saamiseksi (paikallisen bakteeripopulaation prosenttiosuus fylan ja sukujen mukaan). Tavoitteena on karakterisoida endometrioosin kirurgista hoitoa tai idiopaattisen hedelmättömyyden invasiivista diagnostiikkaa saavien naisten suoliston, vatsakalvon ja kohdun mikrobiomia ja vertailla näiden paikkojen bakteeripopulaatioita, jotka voivat myös antaa tietoa bakteerien alkuperästä. peritoneaaliontelossa.