En pilotundersøgelse til vurdering (PGC1)

Nyfødt screening (NBS) baseret på genomsekventering (GS) er i øjeblikket genstand for særlig opmærksomhed på både europæisk og internationalt niveau. I løbet af de sidste tre år har flere publikationer drøftet mulighederne og udfordringerne ved at bruge GS til NBS. Til dato har kun to kinesiske programmer offentliggjort deres resultater, de første på en serie på 29.601 sunde nyfødte og den anden på en serie på 10.334 sunde nyfødte og 668 spædbørn med høj risiko. Globalt er der mere end tyve pilotprojekter i gang, selvom ingen er blevet indledt inden for den franske kontekst indtil videre. På tværs af de forskellige pilotprojekter bruges forskellige undersøgelsesdesign. De fleste har valgt en målrettet GS-baseret analyse til skærm for pædiatriske begyndelsessygdomme. Nogle projekter fokuserer udelukkende på sygdomme, for hvilke der findes effektive lægemidler eller interventioner for at forhindre eller reducere symptomer. I modsætning hertil tilbyder andre forældre mulighed for at screene deres nyfødte for sygdomme uden aktuelle behandlingsmuligheder, men som en behandling er underudvikling eller med interesse for tidlig ledelse, et valg, der udøves af de fleste forældre. Faktisk kan tidlig diagnose af disse sygdomme hjælpe med at indføre behandlinger eller interventioner, når de bliver tilgængelige, til at deltage i forskningsforsøg på nye behandlinger og til at modtage tidlig styring og genetisk rådgivning.

I Frankrig er det nationale NBS -program længe blevet anerkendt over hele verden for sin organisatoriske kvalitet og forståelsesevne, skønt det indtil for nylig har et af de laveste antal sygdomme, der er vist i Europa. Fra midten af ​​2024 inkluderer de franske NBS kun 14 alvorlige sygdomme. For nylig har den franske bioetiklov udviklet sig for at muliggøre anvendelse af genetisk test som en førstelinjeprocedure for NBS. På samme tid rejser udviklingen og effektiviteten af ​​genomiske teknikker og den hurtige stigning i antallet af behandlingsmæssige sjældne sygdomme (RDS) spørgsmål om acceptabilitet og relevans af disse genomiske metoder for NBS og dens mulige udvidelse. Udvidelsen af ​​NBS til mange RD'er med tidlig begyndelse repræsenterer en reel folkesundhedsudfordring som RDS, hvoraf 80% er af genetisk oprindelse, tegner sig for 10% af dødsfaldene før 5 -årsalderen.

FHU-oversættelsen har uddybet Perigenomed Project, et stort projekt, der sigter mod at vurdere relevansen af ​​PGS-NBS i Frankrig (analytisk og klinisk gyldighed, klinisk nytte og psykosociale, etiske og organisatoriske spørgsmål).

PGS-NBS (også kendt som i silico-panelbaseret GS, dvs. en analyse udført helt ved hjælp af informatiske værktøjer) består af bioinformatikfiltreringstrin, der kun returnerede valgte varianter og/eller sjældne varianter fra målrettede gener udstedt fra GS. Så selvom kildedataene kommer fra GS, er det muligt at konfigurere rørledningen til kun at returnere de variationer, der vides at være ansvarlige for specifikke RD'er.

Det perigenomede projekt vil blive ført i to trin. Det første pilottrin (perigenomed-clinics 1-PGC1-undersøgelse), der er præsenteret i denne protokol, sigter mod at evaluere gennemførligheden og acceptabiliteten af ​​PGS-NBS Frankrig. Denne pilotundersøgelse planlægger at screene 2.500 nyfødte ved hjælp af PGS-NBS, der er målrettet mod to lister over gener (1 svarende til genervariabler, der er ansvarlige for behandlingsmæssige sjældne sygdomme, 2 inklusive genervariation, der fører til handlingerbare sjældne sygdomme). På begge lister overvejes kun RDS for tidligt begyndelse. PGC1 -undersøgelse vil blive gennemført i 5 sundhedscentre i Frankrig, med resultater, der forventes at blive returneret til klinikere inden for mindre end 4 uger. Det vil også give en forståelse af de optimale oplysninger og analytiske veje og de mulige organisatoriske konsekvenser af PGS-NBS samt en første indsigt om gyldigheden af ​​PGS-NBS og om det kliniske forløb af nyfødte screenet positiv og med en bekræftet RD to studier i humaniora og sociale videnskaber (HSS) også forbundet til PGC1-undersøgelse. Den første vil fokusere på årsagerne fra decliners og på de medicinske og socioøkonomiske egenskaber (på individuelt og kontekstuelt niveau) af decliners versus deltagere. Den anden vil vurdere den psykosociale virkning af resultatoplysning på familier af positive nyfødte, relativt af negative.

Disse oprindelige resultater vil give de første resultater inden lanceringen af ​​en anden større fase perigenomed-klinikker 2 (PGC2-undersøgelse-22.000 nyfødte), designet til undersøgelse af implementeringen af ​​sådanne PGS-NBS i rutine på regionalt niveau.