Um estudo piloto para avaliar a viabilidade e aceitabilidade da triagem recém-nascida usando no sequenciamento solo de genoma baseado em painel de silico na França (PGC1)

A triagem recém -nascida (NBS) baseada no sequenciamento do genoma (GS) é atualmente objeto de atenção particular nos níveis europeu e internacional. Nos últimos três anos, várias publicações discutiram as oportunidades e desafios do uso da GS para a NBS. Até o momento, apenas dois programas chineses publicaram seus resultados, o primeiro de uma série de 29.601 recém-nascidos saudáveis ​​e o segundo em uma série de 10.334 recém-nascidos saudáveis ​​e 668 bebês de alto risco. Globalmente, mais de vinte projetos piloto estão em andamento, embora nenhum tenha sido iniciado no contexto francês até agora. Nos diferentes projetos piloto, vários projetos de estudo são usados. A maioria optou por uma análise baseada em GS direcionada para rastrear doenças de início pediátrico. Alguns projetos se concentram apenas em doenças para as quais existem medicamentos ou intervenções eficazes para prevenir ou reduzir os sintomas. Por outro lado, outros oferecem aos pais a opção de rastrear seus recém -nascidos para doenças sem opções de tratamento atuais, mas para as quais um tratamento é subdesenvolvimento ou com interesse no gerenciamento precoce, uma escolha exercida pela maioria dos pais. De fato, o diagnóstico precoce dessas doenças pode ajudar a introduzir tratamentos ou intervenções quando estiverem disponíveis, para participar de ensaios de pesquisa sobre novos tratamentos e a receber o gerenciamento precoce e o aconselhamento genético.

Na França, o programa nacional da NBS é reconhecido em todo o mundo por sua qualidade e abrangência organizacional, embora, até recentemente, tenha um dos menores números de doenças rastreadas na Europa. Em meados de 2024, a NBS francesa inclui apenas 14 doenças graves. Recentemente, a lei de bioética francesa evoluiu para permitir o uso de testes genéticos como um procedimento de primeira linha para a NBS. Ao mesmo tempo, o desenvolvimento e a eficiência das técnicas genômicas e o rápido aumento no número de doenças raras tratáveis ​​(RDS) levantam questões sobre a aceitabilidade e a relevância desses métodos genômicos para a NBS e sua possível extensão. A extensão da NBS para muitos RDs de início precoce representa um verdadeiro desafio de saúde pública como RDS, 80% dos quais de origem genética, representam 10% das mortes antes dos 5 anos.

O FHU Translad elaborou o projeto Perigenomed, um projeto em larga escala que visa avaliar a relevância do PGS-NBS na França (validade analítica e clínica, utilidade clínica e questões psicossociais, éticas e organizacionais).

O PGS-NBS (também conhecido como GS baseado em painel de silico, ou seja, uma análise realizada inteiramente usando ferramentas informativas) consiste em etapas de filtragem de bioinformática que retornam apenas variantes selecionadas e/ou variantes raras de genes direcionados emitidos do GS. Portanto, mesmo que os dados de origem venham do GS, é possível configurar o pipeline para retornar apenas as variações conhecidas por serem responsáveis ​​por RDs específicos.

O projeto Perigenomed será liderado em duas etapas. A primeira etapa piloto (estudo de perigenomed-clínica 1-PGC1), apresentado neste protocolo, visa avaliar a viabilidade e aceitabilidade do PGS-NBS França. Este estudo piloto planeja rastrear 2.500 recém-nascidos usando PGS-NBS direcionando duas listas de genes (1 correspondente a genes variáveis ​​responsáveis ​​por doenças raras tratáveis, 2 incluindo variação de genes levando a doenças raras acionáveis). Nas duas listas, apenas RDS de início precoce são considerados. O estudo PGC1 será realizado em 5 centros de saúde na França, com os resultados que devem ser devolvidos aos médicos em menos de 4 semanas. Ele fornecerá uma compreensão das informações ideais e das vias analíticas, e as possíveis repercussões organizacionais dos PGS-NBs, bem como uma primeira visão sobre a validade dos PGS-NBs e sobre o curso clínico de recém-nascidos verificados positivos e com um estudo de PGC1 confirmado em ciências sociais (HSS). O primeiro se concentrará nas razões dadas pelos declinadores e nas características médicas e socioeconômicas (no nível individual e contextual) dos declínios versus participantes. O segundo avaliará o impacto psicossocial da divulgação de resultados em famílias de recém -nascidos positivos, comparativamente de negativos.

Esses resultados iniciais fornecerão os primeiros resultados antes do lançamento de um segundo perigenomado de fase maior (estudo PGC2-22.000 recém-nascidos), projetado para estudar a implementação de tais PGS-NBs em rotina em nível regional.