Uno studio pilota per valutare la fattibilità e l'accettabilità dello screening del neonato utilizzando il sequenziamento del genoma solista a base di pannelli in silico in Francia (PGC1)

Lo screening neonato (NBS) basato sul sequenziamento del genoma (GS) è attualmente oggetto di particolare attenzione sia a livello europeo che internazionale. Negli ultimi tre anni, diverse pubblicazioni hanno discusso delle opportunità e delle sfide dell'utilizzo di GS per NBS. Ad oggi, solo due programmi cinesi hanno pubblicato i loro risultati, il primo su una serie di 29.601 neonati sani e il secondo su una serie di 10.334 neonati sani e 668 neonati ad alto rischio. A livello globale, sono in corso più di venti progetti pilota, sebbene nessuno sia stato avviato nel contesto francese finora. Attraverso i diversi progetti pilota, vengono utilizzati vari progetti di studio. La maggior parte ha optato per un'analisi basata su GS mirata per lo screening per le malattie ad esordio pediatrico. Alcuni progetti si concentrano esclusivamente sulle malattie per le quali esistono farmaci o interventi efficaci per prevenire o ridurre i sintomi. Al contrario, altri offrono ai genitori la possibilità di proiettare i loro neonati per le malattie senza opzioni terapeutiche attuali, ma per le quali un trattamento è sottosviluppo o con interesse per la gestione precoce, una scelta esercitata dalla maggior parte dei genitori. In effetti, la diagnosi precoce di queste malattie può aiutare a introdurre trattamenti o interventi quando diventano disponibili, a partecipare a studi di ricerca su nuovi trattamenti e a ricevere consulenza tematica e tematica.

In Francia, il programma National NBS è stato a lungo riconosciuto in tutto il mondo per la sua qualità organizzativa e completa, sebbene, fino a poco tempo fa, ha uno dei più bassi numeri di malattie screening in Europa. A partire dalla metà del 2024, l'NBS francese comprende solo 14 malattie gravi. Di recente, la legge sulla bioetica francese si è evoluta per consentire l'uso dei test genetici come procedura di prima linea per NBS. Allo stesso tempo, lo sviluppo e l'efficienza delle tecniche genomiche e il rapido aumento del numero di malattie rare curabili (RDS) sollevano domande sull'accettabilità e sulla pertinenza di questi metodi genomici per NBS e sulla sua possibile estensione. L'estensione di NBS a molti RD di esordio precoce rappresenta una vera sfida di salute pubblica poiché gli RD, l'80% delle quali sono di origine genetica, rappresenta il 10% delle decessi prima dei 5 anni.

La traduzione FHU ha elaborato il progetto Perigenomed, un progetto su larga scala che mira a valutare la rilevanza dei PGS-NB in ​​Francia (validità analitica e clinica, utilità clinica e questioni psicosociali, etiche e organizzative).

Il PGS-NBS (noto anche come GS a base di pannelli in silico, ovvero un'analisi condotta interamente utilizzando strumenti informatici) è costituita da fasi di filtraggio bioinformatica che restituiscono solo varianti selezionate e/o rare varianti da geni mirati emessi da GS. Pertanto, anche se i dati di origine provengono dalla GS, è possibile configurare la pipeline per restituire solo quelle variazioni note per essere responsabili di RDS specifici.

Il progetto perigenomed sarà guidato in due passaggi. Il primo passo pilota (studio 1-PGC1 perigenomed-clinics), presentato in questo protocollo, mira a valutare la fattibilità e l'accettabilità della Francia PGS-NBS. Questo studio pilota prevede di proiettare 2.500 neonati usando PGS-NB che mirano a due elenchi di geni (1 corrispondente alle variabili dei geni responsabili delle malattie rare curabili, 2 comprese la variazione dei geni che porta a malattie rare attuabili). In entrambi gli elenchi vengono considerati solo RD di esordio precoce. Lo studio PGC1 sarà condotto in 5 centri sanitari in Francia, con i risultati che dovrebbero essere restituiti ai medici entro meno di 4 settimane. Fornirà inoltre una comprensione delle informazioni ottimali e dei percorsi analitici e delle possibili ripercussioni organizzative di PGS-NB, nonché una prima visione della validità dei PGS-NB e del corso clinico dei neonati scretiti positivi e con un RD Confermate Studi su umanità e scienze sociali (HSS) saranno anche collegati allo studio PGC1. Il primo si concentrerà sulle ragioni fornite dai declino e sulle caratteristiche mediche e socioeconomiche (a livello individuale e contestuale) dei declinatori rispetto ai partecipanti. Il secondo valuterà l'impatto psicosociale della divulgazione dei risultati sulle famiglie di neonati positivi, comparativamente di quelli negativi.

Questi risultati iniziali forniranno i primi risultati prima del lancio di una seconda fase più grande perigenomed-clinics 2 (studio PGC2-22.000 neonati), progettati per studiare l'implementazione di tali PGS-NB a livello regionale.